data_3PXF # _model_server_result.job_id G7EB-BCQe6JNtK7eNng0Yw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 22:32:40' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3pxf # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":302}' # _entry.id 3PXF # _exptl.entry_id 3PXF _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 62.068 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 1,2-ETHANEDIOL _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3PXF _cell.length_a 53.01 _cell.length_b 69.45 _cell.length_c 72.29 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3PXF _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N # _chem_comp.formula 'C2 H6 O2' _chem_comp.formula_weight 62.068 _chem_comp.id EDO _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 1,2-ETHANEDIOL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 'ETHYLENE GLYCOL' # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1 EDO sing 119 n n C1 C2 EDO sing 120 n n C1 H11 EDO sing 121 n n C1 H12 EDO sing 122 n n O1 HO1 EDO sing 123 n n C2 O2 EDO sing 124 n n C2 H21 EDO sing 125 n n C2 H22 EDO sing 126 n n O2 HO2 EDO sing 127 n n # _atom_sites.entry_id 3PXF _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.018864 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.014399 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.013833 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 EDO A 1 299 1 EDO EDO . C 2 EDO A 1 300 2 EDO EDO . D 2 EDO A 1 301 3 EDO EDO . E 2 EDO A 1 302 4 EDO EDO . F 2 EDO A 1 303 5 EDO EDO . G 3 2AN A 1 304 2 2AN 2AN . H 3 2AN A 1 305 3 2AN 2AN . I 4 HOH A 1 306 1 HOH WAT . I 4 HOH A 2 307 2 HOH WAT . I 4 HOH A 3 308 3 HOH WAT . I 4 HOH A 4 309 4 HOH WAT . I 4 HOH A 5 310 5 HOH WAT . I 4 HOH A 6 311 6 HOH WAT . I 4 HOH A 7 312 7 HOH WAT . I 4 HOH A 8 313 8 HOH WAT . I 4 HOH A 9 314 9 HOH WAT . I 4 HOH A 10 315 10 HOH WAT . I 4 HOH A 11 316 11 HOH WAT . I 4 HOH A 12 317 12 HOH WAT . I 4 HOH A 13 318 14 HOH WAT . I 4 HOH A 14 319 16 HOH WAT . I 4 HOH A 15 320 17 HOH WAT . I 4 HOH A 16 321 18 HOH WAT . I 4 HOH A 17 322 19 HOH WAT . I 4 HOH A 18 323 20 HOH WAT . I 4 HOH A 19 324 21 HOH WAT . I 4 HOH A 20 325 22 HOH WAT . I 4 HOH A 21 326 23 HOH WAT . I 4 HOH A 22 327 24 HOH WAT . I 4 HOH A 23 328 25 HOH WAT . I 4 HOH A 24 329 26 HOH WAT . I 4 HOH A 25 330 27 HOH WAT . I 4 HOH A 26 331 28 HOH WAT . I 4 HOH A 27 332 29 HOH WAT . I 4 HOH A 28 333 30 HOH WAT . I 4 HOH A 29 334 31 HOH WAT . I 4 HOH A 30 335 32 HOH WAT . I 4 HOH A 31 336 33 HOH WAT . I 4 HOH A 32 337 34 HOH WAT . I 4 HOH A 33 338 35 HOH WAT . I 4 HOH A 34 339 36 HOH WAT . I 4 HOH A 35 340 37 HOH WAT . I 4 HOH A 36 341 38 HOH WAT . I 4 HOH A 37 342 39 HOH WAT . I 4 HOH A 38 343 40 HOH WAT . I 4 HOH A 39 344 41 HOH WAT . I 4 HOH A 40 345 42 HOH WAT . I 4 HOH A 41 346 43 HOH WAT . I 4 HOH A 42 347 44 HOH WAT . I 4 HOH A 43 348 45 HOH WAT . I 4 HOH A 44 349 46 HOH WAT . I 4 HOH A 45 350 47 HOH WAT . I 4 HOH A 46 351 48 HOH WAT . I 4 HOH A 47 352 49 HOH WAT . I 4 HOH A 48 353 50 HOH WAT . I 4 HOH A 49 354 51 HOH WAT . I 4 HOH A 50 355 52 HOH WAT . I 4 HOH A 51 356 53 HOH WAT . I 4 HOH A 52 357 54 HOH WAT . I 4 HOH A 53 358 55 HOH WAT . I 4 HOH A 54 359 56 HOH WAT . I 4 HOH A 55 360 57 HOH WAT . I 4 HOH A 56 361 58 HOH WAT . I 4 HOH A 57 362 60 HOH WAT . I 4 HOH A 58 363 61 HOH WAT . I 4 HOH A 59 364 62 HOH WAT . I 4 HOH A 60 365 63 HOH WAT . I 4 HOH A 61 366 64 HOH WAT . I 4 HOH A 62 367 66 HOH WAT . I 4 HOH A 63 368 67 HOH WAT . I 4 HOH A 64 369 68 HOH WAT . I 4 HOH A 65 370 69 HOH WAT . I 4 HOH A 66 371 70 HOH WAT . I 4 HOH A 67 372 71 HOH WAT . I 4 HOH A 68 373 72 HOH WAT . I 4 HOH A 69 374 73 HOH WAT . I 4 HOH A 70 375 74 HOH WAT . I 4 HOH A 71 376 75 HOH WAT . I 4 HOH A 72 377 76 HOH WAT . I 4 HOH A 73 378 77 HOH WAT . I 4 HOH A 74 379 78 HOH WAT . I 4 HOH A 75 380 79 HOH WAT . I 4 HOH A 76 381 80 HOH WAT . I 4 HOH A 77 382 81 HOH WAT . I 4 HOH A 78 383 82 HOH WAT . I 4 HOH A 79 384 83 HOH WAT . I 4 HOH A 80 386 85 HOH WAT . I 4 HOH A 81 387 86 HOH WAT . I 4 HOH A 82 388 87 HOH WAT . I 4 HOH A 83 389 88 HOH WAT . I 4 HOH A 84 390 89 HOH WAT . I 4 HOH A 85 391 90 HOH WAT . I 4 HOH A 86 392 91 HOH WAT . I 4 HOH A 87 393 92 HOH WAT . I 4 HOH A 88 394 93 HOH WAT . I 4 HOH A 89 395 94 HOH WAT . I 4 HOH A 90 396 95 HOH WAT . I 4 HOH A 91 397 96 HOH WAT . I 4 HOH A 92 398 97 HOH WAT . I 4 HOH A 93 399 98 HOH WAT . I 4 HOH A 94 400 99 HOH WAT . I 4 HOH A 95 401 100 HOH WAT . I 4 HOH A 96 402 101 HOH WAT . I 4 HOH A 97 403 102 HOH WAT . I 4 HOH A 98 404 103 HOH WAT . I 4 HOH A 99 405 104 HOH WAT . I 4 HOH A 100 406 105 HOH WAT . I 4 HOH A 101 407 106 HOH WAT . I 4 HOH A 102 408 107 HOH WAT . I 4 HOH A 103 409 108 HOH WAT . I 4 HOH A 104 410 109 HOH WAT . I 4 HOH A 105 411 110 HOH WAT . I 4 HOH A 106 412 111 HOH WAT . I 4 HOH A 107 413 112 HOH WAT . I 4 HOH A 108 415 114 HOH WAT . I 4 HOH A 109 416 115 HOH WAT . I 4 HOH A 110 417 116 HOH WAT . I 4 HOH A 111 418 117 HOH WAT . I 4 HOH A 112 419 118 HOH WAT . I 4 HOH A 113 420 119 HOH WAT . I 4 HOH A 114 421 120 HOH WAT . I 4 HOH A 115 422 121 HOH WAT . I 4 HOH A 116 423 122 HOH WAT . I 4 HOH A 117 424 123 HOH WAT . I 4 HOH A 118 425 124 HOH WAT . I 4 HOH A 119 426 125 HOH WAT . I 4 HOH A 120 427 126 HOH WAT . I 4 HOH A 121 428 127 HOH WAT . I 4 HOH A 122 429 128 HOH WAT . I 4 HOH A 123 430 129 HOH WAT . I 4 HOH A 124 431 130 HOH WAT . I 4 HOH A 125 432 131 HOH WAT . I 4 HOH A 126 433 132 HOH WAT . I 4 HOH A 127 434 133 HOH WAT . I 4 HOH A 128 435 134 HOH WAT . I 4 HOH A 129 436 136 HOH WAT . I 4 HOH A 130 437 137 HOH WAT . I 4 HOH A 131 438 138 HOH WAT . I 4 HOH A 132 439 139 HOH WAT . I 4 HOH A 133 440 140 HOH WAT . I 4 HOH A 134 441 141 HOH WAT . I 4 HOH A 135 442 142 HOH WAT . I 4 HOH A 136 443 143 HOH WAT . I 4 HOH A 137 444 144 HOH WAT . I 4 HOH A 138 445 145 HOH WAT . I 4 HOH A 139 446 146 HOH WAT . I 4 HOH A 140 447 147 HOH WAT . I 4 HOH A 141 448 148 HOH WAT . I 4 HOH A 142 449 149 HOH WAT . I 4 HOH A 143 451 151 HOH WAT . I 4 HOH A 144 452 152 HOH WAT . I 4 HOH A 145 453 153 HOH WAT . I 4 HOH A 146 454 154 HOH WAT . I 4 HOH A 147 455 155 HOH WAT . I 4 HOH A 148 456 156 HOH WAT . I 4 HOH A 149 457 157 HOH WAT . I 4 HOH A 150 458 159 HOH WAT . I 4 HOH A 151 459 160 HOH WAT . I 4 HOH A 152 460 161 HOH WAT . I 4 HOH A 153 461 162 HOH WAT . I 4 HOH A 154 462 163 HOH WAT . I 4 HOH A 155 463 164 HOH WAT . I 4 HOH A 156 464 165 HOH WAT . I 4 HOH A 157 465 166 HOH WAT . I 4 HOH A 158 467 170 HOH WAT . I 4 HOH A 159 468 171 HOH WAT . I 4 HOH A 160 469 172 HOH WAT . I 4 HOH A 161 471 174 HOH WAT . I 4 HOH A 162 473 176 HOH WAT . I 4 HOH A 163 474 177 HOH WAT . I 4 HOH A 164 476 179 HOH WAT . I 4 HOH A 165 477 180 HOH WAT . I 4 HOH A 166 478 181 HOH WAT . I 4 HOH A 167 479 182 HOH WAT . I 4 HOH A 168 480 184 HOH WAT . I 4 HOH A 169 481 185 HOH WAT . I 4 HOH A 170 482 186 HOH WAT . I 4 HOH A 171 483 187 HOH WAT . I 4 HOH A 172 484 188 HOH WAT . I 4 HOH A 173 486 190 HOH WAT . I 4 HOH A 174 487 191 HOH WAT . I 4 HOH A 175 488 192 HOH WAT . I 4 HOH A 176 489 193 HOH WAT . I 4 HOH A 177 490 194 HOH WAT . I 4 HOH A 178 493 197 HOH WAT . I 4 HOH A 179 494 198 HOH WAT . I 4 HOH A 180 496 200 HOH WAT . I 4 HOH A 181 497 201 HOH WAT . I 4 HOH A 182 498 202 HOH WAT . I 4 HOH A 183 499 203 HOH WAT . I 4 HOH A 184 500 204 HOH WAT . I 4 HOH A 185 501 205 HOH WAT . I 4 HOH A 186 502 206 HOH WAT . I 4 HOH A 187 503 207 HOH WAT . I 4 HOH A 188 504 208 HOH WAT . I 4 HOH A 189 505 209 HOH WAT . I 4 HOH A 190 506 210 HOH WAT . I 4 HOH A 191 507 211 HOH WAT . I 4 HOH A 192 508 212 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 EDO . . . E 2 118.682 126.154 78.825 1 52.48 ? C1 EDO 302 A 1 HETATM 2 O O1 EDO . . . E 2 117.515 126.206 79.651 1 53.56 ? O1 EDO 302 A 1 HETATM 3 C C2 EDO . . . E 2 119.923 126.01 79.706 1 52.82 ? C2 EDO 302 A 1 HETATM 4 O O2 EDO . . . E 2 120.917 126.949 79.291 1 51.97 ? O2 EDO 302 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 6 _model_server_stats.parse_time_ms 6 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 305 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 4 #