data_3SAG # _model_server_result.job_id nXR64msDtxphp03IORcEIw _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 10:32:41' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3sag # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":1}' # _entry.id 3SAG # _exptl.entry_id 3SAG _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3SAG _cell.length_a 138.8 _cell.length_b 138.8 _cell.length_c 60.3 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3SAG _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 75 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 4' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,D,G 1 1 B,E,F,H 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 3 _struct_asym.id E _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 C Y YT3 . A YT3 1 1_555 G O HOH . A HOH 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.95 ? metalc ? metalc2 C Y YT3 . A YT3 1 1_555 G O HOH . A HOH 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.833 ? metalc ? metalc3 C Y YT3 . A YT3 1 1_555 G O HOH . A HOH 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.735 ? metalc ? metalc4 C Y YT3 . A YT3 1 1_555 A OD2 ASP 310 A ASP 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? metalc ? metalc5 C Y YT3 . A YT3 1 1_555 A OD1 ASP 310 A ASP 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.29 ? metalc ? metalc6 C Y YT3 . A YT3 1 1_555 A OE2 GLU 311 A GLU 489 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.21 ? metalc ? metalc7 C Y YT3 . A YT3 1 1_555 A OE1 GLU 311 A GLU 489 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? metalc ? metalc8 D Y YT3 . A YT3 3 1_555 G O HOH . A HOH 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? metalc ? metalc9 D Y YT3 . A YT3 3 1_555 A OD1 ASP 226 A ASP 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.928 ? metalc ? metalc10 D Y YT3 . A YT3 3 1_555 A OD1 ASP 262 A ASP 440 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc11 D Y YT3 . A YT3 3 1_555 A OD2 ASP 262 A ASP 440 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.082 ? metalc ? metalc12 D Y YT3 . A YT3 3 1_555 G O HOH . A HOH 630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? metalc ? metalc13 D Y YT3 . A YT3 3 1_555 G O HOH . A HOH 632 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.865 ? metalc ? metalc14 E MG MG . B MG 1 1_555 H O HOH . B HOH 33 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? metalc ? metalc15 E MG MG . B MG 1 1_555 H O HOH . B HOH 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.839 ? metalc ? metalc16 E MG MG . B MG 1 1_555 H O HOH . B HOH 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? metalc ? metalc17 E MG MG . B MG 1 1_555 B OD1 ASN 135 B ASN 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.673 ? metalc ? metalc18 E MG MG . B MG 1 1_555 H O HOH . B HOH 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.941 ? metalc ? metalc19 F Y YT3 . B YT3 2 1_555 H O HOH . B HOH 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.927 ? metalc ? metalc20 F Y YT3 . B YT3 2 1_555 B OD1 ASP 310 B ASP 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.658 ? metalc ? metalc21 F Y YT3 . B YT3 2 1_555 B OE1 GLU 311 B GLU 489 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.889 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 3SAG _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007205 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.007205 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.016584 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 YT3 A 1 1 1 YT3 YT3 . D 2 YT3 A 1 3 3 YT3 YT3 . E 3 MG B 1 1 1 MG MG2 . F 2 YT3 B 1 2 2 YT3 YT3 . G 4 HOH A 1 4 4 HOH WAT . G 4 HOH A 2 6 6 HOH WAT . G 4 HOH A 3 8 8 HOH WAT . G 4 HOH A 4 11 11 HOH WAT . G 4 HOH A 5 12 12 HOH WAT . G 4 HOH A 6 14 14 HOH WAT . G 4 HOH A 7 15 15 HOH WAT . G 4 HOH A 8 16 16 HOH WAT . G 4 HOH A 9 23 23 HOH WAT . G 4 HOH A 10 27 27 HOH WAT . G 4 HOH A 11 28 28 HOH WAT . G 4 HOH A 12 29 29 HOH WAT . G 4 HOH A 13 30 30 HOH WAT . G 4 HOH A 14 31 31 HOH WAT . G 4 HOH A 15 32 32 HOH WAT . G 4 HOH A 16 34 34 HOH WAT . G 4 HOH A 17 42 42 HOH WAT . G 4 HOH A 18 47 47 HOH WAT . G 4 HOH A 19 50 50 HOH WAT . G 4 HOH A 20 52 52 HOH WAT . G 4 HOH A 21 53 53 HOH WAT . G 4 HOH A 22 54 54 HOH WAT . G 4 HOH A 23 55 55 HOH WAT . G 4 HOH A 24 57 57 HOH WAT . G 4 HOH A 25 60 60 HOH WAT . G 4 HOH A 26 66 66 HOH WAT . G 4 HOH A 27 67 67 HOH WAT . G 4 HOH A 28 68 68 HOH WAT . G 4 HOH A 29 69 69 HOH WAT . G 4 HOH A 30 72 72 HOH WAT . G 4 HOH A 31 73 73 HOH WAT . G 4 HOH A 32 74 74 HOH WAT . G 4 HOH A 33 77 77 HOH WAT . G 4 HOH A 34 80 80 HOH WAT . G 4 HOH A 35 85 85 HOH WAT . G 4 HOH A 36 88 88 HOH WAT . G 4 HOH A 37 89 89 HOH WAT . G 4 HOH A 38 91 91 HOH WAT . G 4 HOH A 39 92 92 HOH WAT . G 4 HOH A 40 96 96 HOH WAT . G 4 HOH A 41 97 97 HOH WAT . G 4 HOH A 42 99 99 HOH WAT . G 4 HOH A 43 102 102 HOH WAT . G 4 HOH A 44 103 103 HOH WAT . G 4 HOH A 45 104 104 HOH WAT . G 4 HOH A 46 106 106 HOH WAT . G 4 HOH A 47 107 107 HOH WAT . G 4 HOH A 48 109 109 HOH WAT . G 4 HOH A 49 111 111 HOH WAT . G 4 HOH A 50 112 112 HOH WAT . G 4 HOH A 51 113 113 HOH WAT . G 4 HOH A 52 115 115 HOH WAT . G 4 HOH A 53 116 116 HOH WAT . G 4 HOH A 54 120 120 HOH WAT . G 4 HOH A 55 121 121 HOH WAT . G 4 HOH A 56 123 123 HOH WAT . G 4 HOH A 57 124 124 HOH WAT . G 4 HOH A 58 125 125 HOH WAT . G 4 HOH A 59 127 127 HOH WAT . G 4 HOH A 60 130 130 HOH WAT . G 4 HOH A 61 131 131 HOH WAT . G 4 HOH A 62 132 132 HOH WAT . G 4 HOH A 63 133 133 HOH WAT . G 4 HOH A 64 134 134 HOH WAT . G 4 HOH A 65 135 135 HOH WAT . G 4 HOH A 66 137 137 HOH WAT . G 4 HOH A 67 138 138 HOH WAT . G 4 HOH A 68 140 140 HOH WAT . G 4 HOH A 69 145 145 HOH WAT . G 4 HOH A 70 146 146 HOH WAT . G 4 HOH A 71 147 147 HOH WAT . G 4 HOH A 72 149 149 HOH WAT . G 4 HOH A 73 150 150 HOH WAT . G 4 HOH A 74 151 151 HOH WAT . G 4 HOH A 75 152 152 HOH WAT . G 4 HOH A 76 155 155 HOH WAT . G 4 HOH A 77 157 157 HOH WAT . G 4 HOH A 78 159 159 HOH WAT . G 4 HOH A 79 160 160 HOH WAT . G 4 HOH A 80 161 161 HOH WAT . G 4 HOH A 81 165 165 HOH WAT . G 4 HOH A 82 167 167 HOH WAT . G 4 HOH A 83 170 170 HOH WAT . G 4 HOH A 84 171 171 HOH WAT . G 4 HOH A 85 172 172 HOH WAT . G 4 HOH A 86 176 176 HOH WAT . G 4 HOH A 87 178 178 HOH WAT . G 4 HOH A 88 607 180 HOH WAT . G 4 HOH A 89 608 181 HOH WAT . G 4 HOH A 90 609 182 HOH WAT . G 4 HOH A 91 610 184 HOH WAT . G 4 HOH A 92 611 185 HOH WAT . G 4 HOH A 93 612 188 HOH WAT . G 4 HOH A 94 613 191 HOH WAT . G 4 HOH A 95 614 192 HOH WAT . G 4 HOH A 96 615 193 HOH WAT . G 4 HOH A 97 616 195 HOH WAT . G 4 HOH A 98 617 196 HOH WAT . G 4 HOH A 99 618 197 HOH WAT . G 4 HOH A 100 619 198 HOH WAT . G 4 HOH A 101 620 202 HOH WAT . G 4 HOH A 102 621 203 HOH WAT . G 4 HOH A 103 622 205 HOH WAT . G 4 HOH A 104 623 206 HOH WAT . G 4 HOH A 105 624 207 HOH WAT . G 4 HOH A 106 625 211 HOH WAT . G 4 HOH A 107 626 217 HOH WAT . G 4 HOH A 108 627 218 HOH WAT . G 4 HOH A 109 628 219 HOH WAT . G 4 HOH A 110 629 220 HOH WAT . G 4 HOH A 111 630 225 HOH WAT . G 4 HOH A 112 631 226 HOH WAT . G 4 HOH A 113 632 227 HOH WAT . G 4 HOH A 114 633 228 HOH WAT . H 4 HOH B 1 3 3 HOH WAT . H 4 HOH B 2 5 5 HOH WAT . H 4 HOH B 3 7 7 HOH WAT . H 4 HOH B 4 9 9 HOH WAT . H 4 HOH B 5 10 10 HOH WAT . H 4 HOH B 6 13 13 HOH WAT . H 4 HOH B 7 17 17 HOH WAT . H 4 HOH B 8 18 18 HOH WAT . H 4 HOH B 9 19 19 HOH WAT . H 4 HOH B 10 20 20 HOH WAT . H 4 HOH B 11 21 21 HOH WAT . H 4 HOH B 12 22 22 HOH WAT . H 4 HOH B 13 24 24 HOH WAT . H 4 HOH B 14 25 25 HOH WAT . H 4 HOH B 15 26 26 HOH WAT . H 4 HOH B 16 33 33 HOH WAT . H 4 HOH B 17 35 35 HOH WAT . H 4 HOH B 18 36 36 HOH WAT . H 4 HOH B 19 37 37 HOH WAT . H 4 HOH B 20 38 38 HOH WAT . H 4 HOH B 21 39 39 HOH WAT . H 4 HOH B 22 40 40 HOH WAT . H 4 HOH B 23 41 41 HOH WAT . H 4 HOH B 24 43 43 HOH WAT . H 4 HOH B 25 44 44 HOH WAT . H 4 HOH B 26 45 45 HOH WAT . H 4 HOH B 27 46 46 HOH WAT . H 4 HOH B 28 48 48 HOH WAT . H 4 HOH B 29 49 49 HOH WAT . H 4 HOH B 30 51 51 HOH WAT . H 4 HOH B 31 56 56 HOH WAT . H 4 HOH B 32 58 58 HOH WAT . H 4 HOH B 33 59 59 HOH WAT . H 4 HOH B 34 61 61 HOH WAT . H 4 HOH B 35 62 62 HOH WAT . H 4 HOH B 36 63 63 HOH WAT . H 4 HOH B 37 64 64 HOH WAT . H 4 HOH B 38 65 65 HOH WAT . H 4 HOH B 39 70 70 HOH WAT . H 4 HOH B 40 71 71 HOH WAT . H 4 HOH B 41 75 75 HOH WAT . H 4 HOH B 42 76 76 HOH WAT . H 4 HOH B 43 78 78 HOH WAT . H 4 HOH B 44 79 79 HOH WAT . H 4 HOH B 45 81 81 HOH WAT . H 4 HOH B 46 82 82 HOH WAT . H 4 HOH B 47 83 83 HOH WAT . H 4 HOH B 48 84 84 HOH WAT . H 4 HOH B 49 86 86 HOH WAT . H 4 HOH B 50 87 87 HOH WAT . H 4 HOH B 51 90 90 HOH WAT . H 4 HOH B 52 93 93 HOH WAT . H 4 HOH B 53 94 94 HOH WAT . H 4 HOH B 54 95 95 HOH WAT . H 4 HOH B 55 98 98 HOH WAT . H 4 HOH B 56 100 100 HOH WAT . H 4 HOH B 57 101 101 HOH WAT . H 4 HOH B 58 105 105 HOH WAT . H 4 HOH B 59 108 108 HOH WAT . H 4 HOH B 60 110 110 HOH WAT . H 4 HOH B 61 114 114 HOH WAT . H 4 HOH B 62 117 117 HOH WAT . H 4 HOH B 63 118 118 HOH WAT . H 4 HOH B 64 119 119 HOH WAT . H 4 HOH B 65 122 122 HOH WAT . H 4 HOH B 66 126 126 HOH WAT . H 4 HOH B 67 128 128 HOH WAT . H 4 HOH B 68 129 129 HOH WAT . H 4 HOH B 69 136 136 HOH WAT . H 4 HOH B 70 139 139 HOH WAT . H 4 HOH B 71 141 141 HOH WAT . H 4 HOH B 72 142 142 HOH WAT . H 4 HOH B 73 143 143 HOH WAT . H 4 HOH B 74 144 144 HOH WAT . H 4 HOH B 75 148 148 HOH WAT . H 4 HOH B 76 153 153 HOH WAT . H 4 HOH B 77 154 154 HOH WAT . H 4 HOH B 78 156 156 HOH WAT . H 4 HOH B 79 158 158 HOH WAT . H 4 HOH B 80 162 162 HOH WAT . H 4 HOH B 81 163 163 HOH WAT . H 4 HOH B 82 164 164 HOH WAT . H 4 HOH B 83 166 166 HOH WAT . H 4 HOH B 84 168 168 HOH WAT . H 4 HOH B 85 169 169 HOH WAT . H 4 HOH B 86 173 173 HOH WAT . H 4 HOH B 87 174 174 HOH WAT . H 4 HOH B 88 175 175 HOH WAT . H 4 HOH B 89 177 177 HOH WAT . H 4 HOH B 90 607 1 HOH WAT . H 4 HOH B 91 608 2 HOH WAT . H 4 HOH B 92 609 179 HOH WAT . H 4 HOH B 93 610 183 HOH WAT . H 4 HOH B 94 611 186 HOH WAT . H 4 HOH B 95 612 187 HOH WAT . H 4 HOH B 96 613 189 HOH WAT . H 4 HOH B 97 614 190 HOH WAT . H 4 HOH B 98 615 194 HOH WAT . H 4 HOH B 99 616 199 HOH WAT . H 4 HOH B 100 617 200 HOH WAT . H 4 HOH B 101 618 201 HOH WAT . H 4 HOH B 102 619 204 HOH WAT . H 4 HOH B 103 620 208 HOH WAT . H 4 HOH B 104 621 209 HOH WAT . H 4 HOH B 105 622 210 HOH WAT . H 4 HOH B 106 623 212 HOH WAT . H 4 HOH B 107 624 213 HOH WAT . H 4 HOH B 108 625 214 HOH WAT . H 4 HOH B 109 626 215 HOH WAT . H 4 HOH B 110 627 216 HOH WAT . H 4 HOH B 111 628 221 HOH WAT . H 4 HOH B 112 629 222 HOH WAT . H 4 HOH B 113 630 223 HOH WAT . H 4 HOH B 114 631 224 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id E _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 40.365 _atom_site.Cartn_y 40.005 _atom_site.Cartn_z 27.286 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 60.34 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 1 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 20 _model_server_stats.create_model_time_ms 12 _model_server_stats.query_time_ms 283 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #