data_3PXQ # _model_server_result.job_id i00cM7R3msV1VwYEhwTwtg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-23 02:45:38' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3pxq # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":299}' # _entry.id 3PXQ # _exptl.entry_id 3PXQ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 62.068 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 1,2-ETHANEDIOL _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3PXQ _cell.length_a 52.85 _cell.length_b 69.68 _cell.length_c 72.28 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3PXQ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # _chem_comp.formula 'C2 H6 O2' _chem_comp.formula_weight 62.068 _chem_comp.id EDO _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 1,2-ETHANEDIOL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 'ETHYLENE GLYCOL' # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1 EDO sing 119 n n C1 C2 EDO sing 120 n n C1 H11 EDO sing 121 n n C1 H12 EDO sing 122 n n O1 HO1 EDO sing 123 n n C2 O2 EDO sing 124 n n C2 H21 EDO sing 125 n n C2 H22 EDO sing 126 n n O2 HO2 EDO sing 127 n n # _atom_sites.entry_id 3PXQ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.018921 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.014351 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.013835 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 EDO A 1 299 1 EDO EDO . C 3 2AN A 1 300 1 2AN 2AN . D 3 2AN A 1 301 2 2AN 2AN . E 3 2AN A 1 302 3 2AN 2AN . F 4 HOH A 1 303 1 HOH WAT . F 4 HOH A 2 304 2 HOH WAT . F 4 HOH A 3 305 3 HOH WAT . F 4 HOH A 4 306 4 HOH WAT . F 4 HOH A 5 307 5 HOH WAT . F 4 HOH A 6 308 6 HOH WAT . F 4 HOH A 7 309 7 HOH WAT . F 4 HOH A 8 310 8 HOH WAT . F 4 HOH A 9 311 9 HOH WAT . F 4 HOH A 10 312 10 HOH WAT . F 4 HOH A 11 313 11 HOH WAT . F 4 HOH A 12 314 12 HOH WAT . F 4 HOH A 13 315 13 HOH WAT . F 4 HOH A 14 316 14 HOH WAT . F 4 HOH A 15 317 16 HOH WAT . F 4 HOH A 16 318 18 HOH WAT . F 4 HOH A 17 319 19 HOH WAT . F 4 HOH A 18 320 20 HOH WAT . F 4 HOH A 19 321 21 HOH WAT . F 4 HOH A 20 322 22 HOH WAT . F 4 HOH A 21 323 23 HOH WAT . F 4 HOH A 22 324 24 HOH WAT . F 4 HOH A 23 325 25 HOH WAT . F 4 HOH A 24 326 26 HOH WAT . F 4 HOH A 25 327 27 HOH WAT . F 4 HOH A 26 328 28 HOH WAT . F 4 HOH A 27 329 29 HOH WAT . F 4 HOH A 28 330 30 HOH WAT . F 4 HOH A 29 331 31 HOH WAT . F 4 HOH A 30 332 32 HOH WAT . F 4 HOH A 31 333 33 HOH WAT . F 4 HOH A 32 334 34 HOH WAT . F 4 HOH A 33 335 35 HOH WAT . F 4 HOH A 34 336 36 HOH WAT . F 4 HOH A 35 337 37 HOH WAT . F 4 HOH A 36 338 39 HOH WAT . F 4 HOH A 37 339 40 HOH WAT . F 4 HOH A 38 340 41 HOH WAT . F 4 HOH A 39 341 42 HOH WAT . F 4 HOH A 40 342 43 HOH WAT . F 4 HOH A 41 343 44 HOH WAT . F 4 HOH A 42 344 45 HOH WAT . F 4 HOH A 43 345 47 HOH WAT . F 4 HOH A 44 346 48 HOH WAT . F 4 HOH A 45 347 49 HOH WAT . F 4 HOH A 46 348 50 HOH WAT . F 4 HOH A 47 349 51 HOH WAT . F 4 HOH A 48 350 52 HOH WAT . F 4 HOH A 49 351 53 HOH WAT . F 4 HOH A 50 352 55 HOH WAT . F 4 HOH A 51 353 56 HOH WAT . F 4 HOH A 52 354 57 HOH WAT . F 4 HOH A 53 355 58 HOH WAT . F 4 HOH A 54 356 59 HOH WAT . F 4 HOH A 55 357 60 HOH WAT . F 4 HOH A 56 358 61 HOH WAT . F 4 HOH A 57 359 62 HOH WAT . F 4 HOH A 58 360 63 HOH WAT . F 4 HOH A 59 361 64 HOH WAT . F 4 HOH A 60 362 65 HOH WAT . F 4 HOH A 61 363 66 HOH WAT . F 4 HOH A 62 364 67 HOH WAT . F 4 HOH A 63 365 68 HOH WAT . F 4 HOH A 64 366 69 HOH WAT . F 4 HOH A 65 367 70 HOH WAT . F 4 HOH A 66 368 71 HOH WAT . F 4 HOH A 67 369 72 HOH WAT . F 4 HOH A 68 370 73 HOH WAT . F 4 HOH A 69 371 74 HOH WAT . F 4 HOH A 70 372 75 HOH WAT . F 4 HOH A 71 373 76 HOH WAT . F 4 HOH A 72 374 77 HOH WAT . F 4 HOH A 73 375 78 HOH WAT . F 4 HOH A 74 376 80 HOH WAT . F 4 HOH A 75 377 81 HOH WAT . F 4 HOH A 76 378 82 HOH WAT . F 4 HOH A 77 379 84 HOH WAT . F 4 HOH A 78 380 85 HOH WAT . F 4 HOH A 79 381 86 HOH WAT . F 4 HOH A 80 382 87 HOH WAT . F 4 HOH A 81 383 88 HOH WAT . F 4 HOH A 82 384 89 HOH WAT . F 4 HOH A 83 385 90 HOH WAT . F 4 HOH A 84 386 91 HOH WAT . F 4 HOH A 85 387 92 HOH WAT . F 4 HOH A 86 388 93 HOH WAT . F 4 HOH A 87 389 94 HOH WAT . F 4 HOH A 88 390 95 HOH WAT . F 4 HOH A 89 391 96 HOH WAT . F 4 HOH A 90 392 97 HOH WAT . F 4 HOH A 91 393 98 HOH WAT . F 4 HOH A 92 394 99 HOH WAT . F 4 HOH A 93 395 100 HOH WAT . F 4 HOH A 94 396 101 HOH WAT . F 4 HOH A 95 397 102 HOH WAT . F 4 HOH A 96 398 103 HOH WAT . F 4 HOH A 97 399 104 HOH WAT . F 4 HOH A 98 400 105 HOH WAT . F 4 HOH A 99 401 106 HOH WAT . F 4 HOH A 100 402 107 HOH WAT . F 4 HOH A 101 403 108 HOH WAT . F 4 HOH A 102 404 109 HOH WAT . F 4 HOH A 103 405 111 HOH WAT . F 4 HOH A 104 406 112 HOH WAT . F 4 HOH A 105 407 113 HOH WAT . F 4 HOH A 106 408 114 HOH WAT . F 4 HOH A 107 409 115 HOH WAT . F 4 HOH A 108 410 116 HOH WAT . F 4 HOH A 109 411 117 HOH WAT . F 4 HOH A 110 412 118 HOH WAT . F 4 HOH A 111 413 119 HOH WAT . F 4 HOH A 112 414 120 HOH WAT . F 4 HOH A 113 415 121 HOH WAT . F 4 HOH A 114 416 122 HOH WAT . F 4 HOH A 115 417 123 HOH WAT . F 4 HOH A 116 418 124 HOH WAT . F 4 HOH A 117 419 125 HOH WAT . F 4 HOH A 118 420 126 HOH WAT . F 4 HOH A 119 421 127 HOH WAT . F 4 HOH A 120 422 128 HOH WAT . F 4 HOH A 121 423 129 HOH WAT . F 4 HOH A 122 424 130 HOH WAT . F 4 HOH A 123 425 131 HOH WAT . F 4 HOH A 124 426 133 HOH WAT . F 4 HOH A 125 427 134 HOH WAT . F 4 HOH A 126 428 137 HOH WAT . F 4 HOH A 127 429 138 HOH WAT . F 4 HOH A 128 430 139 HOH WAT . F 4 HOH A 129 431 140 HOH WAT . F 4 HOH A 130 432 141 HOH WAT . F 4 HOH A 131 433 142 HOH WAT . F 4 HOH A 132 434 143 HOH WAT . F 4 HOH A 133 435 144 HOH WAT . F 4 HOH A 134 436 145 HOH WAT . F 4 HOH A 135 437 146 HOH WAT . F 4 HOH A 136 438 147 HOH WAT . F 4 HOH A 137 439 148 HOH WAT . F 4 HOH A 138 441 150 HOH WAT . F 4 HOH A 139 442 151 HOH WAT . F 4 HOH A 140 443 152 HOH WAT . F 4 HOH A 141 444 153 HOH WAT . F 4 HOH A 142 445 154 HOH WAT . F 4 HOH A 143 446 155 HOH WAT . F 4 HOH A 144 447 156 HOH WAT . F 4 HOH A 145 448 157 HOH WAT . F 4 HOH A 146 449 158 HOH WAT . F 4 HOH A 147 450 159 HOH WAT . F 4 HOH A 148 451 160 HOH WAT . F 4 HOH A 149 452 161 HOH WAT . F 4 HOH A 150 453 162 HOH WAT . F 4 HOH A 151 454 163 HOH WAT . F 4 HOH A 152 455 164 HOH WAT . F 4 HOH A 153 456 165 HOH WAT . F 4 HOH A 154 457 166 HOH WAT . F 4 HOH A 155 458 167 HOH WAT . F 4 HOH A 156 459 168 HOH WAT . F 4 HOH A 157 460 169 HOH WAT . F 4 HOH A 158 461 170 HOH WAT . F 4 HOH A 159 462 171 HOH WAT . F 4 HOH A 160 463 172 HOH WAT . F 4 HOH A 161 464 173 HOH WAT . F 4 HOH A 162 465 174 HOH WAT . F 4 HOH A 163 466 175 HOH WAT . F 4 HOH A 164 467 176 HOH WAT . F 4 HOH A 165 468 177 HOH WAT . F 4 HOH A 166 469 178 HOH WAT . F 4 HOH A 167 470 179 HOH WAT . F 4 HOH A 168 471 180 HOH WAT . F 4 HOH A 169 472 181 HOH WAT . F 4 HOH A 170 473 182 HOH WAT . F 4 HOH A 171 474 183 HOH WAT . F 4 HOH A 172 475 184 HOH WAT . F 4 HOH A 173 476 185 HOH WAT . F 4 HOH A 174 477 186 HOH WAT . F 4 HOH A 175 478 187 HOH WAT . F 4 HOH A 176 479 188 HOH WAT . F 4 HOH A 177 480 189 HOH WAT . F 4 HOH A 178 481 190 HOH WAT . F 4 HOH A 179 482 191 HOH WAT . F 4 HOH A 180 483 193 HOH WAT . F 4 HOH A 181 484 194 HOH WAT . F 4 HOH A 182 485 196 HOH WAT . F 4 HOH A 183 487 201 HOH WAT . F 4 HOH A 184 489 203 HOH WAT . F 4 HOH A 185 490 204 HOH WAT . F 4 HOH A 186 491 205 HOH WAT . F 4 HOH A 187 492 206 HOH WAT . F 4 HOH A 188 493 207 HOH WAT . F 4 HOH A 189 494 208 HOH WAT . F 4 HOH A 190 496 210 HOH WAT . F 4 HOH A 191 497 211 HOH WAT . F 4 HOH A 192 498 212 HOH WAT . F 4 HOH A 193 499 213 HOH WAT . F 4 HOH A 194 501 215 HOH WAT . F 4 HOH A 195 502 216 HOH WAT . F 4 HOH A 196 503 217 HOH WAT . F 4 HOH A 197 504 218 HOH WAT . F 4 HOH A 198 505 219 HOH WAT . F 4 HOH A 199 506 220 HOH WAT . F 4 HOH A 200 507 221 HOH WAT . F 4 HOH A 201 508 222 HOH WAT . F 4 HOH A 202 510 224 HOH WAT . F 4 HOH A 203 511 225 HOH WAT . F 4 HOH A 204 512 226 HOH WAT . F 4 HOH A 205 513 227 HOH WAT . F 4 HOH A 206 514 228 HOH WAT . F 4 HOH A 207 515 229 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 EDO . . . B 2 116.181 107.185 33.174 1 44.9 ? C1 EDO 299 A 1 HETATM 2 O O1 EDO . . . B 2 115.223 107.638 32.211 1 45.38 ? O1 EDO 299 A 1 HETATM 3 C C2 EDO . . . B 2 115.98 107.937 34.492 1 44.84 ? C2 EDO 299 A 1 HETATM 4 O O2 EDO . . . B 2 116.917 107.454 35.464 1 45.43 ? O2 EDO 299 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 6 _model_server_stats.create_model_time_ms 16 _model_server_stats.query_time_ms 223 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 4 #