data_3PFN
#
_model_server_result.job_id            shQvZXi9ijzMFdA7EtyoDQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-21 13:04:48' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3pfn 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":6}' 
#
_entry.id    3PFN 
#
_exptl.entry_id    3PFN 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              ? 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'UNKNOWN ATOM OR ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    62 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            3PFN 
_cell.length_a            66.095 
_cell.length_b            133.587 
_cell.length_c            162.668 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3PFN 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 E N N 
? 2 F N N 
? 2 G N N 
? 2 H N N 
? 2 I N N 
? 2 J N N 
? 2 K N N 
? 2 L N N 
? 2 M N N 
? 2 N N N 
? 2 O N N 
? 2 P N N 
? 2 Q N N 
? 2 R N N 
? 2 S N N 
? 2 T N N 
? 2 U N N 
? 2 V N N 
? 2 W N N 
? 2 X N N 
? 2 Y N N 
? 2 Z N N 
? 2 AA N N 
? 2 BA N N 
? 2 CA N N 
? 2 DA N N 
? 2 EA N N 
? 2 FA N N 
? 2 GA N N 
? 2 HA N N 
? 2 IA N N 
? 2 JA N N 
? 2 KA N N 
? 2 LA N N 
? 2 MA N N 
? 2 NA N N 
? 2 OA N N 
? 2 PA N N 
? 2 QA N N 
? 2 RA N N 
? 2 SA N N 
? 2 TA N N 
? 2 UA N N 
? 2 VA N N 
? 2 WA N N 
? 2 XA N N 
? 2 YA N N 
? 2 ZA N N 
? 2 AB N N 
? 2 BB N N 
? 2 CB N N 
? 2 DB N N 
? 2 EB N N 
? 2 FB N N 
? 2 GB N N 
? 2 HB N N 
? 2 IB N N 
? 2 JB N N 
? 2 KB N N 
? 2 LB N N 
? 2 MB N N 
? 2 NB N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A C ILE 21 A ILE 87 1_555 A N MSE 22 A MSE 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.353 ? 
covale ? covale2 A C MSE 22 A MSE 88 1_555 A N HIS 23 A HIS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? 
covale ? covale3 A C LYS 46 A LYS 112 1_555 A N MSE 47 A MSE 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale4 A C MSE 47 A MSE 113 1_555 A N ARG 48 A ARG 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.352 ? 
covale ? covale5 A C LEU 63 A LEU 129 1_555 A N MSE 64 A MSE 130 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.346 ? 
covale ? covale6 A C MSE 64 A MSE 130 1_555 A N GLU 65 A GLU 131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.353 ? 
covale ? covale7 A C ASN 67 A ASN 133 1_555 A N MSE 68 A MSE 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale8 A C MSE 68 A MSE 134 1_555 A N ILE 69 A ILE 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale9 A C VAL 135 A VAL 201 1_555 A N MSE 136 A MSE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
covale ? covale10 A C MSE 136 A MSE 202 1_555 A N ALA 137 A ALA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.365 ? 
covale ? covale11 A C ALA 211 A ALA 277 1_555 A N MSE 212 A MSE 278 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale12 A C MSE 212 A MSE 278 1_555 A N GLN 213 A GLN 279 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale13 A C SER 268 A SER 334 1_555 A N MSE 269 A MSE 335 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale14 A C MSE 269 A MSE 335 1_555 A N ILE 270 A ILE 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale15 A C ILE 277 A ILE 343 1_555 A N MSE 278 A MSE 344 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale16 A C MSE 278 A MSE 344 1_555 A N ILE 279 A ILE 345 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale17 A C ILE 302 A ILE 368 1_555 A N MSE 303 A MSE 369 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale18 A C MSE 303 A MSE 369 1_555 A N LEU 304 A LEU 370 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? 
covale ? covale19 B C ILE 21 B ILE 87 1_555 B N MSE 22 B MSE 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale20 B C MSE 22 B MSE 88 1_555 B N HIS 23 B HIS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? 
covale ? covale21 B C LYS 46 B LYS 112 1_555 B N MSE 47 B MSE 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? 
covale ? covale22 B C MSE 47 B MSE 113 1_555 B N ARG 48 B ARG 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.365 ? 
covale ? covale23 B C LEU 63 B LEU 129 1_555 B N MSE 64 B MSE 130 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale24 B C MSE 64 B MSE 130 1_555 B N GLU 65 B GLU 131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.352 ? 
covale ? covale25 B C ASN 67 B ASN 133 1_555 B N MSE 68 B MSE 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.348 ? 
covale ? covale26 B C MSE 68 B MSE 134 1_555 B N ILE 69 B ILE 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.346 ? 
covale ? covale27 B C VAL 135 B VAL 201 1_555 B N MSE 136 B MSE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? 
covale ? covale28 B C MSE 136 B MSE 202 1_555 B N ALA 137 B ALA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale29 B C ALA 211 B ALA 277 1_555 B N MSE 212 B MSE 278 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale30 B C MSE 212 B MSE 278 1_555 B N GLN 213 B GLN 279 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale31 B C SER 268 B SER 334 1_555 B N MSE 269 B MSE 335 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? 
covale ? covale32 B C MSE 269 B MSE 335 1_555 B N ILE 270 B ILE 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale33 B C ILE 277 B ILE 343 1_555 B N MSE 278 B MSE 344 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? 
covale ? covale34 B C MSE 278 B MSE 344 1_555 B N ILE 279 B ILE 345 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale35 B C ILE 302 B ILE 368 1_555 B N MSE 303 B MSE 369 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale36 B C MSE 303 B MSE 369 1_555 B N LEU 304 B LEU 370 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? 
covale ? covale37 C C ILE 21 C ILE 87 1_555 C N MSE 22 C MSE 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
covale ? covale38 C C MSE 22 C MSE 88 1_555 C N HIS 23 C HIS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? 
covale ? covale39 C C LYS 46 C LYS 112 1_555 C N MSE 47 C MSE 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? 
covale ? covale40 C C LEU 63 C LEU 129 1_555 C N MSE 64 C MSE 130 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale41 C C MSE 64 C MSE 130 1_555 C N GLU 65 C GLU 131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? 
covale ? covale42 C C ASN 67 C ASN 133 1_555 C N MSE 68 C MSE 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.348 ? 
covale ? covale43 C C MSE 68 C MSE 134 1_555 C N ILE 69 C ILE 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale44 C C VAL 135 C VAL 201 1_555 C N MSE 136 C MSE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? 
covale ? covale45 C C MSE 136 C MSE 202 1_555 C N ALA 137 C ALA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
covale ? covale46 C C ALA 211 C ALA 277 1_555 C N MSE 212 C MSE 278 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale47 C C MSE 212 C MSE 278 1_555 C N GLN 213 C GLN 279 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale48 C C SER 268 C SER 334 1_555 C N MSE 269 C MSE 335 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale49 C C MSE 269 C MSE 335 1_555 C N ILE 270 C ILE 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale50 C C ILE 277 C ILE 343 1_555 C N MSE 278 C MSE 344 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale51 C C MSE 278 C MSE 344 1_555 C N ILE 279 C ILE 345 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale52 C C ILE 302 C ILE 368 1_555 C N MSE 303 C MSE 369 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale53 C C MSE 303 C MSE 369 1_555 C N LEU 304 C LEU 370 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale54 D C ILE 21 D ILE 87 1_555 D N MSE 22 D MSE 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale55 D C MSE 22 D MSE 88 1_555 D N HIS 23 D HIS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
covale ? covale56 D C LEU 63 D LEU 129 1_555 D N MSE 64 D MSE 130 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? 
covale ? covale57 D C MSE 64 D MSE 130 1_555 D N GLU 65 D GLU 131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.355 ? 
covale ? covale58 D C ASN 67 D ASN 133 1_555 D N MSE 68 D MSE 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? 
covale ? covale59 D C MSE 68 D MSE 134 1_555 D N ILE 69 D ILE 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.348 ? 
covale ? covale60 D C VAL 135 D VAL 201 1_555 D N MSE 136 D MSE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale61 D C MSE 136 D MSE 202 1_555 D N ALA 137 D ALA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale62 D C ALA 211 D ALA 277 1_555 D N MSE 212 D MSE 278 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale63 D C MSE 212 D MSE 278 1_555 D N GLN 213 D GLN 279 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? 
covale ? covale64 D C SER 268 D SER 334 1_555 D N MSE 269 D MSE 335 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? 
covale ? covale65 D C MSE 269 D MSE 335 1_555 D N ILE 270 D ILE 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.319 ? 
covale ? covale66 D C ILE 277 D ILE 343 1_555 D N MSE 278 D MSE 344 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale67 D C MSE 278 D MSE 344 1_555 D N ILE 279 D ILE 345 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale68 D C ILE 302 D ILE 368 1_555 D N MSE 303 D MSE 369 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale69 D C MSE 303 D MSE 369 1_555 D N LEU 304 D LEU 370 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
#
_chem_comp.formula           ? 
_chem_comp.formula_weight    ? 
_chem_comp.id                UNX 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'UNKNOWN ATOM OR ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     3PFN 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.01513 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.007486 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.006147 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
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I 2 UNX A 1 5 5 UNX UNX . 
J 2 UNX A 1 6 6 UNX UNX . 
K 2 UNX A 1 7 7 UNX UNX . 
L 2 UNX A 1 8 8 UNX UNX . 
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N 2 UNX A 1 11 11 UNX UNX . 
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P 2 UNX A 1 14 14 UNX UNX . 
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R 2 UNX A 1 28 28 UNX UNX . 
S 2 UNX A 1 36 36 UNX UNX . 
T 2 UNX A 1 40 40 UNX UNX . 
U 2 UNX A 1 42 42 UNX UNX . 
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Z 2 UNX B 1 12 12 UNX UNX . 
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TA 2 UNX C 1 27 27 UNX UNX . 
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WA 2 UNX C 1 32 32 UNX UNX . 
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