data_3RAQ # _model_server_result.job_id BPnxOPF-4BP61xHqe6Aw9Q _model_server_result.datetime_utc '2024-10-18 15:31:45' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3raq # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"P","auth_seq_id":1001}' # _entry.id 3RAQ # _exptl.entry_id 3RAQ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 238.305 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description '4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 98.97 _cell.angle_beta 103.82 _cell.angle_gamma 93.72 _cell.entry_id 3RAQ _cell.length_a 52.194 _cell.length_b 62.077 _cell.length_c 91.459 _cell.Z_PDB 2 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3RAQ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 1 PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,G,H,I,J,K,Q,R,S 1 1 D,E,F,L,M,N,O,P,T,U,V 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 K N N ? 6 P N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 B O3' DG 12 D DG 813 1_555 B P DOC 13 D DOC 814 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.616 ? covale ? covale2 B O3' DG 12 D DG 813 1_555 B P DOC 13 D DOC 814 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 1.613 ? covale ? covale3 C O3' DC 6 E DC 905 1_555 C P MG1 7 E MG1 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.598 ? covale ? covale4 C O3' MG1 7 E MG1 906 1_555 C P DC 8 E DC 907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.6 ? covale ? covale5 E O3' DG 12 H DG 1813 1_555 E P DOC 13 H DOC 1814 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.614 ? covale ? covale6 F O3' DC 6 J DC 1905 1_555 F P MG1 7 J MG1 1906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.592 ? covale ? covale7 F O3' MG1 7 J MG1 1906 1_555 F P DC 8 J DC 1907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.601 ? metalc ? metalc1 A OD2 ASP 7 A ASP 7 1_555 H CA CA . A CA 415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 7 A ASP 7 1_555 I CA CA . A CA 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 7 A ASP 7 1_555 I CA CA . A CA 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? metalc ? metalc4 A O PHE 8 A PHE 8 1_555 I CA CA . A CA 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc5 A OD1 ASP 105 A ASP 105 1_555 H CA CA . A CA 415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc6 A OD2 ASP 105 A ASP 105 1_555 I CA CA . A CA 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc7 A OE2 GLU 106 A GLU 106 1_555 H CA CA . A CA 415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? metalc ? metalc8 A O ALA 181 A ALA 181 1_555 J CA CA . A CA 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc9 A O ILE 186 A ILE 186 1_555 J CA CA . A CA 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? metalc ? metalc10 G O1A DGT . A DGT 414 1_555 H CA CA . A CA 415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc11 G O1B DGT . A DGT 414 1_555 I CA CA . A CA 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc12 G O1A DGT . A DGT 414 1_555 I CA CA . A CA 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc13 G O1G DGT . A DGT 414 1_555 I CA CA . A CA 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? metalc ? metalc14 H CA CA . A CA 415 1_555 Q O HOH . A HOH 519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc15 H CA CA . A CA 415 1_555 Q O HOH . A HOH 538 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc16 J CA CA . A CA 417 1_555 Q O HOH . A HOH 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc ? metalc17 J CA CA . A CA 417 1_555 Q O HOH . A HOH 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? metalc ? metalc18 J CA CA . A CA 417 1_555 Q O HOH . A HOH 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? metalc ? metalc19 T O HOH . B HOH 60 1_555 M CA CA . B CA 1415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc20 D OD2 ASP 7 B ASP 1007 1_555 M CA CA . B CA 1415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc21 D OD1 ASP 7 B ASP 1007 1_555 M CA CA . B CA 1415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.081 ? metalc ? metalc22 D OD1 ASP 7 B ASP 1007 1_555 N CA CA . B CA 1416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc ? metalc23 D O PHE 8 B PHE 1008 1_555 N CA CA . B CA 1416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc24 D OD1 ASP 105 B ASP 1105 1_555 M CA CA . B CA 1415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? metalc ? metalc25 D OD2 ASP 105 B ASP 1105 1_555 N CA CA . B CA 1416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc26 D OE2 GLU 106 B GLU 1106 1_555 M CA CA . B CA 1415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc27 D O ALA 181 B ALA 1181 1_555 O CA CA . B CA 1417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc28 D O ILE 186 B ILE 1186 1_555 O CA CA . B CA 1417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? metalc ? metalc29 L O2A DGT . B DGT 1414 1_555 M CA CA . B CA 1415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc30 L O2B DGT . B DGT 1414 1_555 N CA CA . B CA 1416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? metalc ? metalc31 L O1G DGT . B DGT 1414 1_555 N CA CA . B CA 1416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.391 ? metalc ? metalc32 L O2A DGT . B DGT 1414 1_555 N CA CA . B CA 1416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? metalc ? metalc33 M CA CA . B CA 1415 1_555 T O HOH . B HOH 1519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc34 O CA CA . B CA 1417 1_555 T O HOH . B HOH 1514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.511 ? metalc ? metalc35 O CA CA . B CA 1417 1_555 T O HOH . B HOH 1515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc36 O CA CA . B CA 1417 1_555 T O HOH . B HOH 1516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 B N1 DG 1 D DG 802 1_555 C N3 DC 19 E DC 918 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 B N2 DG 1 D DG 802 1_555 C O2 DC 19 E DC 918 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 B O6 DG 1 D DG 802 1_555 C N4 DC 19 E DC 918 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 B N3 DT 2 D DT 803 1_555 C N1 DA 18 E DA 917 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 B O4 DT 2 D DT 803 1_555 C N6 DA 18 E DA 917 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 B N3 DT 3 D DT 804 1_555 C N1 DA 17 E DA 916 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 B O4 DT 3 D DT 804 1_555 C N6 DA 17 E DA 916 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 B N1 DG 4 D DG 805 1_555 C N3 DC 16 E DC 915 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 B N2 DG 4 D DG 805 1_555 C O2 DC 16 E DC 915 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 B O6 DG 4 D DG 805 1_555 C N4 DC 16 E DC 915 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 B N1 DG 5 D DG 806 1_555 C N3 DC 15 E DC 914 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 B N2 DG 5 D DG 806 1_555 C O2 DC 15 E DC 914 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 B O6 DG 5 D DG 806 1_555 C N4 DC 15 E DC 914 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 B N1 DA 6 D DA 807 1_555 C N3 DT 14 E DT 913 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 B N6 DA 6 D DA 807 1_555 C O4 DT 14 E DT 913 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 B N3 DT 7 D DT 808 1_555 C N1 DA 13 E DA 912 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 B O4 DT 7 D DT 808 1_555 C N6 DA 13 E DA 912 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 B N1 DG 8 D DG 809 1_555 C N3 DC 12 E DC 911 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 B N2 DG 8 D DG 809 1_555 C O2 DC 12 E DC 911 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 B O6 DG 8 D DG 809 1_555 C N4 DC 12 E DC 911 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 B N1 DG 9 D DG 810 1_555 C N3 DC 11 E DC 910 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 B N2 DG 9 D DG 810 1_555 C O2 DC 11 E DC 910 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 B O6 DG 9 D DG 810 1_555 C N4 DC 11 E DC 910 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 B N3 DT 10 D DT 811 1_555 C N1 DA 10 E DA 909 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 B O4 DT 10 D DT 811 1_555 C N6 DA 10 E DA 909 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 B N1 DA 11 D DA 812 1_555 C N3 DT 9 E DT 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 B N6 DA 11 D DA 812 1_555 C O4 DT 9 E DT 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 B N1 DG 12 D DG 813 1_555 C N3 DC 8 E DC 907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 B N2 DG 12 D DG 813 1_555 C O2 DC 8 E DC 907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 B O6 DG 12 D DG 813 1_555 C N4 DC 8 E DC 907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 E N1 DG 1 H DG 1802 1_555 F N3 DC 19 J DC 1918 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 E N2 DG 1 H DG 1802 1_555 F O2 DC 19 J DC 1918 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 E O6 DG 1 H DG 1802 1_555 F N4 DC 19 J DC 1918 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 E N3 DT 2 H DT 1803 1_555 F N1 DA 18 J DA 1917 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 E O4 DT 2 H DT 1803 1_555 F N6 DA 18 J DA 1917 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 E N3 DT 3 H DT 1804 1_555 F N1 DA 17 J DA 1916 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 E O4 DT 3 H DT 1804 1_555 F N6 DA 17 J DA 1916 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 E N1 DG 4 H DG 1805 1_555 F N3 DC 16 J DC 1915 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 E N2 DG 4 H DG 1805 1_555 F O2 DC 16 J DC 1915 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 E O6 DG 4 H DG 1805 1_555 F N4 DC 16 J DC 1915 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 E N1 DG 5 H DG 1806 1_555 F N3 DC 15 J DC 1914 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 E N2 DG 5 H DG 1806 1_555 F O2 DC 15 J DC 1914 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 E O6 DG 5 H DG 1806 1_555 F N4 DC 15 J DC 1914 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 E N1 DA 6 H DA 1807 1_555 F N3 DT 14 J DT 1913 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 E N6 DA 6 H DA 1807 1_555 F O4 DT 14 J DT 1913 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 E N3 DT 7 H DT 1808 1_555 F N1 DA 13 J DA 1912 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 E O4 DT 7 H DT 1808 1_555 F N6 DA 13 J DA 1912 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 E N1 DG 8 H DG 1809 1_555 F N3 DC 12 J DC 1911 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 E N2 DG 8 H DG 1809 1_555 F O2 DC 12 J DC 1911 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 E O6 DG 8 H DG 1809 1_555 F N4 DC 12 J DC 1911 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 E N1 DG 9 H DG 1810 1_555 F N3 DC 11 J DC 1910 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 E N2 DG 9 H DG 1810 1_555 F O2 DC 11 J DC 1910 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 E O6 DG 9 H DG 1810 1_555 F N4 DC 11 J DC 1910 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DT-DOC MISPAIR' hydrog54 E O2 DT 10 H DT 1811 1_555 E N4 DOC 13 H DOC 1814 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 E N3 DT 10 H DT 1811 1_555 F N1 DA 10 J DA 1909 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 E O4 DT 10 H DT 1811 1_555 F N6 DA 10 J DA 1909 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 E N1 DA 11 H DA 1812 1_555 F N3 DT 9 J DT 1908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 E N6 DA 11 H DA 1812 1_555 F O4 DT 9 J DT 1908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 E N1 DG 12 H DG 1813 1_555 F N3 DC 8 J DC 1907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 E N2 DG 12 H DG 1813 1_555 F O2 DC 8 J DC 1907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 E O6 DG 12 H DG 1813 1_555 F N4 DC 8 J DC 1907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C8 H18 N2 O4 S' _chem_comp.formula_weight 238.305 _chem_comp.id EPE _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name '4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms HEPES # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag N1 C2 EPE sing 315 n n N1 C6 EPE sing 316 n n N1 C9 EPE sing 317 n n C2 C3 EPE sing 318 n n C2 H21 EPE sing 319 n n C2 H22 EPE sing 320 n n C3 N4 EPE sing 321 n n C3 H31 EPE sing 322 n n C3 H32 EPE sing 323 n n N4 C5 EPE sing 324 n n N4 C7 EPE sing 325 n n C5 C6 EPE sing 326 n n C5 H51 EPE sing 327 n n C5 H52 EPE sing 328 n n C6 H61 EPE sing 329 n n C6 H62 EPE sing 330 n n C7 C8 EPE sing 331 n n C7 H71 EPE sing 332 n n C7 H72 EPE sing 333 n n C8 O8 EPE sing 334 n n C8 H81 EPE sing 335 n n C8 H82 EPE sing 336 n n O8 HO8 EPE sing 337 n n C9 C10 EPE sing 338 n n C9 H91 EPE sing 339 n n C9 H92 EPE sing 340 n n C10 S EPE sing 341 n n C10 H101 EPE sing 342 n n C10 H102 EPE sing 343 n n S O1S EPE doub 344 n n S O2S EPE doub 345 n n S O3S EPE sing 346 n n O3S HOS3 EPE sing 347 n n # _atom_sites.entry_id 3RAQ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.019159 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.001246 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.005012 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.016143 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.002901 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.01144 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 4 DGT A 1 414 414 DGT DGT . H 5 CA A 1 415 415 CA CA . I 5 CA A 1 416 416 CA CA . J 5 CA A 1 417 417 CA CA . K 6 EPE D 1 1 1 EPE EPE . L 4 DGT B 1 1414 1414 DGT DGT . M 5 CA B 1 1415 1415 CA CA . N 5 CA B 1 1416 1416 CA CA . O 5 CA B 1 1417 1417 CA CA . P 6 EPE H 1 1001 1001 EPE EPE . Q 7 HOH A 1 342 342 HOH HOH . Q 7 HOH A 2 344 344 HOH HOH . Q 7 HOH A 3 346 346 HOH HOH . Q 7 HOH A 4 513 513 HOH HOH . Q 7 HOH A 5 514 514 HOH HOH . Q 7 HOH A 6 515 515 HOH HOH . Q 7 HOH A 7 516 516 HOH HOH . Q 7 HOH A 8 517 517 HOH HOH . Q 7 HOH A 9 518 518 HOH HOH . Q 7 HOH A 10 519 519 HOH HOH . Q 7 HOH A 11 520 520 HOH HOH . Q 7 HOH A 12 521 521 HOH HOH . Q 7 HOH A 13 522 522 HOH HOH . Q 7 HOH A 14 523 523 HOH HOH . Q 7 HOH A 15 524 524 HOH HOH . Q 7 HOH A 16 525 525 HOH HOH . Q 7 HOH A 17 526 526 HOH HOH . Q 7 HOH A 18 527 527 HOH HOH . Q 7 HOH A 19 529 529 HOH HOH . Q 7 HOH A 20 530 530 HOH HOH . Q 7 HOH A 21 531 531 HOH HOH . Q 7 HOH A 22 532 532 HOH HOH . Q 7 HOH A 23 533 533 HOH HOH . Q 7 HOH A 24 534 534 HOH HOH . Q 7 HOH A 25 535 535 HOH HOH . Q 7 HOH A 26 536 536 HOH HOH . Q 7 HOH A 27 537 537 HOH HOH . Q 7 HOH A 28 538 538 HOH HOH . Q 7 HOH A 29 539 539 HOH HOH . Q 7 HOH A 30 540 540 HOH HOH . Q 7 HOH A 31 541 541 HOH HOH . Q 7 HOH A 32 542 542 HOH HOH . Q 7 HOH A 33 543 543 HOH HOH . Q 7 HOH A 34 544 544 HOH HOH . Q 7 HOH A 35 545 545 HOH HOH . Q 7 HOH A 36 546 546 HOH HOH . Q 7 HOH A 37 547 547 HOH HOH . Q 7 HOH A 38 548 548 HOH HOH . Q 7 HOH A 39 549 549 HOH HOH . Q 7 HOH A 40 550 550 HOH HOH . Q 7 HOH A 41 551 551 HOH HOH . Q 7 HOH A 42 552 552 HOH HOH . Q 7 HOH A 43 553 553 HOH HOH . Q 7 HOH A 44 554 554 HOH HOH . Q 7 HOH A 45 555 555 HOH HOH . Q 7 HOH A 46 556 556 HOH HOH . Q 7 HOH A 47 557 557 HOH HOH . Q 7 HOH A 48 558 558 HOH HOH . Q 7 HOH A 49 559 559 HOH HOH . Q 7 HOH A 50 560 560 HOH HOH . Q 7 HOH A 51 561 561 HOH HOH . Q 7 HOH A 52 562 562 HOH HOH . Q 7 HOH A 53 563 563 HOH HOH . Q 7 HOH A 54 564 564 HOH HOH . Q 7 HOH A 55 565 565 HOH HOH . Q 7 HOH A 56 566 566 HOH HOH . Q 7 HOH A 57 567 567 HOH HOH . Q 7 HOH A 58 568 568 HOH HOH . Q 7 HOH A 59 569 569 HOH HOH . Q 7 HOH A 60 570 570 HOH HOH . Q 7 HOH A 61 571 571 HOH HOH . Q 7 HOH A 62 572 572 HOH HOH . Q 7 HOH A 63 573 573 HOH HOH . Q 7 HOH A 64 574 574 HOH HOH . Q 7 HOH A 65 575 575 HOH HOH . Q 7 HOH A 66 576 576 HOH HOH . Q 7 HOH A 67 577 577 HOH HOH . Q 7 HOH A 68 578 578 HOH HOH . Q 7 HOH A 69 579 579 HOH HOH . Q 7 HOH A 70 580 580 HOH HOH . Q 7 HOH A 71 581 581 HOH HOH . Q 7 HOH A 72 582 582 HOH HOH . Q 7 HOH A 73 583 583 HOH HOH . Q 7 HOH A 74 584 584 HOH HOH . Q 7 HOH A 75 585 585 HOH HOH . Q 7 HOH A 76 586 586 HOH HOH . Q 7 HOH A 77 587 587 HOH HOH . Q 7 HOH A 78 588 588 HOH HOH . Q 7 HOH A 79 589 589 HOH HOH . Q 7 HOH A 80 590 590 HOH HOH . Q 7 HOH A 81 591 591 HOH HOH . Q 7 HOH A 82 592 592 HOH HOH . Q 7 HOH A 83 594 594 HOH HOH . Q 7 HOH A 84 596 596 HOH HOH . Q 7 HOH A 85 597 597 HOH HOH . Q 7 HOH A 86 598 598 HOH HOH . Q 7 HOH A 87 601 601 HOH HOH . Q 7 HOH A 88 602 602 HOH HOH . Q 7 HOH A 89 603 603 HOH HOH . Q 7 HOH A 90 604 604 HOH HOH . Q 7 HOH A 91 605 605 HOH HOH . Q 7 HOH A 92 606 606 HOH HOH . Q 7 HOH A 93 607 607 HOH HOH . Q 7 HOH A 94 608 608 HOH HOH . Q 7 HOH A 95 609 609 HOH HOH . Q 7 HOH A 96 610 610 HOH HOH . Q 7 HOH A 97 611 611 HOH HOH . Q 7 HOH A 98 612 612 HOH HOH . Q 7 HOH A 99 613 613 HOH HOH . Q 7 HOH A 100 614 614 HOH HOH . Q 7 HOH A 101 615 615 HOH HOH . Q 7 HOH A 102 616 616 HOH HOH . Q 7 HOH A 103 617 617 HOH HOH . Q 7 HOH A 104 618 618 HOH HOH . Q 7 HOH A 105 619 619 HOH HOH . Q 7 HOH A 106 620 620 HOH HOH . Q 7 HOH A 107 621 621 HOH HOH . Q 7 HOH A 108 622 622 HOH HOH . Q 7 HOH A 109 623 623 HOH HOH . Q 7 HOH A 110 624 624 HOH HOH . Q 7 HOH A 111 626 626 HOH HOH . Q 7 HOH A 112 627 627 HOH HOH . Q 7 HOH A 113 628 628 HOH HOH . Q 7 HOH A 114 630 630 HOH HOH . Q 7 HOH A 115 631 631 HOH HOH . Q 7 HOH A 116 633 633 HOH HOH . Q 7 HOH A 117 634 634 HOH HOH . Q 7 HOH A 118 635 635 HOH HOH . Q 7 HOH A 119 636 636 HOH HOH . Q 7 HOH A 120 638 638 HOH HOH . Q 7 HOH A 121 639 639 HOH HOH . Q 7 HOH A 122 640 640 HOH HOH . Q 7 HOH A 123 641 641 HOH HOH . Q 7 HOH A 124 642 642 HOH HOH . Q 7 HOH A 125 643 643 HOH HOH . Q 7 HOH A 126 645 645 HOH HOH . Q 7 HOH A 127 646 646 HOH HOH . Q 7 HOH A 128 647 647 HOH HOH . Q 7 HOH A 129 648 648 HOH HOH . Q 7 HOH A 130 649 649 HOH HOH . Q 7 HOH A 131 650 650 HOH HOH . Q 7 HOH A 132 652 652 HOH HOH . Q 7 HOH A 133 653 653 HOH HOH . Q 7 HOH A 134 655 655 HOH HOH . Q 7 HOH A 135 656 656 HOH HOH . Q 7 HOH A 136 657 657 HOH HOH . Q 7 HOH A 137 659 659 HOH HOH . Q 7 HOH A 138 660 660 HOH HOH . Q 7 HOH A 139 661 661 HOH HOH . Q 7 HOH A 140 662 662 HOH HOH . Q 7 HOH A 141 663 663 HOH HOH . Q 7 HOH A 142 664 664 HOH HOH . Q 7 HOH A 143 665 665 HOH HOH . Q 7 HOH A 144 666 666 HOH HOH . Q 7 HOH A 145 667 667 HOH HOH . Q 7 HOH A 146 668 668 HOH HOH . R 7 HOH D 1 27 27 HOH HOH . R 7 HOH D 2 39 39 HOH HOH . R 7 HOH D 3 41 41 HOH HOH . R 7 HOH D 4 45 45 HOH HOH . R 7 HOH D 5 50 50 HOH HOH . R 7 HOH D 6 108 108 HOH HOH . R 7 HOH D 7 115 115 HOH HOH . R 7 HOH D 8 144 144 HOH HOH . R 7 HOH D 9 148 148 HOH HOH . R 7 HOH D 10 195 195 HOH HOH . R 7 HOH D 11 228 228 HOH HOH . R 7 HOH D 12 231 231 HOH HOH . R 7 HOH D 13 253 253 HOH HOH . R 7 HOH D 14 258 258 HOH HOH . R 7 HOH D 15 274 274 HOH HOH . R 7 HOH D 16 313 313 HOH HOH . R 7 HOH D 17 325 325 HOH HOH . R 7 HOH D 18 341 341 HOH HOH . R 7 HOH D 19 343 343 HOH HOH . R 7 HOH D 20 350 350 HOH HOH . S 7 HOH E 1 2 2 HOH HOH . S 7 HOH E 2 4 4 HOH HOH . S 7 HOH E 3 22 22 HOH HOH . S 7 HOH E 4 49 49 HOH HOH . S 7 HOH E 5 51 51 HOH HOH . S 7 HOH E 6 54 54 HOH HOH . S 7 HOH E 7 131 131 HOH HOH . S 7 HOH E 8 135 135 HOH HOH . S 7 HOH E 9 149 149 HOH HOH . S 7 HOH E 10 171 171 HOH HOH . S 7 HOH E 11 219 219 HOH HOH . S 7 HOH E 12 226 226 HOH HOH . S 7 HOH E 13 273 273 HOH HOH . S 7 HOH E 14 317 317 HOH HOH . S 7 HOH E 15 334 334 HOH HOH . S 7 HOH E 16 348 348 HOH HOH . T 7 HOH B 1 1 1 HOH HOH . T 7 HOH B 2 9 9 HOH HOH . T 7 HOH B 3 12 12 HOH HOH . T 7 HOH B 4 15 15 HOH HOH . T 7 HOH B 5 20 20 HOH HOH . T 7 HOH B 6 26 26 HOH HOH . T 7 HOH B 7 28 28 HOH HOH . T 7 HOH B 8 30 30 HOH HOH . T 7 HOH B 9 31 31 HOH HOH . T 7 HOH B 10 35 35 HOH HOH . T 7 HOH B 11 55 55 HOH HOH . T 7 HOH B 12 58 58 HOH HOH . T 7 HOH B 13 59 59 HOH HOH . T 7 HOH B 14 60 60 HOH HOH . T 7 HOH B 15 64 64 HOH HOH . T 7 HOH B 16 68 68 HOH HOH . T 7 HOH B 17 72 72 HOH HOH . T 7 HOH B 18 77 77 HOH HOH . T 7 HOH B 19 84 84 HOH HOH . T 7 HOH B 20 86 86 HOH HOH . T 7 HOH B 21 87 87 HOH HOH . T 7 HOH B 22 90 90 HOH HOH . T 7 HOH B 23 94 94 HOH HOH . T 7 HOH B 24 96 96 HOH HOH . T 7 HOH B 25 97 97 HOH HOH . T 7 HOH B 26 102 102 HOH HOH . T 7 HOH B 27 103 103 HOH HOH . T 7 HOH B 28 106 106 HOH HOH . T 7 HOH B 29 112 112 HOH HOH . T 7 HOH B 30 116 116 HOH HOH . T 7 HOH B 31 121 121 HOH HOH . T 7 HOH B 32 123 123 HOH HOH . T 7 HOH B 33 124 124 HOH HOH . T 7 HOH B 34 133 133 HOH HOH . T 7 HOH B 35 134 134 HOH HOH . T 7 HOH B 36 138 138 HOH HOH . T 7 HOH B 37 139 139 HOH HOH . T 7 HOH B 38 143 143 HOH HOH . T 7 HOH B 39 145 145 HOH HOH . T 7 HOH B 40 146 146 HOH HOH . T 7 HOH B 41 151 151 HOH HOH . T 7 HOH B 42 153 153 HOH HOH . T 7 HOH B 43 154 154 HOH HOH . T 7 HOH B 44 157 157 HOH HOH . T 7 HOH B 45 159 159 HOH HOH . T 7 HOH B 46 160 160 HOH HOH . T 7 HOH B 47 177 177 HOH HOH . T 7 HOH B 48 178 178 HOH HOH . T 7 HOH B 49 181 181 HOH HOH . T 7 HOH B 50 184 184 HOH HOH . T 7 HOH B 51 185 185 HOH HOH . T 7 HOH B 52 189 189 HOH HOH . T 7 HOH B 53 192 192 HOH HOH . T 7 HOH B 54 194 194 HOH HOH . T 7 HOH B 55 196 196 HOH HOH . T 7 HOH B 56 197 197 HOH HOH . T 7 HOH B 57 199 199 HOH HOH . T 7 HOH B 58 203 203 HOH HOH . T 7 HOH B 59 205 205 HOH HOH . T 7 HOH B 60 209 209 HOH HOH . T 7 HOH B 61 211 211 HOH HOH . T 7 HOH B 62 213 213 HOH HOH . T 7 HOH B 63 215 215 HOH HOH . T 7 HOH B 64 217 217 HOH HOH . T 7 HOH B 65 224 224 HOH HOH . T 7 HOH B 66 225 225 HOH HOH . T 7 HOH B 67 227 227 HOH HOH . T 7 HOH B 68 230 230 HOH HOH . T 7 HOH B 69 237 237 HOH HOH . T 7 HOH B 70 239 239 HOH HOH . T 7 HOH B 71 240 240 HOH HOH . T 7 HOH B 72 247 247 HOH HOH . T 7 HOH B 73 249 249 HOH HOH . T 7 HOH B 74 250 250 HOH HOH . T 7 HOH B 75 256 256 HOH HOH . T 7 HOH B 76 257 257 HOH HOH . T 7 HOH B 77 261 261 HOH HOH . T 7 HOH B 78 276 276 HOH HOH . T 7 HOH B 79 294 294 HOH HOH . T 7 HOH B 80 296 296 HOH HOH . T 7 HOH B 81 297 297 HOH HOH . T 7 HOH B 82 298 298 HOH HOH . T 7 HOH B 83 302 302 HOH HOH . T 7 HOH B 84 303 303 HOH HOH . T 7 HOH B 85 312 312 HOH HOH . T 7 HOH B 86 324 324 HOH HOH . T 7 HOH B 87 327 327 HOH HOH . T 7 HOH B 88 329 329 HOH HOH . T 7 HOH B 89 335 335 HOH HOH . T 7 HOH B 90 340 340 HOH HOH . T 7 HOH B 91 345 345 HOH HOH . T 7 HOH B 92 1514 1514 HOH HOH . T 7 HOH B 93 1515 1515 HOH HOH . T 7 HOH B 94 1516 1516 HOH HOH . T 7 HOH B 95 1519 1519 HOH HOH . U 7 HOH H 1 119 119 HOH HOH . U 7 HOH H 2 122 122 HOH HOH . U 7 HOH H 3 132 132 HOH HOH . U 7 HOH H 4 147 147 HOH HOH . U 7 HOH H 5 165 165 HOH HOH . U 7 HOH H 6 188 188 HOH HOH . U 7 HOH H 7 233 233 HOH HOH . U 7 HOH H 8 322 322 HOH HOH . U 7 HOH H 9 347 347 HOH HOH . V 7 HOH J 1 14 14 HOH HOH . V 7 HOH J 2 25 25 HOH HOH . V 7 HOH J 3 65 65 HOH HOH . V 7 HOH J 4 67 67 HOH HOH . V 7 HOH J 5 71 71 HOH HOH . V 7 HOH J 6 95 95 HOH HOH . V 7 HOH J 7 114 114 HOH HOH . V 7 HOH J 8 152 152 HOH HOH . V 7 HOH J 9 204 204 HOH HOH . V 7 HOH J 10 229 229 HOH HOH . V 7 HOH J 11 270 270 HOH HOH . V 7 HOH J 12 288 288 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N1 EPE . . . P 6 27.417 25.33 40.154 1 43 ? N1 EPE 1001 H 1 HETATM 2 C C2 EPE . . . P 6 26.366 26.374 40.182 1 43.07 ? C2 EPE 1001 H 1 HETATM 3 C C3 EPE . . . P 6 26.84 27.647 40.879 1 43.96 ? C3 EPE 1001 H 1 HETATM 4 N N4 EPE . . . P 6 28.135 28.091 40.402 1 44.96 ? N4 EPE 1001 H 1 HETATM 5 C C5 EPE . . . P 6 29.146 27.068 40.608 1 43.72 ? C5 EPE 1001 H 1 HETATM 6 C C6 EPE . . . P 6 28.605 25.693 40.943 1 42.64 ? C6 EPE 1001 H 1 HETATM 7 C C7 EPE . . . P 6 28.518 29.359 41.022 1 46.65 ? C7 EPE 1001 H 1 HETATM 8 C C8 EPE . . . P 6 28.838 30.441 39.994 1 48.16 ? C8 EPE 1001 H 1 HETATM 9 O O8 EPE . . . P 6 27.637 31.096 39.645 1 49.38 ? O8 EPE 1001 H 1 HETATM 10 C C9 EPE . . . P 6 26.85 24.03 40.559 1 41.91 ? C9 EPE 1001 H 1 HETATM 11 C C10 EPE . . . P 6 27.927 22.979 40.745 1 42.47 ? C10 EPE 1001 H 1 HETATM 12 S S EPE . . . P 6 27.364 21.293 40.445 1 44.25 ? S EPE 1001 H 1 HETATM 13 O O1S EPE . . . P 6 25.908 21.203 40.585 1 43.88 ? O1S EPE 1001 H 1 HETATM 14 O O2S EPE . . . P 6 27.715 20.885 39.084 1 42 ? O2S EPE 1001 H 1 HETATM 15 O O3S EPE . . . P 6 28.037 20.445 41.435 1 43.26 ? O3S EPE 1001 H 1 # _model_server_stats.io_time_ms 19 _model_server_stats.parse_time_ms 65 _model_server_stats.create_model_time_ms 158 _model_server_stats.query_time_ms 388 _model_server_stats.encode_time_ms 9 _model_server_stats.element_count 15 #