data_3R9W
#
_model_server_result.job_id            aQTfbD4OOZcxzhrlMyds4w 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-26 10:29:53' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3r9w 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":502}' 
#
_entry.id    3R9W 
#
_exptl.entry_id    3R9W 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              59.044 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'ACETATE ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    5 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          111.2 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            3R9W 
_cell.length_a            88.946 
_cell.length_b            85.604 
_cell.length_c            67.184 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3R9W 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        5 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'C 1 2 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA tetrameric 4 software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N 1 1 
A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N 2 1,2 
#
loop_
_pdbx_struct_oper_list.id
_pdbx_struct_oper_list.type
_pdbx_struct_oper_list.name
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]
1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 
2 'crystal symmetry operation' 2_455 -x-1,y,-z -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 -88.946 0 0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 E N N 
? 5 F N N 
? 5 G N N 
? 5 H N N 
? 5 L N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OG SER 23 A SER 17 1_555 C MG MG . A MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? 
metalc ? metalc2 A OG1 THR 44 A THR 38 1_555 C MG MG . A MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? 
metalc ? metalc3 C MG MG . A MG 401 1_555 D O1G GNP . A GNP 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.106 ? 
metalc ? metalc4 C MG MG . A MG 401 1_555 D O2B GNP . A GNP 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? 
metalc ? metalc5 C MG MG . A MG 401 1_555 M O HOH . A HOH 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? 
metalc ? metalc6 C MG MG . A MG 401 1_555 M O HOH . A HOH 632 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.198 ? 
metalc ? metalc7 K CA CA . B CA 501 1_555 B O6 G 18 B G 1523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.751 ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog1 B N3 C 1 B C 1506 1_555 B N1 G 24 B G 1529 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog2 B N4 C 1 B C 1506 1_555 B O6 G 24 B G 1529 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog3 B O2 C 1 B C 1506 1_555 B N2 G 24 B G 1529 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog4 B N1 A 2 B A 1507 1_555 B N3 U 23 B U 1528 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog5 B N6 A 2 B A 1507 1_555 B O4 U 23 B U 1528 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog6 B N1 A 3 B A 1508 1_555 B N3 U 22 B U 1527 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog7 B N6 A 3 B A 1508 1_555 B O4 U 22 B U 1527 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog8 B N3 C 4 B C 1509 1_555 B N1 G 21 B G 1526 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog9 B N4 C 4 B C 1509 1_555 B O6 G 21 B G 1526 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog10 B O2 C 4 B C 1509 1_555 B N2 G 21 B G 1526 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog11 B N3 C 5 B C 1510 1_555 B N1 G 20 B G 1525 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog12 B N4 C 5 B C 1510 1_555 B O6 G 20 B G 1525 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog13 B O2 C 5 B C 1510 1_555 B N2 G 20 B G 1525 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog14 B N1 G 6 B G 1511 1_555 B N3 C 19 B C 1524 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog15 B N2 G 6 B G 1511 1_555 B O2 C 19 B C 1524 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog16 B O6 G 6 B G 1511 1_555 B N4 C 19 B C 1524 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_28_PAIR hydrog17 B N3 U 7 B U 1512 1_555 B O6 G 18 B G 1523 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_28_PAIR hydrog18 B O2 U 7 B U 1512 1_555 B N1 G 18 B G 1523 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog19 B N1 A 8 B A 1513 1_555 B N3 U 17 B U 1522 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog20 B N6 A 8 B A 1513 1_555 B O4 U 17 B U 1522 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog21 B N1 G 9 B G 1514 1_555 B N3 C 16 B C 1521 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog22 B N2 G 9 B G 1514 1_555 B O2 C 16 B C 1521 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog23 B O6 G 9 B G 1514 1_555 B N4 C 16 B C 1521 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog24 B N1 G 10 B G 1515 1_555 B N3 C 15 B C 1520 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog25 B N2 G 10 B G 1515 1_555 B O2 C 15 B C 1520 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog26 B O6 G 10 B G 1515 1_555 B N4 C 15 B C 1520 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_11_PAIR hydrog27 B N2 G 11 B G 1516 1_555 B N7 A 14 B A 1519 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_11_PAIR hydrog28 B N3 G 11 B G 1516 1_555 B N6 A 14 B A 1519 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog29 B N2 G 12 B G 1517 1_555 B N7 A 13 B A 1518 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'A-G MISPAIR' hydrog30 B N7 A 13 B A 1518 1_555 B N2 G 12 B G 1517 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_11_PAIR hydrog31 B N6 A 14 B A 1519 1_555 B N3 G 11 B G 1516 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_11_PAIR hydrog32 B N7 A 14 B A 1519 1_555 B N2 G 11 B G 1516 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog33 B N3 C 15 B C 1520 1_555 B N1 G 10 B G 1515 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog34 B N4 C 15 B C 1520 1_555 B O6 G 10 B G 1515 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog35 B O2 C 15 B C 1520 1_555 B N2 G 10 B G 1515 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog36 B N3 C 16 B C 1521 1_555 B N1 G 9 B G 1514 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog37 B N4 C 16 B C 1521 1_555 B O6 G 9 B G 1514 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog38 B O2 C 16 B C 1521 1_555 B N2 G 9 B G 1514 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog39 B N3 U 17 B U 1522 1_555 B N1 A 8 B A 1513 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog40 B O4 U 17 B U 1522 1_555 B N6 A 8 B A 1513 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_28_PAIR hydrog41 B N1 G 18 B G 1523 1_555 B O2 U 7 B U 1512 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_28_PAIR hydrog42 B O6 G 18 B G 1523 1_555 B N3 U 7 B U 1512 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog43 B N3 C 19 B C 1524 1_555 B N1 G 6 B G 1511 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog44 B N4 C 19 B C 1524 1_555 B O6 G 6 B G 1511 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog45 B O2 C 19 B C 1524 1_555 B N2 G 6 B G 1511 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog46 B N1 G 20 B G 1525 1_555 B N3 C 5 B C 1510 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog47 B N2 G 20 B G 1525 1_555 B O2 C 5 B C 1510 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog48 B O6 G 20 B G 1525 1_555 B N4 C 5 B C 1510 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog49 B N1 G 21 B G 1526 1_555 B N3 C 4 B C 1509 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog50 B N2 G 21 B G 1526 1_555 B O2 C 4 B C 1509 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog51 B O6 G 21 B G 1526 1_555 B N4 C 4 B C 1509 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog52 B N3 U 22 B U 1527 1_555 B N1 A 3 B A 1508 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog53 B O4 U 22 B U 1527 1_555 B N6 A 3 B A 1508 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog54 B N3 U 23 B U 1528 1_555 B N1 A 2 B A 1507 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog55 B O4 U 23 B U 1528 1_555 B N6 A 2 B A 1507 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog56 B N1 G 24 B G 1529 1_555 B N3 C 1 B C 1506 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog57 B N2 G 24 B G 1529 1_555 B O2 C 1 B C 1506 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog58 B O6 G 24 B G 1529 1_555 B N4 C 1 B C 1506 2_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
#
_chem_comp.formula           'C2 H3 O2 -1' 
_chem_comp.formula_weight    59.044 
_chem_comp.id                ACT 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'ACETATE ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C O ACT doub 40 n n 
C OXT ACT sing 41 n n 
C CH3 ACT sing 42 n n 
CH3 H1 ACT sing 43 n n 
CH3 H2 ACT sing 44 n n 
CH3 H3 ACT sing 45 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     3R9W 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.011243 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.004361 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.011682 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.015965 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 3 MG A 1 401 401 MG MG . 
D 4 GNP A 1 402 402 GNP GNP . 
E 5 ACT A 1 502 502 ACT ACT . 
F 5 ACT A 1 503 503 ACT ACT . 
G 5 ACT A 1 505 505 ACT ACT . 
H 5 ACT A 1 506 506 ACT ACT . 
I 6 MRD A 1 507 507 MRD MRD . 
J 6 MRD A 1 508 508 MRD MRD . 
K 7 CA B 1 501 501 CA CA . 
L 5 ACT B 1 504 504 ACT ACT . 
M 8 HOH A 1 601 601 HOH HOH . 
M 8 HOH A 2 602 602 HOH HOH . 
M 8 HOH A 3 604 604 HOH HOH . 
M 8 HOH A 4 605 605 HOH HOH . 
M 8 HOH A 5 606 606 HOH HOH . 
M 8 HOH A 6 607 607 HOH HOH . 
M 8 HOH A 7 608 608 HOH HOH . 
M 8 HOH A 8 609 609 HOH HOH . 
M 8 HOH A 9 611 611 HOH HOH . 
M 8 HOH A 10 614 614 HOH HOH . 
M 8 HOH A 11 615 615 HOH HOH . 
M 8 HOH A 12 616 616 HOH HOH . 
M 8 HOH A 13 617 617 HOH HOH . 
M 8 HOH A 14 618 618 HOH HOH . 
M 8 HOH A 15 619 619 HOH HOH . 
M 8 HOH A 16 620 620 HOH HOH . 
M 8 HOH A 17 621 621 HOH HOH . 
M 8 HOH A 18 622 622 HOH HOH . 
M 8 HOH A 19 623 623 HOH HOH . 
M 8 HOH A 20 624 624 HOH HOH . 
M 8 HOH A 21 625 625 HOH HOH . 
M 8 HOH A 22 626 626 HOH HOH . 
M 8 HOH A 23 627 627 HOH HOH . 
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M 8 HOH A 25 629 629 HOH HOH . 
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