data_3NUH # _model_server_result.job_id gqizCUsJ66x1M6XtVycCPg _model_server_result.datetime_utc '2024-12-27 13:18:02' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3nuh # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":526}' # _entry.id 3NUH # _exptl.entry_id 3NUH _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3NUH _cell.length_a 108.062 _cell.length_b 147.493 _cell.length_c 138.87 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3NUH _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 20 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 2 2 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 4_555 x,-y,-z 1 0 0 0 -1 0 0 0 -1 0 0 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 C N N ? 3 D N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C ALA 25 A ALA 25 1_555 A N MSE 26 A MSE 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale2 A C MSE 26 A MSE 26 1_555 A N SER 27 A SER 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale3 A C ALA 51 A ALA 51 1_555 A N MSE 52 A MSE 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale4 A C MSE 52 A MSE 52 1_555 A N ASN 53 A ASN 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale5 A C ARG 91 A ARG 91 1_555 A N MSE 92 A MSE 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale6 A C MSE 92 A MSE 92 1_555 A N ALA 93 A ALA 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale7 A C TYR 100 A TYR 100 1_555 A N MSE 101 A MSE 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale8 A C MSE 101 A MSE 101 1_555 A N LEU 102 A LEU 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale9 A C ALA 119 A ALA 119 1_555 A N MSE 120 A MSE 120 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale10 A C MSE 120 A MSE 120 1_555 A N ARG 121 A ARG 121 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale11 A C LEU 134 A LEU 134 1_555 A N MSE 135 A MSE 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale12 A C MSE 135 A MSE 135 1_555 A N ALA 136 A ALA 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale13 A C VAL 158 A VAL 158 1_555 A N MSE 159 A MSE 159 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale14 A C MSE 159 A MSE 159 1_555 A N PRO 160 A PRO 160 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? covale ? covale15 A C LEU 208 A LEU 208 1_555 A N MSE 209 A MSE 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale16 A C MSE 209 A MSE 209 1_555 A N GLU 210 A GLU 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale17 A C GLY 300 A GLY 300 1_555 A N MSE 301 A MSE 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale18 A C MSE 301 A MSE 301 1_555 A N ARG 302 A ARG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale19 A C ASN 333 A ASN 333 1_555 A N MSE 334 A MSE 334 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale20 A C MSE 334 A MSE 334 1_555 A N VAL 335 A VAL 335 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale21 A C ILE 344 A ILE 344 1_555 A N MSE 345 A MSE 345 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale22 A C MSE 345 A MSE 345 1_555 A N ASN 346 A ASN 346 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale23 A C ALA 422 A ALA 422 1_555 A N MSE 423 A MSE 423 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale24 A C MSE 423 A MSE 423 1_555 A N LEU 424 A LEU 424 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale25 A C LEU 498 A LEU 498 1_555 A N MSE 499 A MSE 499 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale26 A C MSE 499 A MSE 499 1_555 A N GLU 500 A GLU 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale27 B C ILE 111 B ILE 495 1_555 B N MSE 112 B MSE 496 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale28 B C MSE 112 B MSE 496 1_555 B N THR 113 B THR 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale29 B C GLN 133 B GLN 517 1_555 B N MSE 134 B MSE 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale30 B C MSE 134 B MSE 518 1_555 B N PRO 135 B PRO 519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? covale ? covale31 B C ALA 167 B ALA 551 1_555 B N MSE 168 B MSE 552 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale32 B C MSE 168 B MSE 552 1_555 B N ASP 169 B ASP 553 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale33 B C LYS 208 B LYS 592 1_555 B N MSE 209 B MSE 593 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale34 B C MSE 209 B MSE 593 1_555 B N ILE 210 B ILE 594 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale35 B C ARG 212 B ARG 596 1_555 B N MSE 213 B MSE 597 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale36 B C MSE 213 B MSE 597 1_555 B N GLU 214 B GLU 598 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale37 B C ALA 220 B ALA 604 1_555 B N MSE 221 B MSE 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale38 B C MSE 221 B MSE 605 1_555 B N LEU 222 B LEU 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale39 B C GLU 360 B GLU 744 1_555 B N MSE 361 B MSE 745 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale40 B C MSE 361 B MSE 745 1_555 B N ASN 362 B ASN 746 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale41 B C THR 370 B THR 754 1_555 B N MSE 371 B MSE 755 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale42 B C MSE 371 B MSE 755 1_555 B N ASP 372 B ASP 756 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale43 B C ARG 377 B ARG 761 1_555 B N MSE 378 B MSE 762 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale44 B C MSE 378 B MSE 762 1_555 B N LEU 379 B LEU 763 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale45 B C LEU 396 B LEU 780 1_555 B N MSE 397 B MSE 781 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale46 B C MSE 397 B MSE 781 1_555 B N GLY 398 B GLY 782 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 3NUH _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009254 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.00678 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007201 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 3 MG A 1 526 1 MG MG . D 3 MG A 1 527 1 MG MG . E 4 HOH A 1 528 1 HOH HOH . E 4 HOH A 2 529 15 HOH HOH . E 4 HOH A 3 530 17 HOH HOH . E 4 HOH A 4 531 19 HOH HOH . E 4 HOH A 5 532 21 HOH HOH . E 4 HOH A 6 533 22 HOH HOH . F 4 HOH B 1 9 9 HOH HOH . F 4 HOH B 2 12 12 HOH HOH . F 4 HOH B 3 13 13 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id C _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 18.873 _atom_site.Cartn_y -11.867 _atom_site.Cartn_z -35.345 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 56.19 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 526 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 19 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 14 _model_server_stats.query_time_ms 333 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #