data_3PY0
#
_model_server_result.job_id            -hj04UYTB9S6zT6zIXdEHg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-06 00:49:35' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3py0 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":299}' 
#
_entry.id    3PY0 
#
_exptl.entry_id    3PY0 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              62.068 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            1,2-ETHANEDIOL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            3PY0 
_cell.length_a            53.54 
_cell.length_b            71.92 
_cell.length_c            72.28 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3PY0 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    monomeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      1 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      2 
_struct_asym.id                             B 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
_chem_comp.formula           'C2 H6 O2' 
_chem_comp.formula_weight    62.068 
_chem_comp.id                EDO 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              1,2-ETHANEDIOL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     'ETHYLENE GLYCOL' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 EDO sing 83 n n 
C1 C2 EDO sing 84 n n 
C1 H11 EDO sing 85 n n 
C1 H12 EDO sing 86 n n 
O1 HO1 EDO sing 87 n n 
C2 O2 EDO sing 88 n n 
C2 H21 EDO sing 89 n n 
C2 H22 EDO sing 90 n n 
O2 HO2 EDO sing 91 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     3PY0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.018678 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.013904 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.013835 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 EDO A 1 299 1 EDO EDO . 
C 3 PO4 A 1 300 1 PO4 PO4 . 
D 4 SU9 A 1 301 1 SU9 SU9 . 
E 5 HOH A 1 302 1 HOH WAT . 
E 5 HOH A 2 303 2 HOH WAT . 
E 5 HOH A 3 304 3 HOH WAT . 
E 5 HOH A 4 305 4 HOH WAT . 
E 5 HOH A 5 306 5 HOH WAT . 
E 5 HOH A 6 307 6 HOH WAT . 
E 5 HOH A 7 308 7 HOH WAT . 
E 5 HOH A 8 309 8 HOH WAT . 
E 5 HOH A 9 310 9 HOH WAT . 
E 5 HOH A 10 311 10 HOH WAT . 
E 5 HOH A 11 312 11 HOH WAT . 
E 5 HOH A 12 313 12 HOH WAT . 
E 5 HOH A 13 314 13 HOH WAT . 
E 5 HOH A 14 315 14 HOH WAT . 
E 5 HOH A 15 316 15 HOH WAT . 
E 5 HOH A 16 317 16 HOH WAT . 
E 5 HOH A 17 318 17 HOH WAT . 
E 5 HOH A 18 319 18 HOH WAT . 
E 5 HOH A 19 320 19 HOH WAT . 
E 5 HOH A 20 321 20 HOH WAT . 
E 5 HOH A 21 322 21 HOH WAT . 
E 5 HOH A 22 323 22 HOH WAT . 
E 5 HOH A 23 324 23 HOH WAT . 
E 5 HOH A 24 325 24 HOH WAT . 
E 5 HOH A 25 326 25 HOH WAT . 
E 5 HOH A 26 327 26 HOH WAT . 
E 5 HOH A 27 328 27 HOH WAT . 
E 5 HOH A 28 329 28 HOH WAT . 
E 5 HOH A 29 330 29 HOH WAT . 
E 5 HOH A 30 331 30 HOH WAT . 
E 5 HOH A 31 332 31 HOH WAT . 
E 5 HOH A 32 333 32 HOH WAT . 
E 5 HOH A 33 334 33 HOH WAT . 
E 5 HOH A 34 335 34 HOH WAT . 
E 5 HOH A 35 336 35 HOH WAT . 
E 5 HOH A 36 337 36 HOH WAT . 
E 5 HOH A 37 338 37 HOH WAT . 
E 5 HOH A 38 339 38 HOH WAT . 
E 5 HOH A 39 340 39 HOH WAT . 
E 5 HOH A 40 341 40 HOH WAT . 
E 5 HOH A 41 342 41 HOH WAT . 
E 5 HOH A 42 343 42 HOH WAT . 
E 5 HOH A 43 344 43 HOH WAT . 
E 5 HOH A 44 345 44 HOH WAT . 
E 5 HOH A 45 346 45 HOH WAT . 
E 5 HOH A 46 347 46 HOH WAT . 
E 5 HOH A 47 348 47 HOH WAT . 
E 5 HOH A 48 349 48 HOH WAT . 
E 5 HOH A 49 350 49 HOH WAT . 
E 5 HOH A 50 351 50 HOH WAT . 
E 5 HOH A 51 352 51 HOH WAT . 
E 5 HOH A 52 353 52 HOH WAT . 
E 5 HOH A 53 354 53 HOH WAT . 
E 5 HOH A 54 355 54 HOH WAT . 
E 5 HOH A 55 356 55 HOH WAT . 
E 5 HOH A 56 357 56 HOH WAT . 
E 5 HOH A 57 358 57 HOH WAT . 
E 5 HOH A 58 359 58 HOH WAT . 
E 5 HOH A 59 360 59 HOH WAT . 
E 5 HOH A 60 361 60 HOH WAT . 
E 5 HOH A 61 362 61 HOH WAT . 
E 5 HOH A 62 363 62 HOH WAT . 
E 5 HOH A 63 364 63 HOH WAT . 
E 5 HOH A 64 365 64 HOH WAT . 
E 5 HOH A 65 366 65 HOH WAT . 
E 5 HOH A 66 367 67 HOH WAT . 
E 5 HOH A 67 368 68 HOH WAT . 
E 5 HOH A 68 369 69 HOH WAT . 
E 5 HOH A 69 370 70 HOH WAT . 
E 5 HOH A 70 371 71 HOH WAT . 
E 5 HOH A 71 372 72 HOH WAT . 
E 5 HOH A 72 373 73 HOH WAT . 
E 5 HOH A 73 374 74 HOH WAT . 
E 5 HOH A 74 375 75 HOH WAT . 
E 5 HOH A 75 377 77 HOH WAT . 
E 5 HOH A 76 378 78 HOH WAT . 
E 5 HOH A 77 379 79 HOH WAT . 
E 5 HOH A 78 381 81 HOH WAT . 
E 5 HOH A 79 382 82 HOH WAT . 
E 5 HOH A 80 384 84 HOH WAT . 
E 5 HOH A 81 385 85 HOH WAT . 
E 5 HOH A 82 386 86 HOH WAT . 
E 5 HOH A 83 388 88 HOH WAT . 
E 5 HOH A 84 389 89 HOH WAT . 
E 5 HOH A 85 390 90 HOH WAT . 
E 5 HOH A 86 391 92 HOH WAT . 
E 5 HOH A 87 392 93 HOH WAT . 
E 5 HOH A 88 393 94 HOH WAT . 
E 5 HOH A 89 394 95 HOH WAT . 
E 5 HOH A 90 395 96 HOH WAT . 
E 5 HOH A 91 396 97 HOH WAT . 
E 5 HOH A 92 397 98 HOH WAT . 
E 5 HOH A 93 398 99 HOH WAT . 
E 5 HOH A 94 401 102 HOH WAT . 
E 5 HOH A 95 402 103 HOH WAT . 
E 5 HOH A 96 403 104 HOH WAT . 
E 5 HOH A 97 404 105 HOH WAT . 
E 5 HOH A 98 406 107 HOH WAT . 
E 5 HOH A 99 407 108 HOH WAT . 
E 5 HOH A 100 410 111 HOH WAT . 
E 5 HOH A 101 411 112 HOH WAT . 
E 5 HOH A 102 412 113 HOH WAT . 
E 5 HOH A 103 413 114 HOH WAT . 
E 5 HOH A 104 414 115 HOH WAT . 
E 5 HOH A 105 415 116 HOH WAT . 
E 5 HOH A 106 416 118 HOH WAT . 
E 5 HOH A 107 417 119 HOH WAT . 
E 5 HOH A 108 418 120 HOH WAT . 
E 5 HOH A 109 419 121 HOH WAT . 
E 5 HOH A 110 420 122 HOH WAT . 
E 5 HOH A 111 421 123 HOH WAT . 
E 5 HOH A 112 422 124 HOH WAT . 
E 5 HOH A 113 423 125 HOH WAT . 
E 5 HOH A 114 424 126 HOH WAT . 
E 5 HOH A 115 425 127 HOH WAT . 
E 5 HOH A 116 426 128 HOH WAT . 
E 5 HOH A 117 427 129 HOH WAT . 
E 5 HOH A 118 428 130 HOH WAT . 
E 5 HOH A 119 429 131 HOH WAT . 
E 5 HOH A 120 430 132 HOH WAT . 
E 5 HOH A 121 431 133 HOH WAT . 
E 5 HOH A 122 432 134 HOH WAT . 
E 5 HOH A 123 433 137 HOH WAT . 
E 5 HOH A 124 434 138 HOH WAT . 
E 5 HOH A 125 435 139 HOH WAT . 
E 5 HOH A 126 437 141 HOH WAT . 
E 5 HOH A 127 438 142 HOH WAT . 
E 5 HOH A 128 439 143 HOH WAT . 
E 5 HOH A 129 440 144 HOH WAT . 
E 5 HOH A 130 441 145 HOH WAT . 
E 5 HOH A 131 442 146 HOH WAT . 
E 5 HOH A 132 443 147 HOH WAT . 
E 5 HOH A 133 444 148 HOH WAT . 
E 5 HOH A 134 445 149 HOH WAT . 
E 5 HOH A 135 446 150 HOH WAT . 
E 5 HOH A 136 447 151 HOH WAT . 
E 5 HOH A 137 448 152 HOH WAT . 
E 5 HOH A 138 450 154 HOH WAT . 
E 5 HOH A 139 451 155 HOH WAT . 
E 5 HOH A 140 452 156 HOH WAT . 
E 5 HOH A 141 453 157 HOH WAT . 
E 5 HOH A 142 454 158 HOH WAT . 
E 5 HOH A 143 455 159 HOH WAT . 
E 5 HOH A 144 456 160 HOH WAT . 
E 5 HOH A 145 457 161 HOH WAT . 
E 5 HOH A 146 458 162 HOH WAT . 
E 5 HOH A 147 459 163 HOH WAT . 
E 5 HOH A 148 460 164 HOH WAT . 
E 5 HOH A 149 461 165 HOH WAT . 
E 5 HOH A 150 462 166 HOH WAT . 
E 5 HOH A 151 463 167 HOH WAT . 
E 5 HOH A 152 464 168 HOH WAT . 
E 5 HOH A 153 465 169 HOH WAT . 
E 5 HOH A 154 466 170 HOH WAT . 
E 5 HOH A 155 467 171 HOH WAT . 
E 5 HOH A 156 468 172 HOH WAT . 
E 5 HOH A 157 469 173 HOH WAT . 
E 5 HOH A 158 470 174 HOH WAT . 
E 5 HOH A 159 471 175 HOH WAT . 
E 5 HOH A 160 473 177 HOH WAT . 
E 5 HOH A 161 474 178 HOH WAT . 
E 5 HOH A 162 475 179 HOH WAT . 
E 5 HOH A 163 476 180 HOH WAT . 
E 5 HOH A 164 477 181 HOH WAT . 
E 5 HOH A 165 478 182 HOH WAT . 
E 5 HOH A 166 479 183 HOH WAT . 
E 5 HOH A 167 480 184 HOH WAT . 
E 5 HOH A 168 482 186 HOH WAT . 
E 5 HOH A 169 483 187 HOH WAT . 
E 5 HOH A 170 484 188 HOH WAT . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 EDO . . . B 2 -88.51 84.808 80.664 1 49.76 ? C1 EDO 299 A 1 
HETATM 2 O O1 EDO . . . B 2 -88.376 85.786 81.697 1 49.31 ? O1 EDO 299 A 1 
HETATM 3 C C2 EDO . . . B 2 -87.223 84.752 79.846 1 50.14 ? C2 EDO 299 A 1 
HETATM 4 O O2 EDO . . . B 2 -86.389 83.699 80.338 1 49.96 ? O2 EDO 299 A 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              7 
_model_server_stats.parse_time_ms           10 
_model_server_stats.create_model_time_ms    16 
_model_server_stats.query_time_ms           295 
_model_server_stats.encode_time_ms          10 
_model_server_stats.element_count           4 
#