data_3TCX # _model_server_result.job_id b5VKb0Sw-dAWOyvdQAIKug _model_server_result.datetime_utc '2025-03-04 21:59:28' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3tcx # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"LA","auth_seq_id":901}' # _entry.id 3TCX # _exptl.entry_id 3TCX _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 14 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3TCX _cell.length_a 104.041 _cell.length_b 166.334 _cell.length_c 299.372 _cell.Z_PDB 56 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3TCX _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 3 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 4 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 5 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 6 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 7 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 8 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 9 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 10 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 11 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 12 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 13 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 14 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,CA 1 1 C,D,DA 2 1 E,F,EA 3 1 G,H,FA 4 1 I,J,GA 5 1 K,L,HA 6 1 M,N,IA 7 1 O,P,JA 8 1 Q,R,KA 9 1 S,T,LA 10 1 U,V,MA 11 1 W,X,NA 12 1 Y,Z,OA 13 1 AA,BA,PA 14 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 CA N N ? 3 DA N N ? 3 EA N N ? 3 FA N N ? 3 GA N N ? 3 HA N N ? 3 IA N N ? 3 JA N N ? 3 KA N N ? 3 LA N N ? 3 MA N N ? 3 NA N N ? 3 OA N N ? 3 PA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 21 A CYS 21 1_555 A SG CYS 65 A CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 25 A CYS 25 1_555 A SG CYS 69 A CYS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf3 C SG CYS 21 C CYS 21 1_555 C SG CYS 65 C CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? disulf ? disulf4 C SG CYS 25 C CYS 25 1_555 C SG CYS 69 C CYS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? disulf ? disulf5 E SG CYS 21 E CYS 21 1_555 E SG CYS 65 E CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? disulf ? disulf6 E SG CYS 25 E CYS 25 1_555 E SG CYS 69 E CYS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? disulf ? disulf7 G SG CYS 21 G CYS 21 1_555 G SG CYS 65 G CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf8 G SG CYS 25 G CYS 25 1_555 G SG CYS 69 G CYS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? disulf ? disulf9 I SG CYS 21 I CYS 21 1_555 I SG CYS 65 I CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf10 I SG CYS 25 I CYS 25 1_555 I SG CYS 69 I CYS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf11 K SG CYS 21 K CYS 21 1_555 K SG CYS 65 K CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? disulf ? disulf12 K SG CYS 25 K CYS 25 1_555 K SG CYS 69 K CYS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf13 M SG CYS 21 M CYS 21 1_555 M SG CYS 65 M CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf14 M SG CYS 25 M CYS 25 1_555 M SG CYS 69 M CYS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? disulf ? disulf15 O SG CYS 21 O CYS 21 1_555 O SG CYS 65 O CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf16 O SG CYS 25 O CYS 25 1_555 O SG CYS 69 O CYS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf17 Q SG CYS 21 Q CYS 21 1_555 Q SG CYS 65 Q CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? disulf ? disulf18 Q SG CYS 25 Q CYS 25 1_555 Q SG CYS 69 Q CYS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf19 S SG CYS 21 S CYS 21 1_555 S SG CYS 65 S CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? disulf ? disulf20 S SG CYS 25 S CYS 25 1_555 S SG CYS 69 S CYS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf21 U SG CYS 21 U CYS 21 1_555 U SG CYS 65 U CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? disulf ? disulf22 U SG CYS 25 U CYS 25 1_555 U SG CYS 69 U CYS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? disulf ? disulf23 W SG CYS 21 W CYS 21 1_555 W SG CYS 65 W CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf24 W SG CYS 25 W CYS 25 1_555 W SG CYS 69 W CYS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? disulf ? disulf25 Y SG CYS 21 Y CYS 21 1_555 Y SG CYS 65 Y CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf26 Y SG CYS 25 Y CYS 25 1_555 Y SG CYS 69 Y CYS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? disulf ? disulf27 AA SG CYS 21 a CYS 21 1_555 AA SG CYS 65 a CYS 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf28 AA SG CYS 25 a CYS 25 1_555 AA SG CYS 69 a CYS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? metalc ? metalc1 A OE2 GLU 34 A GLU 34 1_555 CA MG MG . B MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.962 ? metalc ? metalc2 B OG SER 12 B SER 139 1_555 CA MG MG . B MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? metalc ? metalc3 B OG SER 14 B SER 141 1_555 CA MG MG . B MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.855 ? metalc ? metalc4 B OG1 THR 79 B THR 206 1_555 CA MG MG . B MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.191 ? metalc ? metalc5 C OE2 GLU 34 C GLU 34 1_555 DA MG MG . D MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.964 ? metalc ? metalc6 D OG SER 12 D SER 139 1_555 DA MG MG . D MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.63 ? metalc ? metalc7 D OG SER 14 D SER 141 1_555 DA MG MG . D MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.88 ? metalc ? metalc8 D OG1 THR 79 D THR 206 1_555 DA MG MG . D MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.235 ? metalc ? metalc9 F OG SER 12 F SER 139 1_555 EA MG MG . F MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.605 ? metalc ? metalc10 F OG SER 14 F SER 141 1_555 EA MG MG . F MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.996 ? metalc ? metalc11 F OG1 THR 79 F THR 206 1_555 EA MG MG . F MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.12 ? metalc ? metalc12 H OG SER 12 H SER 139 1_555 FA MG MG . H MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.526 ? metalc ? metalc13 H OG SER 14 H SER 141 1_555 FA MG MG . H MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.853 ? metalc ? metalc14 H OG1 THR 79 H THR 206 1_555 FA MG MG . H MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.13 ? metalc ? metalc15 I OE2 GLU 34 I GLU 34 1_555 GA MG MG . J MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.85 ? metalc ? metalc16 J OG SER 12 J SER 139 1_555 GA MG MG . J MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.51 ? metalc ? metalc17 J OG SER 14 J SER 141 1_555 GA MG MG . J MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.833 ? metalc ? metalc18 J OG1 THR 79 J THR 206 1_555 GA MG MG . J MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? metalc ? metalc19 K OE2 GLU 34 K GLU 34 1_555 HA MG MG . L MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.614 ? metalc ? metalc20 L OG SER 12 L SER 139 1_555 HA MG MG . L MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? metalc ? metalc21 L OG SER 14 L SER 141 1_555 HA MG MG . L MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.805 ? metalc ? metalc22 L OG1 THR 79 L THR 206 1_555 HA MG MG . L MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.164 ? metalc ? metalc23 M OE2 GLU 34 M GLU 34 1_555 IA MG MG . N MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.786 ? metalc ? metalc24 N OG SER 12 N SER 139 1_555 IA MG MG . N MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? metalc ? metalc25 N OG SER 14 N SER 141 1_555 IA MG MG . N MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.848 ? metalc ? metalc26 N OG1 THR 79 N THR 206 1_555 IA MG MG . N MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.966 ? metalc ? metalc27 O OE2 GLU 34 O GLU 34 1_555 JA MG MG . P MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.889 ? metalc ? metalc28 P OG SER 12 P SER 139 1_555 JA MG MG . P MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.53 ? metalc ? metalc29 P OG SER 14 P SER 141 1_555 JA MG MG . P MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.893 ? metalc ? metalc30 P OG1 THR 79 P THR 206 1_555 JA MG MG . P MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? metalc ? metalc31 Q OE2 GLU 34 Q GLU 34 1_555 KA MG MG . R MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? metalc ? metalc32 R OG SER 12 R SER 139 1_555 KA MG MG . R MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? metalc ? metalc33 R OG SER 14 R SER 141 1_555 KA MG MG . R MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.898 ? metalc ? metalc34 R OG1 THR 79 R THR 206 1_555 KA MG MG . R MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? metalc ? metalc35 S OE2 GLU 34 S GLU 34 1_555 LA MG MG . T MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.97 ? metalc ? metalc36 T OG SER 12 T SER 139 1_555 LA MG MG . T MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.53 ? metalc ? metalc37 T OG SER 14 T SER 141 1_555 LA MG MG . T MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.888 ? metalc ? metalc38 T OG1 THR 79 T THR 206 1_555 LA MG MG . T MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? metalc ? metalc39 U OE2 GLU 34 U GLU 34 1_555 MA MG MG . V MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.826 ? metalc ? metalc40 V OG SER 12 V SER 139 1_555 MA MG MG . V MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? metalc ? metalc41 V OG SER 14 V SER 141 1_555 MA MG MG . V MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.918 ? metalc ? metalc42 V OG1 THR 79 V THR 206 1_555 MA MG MG . V MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.206 ? metalc ? metalc43 W OE2 GLU 34 W GLU 34 1_555 NA MG MG . X MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.893 ? metalc ? metalc44 X OG SER 12 X SER 139 1_555 NA MG MG . X MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? metalc ? metalc45 X OG SER 14 X SER 141 1_555 NA MG MG . X MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.877 ? metalc ? metalc46 X OG1 THR 79 X THR 206 1_555 NA MG MG . X MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.122 ? metalc ? metalc47 Z OG SER 12 Z SER 139 1_555 OA MG MG . Z MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.575 ? metalc ? metalc48 Z OG SER 14 Z SER 141 1_555 OA MG MG . Z MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.774 ? metalc ? metalc49 Z OG1 THR 79 Z THR 206 1_555 OA MG MG . Z MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? metalc ? metalc50 BA OG SER 12 b SER 139 1_555 PA MG MG . b MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? metalc ? metalc51 BA OG SER 14 b SER 141 1_555 PA MG MG . b MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.859 ? metalc ? metalc52 BA OG1 THR 79 b THR 206 1_555 PA MG MG . b MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 3TCX _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009612 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006012 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00334 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code CA 3 MG B 1 901 901 MG MG . DA 3 MG D 1 901 901 MG MG . EA 3 MG F 1 901 901 MG MG . FA 3 MG H 1 901 901 MG MG . GA 3 MG J 1 901 901 MG MG . HA 3 MG L 1 901 901 MG MG . IA 3 MG N 1 901 901 MG MG . JA 3 MG P 1 901 901 MG MG . KA 3 MG R 1 901 901 MG MG . LA 3 MG T 1 901 901 MG MG . MA 3 MG V 1 901 901 MG MG . NA 3 MG X 1 901 901 MG MG . OA 3 MG Z 1 901 901 MG MG . PA 3 MG b 1 901 901 MG MG . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id LA _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 21.139 _atom_site.Cartn_y -34.932 _atom_site.Cartn_z 29.2 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 84.93 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 901 _atom_site.auth_asym_id T _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 66 _model_server_stats.parse_time_ms 18 _model_server_stats.create_model_time_ms 32 _model_server_stats.query_time_ms 320 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #