data_3TLR
#
_model_server_result.job_id            1Rwi_a4xdcw7kFRx4Y1SAA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-14 14:27:47' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3tlr 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"O","auth_seq_id":100}' 
#
_entry.id    3TLR 
#
_exptl.entry_id    3TLR 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              112.411 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CADMIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    10 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            3TLR 
_cell.length_a            29.93 
_cell.length_b            98.2 
_cell.length_c            142.38 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3TLR 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 E N N 
? 2 F N N 
? 2 G N N 
? 2 I N N 
? 2 J N N 
? 2 K N N 
? 2 L N N 
? 2 N N N 
? 2 O N N 
? 2 P N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 21 A CYS 20 1_555 D SG CYS 21 D CYS 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 26 A CYS 25 1_555 A SG CYS 81 A CYS 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf3 B SG CYS 21 B CYS 20 1_555 C SG CYS 21 C CYS 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf4 B SG CYS 26 B CYS 25 1_555 B SG CYS 81 B CYS 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? 
disulf ? disulf5 C SG CYS 26 C CYS 25 1_555 C SG CYS 81 C CYS 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? 
disulf ? disulf6 D SG CYS 26 D CYS 25 1_555 D SG CYS 81 D CYS 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? 
metalc ? metalc1 A O MET 1 A MET 0 1_555 E CD CD . A CD 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? 
metalc ? metalc2 A N MET 1 A MET 0 1_555 E CD CD . A CD 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? 
metalc ? metalc3 A NE2 HIS 14 A HIS 13 1_555 P CD CD . D CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? 
metalc ? metalc4 A OE2 GLU 17 A GLU 16 1_555 G CD CD . A CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? 
metalc ? metalc5 A NE2 HIS 32 A HIS 31 1_555 E CD CD . A CD 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? 
metalc ? metalc6 A OD2 ASP 35 A ASP 34 1_555 N CD CD . C CD 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? 
metalc ? metalc7 A OD1 ASP 35 A ASP 34 1_555 N CD CD . C CD 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.588 ? 
metalc ? metalc8 A OE1 GLU 51 A GLU 50 1_555 F CD CD . A CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? 
metalc ? metalc9 A OE2 GLU 51 A GLU 50 1_555 F CD CD . A CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.636 ? 
metalc ? metalc10 A OE1 GLU 70 A GLU 69 1_555 F CD CD . A CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? 
metalc ? metalc11 E CD CD . A CD 100 1_555 C OD2 ASP 35 C ASP 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? 
metalc ? metalc12 E CD CD . A CD 100 1_555 S O HOH . C HOH 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.119 ? 
metalc ? metalc13 F CD CD . A CD 101 1_555 D NE2 HIS 14 D HIS 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? 
metalc ? metalc14 Q O HOH . A HOH 112 1_555 N CD CD . C CD 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? 
metalc ? metalc15 B N MET 1 B MET 0 1_555 J CD CD . B CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.237 ? 
metalc ? metalc16 B O MET 1 B MET 0 1_555 J CD CD . B CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? 
metalc ? metalc17 B NE2 HIS 14 B HIS 13 1_555 I CD CD . B CD 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.633 ? 
metalc ? metalc18 B OE1 GLU 17 B GLU 16 1_555 L CD CD . B CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? 
metalc ? metalc19 B OE2 GLU 17 B GLU 16 1_555 L CD CD . B CD 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.428 ? 
metalc ? metalc20 B NE2 HIS 32 B HIS 31 1_555 J CD CD . B CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? 
metalc ? metalc21 B OD2 ASP 35 B ASP 34 1_555 O CD CD . D CD 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? 
metalc ? metalc22 B OE2 GLU 48 B GLU 47 1_555 K CD CD . B CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? 
metalc ? metalc23 B OE1 GLU 70 B GLU 69 1_555 K CD CD . B CD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? 
metalc ? metalc24 B OD1 ASP 97 B ASP 96 1_555 M NA NA . B NA 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.38 ? 
metalc ? metalc25 B OD2 ASP 97 B ASP 96 1_555 M NA NA . B NA 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? 
metalc ? metalc26 I CD CD . B CD 100 1_555 R O HOH . B HOH 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? 
metalc ? metalc27 I CD CD . B CD 100 1_555 C OE1 GLU 70 C GLU 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? 
metalc ? metalc28 J CD CD . B CD 101 1_555 D OD2 ASP 35 D ASP 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? 
metalc ? metalc29 J CD CD . B CD 101 1_555 D OD1 ASP 35 D ASP 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.662 ? 
metalc ? metalc30 J CD CD . B CD 101 1_555 T O HOH . D HOH 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? 
metalc ? metalc31 K CD CD . B CD 102 1_555 C NE2 HIS 14 C HIS 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? 
metalc ? metalc32 K CD CD . B CD 102 1_555 S O HOH . C HOH 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.606 ? 
metalc ? metalc33 C O MET 1 C MET 0 1_555 N CD CD . C CD 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? 
metalc ? metalc34 C N MET 1 C MET 0 1_555 N CD CD . C CD 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? 
metalc ? metalc35 C NE2 HIS 32 C HIS 31 1_555 N CD CD . C CD 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? 
metalc ? metalc36 D O MET 1 D MET 0 1_555 O CD CD . D CD 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? 
metalc ? metalc37 D N MET 1 D MET 0 1_555 O CD CD . D CD 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.477 ? 
metalc ? metalc38 D NE2 HIS 32 D HIS 31 1_555 O CD CD . D CD 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? 
metalc ? metalc39 D OE2 GLU 51 D GLU 50 1_555 P CD CD . D CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? 
metalc ? metalc40 D OE1 GLU 51 D GLU 50 1_555 P CD CD . D CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.676 ? 
metalc ? metalc41 D OE1 GLU 70 D GLU 69 1_555 P CD CD . D CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? 
metalc ? metalc42 D OE2 GLU 70 D GLU 69 1_555 P CD CD . D CD 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.557 ? 
#
_chem_comp.formula           'Cd 2' 
_chem_comp.formula_weight    112.411 
_chem_comp.id                CD 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CADMIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     3TLR 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.033411 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.010183 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007023 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 CD A 1 100 4 CD CD . 
F 2 CD A 1 101 8 CD CD . 
G 2 CD A 1 102 10 CD CD . 
H 3 NA A 1 103 2 NA NA . 
I 2 CD B 1 100 2 CD CD . 
J 2 CD B 1 101 3 CD CD . 
K 2 CD B 1 102 7 CD CD . 
L 2 CD B 1 103 9 CD CD . 
M 3 NA B 1 104 1 NA NA . 
N 2 CD C 1 100 1 CD CD . 
O 2 CD D 1 100 5 CD CD . 
P 2 CD D 1 101 6 CD CD . 
Q 4 HOH A 1 104 2 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 2 105 3 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 3 106 4 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 4 107 9 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 5 108 10 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 6 109 11 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 7 110 12 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 8 111 13 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 9 112 26 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 10 113 30 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 11 114 32 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 12 115 37 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 13 116 38 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 14 118 43 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 15 119 44 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 16 120 45 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 17 121 46 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 18 122 63 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 19 123 64 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 20 124 65 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 21 125 72 HOH HOH . 
R 4 HOH B 1 105 1 HOH HOH . 
R 4 HOH B 2 106 5 HOH HOH . 
R 4 HOH B 3 107 14 HOH HOH . 
R 4 HOH B 4 108 15 HOH HOH . 
R 4 HOH B 5 109 29 HOH HOH . 
R 4 HOH B 6 110 40 HOH HOH . 
R 4 HOH B 7 111 41 HOH HOH . 
R 4 HOH B 8 112 47 HOH HOH . 
R 4 HOH B 9 113 48 HOH HOH . 
R 4 HOH B 10 114 49 HOH HOH . 
R 4 HOH B 11 115 50 HOH HOH . 
R 4 HOH B 12 116 52 HOH HOH . 
R 4 HOH B 13 117 53 HOH HOH . 
R 4 HOH B 14 118 56 HOH HOH . 
R 4 HOH B 15 119 57 HOH HOH . 
R 4 HOH B 16 120 58 HOH HOH . 
R 4 HOH B 17 121 67 HOH HOH . 
R 4 HOH B 18 122 73 HOH HOH . 
R 4 HOH B 19 123 74 HOH HOH . 
R 4 HOH B 20 124 78 HOH HOH . 
S 4 HOH C 1 101 6 HOH HOH . 
S 4 HOH C 2 102 16 HOH HOH . 
S 4 HOH C 3 103 17 HOH HOH . 
S 4 HOH C 4 104 18 HOH HOH . 
S 4 HOH C 5 105 19 HOH HOH . 
S 4 HOH C 6 106 20 HOH HOH . 
S 4 HOH C 7 107 25 HOH HOH . 
S 4 HOH C 8 108 28 HOH HOH . 
S 4 HOH C 9 109 39 HOH HOH . 
S 4 HOH C 10 110 59 HOH HOH . 
S 4 HOH C 11 111 60 HOH HOH . 
S 4 HOH C 12 112 61 HOH HOH . 
S 4 HOH C 13 113 75 HOH HOH . 
S 4 HOH C 14 114 80 HOH HOH . 
S 4 HOH C 15 117 42 HOH HOH . 
T 4 HOH D 1 102 7 HOH HOH . 
T 4 HOH D 2 103 8 HOH HOH . 
T 4 HOH D 3 104 21 HOH HOH . 
T 4 HOH D 4 105 22 HOH HOH . 
T 4 HOH D 5 106 23 HOH HOH . 
T 4 HOH D 6 107 24 HOH HOH . 
T 4 HOH D 7 108 27 HOH HOH . 
T 4 HOH D 8 109 31 HOH HOH . 
T 4 HOH D 9 110 33 HOH HOH . 
T 4 HOH D 10 111 34 HOH HOH . 
T 4 HOH D 11 112 35 HOH HOH . 
T 4 HOH D 12 113 36 HOH HOH . 
T 4 HOH D 13 114 54 HOH HOH . 
T 4 HOH D 14 115 55 HOH HOH . 
T 4 HOH D 15 116 62 HOH HOH . 
T 4 HOH D 16 117 68 HOH HOH . 
T 4 HOH D 17 118 69 HOH HOH . 
T 4 HOH D 18 119 70 HOH HOH . 
T 4 HOH D 19 120 71 HOH HOH . 
T 4 HOH D 20 121 76 HOH HOH . 
T 4 HOH D 21 122 79 HOH HOH . 
T 4 HOH D 22 126 77 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CD 
_atom_site.label_atom_id         CD 
_atom_site.label_comp_id         CD 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         O 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               -3.574 
_atom_site.Cartn_y               -23.129 
_atom_site.Cartn_z               -54.822 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        57.43 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          CD 
_atom_site.auth_comp_id          CD 
_atom_site.auth_seq_id           100 
_atom_site.auth_asym_id          D 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              8 
_model_server_stats.parse_time_ms           10 
_model_server_stats.create_model_time_ms    14 
_model_server_stats.query_time_ms           314 
_model_server_stats.encode_time_ms          12 
_model_server_stats.element_count           1 
#