data_3PLA # _model_server_result.job_id gYmUOPbkk5fyngX5Qs0Kig _model_server_result.datetime_utc '2025-01-14 14:43:42' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3pla # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"Q","auth_seq_id":301}' # _entry.id 3PLA # _exptl.entry_id 3PLA _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 384.411 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3PLA _cell.length_a 241.199 _cell.length_b 241.199 _cell.length_c 145.408 _cell.Z_PDB 24 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3PLA _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 92 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41 21 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA decameric 10 author_and_software_defined_assembly 1 PISA decameric 10 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,P,Q 1 1 K,L,M,N,O,R 2 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 7_645 y+1,x-1,-z 0 1 0 1 0 0 0 0 -1 241.199 -241.199 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 P N N ? 6 Q N N ? 6 R N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order hydrog 'G-C PAIR' hydrog1 G N2 G 1 G G 1 1_555 H O2 C 40 H C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 G N1 G 2 G G 2 1_555 H N3 C 39 H C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 G N2 G 2 G G 2 1_555 H O2 C 39 H C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 G O6 G 2 G G 2 1_555 H N4 C 39 H C 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog5 G N1 G 2 G G 2 1_555 H N3 C 40 H C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog6 G N1 G 3 G G 3 1_555 H N3 C 38 H C 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-U PAIR' hydrog7 G N1 A 4 G A 4 1_555 H N3 U 37 H U 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog8 G N1 G 5 G G 5 1_555 H O2 C 36 H C 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 G N3 U 6 G U 6 1_555 H N1 A 35 H A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 G O4 U 6 G U 6 1_555 H N6 A 35 H A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 G N3 C 7 G C 7 1_555 H N1 G 34 H G 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 G N4 C 7 G C 7 1_555 H O6 G 34 H G 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 G O2 C 7 G C 7 1_555 H N2 G 34 H G 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 G N3 U 8 G U 8 1_555 H N1 A 33 H A 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 G O4 U 8 G U 8 1_555 H N6 A 33 H A 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-G MISPAIR' hydrog16 G O2 U 9 G U 9 1_555 G N2 G 10 G G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog17 G N2 G 12 G G 12 1_555 H N7 A 32 H A 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog18 G N3 G 12 G G 12 1_555 H N6 A 32 H A 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog19 G N6 A 13 G A 13 1_555 H N3 G 31 H G 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog20 G N7 A 13 G A 13 1_555 H N2 G 31 H G 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog21 G N3 U 14 G U 14 1_555 H O2 U 30 H U 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog22 G O4 U 14 G U 14 1_555 H N3 U 30 H U 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 G N1 G 15 G G 15 1_555 H N3 C 29 H C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 G N2 G 15 G G 15 1_555 H O2 C 29 H C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 G O6 G 15 G G 15 1_555 H N4 C 29 H C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog26 G N1 A 16 G A 16 1_555 H N4 C 29 H C 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 G N1 A 18 G A 18 1_555 I N3 U 10 I U 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 G N6 A 18 G A 18 1_555 I O4 U 10 I U 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 G N3 C 19 G C 19 1_555 I N1 G 9 I G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 G N4 C 19 G C 19 1_555 I O6 G 9 I G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 G O2 C 19 G C 19 1_555 I N2 G 9 I G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 G N1 A 20 G A 20 1_555 I N3 U 8 I U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 G N6 A 20 G A 20 1_555 I O4 U 8 I U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 G N3 C 21 G C 21 1_555 I N1 G 7 I G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 G N4 C 21 G C 21 1_555 I O6 G 7 I G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 G O2 C 21 G C 21 1_555 I N2 G 7 I G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 G N3 U 22 G U 22 1_555 I N1 A 6 I A 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 G O4 U 22 G U 22 1_555 I N6 A 6 I A 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 G N3 C 23 G C 23 1_555 I N1 G 5 I G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 G N4 C 23 G C 23 1_555 I O6 G 5 I G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 G O2 C 23 G C 23 1_555 I N2 G 5 I G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 G N1 A 24 G A 24 1_555 I N3 U 4 I U 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 G N6 A 24 G A 24 1_555 I O4 U 4 I U 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 G N3 U 25 G U 25 1_555 I N1 A 3 I A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 G O4 U 25 G U 25 1_555 I N6 A 3 I A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 G N1 G 26 G G 26 1_555 I N3 C 2 I C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 G N2 G 26 G G 26 1_555 I O2 C 2 I C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 G O6 G 26 G G 26 1_555 I N4 C 2 I C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 G N1 G 27 G G 27 1_555 I N3 C 1 I C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 G N2 G 27 G G 27 1_555 I O2 C 1 I C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 G O6 G 27 G G 27 1_555 I N4 C 1 I C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 G N3 C 29 G C 29 1_555 H N1 G 15 H G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 G N4 C 29 G C 29 1_555 H O6 G 15 H G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 G O2 C 29 G C 29 1_555 H N2 G 15 H G 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-A MISPAIR' hydrog55 G N4 C 29 G C 29 1_555 H N1 A 16 H A 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog56 G N3 U 30 G U 30 1_555 H O4 U 14 H U 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_16_PAIR hydrog57 G O2 U 30 G U 30 1_555 H N3 U 14 H U 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog58 G N2 G 31 G G 31 1_555 H N7 A 13 H A 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog59 G N3 G 31 G G 31 1_555 H N6 A 13 H A 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog60 G N6 A 32 G A 32 1_555 H N3 G 12 H G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog61 G N7 A 32 G A 32 1_555 H N2 G 12 H G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-G MISPAIR' hydrog62 H O2 U 9 H U 9 1_555 H N2 G 10 H G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 H N1 A 18 H A 18 1_555 J N3 U 10 J U 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 H N6 A 18 H A 18 1_555 J O4 U 10 J U 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 H N3 C 19 H C 19 1_555 J N1 G 9 J G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 H N4 C 19 H C 19 1_555 J O6 G 9 J G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 H O2 C 19 H C 19 1_555 J N2 G 9 J G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 H N1 A 20 H A 20 1_555 J N3 U 8 J U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 H N6 A 20 H A 20 1_555 J O4 U 8 J U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 H N3 C 21 H C 21 1_555 J N1 G 7 J G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 H N4 C 21 H C 21 1_555 J O6 G 7 J G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 H O2 C 21 H C 21 1_555 J N2 G 7 J G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 H N3 U 22 H U 22 1_555 J N1 A 6 J A 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 H O4 U 22 H U 22 1_555 J N6 A 6 J A 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 H N3 C 23 H C 23 1_555 J N1 G 5 J G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 H N4 C 23 H C 23 1_555 J O6 G 5 J G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 H O2 C 23 H C 23 1_555 J N2 G 5 J G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 H N1 A 24 H A 24 1_555 J N3 U 4 J U 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 H N6 A 24 H A 24 1_555 J O4 U 4 J U 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 H N3 U 25 H U 25 1_555 J N1 A 3 J A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 H O4 U 25 H U 25 1_555 J N6 A 3 J A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog82 H N1 G 26 H G 26 1_555 J N3 C 2 J C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog83 H N2 G 26 H G 26 1_555 J O2 C 2 J C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog84 H O6 G 26 H G 26 1_555 J N4 C 2 J C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog85 H N1 G 27 H G 27 1_555 J N3 C 1 J C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog86 H N2 G 27 H G 27 1_555 J O2 C 1 J C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog87 H O6 G 27 H G 27 1_555 J N4 C 1 J C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-G MISPAIR' hydrog88 N O2 U 9 N U 9 1_555 N N2 G 10 N G 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog89 N N1 A 18 N A 18 1_555 O N3 U 10 O U 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog90 N N6 A 18 N A 18 1_555 O O4 U 10 O U 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog91 N N3 C 19 N C 19 1_555 O N1 G 9 O G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog92 N N4 C 19 N C 19 1_555 O O6 G 9 O G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog93 N O2 C 19 N C 19 1_555 O N2 G 9 O G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog94 N N1 A 20 N A 20 1_555 O N3 U 8 O U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog95 N N6 A 20 N A 20 1_555 O O4 U 8 O U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog96 N N3 C 21 N C 21 1_555 O N1 G 7 O G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog97 N N4 C 21 N C 21 1_555 O O6 G 7 O G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog98 N O2 C 21 N C 21 1_555 O N2 G 7 O G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog99 N N3 U 22 N U 22 1_555 O N1 A 6 O A 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog100 N O4 U 22 N U 22 1_555 O N6 A 6 O A 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog101 N N3 C 23 N C 23 1_555 O N1 G 5 O G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog102 N N4 C 23 N C 23 1_555 O O6 G 5 O G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog103 N O2 C 23 N C 23 1_555 O N2 G 5 O G 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog104 N N1 A 24 N A 24 1_555 O N3 U 4 O U 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog105 N N6 A 24 N A 24 1_555 O O4 U 4 O U 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog106 N N3 U 25 N U 25 1_555 O N1 A 3 O A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog107 N O4 U 25 N U 25 1_555 O N6 A 3 O A 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog108 N N1 G 26 N G 26 1_555 O N3 C 2 O C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog109 N N2 G 26 N G 26 1_555 O O2 C 2 O C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog110 N O6 G 26 N G 26 1_555 O N4 C 2 O C 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog111 N N1 G 27 N G 27 1_555 O N3 C 1 O C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog112 N N2 G 27 N G 27 1_555 O O2 C 1 O C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog113 N O6 G 27 N G 27 1_555 O N4 C 1 O C 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C14 H20 N6 O5 S' _chem_comp.formula_weight 384.411 _chem_comp.id SAH _chem_comp.mon_nstd_flag n _chem_comp.name S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE _chem_comp.type 'l-peptide linking' _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag N CA SAH sing 390 n n N HN1 SAH sing 391 n n N HN2 SAH sing 392 n n CA CB SAH sing 393 n n CA C SAH sing 394 n n CA HA SAH sing 395 n n CB CG SAH sing 396 n n CB HB1 SAH sing 397 n n CB HB2 SAH sing 398 n n CG SD SAH sing 399 n n CG HG1 SAH sing 400 n n CG HG2 SAH sing 401 n n SD C5' SAH sing 402 n n C O SAH doub 403 n n C OXT SAH sing 404 n n OXT HXT SAH sing 405 n n C5' C4' SAH sing 406 n n C5' "H5'1" SAH sing 407 n n C5' "H5'2" SAH sing 408 n n C4' O4' SAH sing 409 n n C4' C3' SAH sing 410 n n C4' H4' SAH sing 411 n n O4' C1' SAH sing 412 n n C3' O3' SAH sing 413 n n C3' C2' SAH sing 414 n n C3' H3' SAH sing 415 n n O3' HO3' SAH sing 416 n n C2' O2' SAH sing 417 n n C2' C1' SAH sing 418 n n C2' H2' SAH sing 419 n n O2' HO2' SAH sing 420 n n C1' N9 SAH sing 421 n n C1' H1' SAH sing 422 n n N9 C8 SAH sing 423 n y N9 C4 SAH sing 424 n y C8 N7 SAH doub 425 n y C8 H8 SAH sing 426 n n N7 C5 SAH sing 427 n y C5 C6 SAH sing 428 n y C5 C4 SAH doub 429 n y C6 N6 SAH sing 430 n n C6 N1 SAH doub 431 n y N6 HN61 SAH sing 432 n n N6 HN62 SAH sing 433 n n N1 C2 SAH sing 434 n y C2 N3 SAH doub 435 n y C2 H2 SAH sing 436 n n N3 C4 SAH sing 437 n y # _atom_sites.entry_id 3PLA _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.004146 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.004146 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006877 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code P 6 SAH E 1 301 301 SAH SAH . Q 6 SAH F 1 301 301 SAH SAH . R 6 SAH M 1 301 301 SAH SAH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N SAH . . . Q 6 131.924 -39.861 -5.795 1 75.24 ? N SAH 301 F 1 HETATM 2 C CA SAH . . . Q 6 130.966 -40.234 -4.768 1 75.13 ? CA SAH 301 F 1 HETATM 3 C CB SAH . . . Q 6 129.874 -39.175 -4.602 1 75.42 ? CB SAH 301 F 1 HETATM 4 C CG SAH . . . Q 6 130.399 -37.747 -4.425 1 76.5 ? CG SAH 301 F 1 HETATM 5 S SD SAH . . . Q 6 129.377 -36.841 -3.292 1 78.91 ? SD SAH 301 F 1 HETATM 6 C C SAH . . . Q 6 130.353 -41.523 -5.194 1 74.81 ? C SAH 301 F 1 HETATM 7 O O SAH . . . Q 6 130.378 -42.493 -4.452 1 74.87 ? O SAH 301 F 1 HETATM 8 O OXT SAH . . . Q 6 129.822 -41.642 -6.291 1 74.78 ? OXT SAH 301 F 1 HETATM 9 C C5' SAH . . . Q 6 130.084 -35.215 -3.359 1 77.85 ? C5' SAH 301 F 1 HETATM 10 C C4' SAH . . . Q 6 131.384 -35.127 -2.559 1 77.66 ? C4' SAH 301 F 1 HETATM 11 O O4' SAH . . . Q 6 132.219 -34.086 -3.076 1 76.88 ? O4' SAH 301 F 1 HETATM 12 C C3' SAH . . . Q 6 131.165 -34.813 -1.08 1 77.85 ? C3' SAH 301 F 1 HETATM 13 O O3' SAH . . . Q 6 131.636 -35.883 -0.26 1 77.79 ? O3' SAH 301 F 1 HETATM 14 C C2' SAH . . . Q 6 131.976 -33.55 -0.834 1 77.89 ? C2' SAH 301 F 1 HETATM 15 O O2' SAH . . . Q 6 132.611 -33.506 0.449 1 78.66 ? O2' SAH 301 F 1 HETATM 16 C C1' SAH . . . Q 6 132.974 -33.586 -1.976 1 76.98 ? C1' SAH 301 F 1 HETATM 17 N N9 SAH . . . Q 6 133.544 -32.251 -2.253 1 76.71 ? N9 SAH 301 F 1 HETATM 18 C C8 SAH . . . Q 6 132.861 -31.097 -2.402 1 76.7 ? C8 SAH 301 F 1 HETATM 19 N N7 SAH . . . Q 6 133.706 -30.056 -2.642 1 76.56 ? N7 SAH 301 F 1 HETATM 20 C C5 SAH . . . Q 6 134.952 -30.553 -2.653 1 75.96 ? C5 SAH 301 F 1 HETATM 21 C C6 SAH . . . Q 6 136.3 -29.998 -2.843 1 75.72 ? C6 SAH 301 F 1 HETATM 22 N N6 SAH . . . Q 6 136.443 -28.675 -3.083 1 76.66 ? N6 SAH 301 F 1 HETATM 23 N N1 SAH . . . Q 6 137.352 -30.85 -2.773 1 75.16 ? N1 SAH 301 F 1 HETATM 24 C C2 SAH . . . Q 6 137.193 -32.171 -2.539 1 74.79 ? C2 SAH 301 F 1 HETATM 25 N N3 SAH . . . Q 6 135.993 -32.749 -2.351 1 74.97 ? N3 SAH 301 F 1 HETATM 26 C C4 SAH . . . Q 6 134.852 -32.002 -2.395 1 76.31 ? C4 SAH 301 F 1 # _model_server_stats.io_time_ms 35 _model_server_stats.parse_time_ms 15 _model_server_stats.create_model_time_ms 21 _model_server_stats.query_time_ms 215 _model_server_stats.encode_time_ms 12 _model_server_stats.element_count 26 #