data_3RV5 # _model_server_result.job_id UG0bIw8GXRtEnDV5ZkOkmw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 00:34:43' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3rv5 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"P","auth_seq_id":102}' # _entry.id 3RV5 # _exptl.entry_id 3RV5 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 112.411 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CADMIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 21 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3RV5 _cell.length_a 51.844 _cell.length_b 81.783 _cell.length_c 100.469 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3RV5 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 18 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 ? monomeric 1 author_defined_assembly 3 ? monomeric 1 author_defined_assembly 4 PISA octameric 8 software_defined_assembly 5 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,E,F,G,H,I,J,K,HA 1 1 B,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,IA 2 1 C,V,W,X,Y,Z,AA,BA,JA 3 1 D,CA,DA,EA,FA,GA,KA 4 1 A,B,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,HA,IA 5 1,2 C,D,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,JA,KA 5 3,4 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_655 -x+1,-y,z -1 0 0 0 -1 0 0 0 1 51.844 0 0 3 'crystal symmetry operation' 1_655 x+1,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 51.844 0 0 4 'crystal symmetry operation' 2_555 -x,-y,z -1 0 0 0 -1 0 0 0 1 0 0 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N ? 2 I N N ? 2 O N N ? 2 P N N ? 2 Q N N ? 2 R N N ? 2 S N N ? 2 T N N ? 2 U N N ? 2 V N N ? 2 W N N ? 2 X N N ? 2 Y N N ? 2 Z N N ? 2 CA N N ? 2 DA N N ? 2 EA N N ? 2 FA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C VAL 44 A VAL 44 1_555 A N MSE 45 A MSE 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale2 A C MSE 45 A MSE 45 1_555 A N ARG 46 A ARG 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.353 ? covale ? covale3 A C ARG 46 A ARG 46 1_555 A N MSE 47 A MSE 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale4 A C MSE 47 A MSE 47 1_555 A N LEU 48 A LEU 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale5 A C GLU 59 A GLU 59 1_555 A N MSE 60 A MSE 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? covale ? covale6 A C MSE 60 A MSE 60 1_555 A N ILE 61 A ILE 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale7 A C VAL 79 A VAL 79 1_555 A N MSE 80 A MSE 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale8 A C MSE 80 A MSE 80 1_555 A N MSE 81 A MSE 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale9 A C MSE 81 A MSE 81 1_555 A N VAL 82 A VAL 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale10 A C CYS 84 A CYS 84 1_555 A N MSE 85 A MSE 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale11 B C VAL 44 B VAL 44 1_555 B N MSE 45 B MSE 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale12 B C MSE 45 B MSE 45 1_555 B N ARG 46 B ARG 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale13 B C ARG 46 B ARG 46 1_555 B N MSE 47 B MSE 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale14 B C MSE 47 B MSE 47 1_555 B N LEU 48 B LEU 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale15 B C GLU 59 B GLU 59 1_555 B N MSE 60 B MSE 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale16 B C MSE 60 B MSE 60 1_555 B N ILE 61 B ILE 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.317 ? covale ? covale17 B C VAL 79 B VAL 79 1_555 B N MSE 80 B MSE 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale18 B C MSE 80 B MSE 80 1_555 B N MSE 81 B MSE 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale19 B C MSE 81 B MSE 81 1_555 B N VAL 82 B VAL 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale20 C C VAL 44 C VAL 44 1_555 C N MSE 45 C MSE 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale21 C C MSE 45 C MSE 45 1_555 C N ARG 46 C ARG 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale22 C C ARG 46 C ARG 46 1_555 C N MSE 47 C MSE 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale23 C C MSE 47 C MSE 47 1_555 C N LEU 48 C LEU 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale24 C C GLU 59 C GLU 59 1_555 C N MSE 60 C MSE 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale25 C C MSE 60 C MSE 60 1_555 C N ILE 61 C ILE 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale26 C C VAL 79 C VAL 79 1_555 C N MSE 80 C MSE 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? covale ? covale27 C C MSE 80 C MSE 80 1_555 C N MSE 81 C MSE 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale28 C C MSE 81 C MSE 81 1_555 C N VAL 82 C VAL 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale29 C C CYS 84 C CYS 84 1_555 C N MSE 85 C MSE 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale30 D C VAL 44 D VAL 44 1_555 D N MSE 45 D MSE 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? covale ? covale31 D C MSE 45 D MSE 45 1_555 D N ARG 46 D ARG 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale32 D C ARG 46 D ARG 46 1_555 D N MSE 47 D MSE 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale33 D C MSE 47 D MSE 47 1_555 D N LEU 48 D LEU 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? covale ? covale34 D C GLU 59 D GLU 59 1_555 D N MSE 60 D MSE 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale35 D C MSE 60 D MSE 60 1_555 D N ILE 61 D ILE 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? covale ? covale36 D C VAL 79 D VAL 79 1_555 D N MSE 80 D MSE 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale37 D C MSE 80 D MSE 80 1_555 D N MSE 81 D MSE 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale38 D C MSE 81 D MSE 81 1_555 D N VAL 82 D VAL 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? metalc ? metalc1 A O GLY 30 A GLY 30 1_555 E CD CD . A CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 33 A ASP 33 1_555 E CD CD . A CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 33 A ASP 33 1_555 E CD CD . A CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 35 A CYS 35 1_555 E CD CD . A CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.487 ? metalc ? metalc5 A O CYS 35 A CYS 35 1_555 E CD CD . A CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? metalc ? metalc6 A SG CYS 35 A CYS 35 1_555 G CD CD . A CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.654 ? metalc ? metalc7 A OE1 GLU 40 A GLU 40 1_555 E CD CD . A CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.412 ? metalc ? metalc8 A OE2 GLU 40 A GLU 40 1_555 E CD CD . A CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.558 ? metalc ? metalc9 A OD2 ASP 65 A ASP 65 1_555 F CD CD . A CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? metalc ? metalc10 A OE2 GLU 66 A GLU 66 1_555 I CD CD . A CD 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? metalc ? metalc11 A OD1 ASP 67 A ASP 67 1_555 F CD CD . A CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? metalc ? metalc12 A OG SER 69 A SER 69 1_555 F CD CD . A CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? metalc ? metalc13 A O THR 71 A THR 71 1_555 F CD CD . A CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? metalc ? metalc14 A OD2 ASP 73 A ASP 73 1_555 H CD CD . A CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? metalc ? metalc15 A OD1 ASP 75 A ASP 75 1_555 H CD CD . A CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc16 A OD2 ASP 75 A ASP 75 1_555 H CD CD . A CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? metalc ? metalc17 A OE1 GLU 76 A GLU 76 1_555 F CD CD . A CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc18 A OE2 GLU 76 A GLU 76 1_555 F CD CD . A CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? metalc ? metalc19 F CD CD . A CD 102 1_555 HA O HOH . A HOH 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? metalc ? metalc20 G CD CD . A CD 103 1_555 HA O HOH . A HOH 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? metalc ? metalc21 G CD CD . A CD 103 1_555 HA O HOH . A HOH 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? metalc ? metalc22 H CD CD . A CD 104 1_555 HA O HOH . A HOH 120 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? metalc ? metalc23 H CD CD . A CD 104 1_555 HA O HOH . A HOH 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.428 ? metalc ? metalc24 H CD CD . A CD 104 1_555 HA O HOH . A HOH 132 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? metalc ? metalc25 I CD CD . A CD 105 1_555 HA O HOH . A HOH 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc ? metalc26 I CD CD . A CD 105 1_555 JA O HOH . C HOH 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.522 ? metalc ? metalc27 B O GLY 30 B GLY 30 1_555 O CD CD . B CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc28 B OE2 GLU 32 B GLU 32 1_555 S CD CD . B CD 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.37 ? metalc ? metalc29 B OE1 GLU 32 B GLU 32 1_555 S CD CD . B CD 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? metalc ? metalc30 B OD1 ASP 33 B ASP 33 1_555 O CD CD . B CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.49 ? metalc ? metalc31 B OD2 ASP 33 B ASP 33 1_555 O CD CD . B CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? metalc ? metalc32 B O CYS 35 B CYS 35 1_555 O CD CD . B CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.407 ? metalc ? metalc33 B SG CYS 35 B CYS 35 1_555 O CD CD . B CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.605 ? metalc ? metalc34 B SG CYS 35 B CYS 35 1_555 Q CD CD . B CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? metalc ? metalc35 B OE2 GLU 40 B GLU 40 1_555 O CD CD . B CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc36 B OE1 GLU 40 B GLU 40 1_555 O CD CD . B CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? metalc ? metalc37 B OE1 GLU 59 B GLU 59 1_555 T CD CD . B CD 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc38 B OE2 GLU 59 B GLU 59 1_555 T CD CD . B CD 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc ? metalc39 B OE2 GLU 59 B GLU 59 1_555 N CA CA . B CA 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.541 ? metalc ? metalc40 B OE2 GLU 63 B GLU 63 1_555 N CA CA . B CA 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? metalc ? metalc41 B OE1 GLU 63 B GLU 63 1_555 N CA CA . B CA 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.117 ? metalc ? metalc42 B OD1 ASP 65 B ASP 65 1_555 P CD CD . B CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.173 ? metalc ? metalc43 B OE2 GLU 66 B GLU 66 1_555 M CA CA . B CA 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc44 B OD1 ASP 67 B ASP 67 1_555 P CD CD . B CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? metalc ? metalc45 B OG SER 69 B SER 69 1_555 P CD CD . B CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc46 B O THR 71 B THR 71 1_555 P CD CD . B CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.521 ? metalc ? metalc47 B OD2 ASP 73 B ASP 73 1_555 R CD CD . B CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? metalc ? metalc48 B OD1 ASP 75 B ASP 75 1_555 R CD CD . B CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.195 ? metalc ? metalc49 B OD2 ASP 75 B ASP 75 1_555 R CD CD . B CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.508 ? metalc ? metalc50 B OE1 GLU 76 B GLU 76 1_555 P CD CD . B CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.161 ? metalc ? metalc51 B OE2 GLU 76 B GLU 76 1_555 P CD CD . B CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc52 P CD CD . B CD 102 1_555 IA O HOH . B HOH 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? metalc ? metalc53 Q CD CD . B CD 103 1_555 IA O HOH . B HOH 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? metalc ? metalc54 Q CD CD . B CD 103 1_555 IA O HOH . B HOH 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? metalc ? metalc55 Q CD CD . B CD 103 1_555 IA O HOH . B HOH 146 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? metalc ? metalc56 Q CD CD . B CD 103 1_555 IA O HOH . B HOH 147 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? metalc ? metalc57 Q CD CD . B CD 103 1_555 IA O HOH . B HOH 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.509 ? metalc ? metalc58 R CD CD . B CD 104 1_555 IA O HOH . B HOH 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc59 R CD CD . B CD 104 1_555 IA O HOH . B HOH 114 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? metalc ? metalc60 R CD CD . B CD 104 1_555 IA O HOH . B HOH 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? metalc ? metalc61 R CD CD . B CD 104 1_555 IA O HOH . B HOH 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? metalc ? metalc62 S CD CD . B CD 105 1_555 IA O HOH . B HOH 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? metalc ? metalc63 S CD CD . B CD 105 1_555 IA O HOH . B HOH 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc64 S CD CD . B CD 105 1_555 C OE2 GLU 15 C GLU 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? metalc ? metalc65 S CD CD . B CD 105 1_555 JA O HOH . C HOH 138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc66 T CD CD . B CD 106 1_555 IA O HOH . B HOH 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc67 T CD CD . B CD 106 1_555 IA O HOH . B HOH 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? metalc ? metalc68 T CD CD . B CD 106 1_555 IA O HOH . B HOH 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc ? metalc69 N CA CA . B CA 108 1_555 IA O HOH . B HOH 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.588 ? metalc ? metalc70 C O GLY 30 C GLY 30 1_555 V CD CD . C CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? metalc ? metalc71 C OE1 GLU 32 C GLU 32 1_555 AA CA CA . C CA 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.568 ? metalc ? metalc72 C OD2 ASP 33 C ASP 33 1_555 V CD CD . C CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? metalc ? metalc73 C OD1 ASP 33 C ASP 33 1_555 X CD CD . C CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? metalc ? metalc74 C O CYS 35 C CYS 35 1_555 V CD CD . C CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.383 ? metalc ? metalc75 C SG CYS 35 C CYS 35 1_555 V CD CD . C CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? metalc ? metalc76 C SG CYS 35 C CYS 35 1_555 X CD CD . C CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? metalc ? metalc77 C OE2 GLU 40 C GLU 40 1_555 V CD CD . C CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc78 C OE1 GLU 40 C GLU 40 1_555 V CD CD . C CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? metalc ? metalc79 C OE2 GLU 59 C GLU 59 1_555 Z CD CD . C CD 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc ? metalc80 C OE1 GLU 59 C GLU 59 1_555 Z CD CD . C CD 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? metalc ? metalc81 C OD1 ASP 65 C ASP 65 1_555 W CD CD . C CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.191 ? metalc ? metalc82 C OD1 ASP 67 C ASP 67 1_555 W CD CD . C CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? metalc ? metalc83 C OG SER 69 C SER 69 1_555 W CD CD . C CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? metalc ? metalc84 C O THR 71 C THR 71 1_555 W CD CD . C CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.451 ? metalc ? metalc85 C OD1 ASP 73 C ASP 73 1_555 Y CD CD . C CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc86 C OD1 ASP 75 C ASP 75 1_555 Y CD CD . C CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc87 C OD2 ASP 75 C ASP 75 1_555 Y CD CD . C CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.388 ? metalc ? metalc88 C OE2 GLU 76 C GLU 76 1_555 W CD CD . C CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? metalc ? metalc89 C OE1 GLU 76 C GLU 76 1_555 W CD CD . C CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? metalc ? metalc90 W CD CD . C CD 102 1_555 JA O HOH . C HOH 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc91 X CD CD . C CD 103 1_555 JA O HOH . C HOH 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.475 ? metalc ? metalc92 X CD CD . C CD 103 1_555 JA O HOH . C HOH 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? metalc ? metalc93 X CD CD . C CD 103 1_555 JA O HOH . C HOH 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? metalc ? metalc94 X CD CD . C CD 103 1_555 JA O HOH . C HOH 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc95 Y CD CD . C CD 104 1_555 JA O HOH . C HOH 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? metalc ? metalc96 Y CD CD . C CD 104 1_555 JA O HOH . C HOH 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? metalc ? metalc97 Y CD CD . C CD 104 1_555 JA O HOH . C HOH 130 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? metalc ? metalc98 AA CA CA . C CA 106 1_555 D OD2 ASP 75 D ASP 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.885 ? metalc ? metalc99 D O GLY 30 D GLY 30 1_555 CA CD CD . D CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc100 D OD1 ASP 33 D ASP 33 1_555 CA CD CD . D CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.936 ? metalc ? metalc101 D OD2 ASP 33 D ASP 33 1_555 CA CD CD . D CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? metalc ? metalc102 D SG CYS 35 D CYS 35 1_555 CA CD CD . D CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? metalc ? metalc103 D O CYS 35 D CYS 35 1_555 CA CD CD . D CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.487 ? metalc ? metalc104 D SG CYS 35 D CYS 35 1_555 EA CD CD . D CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.622 ? metalc ? metalc105 D OE1 GLU 40 D GLU 40 1_555 CA CD CD . D CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? metalc ? metalc106 D OE2 GLU 40 D GLU 40 1_555 CA CD CD . D CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? metalc ? metalc107 D OD1 ASP 65 D ASP 65 1_555 DA CD CD . D CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? metalc ? metalc108 D OD1 ASP 67 D ASP 67 1_555 DA CD CD . D CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? metalc ? metalc109 D OG SER 69 D SER 69 1_555 DA CD CD . D CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? metalc ? metalc110 D O THR 71 D THR 71 1_555 DA CD CD . D CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? metalc ? metalc111 D OD2 ASP 73 D ASP 73 1_555 FA CD CD . D CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.117 ? metalc ? metalc112 D OD1 ASP 75 D ASP 75 1_555 FA CD CD . D CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.502 ? metalc ? metalc113 D OD2 ASP 75 D ASP 75 1_555 FA CD CD . D CD 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? metalc ? metalc114 D OE1 GLU 76 D GLU 76 1_555 DA CD CD . D CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? metalc ? metalc115 D OE2 GLU 76 D GLU 76 1_555 DA CD CD . D CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? metalc ? metalc116 DA CD CD . D CD 102 1_555 KA O HOH . D HOH 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? metalc ? metalc117 EA CD CD . D CD 103 1_555 KA O HOH . D HOH 128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc118 FA CD CD . D CD 104 1_555 KA O HOH . D HOH 118 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? metalc ? metalc119 FA CD CD . D CD 104 1_555 KA O HOH . D HOH 120 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.131 ? # _chem_comp.formula 'Cd 2' _chem_comp.formula_weight 112.411 _chem_comp.id CD _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CADMIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 3RV5 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.019289 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.012227 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.009953 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 CD A 1 101 101 CD CD . F 2 CD A 1 102 103 CD CD . G 2 CD A 1 103 102 CD CD . H 2 CD A 1 104 104 CD CD . I 2 CD A 1 105 105 CD CD . J 3 DXC A 1 92 111 DXC DXC . K 3 DXC A 1 91 112 DXC DXC . L 3 DXC B 1 92 111 DXC DXC . M 4 CA B 1 109 109 CA CA . N 4 CA B 1 108 109 CA CA . O 2 CD B 1 101 101 CD CD . P 2 CD B 1 102 103 CD CD . Q 2 CD B 1 103 102 CD CD . R 2 CD B 1 104 104 CD CD . S 2 CD B 1 105 105 CD CD . T 2 CD B 1 106 106 CD CD . U 2 CD B 1 107 107 CD CD . V 2 CD C 1 101 101 CD CD . W 2 CD C 1 102 103 CD CD . X 2 CD C 1 103 102 CD CD . Y 2 CD C 1 104 104 CD CD . Z 2 CD C 1 105 105 CD CD . AA 4 CA C 1 106 109 CA CA . BA 3 DXC C 1 92 111 DXC DXC . CA 2 CD D 1 101 101 CD CD . DA 2 CD D 1 102 103 CD CD . EA 2 CD D 1 103 102 CD CD . FA 2 CD D 1 104 104 CD CD . GA 3 DXC D 1 92 111 DXC DXC . HA 5 HOH A 1 110 15 HOH HOH . HA 5 HOH A 2 111 1 HOH HOH . HA 5 HOH A 3 112 4 HOH HOH . HA 5 HOH A 4 113 6 HOH HOH . HA 5 HOH A 5 114 94 HOH HOH . HA 5 HOH A 6 115 95 HOH HOH . HA 5 HOH A 7 116 96 HOH HOH . HA 5 HOH A 8 117 97 HOH HOH . HA 5 HOH A 9 118 7 HOH HOH . HA 5 HOH A 10 119 8 HOH HOH . HA 5 HOH A 11 120 13 HOH HOH . HA 5 HOH A 12 121 107 HOH HOH . HA 5 HOH A 13 122 108 HOH HOH . HA 5 HOH A 14 123 16 HOH HOH . HA 5 HOH A 15 124 26 HOH HOH . HA 5 HOH A 16 125 27 HOH HOH . HA 5 HOH A 17 126 114 HOH HOH . HA 5 HOH A 18 127 115 HOH HOH . HA 5 HOH A 19 128 29 HOH HOH . HA 5 HOH A 20 129 31 HOH HOH . HA 5 HOH A 21 130 32 HOH HOH . HA 5 HOH A 22 131 35 HOH HOH . HA 5 HOH A 23 132 36 HOH HOH . HA 5 HOH A 24 133 42 HOH HOH . HA 5 HOH A 25 134 43 HOH HOH . HA 5 HOH A 26 135 45 HOH HOH . HA 5 HOH A 27 136 124 HOH HOH . HA 5 HOH A 28 137 55 HOH HOH . HA 5 HOH A 29 138 58 HOH HOH . HA 5 HOH A 30 139 59 HOH HOH . HA 5 HOH A 31 140 128 HOH HOH . HA 5 HOH A 32 141 129 HOH HOH . HA 5 HOH A 33 142 61 HOH HOH . HA 5 HOH A 34 143 70 HOH HOH . HA 5 HOH A 35 144 72 HOH HOH . HA 5 HOH A 36 145 79 HOH HOH . HA 5 HOH A 37 146 80 HOH HOH . HA 5 HOH A 38 147 82 HOH HOH . HA 5 HOH A 39 148 84 HOH HOH . IA 5 HOH B 1 110 14 HOH HOH . IA 5 HOH B 2 111 91 HOH HOH . IA 5 HOH B 3 112 5 HOH HOH . IA 5 HOH B 4 113 9 HOH HOH . IA 5 HOH B 5 114 10 HOH HOH . IA 5 HOH B 6 115 11 HOH HOH . IA 5 HOH B 7 116 24 HOH HOH . IA 5 HOH B 8 117 98 HOH HOH . IA 5 HOH B 9 118 99 HOH HOH . IA 5 HOH B 10 119 100 HOH HOH . IA 5 HOH B 11 120 25 HOH HOH . IA 5 HOH B 12 121 110 HOH HOH . IA 5 HOH B 13 122 28 HOH HOH . IA 5 HOH B 14 123 30 HOH HOH . IA 5 HOH B 15 124 37 HOH HOH . IA 5 HOH B 16 125 38 HOH HOH . IA 5 HOH B 17 126 39 HOH HOH . IA 5 HOH B 18 127 47 HOH HOH . IA 5 HOH B 19 128 49 HOH HOH . IA 5 HOH B 20 129 118 HOH HOH . IA 5 HOH B 21 130 119 HOH HOH . IA 5 HOH B 22 131 120 HOH HOH . IA 5 HOH B 23 132 121 HOH HOH . IA 5 HOH B 24 133 50 HOH HOH . IA 5 HOH B 25 134 51 HOH HOH . IA 5 HOH B 26 135 52 HOH HOH . IA 5 HOH B 27 136 125 HOH HOH . IA 5 HOH B 28 137 66 HOH HOH . IA 5 HOH B 29 138 67 HOH HOH . IA 5 HOH B 30 139 68 HOH HOH . IA 5 HOH B 31 140 69 HOH HOH . IA 5 HOH B 32 141 73 HOH HOH . IA 5 HOH B 33 142 131 HOH HOH . IA 5 HOH B 34 143 77 HOH HOH . IA 5 HOH B 35 144 133 HOH HOH . IA 5 HOH B 36 145 78 HOH HOH . IA 5 HOH B 37 146 87 HOH HOH . IA 5 HOH B 38 147 88 HOH HOH . IA 5 HOH B 39 148 104 HOH HOH . IA 5 HOH B 40 149 105 HOH HOH . IA 5 HOH B 41 150 106 HOH HOH . JA 5 HOH C 1 110 57 HOH HOH . JA 5 HOH C 2 111 90 HOH HOH . JA 5 HOH C 3 112 2 HOH HOH . JA 5 HOH C 4 113 92 HOH HOH . JA 5 HOH C 5 114 93 HOH HOH . JA 5 HOH C 6 115 17 HOH HOH . JA 5 HOH C 7 116 18 HOH HOH . JA 5 HOH C 8 117 19 HOH HOH . JA 5 HOH C 9 118 23 HOH HOH . JA 5 HOH C 10 119 40 HOH HOH . JA 5 HOH C 11 120 44 HOH HOH . JA 5 HOH C 12 121 46 HOH HOH . JA 5 HOH C 13 122 48 HOH HOH . JA 5 HOH C 14 123 53 HOH HOH . JA 5 HOH C 15 124 60 HOH HOH . JA 5 HOH C 16 125 112 HOH HOH . JA 5 HOH C 17 126 62 HOH HOH . JA 5 HOH C 18 127 63 HOH HOH . JA 5 HOH C 19 128 64 HOH HOH . JA 5 HOH C 20 129 75 HOH HOH . JA 5 HOH C 21 130 81 HOH HOH . JA 5 HOH C 22 131 85 HOH HOH . JA 5 HOH C 23 132 86 HOH HOH . JA 5 HOH C 24 133 89 HOH HOH . JA 5 HOH C 25 134 101 HOH HOH . JA 5 HOH C 26 135 122 HOH HOH . JA 5 HOH C 27 136 123 HOH HOH . JA 5 HOH C 28 137 102 HOH HOH . JA 5 HOH C 29 138 109 HOH HOH . JA 5 HOH C 30 139 126 HOH HOH . JA 5 HOH C 31 140 127 HOH HOH . JA 5 HOH C 32 141 111 HOH HOH . JA 5 HOH C 33 142 130 HOH HOH . JA 5 HOH C 34 143 134 HOH HOH . KA 5 HOH D 1 110 41 HOH HOH . KA 5 HOH D 2 111 3 HOH HOH . KA 5 HOH D 3 112 12 HOH HOH . KA 5 HOH D 4 113 20 HOH HOH . KA 5 HOH D 5 114 21 HOH HOH . KA 5 HOH D 6 115 22 HOH HOH . KA 5 HOH D 7 116 33 HOH HOH . KA 5 HOH D 8 117 34 HOH HOH . KA 5 HOH D 9 118 54 HOH HOH . KA 5 HOH D 10 119 56 HOH HOH . KA 5 HOH D 11 120 65 HOH HOH . KA 5 HOH D 12 121 71 HOH HOH . KA 5 HOH D 13 122 74 HOH HOH . KA 5 HOH D 14 123 76 HOH HOH . KA 5 HOH D 15 124 83 HOH HOH . KA 5 HOH D 16 125 103 HOH HOH . KA 5 HOH D 17 126 113 HOH HOH . KA 5 HOH D 18 127 116 HOH HOH . KA 5 HOH D 19 128 117 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CD _atom_site.label_atom_id CD _atom_site.label_comp_id CD _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id P _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 9.695 _atom_site.Cartn_y 6.413 _atom_site.Cartn_z -2.162 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 28.34 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CD _atom_site.auth_comp_id CD _atom_site.auth_seq_id 102 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 11 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 277 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #