data_3OAA # _model_server_result.job_id NP3k2Zx8nPwi0FARQA6vsg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-27 16:15:56' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3oaa # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"VB","auth_seq_id":601}' # _entry.id 3OAA # _exptl.entry_id 3OAA _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 16 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 108.99 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3OAA _cell.length_a 435.97 _cell.length_b 183 _cell.length_c 225.39 _cell.Z_PDB 48 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3OAA _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? octameric 8 author_defined_assembly 1 ? octameric 8 author_defined_assembly 2 ? octameric 8 author_defined_assembly 3 ? octameric 8 author_defined_assembly 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,G,H,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC 1 1 I,J,K,L,M,N,O,P,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,LC,MC,NC,OC,PC 2 1 Q,R,S,T,U,V,W,X,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,QC,RC,SC,TC,UC 3 1 Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,VC,WC,XC 4 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 HA N N ? 6 JA N N ? 6 LA N N ? 6 NA N N ? 6 UA N N ? 6 WA N N ? 6 YA N N ? 6 AB N N ? 6 HB N N ? 6 JB N N ? 6 LB N N ? 6 NB N N ? 6 TB N N ? 6 VB N N ? 6 XB N N ? 6 ZB N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OG1 THR 176 A THR 176 1_555 HA MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.106 ? metalc ? metalc2 GA O2G ANP . A ANP 600 1_555 HA MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? metalc ? metalc3 GA O2B ANP . A ANP 600 1_555 HA MG MG . A MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.439 ? metalc ? metalc4 B OG1 THR 176 B THR 176 1_555 JA MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? metalc ? metalc5 IA O2G ANP . B ANP 600 1_555 JA MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? metalc ? metalc6 IA O2B ANP . B ANP 600 1_555 JA MG MG . B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc7 C OG1 THR 176 C THR 176 1_555 LA MG MG . C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? metalc ? metalc8 KA O2G ANP . C ANP 600 1_555 LA MG MG . C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? metalc ? metalc9 KA O2B ANP . C ANP 600 1_555 LA MG MG . C MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? metalc ? metalc10 D OG1 THR 156 D THR 156 1_555 NA MG MG . D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.106 ? metalc ? metalc11 MA O2B ADP . D ADP 600 1_555 NA MG MG . D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? metalc ? metalc12 NA MG MG . D MG 601 1_555 OA O3 SO4 . D SO4 630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? metalc ? metalc13 I OG1 THR 176 I THR 176 1_555 UA MG MG . I MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? metalc ? metalc14 TA O2G ANP . I ANP 600 1_555 UA MG MG . I MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? metalc ? metalc15 TA O2B ANP . I ANP 600 1_555 UA MG MG . I MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.195 ? metalc ? metalc16 J OG1 THR 176 J THR 176 1_555 WA MG MG . J MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? metalc ? metalc17 VA O2G ANP . J ANP 600 1_555 WA MG MG . J MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? metalc ? metalc18 VA O2B ANP . J ANP 600 1_555 WA MG MG . J MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.17 ? metalc ? metalc19 K OG1 THR 176 K THR 176 1_555 YA MG MG . K MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.956 ? metalc ? metalc20 XA O2G ANP . K ANP 600 1_555 YA MG MG . K MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.998 ? metalc ? metalc21 XA O2B ANP . K ANP 600 1_555 YA MG MG . K MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? metalc ? metalc22 L OG1 THR 156 L THR 156 1_555 AB MG MG . L MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? metalc ? metalc23 ZA O2B ADP . L ADP 600 1_555 AB MG MG . L MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.282 ? metalc ? metalc24 AB MG MG . L MG 601 1_555 BB O3 SO4 . L SO4 630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.997 ? metalc ? metalc25 Q OG1 THR 176 Q THR 176 1_555 HB MG MG . Q MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.116 ? metalc ? metalc26 GB O2G ANP . Q ANP 600 1_555 HB MG MG . Q MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? metalc ? metalc27 GB O2B ANP . Q ANP 600 1_555 HB MG MG . Q MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? metalc ? metalc28 R OG1 THR 176 R THR 176 1_555 JB MG MG . R MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.087 ? metalc ? metalc29 IB O2G ANP . R ANP 600 1_555 JB MG MG . R MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? metalc ? metalc30 IB O2B ANP . R ANP 600 1_555 JB MG MG . R MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.17 ? metalc ? metalc31 S OG1 THR 176 S THR 176 1_555 LB MG MG . S MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? metalc ? metalc32 KB O2G ANP . S ANP 600 1_555 LB MG MG . S MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.928 ? metalc ? metalc33 KB O2B ANP . S ANP 600 1_555 LB MG MG . S MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? metalc ? metalc34 T OG1 THR 156 T THR 156 1_555 NB MG MG . T MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? metalc ? metalc35 MB O2B ADP . T ADP 600 1_555 NB MG MG . T MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? metalc ? metalc36 NB MG MG . T MG 601 1_555 OB O3 SO4 . T SO4 630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? metalc ? metalc37 Y OG1 THR 176 Y THR 176 1_555 TB MG MG . Y MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? metalc ? metalc38 SB O2G ANP . Y ANP 600 1_555 TB MG MG . Y MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? metalc ? metalc39 SB O2B ANP . Y ANP 600 1_555 TB MG MG . Y MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? metalc ? metalc40 Z OG1 THR 176 Z THR 176 1_555 VB MG MG . Z MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? metalc ? metalc41 UB O2G ANP . Z ANP 600 1_555 VB MG MG . Z MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? metalc ? metalc42 UB O2B ANP . Z ANP 600 1_555 VB MG MG . Z MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? metalc ? metalc43 AA OG1 THR 176 a THR 176 1_555 XB MG MG . a MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.126 ? metalc ? metalc44 WB O2G ANP . a ANP 600 1_555 XB MG MG . a MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.932 ? metalc ? metalc45 WB O2B ANP . a ANP 600 1_555 XB MG MG . a MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.219 ? metalc ? metalc46 BA OG1 THR 156 b THR 156 1_555 ZB MG MG . b MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? metalc ? metalc47 YB O2B ADP . b ADP 600 1_555 ZB MG MG . b MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc48 ZB MG MG . b MG 601 1_555 AC O3 SO4 . b SO4 630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 3OAA _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.002294 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000789 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005464 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004692 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code GA 5 ANP A 1 600 600 ANP ANP . HA 6 MG A 1 601 601 MG MG . IA 5 ANP B 1 600 600 ANP ANP . JA 6 MG B 1 601 601 MG MG . KA 5 ANP C 1 600 600 ANP ANP . LA 6 MG C 1 601 601 MG MG . MA 7 ADP D 1 600 600 ADP ADP . NA 6 MG D 1 601 601 MG MG . OA 8 SO4 D 1 630 630 SO4 SO4 . PA 8 SO4 E 1 530 530 SO4 SO4 . QA 8 SO4 F 1 530 530 SO4 SO4 . RA 8 SO4 G 1 300 300 SO4 SO4 . SA 8 SO4 H 1 200 200 SO4 SO4 . TA 5 ANP I 1 600 600 ANP ANP . UA 6 MG I 1 601 601 MG MG . VA 5 ANP J 1 600 600 ANP ANP . WA 6 MG J 1 601 601 MG MG . XA 5 ANP K 1 600 600 ANP ANP . YA 6 MG K 1 601 601 MG MG . ZA 7 ADP L 1 600 600 ADP ADP . AB 6 MG L 1 601 601 MG MG . BB 8 SO4 L 1 630 630 SO4 SO4 . CB 8 SO4 M 1 530 530 SO4 SO4 . DB 8 SO4 N 1 530 530 SO4 SO4 . EB 8 SO4 O 1 300 300 SO4 SO4 . FB 8 SO4 P 1 200 200 SO4 SO4 . GB 5 ANP Q 1 600 600 ANP ANP . HB 6 MG Q 1 601 601 MG MG . IB 5 ANP R 1 600 600 ANP ANP . JB 6 MG R 1 601 601 MG MG . KB 5 ANP S 1 600 600 ANP ANP . LB 6 MG S 1 601 601 MG MG . MB 7 ADP T 1 600 600 ADP ADP . NB 6 MG T 1 601 601 MG MG . OB 8 SO4 T 1 630 630 SO4 SO4 . PB 8 SO4 U 1 530 530 SO4 SO4 . QB 8 SO4 V 1 530 530 SO4 SO4 . RB 8 SO4 W 1 300 300 SO4 SO4 . SB 5 ANP Y 1 600 600 ANP ANP . TB 6 MG Y 1 601 601 MG MG . UB 5 ANP Z 1 600 600 ANP ANP . VB 6 MG Z 1 601 601 MG MG . WB 5 ANP a 1 600 600 ANP ANP . XB 6 MG a 1 601 601 MG MG . YB 7 ADP b 1 600 600 ADP ADP . ZB 6 MG b 1 601 601 MG MG . AC 8 SO4 b 1 630 630 SO4 SO4 . BC 8 SO4 c 1 530 530 SO4 SO4 . CC 8 SO4 d 1 530 530 SO4 SO4 . DC 9 HOH A 1 514 514 HOH HOH . DC 9 HOH A 2 515 515 HOH HOH . DC 9 HOH A 3 516 516 HOH HOH . EC 9 HOH B 1 514 514 HOH HOH . EC 9 HOH B 2 515 515 HOH HOH . FC 9 HOH C 1 514 514 HOH HOH . FC 9 HOH C 2 515 515 HOH HOH . GC 9 HOH D 1 460 460 HOH HOH . GC 9 HOH D 2 461 461 HOH HOH . GC 9 HOH D 3 462 462 HOH HOH . GC 9 HOH D 4 463 463 HOH HOH . GC 9 HOH D 5 464 464 HOH HOH . GC 9 HOH D 6 465 465 HOH HOH . GC 9 HOH D 7 466 466 HOH HOH . GC 9 HOH D 8 467 467 HOH HOH . HC 9 HOH E 1 460 460 HOH HOH . IC 9 HOH F 1 460 460 HOH HOH . IC 9 HOH F 2 461 461 HOH HOH . IC 9 HOH F 3 462 462 HOH HOH . IC 9 HOH F 4 463 463 HOH HOH . IC 9 HOH F 5 464 464 HOH HOH . JC 9 HOH G 1 287 287 HOH HOH . JC 9 HOH G 2 288 288 HOH HOH . JC 9 HOH G 3 289 289 HOH HOH . JC 9 HOH G 4 290 290 HOH HOH . JC 9 HOH G 5 291 291 HOH HOH . JC 9 HOH G 6 292 292 HOH HOH . JC 9 HOH G 7 293 293 HOH HOH . JC 9 HOH G 8 294 294 HOH HOH . JC 9 HOH G 9 295 295 HOH HOH . JC 9 HOH G 10 296 296 HOH HOH . KC 9 HOH H 1 139 139 HOH HOH . KC 9 HOH H 2 140 140 HOH HOH . KC 9 HOH H 3 141 141 HOH HOH . KC 9 HOH H 4 142 142 HOH HOH . LC 9 HOH J 1 514 514 HOH HOH . LC 9 HOH J 2 515 515 HOH HOH . LC 9 HOH J 3 516 516 HOH HOH . MC 9 HOH L 1 460 460 HOH HOH . MC 9 HOH L 2 461 461 HOH HOH . MC 9 HOH L 3 462 462 HOH HOH . MC 9 HOH L 4 463 463 HOH HOH . MC 9 HOH L 5 464 464 HOH HOH . MC 9 HOH L 6 465 465 HOH HOH . NC 9 HOH N 1 460 460 HOH HOH . NC 9 HOH N 2 461 461 HOH HOH . NC 9 HOH N 3 462 462 HOH HOH . OC 9 HOH O 1 287 287 HOH HOH . OC 9 HOH O 2 288 288 HOH HOH . OC 9 HOH O 3 289 289 HOH HOH . OC 9 HOH O 4 290 290 HOH HOH . OC 9 HOH O 5 291 291 HOH HOH . PC 9 HOH P 1 139 139 HOH HOH . PC 9 HOH P 2 140 140 HOH HOH . QC 9 HOH Q 1 514 514 HOH HOH . RC 9 HOH R 1 514 514 HOH HOH . SC 9 HOH S 1 514 514 HOH HOH . TC 9 HOH V 1 460 460 HOH HOH . TC 9 HOH V 2 461 461 HOH HOH . UC 9 HOH X 1 139 139 HOH HOH . VC 9 HOH a 1 514 514 HOH HOH . WC 9 HOH b 1 460 460 HOH HOH . XC 9 HOH d 1 460 460 HOH HOH . XC 9 HOH d 2 461 461 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id VB _atom_site.label_entity_id 6 _atom_site.Cartn_x -23.423 _atom_site.Cartn_y -30.459 _atom_site.Cartn_z -63.538 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 147.17 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 601 _atom_site.auth_asym_id Z _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 189 _model_server_stats.parse_time_ms 210 _model_server_stats.create_model_time_ms 293 _model_server_stats.query_time_ms 271 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 1 #