data_3R23
#
_model_server_result.job_id            i3Dg-WiIHPwDGkoo35BdAA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-09 02:48:10' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3r23 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":311}' 
#
_entry.id    3R23 
#
_exptl.entry_id    3R23 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              62.068 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            1,2-ETHANEDIOL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            3R23 
_cell.length_a            65.878 
_cell.length_b            83.187 
_cell.length_c            128.38 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3R23 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 C N N 
? 2 D N N 
? 2 E N N 
? 2 F N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A C ALA 3 A ALA 0 1_555 A N MSE 4 A MSE 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale2 A C MSE 4 A MSE 1 1_555 A N ARG 5 A ARG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? 
covale ? covale3 A C ILE 9 A ILE 6 1_555 A N MSE 10 A MSE 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale4 A C MSE 10 A MSE 7 1_555 A N GLY 11 A GLY 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale5 A C ILE 21 A ILE 18 1_555 A N MSE 22 A MSE 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
covale ? covale6 A C MSE 22 A MSE 19 1_555 A N THR 23 A THR 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale7 A C GLU 26 A GLU 23 1_555 A N MSE 27 A MSE 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale8 A C MSE 27 A MSE 24 1_555 A N ILE 28 A ILE 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale9 A C LYS 46 A LYS 43 1_555 A N MSE 47 A MSE 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale10 A C MSE 47 A MSE 44 1_555 A N ASP 48 A ASP 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale11 A C ASN 88 A ASN 85 1_555 A N MSE 89 A MSE 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale12 A C MSE 89 A MSE 86 1_555 A N LEU 90 A LEU 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale13 A C CYS 95 A CYS 92 1_555 A N MSE 96 A MSE 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale14 A C MSE 96 A MSE 93 1_555 A N ASP 97 A ASP 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale15 A C LYS 120 A LYS 117 1_555 A N MSE 121 A MSE 118 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale16 A C MSE 121 A MSE 118 1_555 A N GLU 122 A GLU 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale17 A C SER 160 A SER 157 1_555 A N MSE 161 A MSE 158 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale18 A C MSE 161 A MSE 158 1_555 A N LEU 162 A LEU 159 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale19 A C ASP 251 A ASP 248 1_555 A N MSE 252 A MSE 249 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale20 A C MSE 252 A MSE 249 1_555 A N MSE 253 A MSE 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? 
covale ? covale21 A C MSE 253 A MSE 250 1_555 A N VAL 254 A VAL 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale22 A C VAL 261 A VAL 258 1_555 A N MSE 262 A MSE 259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale23 A C MSE 262 A MSE 259 1_555 A N GLU 263 A GLU 260 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale24 A C GLY 269 A GLY 266 1_555 A N MSE 270 A MSE 267 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? 
covale ? covale25 A C MSE 270 A MSE 267 1_555 A N THR 271 A THR 268 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale26 A C ASP 292 A ASP 289 1_555 A N MSE 293 A MSE 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale27 A C MSE 293 A MSE 290 1_555 A N ILE 294 A ILE 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale28 B C ALA 3 B ALA 0 1_555 B N MSE 4 B MSE 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale29 B C MSE 4 B MSE 1 1_555 B N ARG 5 B ARG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale30 B C ILE 9 B ILE 6 1_555 B N MSE 10 B MSE 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale31 B C MSE 10 B MSE 7 1_555 B N GLY 11 B GLY 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale32 B C ILE 21 B ILE 18 1_555 B N MSE 22 B MSE 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale33 B C MSE 22 B MSE 19 1_555 B N THR 23 B THR 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale34 B C GLU 26 B GLU 23 1_555 B N MSE 27 B MSE 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale35 B C MSE 27 B MSE 24 1_555 B N ILE 28 B ILE 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale36 B C LYS 46 B LYS 43 1_555 B N MSE 47 B MSE 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale37 B C MSE 47 B MSE 44 1_555 B N ASP 48 B ASP 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale38 B C ASN 88 B ASN 85 1_555 B N MSE 89 B MSE 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale39 B C MSE 89 B MSE 86 1_555 B N LEU 90 B LEU 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale40 B C CYS 95 B CYS 92 1_555 B N MSE 96 B MSE 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? 
covale ? covale41 B C MSE 96 B MSE 93 1_555 B N ASP 97 B ASP 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale42 B C LYS 120 B LYS 117 1_555 B N MSE 121 B MSE 118 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale43 B C MSE 121 B MSE 118 1_555 B N GLU 122 B GLU 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale44 B C SER 160 B SER 157 1_555 B N MSE 161 B MSE 158 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale45 B C MSE 161 B MSE 158 1_555 B N LEU 162 B LEU 159 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale46 B C ASP 251 B ASP 248 1_555 B N MSE 252 B MSE 249 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale47 B C MSE 252 B MSE 249 1_555 B N MSE 253 B MSE 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale48 B C MSE 253 B MSE 250 1_555 B N VAL 254 B VAL 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale49 B C VAL 261 B VAL 258 1_555 B N MSE 262 B MSE 259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale50 B C MSE 262 B MSE 259 1_555 B N GLU 263 B GLU 260 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale51 B C GLY 269 B GLY 266 1_555 B N MSE 270 B MSE 267 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale52 B C MSE 270 B MSE 267 1_555 B N THR 271 B THR 268 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale53 B C ASP 292 B ASP 289 1_555 B N MSE 293 B MSE 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale54 B C MSE 293 B MSE 290 1_555 B N ILE 294 B ILE 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
#
_chem_comp.formula           'C2 H6 O2' 
_chem_comp.formula_weight    62.068 
_chem_comp.id                EDO 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              1,2-ETHANEDIOL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     'ETHYLENE GLYCOL' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 EDO sing 83 n n 
C1 C2 EDO sing 84 n n 
C1 H11 EDO sing 85 n n 
C1 H12 EDO sing 86 n n 
O1 HO1 EDO sing 87 n n 
C2 O2 EDO sing 88 n n 
C2 H21 EDO sing 89 n n 
C2 H22 EDO sing 90 n n 
O2 HO2 EDO sing 91 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     3R23 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.01518 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.012021 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007789 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 EDO A 1 311 311 EDO EDO . 
D 2 EDO A 1 312 312 EDO EDO . 
E 2 EDO B 1 311 311 EDO EDO . 
F 2 EDO B 1 312 312 EDO EDO . 
G 3 HOH A 1 305 2 HOH HOH . 
G 3 HOH A 2 306 3 HOH HOH . 
G 3 HOH A 3 307 4 HOH HOH . 
G 3 HOH A 4 308 6 HOH HOH . 
G 3 HOH A 5 309 8 HOH HOH . 
G 3 HOH A 6 310 9 HOH HOH . 
G 3 HOH A 7 313 10 HOH HOH . 
G 3 HOH A 8 314 11 HOH HOH . 
G 3 HOH A 9 315 12 HOH HOH . 
G 3 HOH A 10 316 13 HOH HOH . 
G 3 HOH A 11 317 14 HOH HOH . 
G 3 HOH A 12 318 15 HOH HOH . 
G 3 HOH A 13 319 16 HOH HOH . 
G 3 HOH A 14 320 17 HOH HOH . 
G 3 HOH A 15 321 18 HOH HOH . 
G 3 HOH A 16 322 19 HOH HOH . 
G 3 HOH A 17 323 20 HOH HOH . 
G 3 HOH A 18 324 21 HOH HOH . 
G 3 HOH A 19 325 22 HOH HOH . 
G 3 HOH A 20 326 23 HOH HOH . 
G 3 HOH A 21 327 25 HOH HOH . 
G 3 HOH A 22 328 27 HOH HOH . 
G 3 HOH A 23 329 29 HOH HOH . 
G 3 HOH A 24 330 31 HOH HOH . 
G 3 HOH A 25 331 32 HOH HOH . 
G 3 HOH A 26 332 33 HOH HOH . 
G 3 HOH A 27 333 35 HOH HOH . 
G 3 HOH A 28 334 36 HOH HOH . 
G 3 HOH A 29 335 41 HOH HOH . 
G 3 HOH A 30 336 42 HOH HOH . 
G 3 HOH A 31 337 45 HOH HOH . 
G 3 HOH A 32 338 48 HOH HOH . 
G 3 HOH A 33 339 49 HOH HOH . 
G 3 HOH A 34 340 51 HOH HOH . 
G 3 HOH A 35 341 52 HOH HOH . 
G 3 HOH A 36 342 53 HOH HOH . 
G 3 HOH A 37 343 54 HOH HOH . 
G 3 HOH A 38 344 55 HOH HOH . 
G 3 HOH A 39 345 56 HOH HOH . 
G 3 HOH A 40 346 58 HOH HOH . 
G 3 HOH A 41 347 59 HOH HOH . 
G 3 HOH A 42 348 61 HOH HOH . 
G 3 HOH A 43 349 62 HOH HOH . 
G 3 HOH A 44 350 63 HOH HOH . 
G 3 HOH A 45 351 69 HOH HOH . 
G 3 HOH A 46 352 70 HOH HOH . 
G 3 HOH A 47 353 72 HOH HOH . 
G 3 HOH A 48 354 74 HOH HOH . 
G 3 HOH A 49 355 75 HOH HOH . 
G 3 HOH A 50 356 76 HOH HOH . 
G 3 HOH A 51 357 77 HOH HOH . 
G 3 HOH A 52 358 78 HOH HOH . 
G 3 HOH A 53 359 79 HOH HOH . 
G 3 HOH A 54 360 81 HOH HOH . 
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