data_3OX6
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_model_server_result.job_id            7TQirVPjmvuqPOyFans3Vw 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-04-19 12:27:54' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3ox6 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"S","auth_seq_id":502}' 
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_entry.id    3OX6 
#
_exptl.entry_id    3OX6 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
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_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    11 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            3OX6 
_cell.length_a            68.716 
_cell.length_b            68.716 
_cell.length_c            344.195 
_cell.Z_PDB               36 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3OX6 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        152 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 31 2 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? monomeric 1 author_defined_assembly 1 
? monomeric 1 author_defined_assembly 2 
? monomeric 1 author_defined_assembly 3 
? monomeric 1 author_defined_assembly 4 
? monomeric 1 author_defined_assembly 5 
? monomeric 1 author_defined_assembly 6 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,G,H,I,J,V 1 1 
B,K,L,M,N,W 2 1 
C,O,P,X 3 1 
D,Q,R,Y 4 1 
E,S,Z 5 1 
F,T,U,AA 6 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 G N N 
? 2 H N N 
? 2 K N N 
? 2 L N N 
? 2 O N N 
? 2 P N N 
? 2 Q N N 
? 2 R N N 
? 2 S N N 
? 2 T N N 
? 2 U N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASP 98 A ASP 112 1_555 G CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? 
metalc ? metalc2 A OD1 ASN 100 A ASN 114 1_555 G CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.156 ? 
metalc ? metalc3 A OD1 ASP 102 A ASP 116 1_555 G CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.486 ? 
metalc ? metalc4 A OD2 ASP 102 A ASP 116 1_555 G CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.16 ? 
metalc ? metalc5 A O GLU 104 A GLU 118 1_555 G CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? 
metalc ? metalc6 A OE1 GLU 109 A GLU 123 1_555 G CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? 
metalc ? metalc7 A OE2 GLU 109 A GLU 123 1_555 G CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.615 ? 
metalc ? metalc8 A OD1 ASP 135 A ASP 149 1_555 H CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? 
metalc ? metalc9 A OD1 ASN 137 A ASN 151 1_555 H CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? 
metalc ? metalc10 A OD1 ASP 139 A ASP 153 1_555 H CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.59 ? 
metalc ? metalc11 A O ARG 141 A ARG 155 1_555 H CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? 
metalc ? metalc12 A OE2 GLU 146 A GLU 160 1_555 H CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.541 ? 
metalc ? metalc13 A OE1 GLU 146 A GLU 160 1_555 H CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.655 ? 
metalc ? metalc14 B OD1 ASP 98 B ASP 112 1_555 K CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? 
metalc ? metalc15 B OD1 ASN 100 B ASN 114 1_555 K CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? 
metalc ? metalc16 B OD1 ASP 102 B ASP 116 1_555 K CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? 
metalc ? metalc17 B O GLU 104 B GLU 118 1_555 K CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? 
metalc ? metalc18 B OE1 GLU 109 B GLU 123 1_555 K CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? 
metalc ? metalc19 B OE2 GLU 109 B GLU 123 1_555 K CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.489 ? 
metalc ? metalc20 B OD1 ASP 135 B ASP 149 1_555 L CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.46 ? 
metalc ? metalc21 B OD1 ASN 137 B ASN 151 1_555 L CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? 
metalc ? metalc22 B OD1 ASP 139 B ASP 153 1_555 L CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? 
metalc ? metalc23 B O ARG 141 B ARG 155 1_555 L CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? 
metalc ? metalc24 B OE1 GLU 146 B GLU 160 1_555 L CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.416 ? 
metalc ? metalc25 B OE2 GLU 146 B GLU 160 1_555 L CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.6 ? 
metalc ? metalc26 W O HOH . B HOH 168 1_555 L CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.159 ? 
metalc ? metalc27 W O HOH . B HOH 170 1_555 K CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? 
metalc ? metalc28 C OD1 ASP 98 C ASP 112 1_555 O CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? 
metalc ? metalc29 C OD1 ASN 100 C ASN 114 1_555 O CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.412 ? 
metalc ? metalc30 C OD1 ASP 102 C ASP 116 1_555 O CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? 
metalc ? metalc31 C O GLU 104 C GLU 118 1_555 O CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.207 ? 
metalc ? metalc32 C OE1 GLU 109 C GLU 123 1_555 O CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? 
metalc ? metalc33 C OE2 GLU 109 C GLU 123 1_555 O CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? 
metalc ? metalc34 C OD1 ASP 135 C ASP 149 1_555 P CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? 
metalc ? metalc35 C OD1 ASN 137 C ASN 151 1_555 P CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.136 ? 
metalc ? metalc36 C OD1 ASP 139 C ASP 153 1_555 P CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.537 ? 
metalc ? metalc37 C O ARG 141 C ARG 155 1_555 P CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.168 ? 
metalc ? metalc38 C OE2 GLU 146 C GLU 160 1_555 P CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? 
metalc ? metalc39 C OE1 GLU 146 C GLU 160 1_555 P CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? 
metalc ? metalc40 X O HOH . C HOH 179 1_555 P CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? 
metalc ? metalc41 D OD1 ASP 98 D ASP 112 1_555 Q CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? 
metalc ? metalc42 D OD1 ASN 100 D ASN 114 1_555 Q CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? 
metalc ? metalc43 D OD1 ASP 102 D ASP 116 1_555 Q CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? 
metalc ? metalc44 D O GLU 104 D GLU 118 1_555 Q CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.438 ? 
metalc ? metalc45 D OE2 GLU 109 D GLU 123 1_555 Q CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? 
metalc ? metalc46 D OE1 GLU 109 D GLU 123 1_555 Q CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? 
metalc ? metalc47 D OD1 ASP 135 D ASP 149 1_555 R CA CA . D CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? 
metalc ? metalc48 D OD1 ASN 137 D ASN 151 1_555 R CA CA . D CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? 
metalc ? metalc49 D OD1 ASP 139 D ASP 153 1_555 R CA CA . D CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.539 ? 
metalc ? metalc50 D O ARG 141 D ARG 155 1_555 R CA CA . D CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? 
metalc ? metalc51 D OE2 GLU 146 D GLU 160 1_555 R CA CA . D CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? 
metalc ? metalc52 D OE1 GLU 146 D GLU 160 1_555 R CA CA . D CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? 
metalc ? metalc53 E OD1 ASP 135 E ASP 149 1_555 S CA CA . E CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? 
metalc ? metalc54 E OD1 ASN 137 E ASN 151 1_555 S CA CA . E CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.157 ? 
metalc ? metalc55 E OD1 ASP 139 E ASP 153 1_555 S CA CA . E CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? 
metalc ? metalc56 E O ARG 141 E ARG 155 1_555 S CA CA . E CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? 
metalc ? metalc57 E OE2 GLU 146 E GLU 160 1_555 S CA CA . E CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.918 ? 
metalc ? metalc58 E OE1 GLU 146 E GLU 160 1_555 S CA CA . E CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.031 ? 
metalc ? metalc59 F OD1 ASP 98 F ASP 112 1_555 T CA CA . F CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? 
metalc ? metalc60 F OD1 ASN 100 F ASN 114 1_555 T CA CA . F CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.855 ? 
metalc ? metalc61 F OD1 ASP 102 F ASP 116 1_555 T CA CA . F CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? 
metalc ? metalc62 F O GLU 104 F GLU 118 1_555 T CA CA . F CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.804 ? 
metalc ? metalc63 F OE2 GLU 109 F GLU 123 1_555 T CA CA . F CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.58 ? 
metalc ? metalc64 F OD1 ASP 135 F ASP 149 1_555 U CA CA . F CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? 
metalc ? metalc65 F OD1 ASN 137 F ASN 151 1_555 U CA CA . F CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? 
metalc ? metalc66 F OD1 ASP 139 F ASP 153 1_555 U CA CA . F CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? 
metalc ? metalc67 F O ARG 141 F ARG 155 1_555 U CA CA . F CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? 
metalc ? metalc68 F OE1 GLU 146 F GLU 160 1_555 U CA CA . F CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? 
metalc ? metalc69 F OE2 GLU 146 F GLU 160 1_555 U CA CA . F CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     3OX6 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.014553 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.008402 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.016804 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.002905 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
G 2 CA A 1 501 501 CA CA . 
H 2 CA A 1 502 502 CA CA . 
I 3 HEZ A 1 603 603 HEZ HEZ . 
J 3 HEZ A 1 604 604 HEZ HEZ . 
K 2 CA B 1 501 501 CA CA . 
L 2 CA B 1 502 502 CA CA . 
M 3 HEZ B 1 601 601 HEZ HEZ . 
N 3 HEZ B 1 602 602 HEZ HEZ . 
O 2 CA C 1 501 501 CA CA . 
P 2 CA C 1 502 502 CA CA . 
Q 2 CA D 1 501 501 CA CA . 
R 2 CA D 1 502 502 CA CA . 
S 2 CA E 1 502 502 CA CA . 
T 2 CA F 1 501 501 CA CA . 
U 2 CA F 1 502 502 CA CA . 
V 4 HOH A 1 10 10 HOH HOH . 
V 4 HOH A 2 11 11 HOH HOH . 
V 4 HOH A 3 13 13 HOH HOH . 
V 4 HOH A 4 168 18 HOH HOH . 
V 4 HOH A 5 169 20 HOH HOH . 
V 4 HOH A 6 170 24 HOH HOH . 
V 4 HOH A 7 171 26 HOH HOH . 
V 4 HOH A 8 172 27 HOH HOH . 
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V 4 HOH A 10 174 41 HOH HOH . 
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