data_3SUX # _model_server_result.job_id wXtXdJYfknSc7UZkD8TWkw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-20 15:21:53' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3sux # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":201}' # _entry.id 3SUX # _exptl.entry_id 3SUX _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 22.99 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'SODIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 3SUX _cell.length_a 126.173 _cell.length_b 126.173 _cell.length_c 149.222 _cell.Z_PDB 18 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3SUX _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 155 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'H 3 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 PISA dimeric 2 software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D 1 1 A,B,C,D 2 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 17_555 x-y+1/3,-y+2/3,-z+2/3 1 0 0 0 -1 0 0 0 -1 0 72.846016 99.481333 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A O3' U 100 X U 100 1_555 A P CCC 101 X CCC 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.605 ? hydrog TYPE_8_PAIR hydrog1 A N1 A 10 X A 10 1_555 A N1 G 88 X G 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_8_PAIR hydrog2 A N6 A 10 X A 10 1_555 A O6 G 88 X G 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A N1 G 11 X G 11 1_555 A N3 C 87 X C 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N2 G 11 X G 11 1_555 A O2 C 87 X C 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A O6 G 11 X G 11 1_555 A N4 C 87 X C 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A N1 G 12 X G 12 1_555 A N3 C 86 X C 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N2 G 12 X G 12 1_555 A O2 C 86 X C 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A O6 G 12 X G 12 1_555 A N4 C 86 X C 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A N3 U 13 X U 13 1_555 A N1 A 85 X A 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A O4 U 13 X U 13 1_555 A N6 A 85 X A 85 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N1 A 14 X A 14 1_555 A N3 U 84 X U 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A N6 A 14 X A 14 1_555 A O4 U 84 X U 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A N1 A 15 X A 15 1_555 A N3 U 83 X U 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A N6 A 15 X A 15 1_555 A O4 U 83 X U 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N1 A 16 X A 16 1_555 A N3 U 82 X U 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A N6 A 16 X A 16 1_555 A O4 U 82 X U 82 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N3 C 17 X C 17 1_555 A N1 G 81 X G 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A N4 C 17 X C 17 1_555 A O6 G 81 X G 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A O2 C 17 X C 17 1_555 A N2 G 81 X G 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A N1 G 18 X G 18 1_555 A N3 C 80 X C 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A N2 G 18 X G 18 1_555 A O2 C 80 X C 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A O6 G 18 X G 18 1_555 A N4 C 80 X C 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A N3 U 19 X U 19 1_555 A N1 A 79 X A 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A O4 U 19 X U 19 1_555 A N6 A 79 X A 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog25 A N1 G 20 X G 20 1_555 A O2 U 78 X U 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog26 A O6 G 20 X G 20 1_555 A N3 U 78 X U 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 A N3 C 21 X C 21 1_555 A N1 G 76 X G 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 A N4 C 21 X C 21 1_555 A O6 G 76 X G 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 A O2 C 21 X C 21 1_555 A N2 G 76 X G 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog30 A N2 G 22 X G 22 1_555 A N1 A 25 X A 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 A N1 G 22 X G 22 1_555 A N3 C 75 X C 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 A N2 G 22 X G 22 1_555 A O2 C 75 X C 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 A O6 G 22 X G 22 1_555 A N4 C 75 X C 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog34 A N3 U 23 X U 23 1_555 A O6 G 74 X G 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog35 A O2 U 23 X U 23 1_555 A N1 G 74 X G 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_5_PAIR hydrog36 A N6 A 26 X A 26 1_555 A N1 A 60 X A 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_5_PAIR hydrog37 A N7 A 26 X A 26 1_555 A N6 A 60 X A 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-G MISPAIR' hydrog38 A N1 A 26 X A 26 1_555 A N2 G 76 X G 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-G MISPAIR' hydrog39 A O6 G 27 X G 27 1_555 A N1 G 59 X G 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_8_PAIR hydrog40 A N1 G 29 X G 29 1_555 A N1 A 57 X A 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_8_PAIR hydrog41 A O6 G 29 X G 29 1_555 A N6 A 57 X A 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 A N3 C 30 X C 30 1_555 A N1 G 56 X G 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 A N4 C 30 X C 30 1_555 A O6 G 56 X G 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 A O2 C 30 X C 30 1_555 A N2 G 56 X G 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 A N3 C 31 X C 31 1_555 A N1 G 55 X G 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 A N4 C 31 X C 31 1_555 A O6 G 55 X G 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 A O2 C 31 X C 31 1_555 A N2 G 55 X G 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 A N3 U 32 X U 32 1_555 A N1 A 54 X A 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 A O4 U 32 X U 32 1_555 A N6 A 54 X A 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 A N1 G 33 X G 33 1_555 A N3 C 53 X C 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 A N2 G 33 X G 33 1_555 A O2 C 53 X C 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 A O6 G 33 X G 33 1_555 A N4 C 53 X C 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 A N1 A 34 X A 34 1_555 A N3 U 52 X U 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 A N6 A 34 X A 34 1_555 A O4 U 52 X U 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 A N1 G 35 X G 35 1_555 A N3 C 51 X C 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 A N2 G 35 X G 35 1_555 A O2 C 51 X C 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 A O6 G 35 X G 35 1_555 A N4 C 51 X C 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 A N1 G 36 X G 36 1_555 A N3 C 50 X C 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 A N2 G 36 X G 36 1_555 A O2 C 50 X C 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 A O6 G 36 X G 36 1_555 A N4 C 50 X C 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog61 A N1 G 37 X G 37 1_555 A O2 U 49 X U 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog62 A O6 G 37 X G 37 1_555 A N3 U 49 X U 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-U PAIR' hydrog63 A N1 A 38 X A 38 1_555 A N3 U 47 X U 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-U MISPAIR' hydrog64 A N3 C 39 X C 39 1_555 A N3 U 46 X U 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 A N1 G 41 X G 41 1_555 A N3 C 94 X C 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 A N2 G 41 X G 41 1_555 A O2 C 94 X C 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 A O6 G 41 X G 41 1_555 A N4 C 94 X C 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog68 A N1 G 42 X G 42 1_555 A O2 U 93 X U 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog69 A O6 G 42 X G 42 1_555 A N3 U 93 X U 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 A N1 G 43 X G 43 1_555 A N3 C 92 X C 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 A N2 G 43 X G 43 1_555 A O2 C 92 X C 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 A O6 G 43 X G 43 1_555 A N4 C 92 X C 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-U PAIR' hydrog73 A N6 A 44 X A 44 1_555 A O4 U 91 X U 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-G MISPAIR' hydrog74 A N3 A 61 X A 61 1_555 A N2 G 74 X G 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 A N3 C 62 X C 62 1_555 A N1 G 73 X G 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 A N4 C 62 X C 62 1_555 A O6 G 73 X G 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 A O2 C 62 X C 62 1_555 A N2 G 73 X G 73 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 A N1 A 63 X A 63 1_555 A N3 U 72 X U 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 A N6 A 63 X A 63 1_555 A O4 U 72 X U 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 A N3 C 64 X C 64 1_555 A N1 G 71 X G 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 A N4 C 64 X C 64 1_555 A O6 G 71 X G 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog82 A O2 C 64 X C 64 1_555 A N2 G 71 X G 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog83 A N3 C 65 X C 65 1_555 A N1 G 70 X G 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog84 A N4 C 65 X C 65 1_555 A O6 G 70 X G 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog85 A O2 C 65 X C 65 1_555 A N2 G 70 X G 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog86 A N2 G 66 X G 66 1_555 A N7 A 69 X A 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Na 1' _chem_comp.formula_weight 22.99 _chem_comp.id NA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'SODIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 3SUX _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007926 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.004576 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009152 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006701 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 NA X 1 201 201 NA NA . C 3 THF X 1 103 103 THF THF . D 4 HOH X 1 102 1 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol NA _atom_site.label_atom_id NA _atom_site.label_comp_id NA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id B _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 6.236 _atom_site.Cartn_y 26.944 _atom_site.Cartn_z 65.54 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 90.59 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id NA _atom_site.auth_comp_id NA _atom_site.auth_seq_id 201 _atom_site.auth_asym_id X _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 6 _model_server_stats.parse_time_ms 6 _model_server_stats.create_model_time_ms 2 _model_server_stats.query_time_ms 250 _model_server_stats.encode_time_ms 10 _model_server_stats.element_count 1 #