data_3TXF
#
_model_server_result.job_id            EdvX7y4rKBkyEgNTVpMKDw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-19 23:50:47' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3txf 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"AA","auth_seq_id":146}' 
#
_entry.id    3TXF 
#
_exptl.entry_id    3TXF 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              92.094 
_entity.id                          6 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            GLYCEROL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    21 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            3TXF 
_cell.length_a            78.443 
_cell.length_b            78.443 
_cell.length_c            36.971 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3TXF 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        96 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 43 21 2' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    monomeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      1 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 6 S N N 
? 6 T N N 
? 6 U N N 
? 6 V N N 
? 6 W N N 
? 6 X N N 
? 6 Y N N 
? 6 Z N N 
? 6 AA N N 
? 6 BA N N 
? 6 KA N N 
? 6 LA N N 
? 6 MA N N 
? 6 NA N N 
? 6 OA N N 
? 6 PA N N 
? 6 QA N N 
? 6 RA N N 
? 6 SA N N 
? 6 TA N N 
? 6 UA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 6 A CYS 6 1_555 A SG CYS 127 A CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.998 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 30 A CYS 30 1_555 A SG CYS 115 A CYS 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? 
disulf ? disulf3 A SG CYS 64 A CYS 64 1_555 A SG CYS 80 A CYS 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf4 A SG CYS 76 A CYS 76 1_555 A SG CYS 94 A CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? 
metalc ? metalc1 A ND1 HIS 15 A HIS 15 1_555 J PT1 CPT . A CPT 130 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? 
metalc ? metalc2 A O SER 60 A SER 60 1_555 I NA NA . A NA 1138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? 
metalc ? metalc3 A O CYS 64 A CYS 64 1_555 I NA NA . A NA 1138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? 
metalc ? metalc4 A OG SER 72 A SER 72 1_555 I NA NA . A NA 1138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.57 ? 
metalc ? metalc5 A O ARG 73 A ARG 73 1_555 I NA NA . A NA 1138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? 
metalc ? metalc6 CA O DMS . A DMS 148 1_555 I NA NA . A NA 1138 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.117 ? 
#
_chem_comp.formula           'C3 H8 O3' 
_chem_comp.formula_weight    92.094 
_chem_comp.id                GOL 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              GLYCEROL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     GLYCERIN;PROPANE-1,2,3-TRIOL 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 GOL sing 148 n n 
C1 C2 GOL sing 149 n n 
C1 H11 GOL sing 150 n n 
C1 H12 GOL sing 151 n n 
O1 HO1 GOL sing 152 n n 
C2 O2 GOL sing 153 n n 
C2 C3 GOL sing 154 n n 
C2 H2 GOL sing 155 n n 
O2 HO2 GOL sing 156 n n 
C3 O3 GOL sing 157 n n 
C3 H31 GOL sing 158 n n 
C3 H32 GOL sing 159 n n 
O3 HO3 GOL sing 160 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     3TXF 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.012748 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.012748 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.027048 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 CL A 1 1130 1130 CL CL . 
C 2 CL A 1 1131 1131 CL CL . 
D 2 CL A 1 1132 1132 CL CL . 
E 2 CL A 1 1134 1134 CL CL . 
F 2 CL A 1 1135 1135 CL CL . 
G 2 CL A 1 1136 1136 CL CL . 
H 2 CL A 1 1137 1137 CL CL . 
I 3 NA A 1 1138 1138 NA NA . 
J 4 CPT A 1 130 1 CPT CPT . 
K 5 DMS A 1 131 1 DMS DMS . 
L 5 DMS A 1 132 1 DMS DMS . 
M 5 DMS A 1 133 1 DMS DMS . 
N 5 DMS A 1 134 1 DMS DMS . 
O 5 DMS A 1 135 1 DMS DMS . 
P 5 DMS A 1 136 1 DMS DMS . 
Q 5 DMS A 1 137 1 DMS DMS . 
R 5 DMS A 1 138 1 DMS DMS . 
S 6 GOL A 1 801 801 GOL GOL . 
T 6 GOL A 1 139 801 GOL GOL . 
U 6 GOL A 1 140 801 GOL GOL . 
V 6 GOL A 1 141 801 GOL GOL . 
W 6 GOL A 1 142 801 GOL GOL . 
X 6 GOL A 1 143 801 GOL GOL . 
Y 6 GOL A 1 144 801 GOL GOL . 
Z 6 GOL A 1 145 801 GOL GOL . 
AA 6 GOL A 1 146 801 GOL GOL . 
BA 6 GOL A 1 147 801 GOL GOL . 
CA 5 DMS A 1 148 1 DMS DMS . 
DA 5 DMS A 1 149 1 DMS DMS . 
EA 5 DMS A 1 150 1 DMS DMS . 
FA 5 DMS A 1 151 1 DMS DMS . 
GA 5 DMS A 1 152 1 DMS DMS . 
HA 5 DMS A 1 153 1 DMS DMS . 
IA 5 DMS A 1 154 1 DMS DMS . 
JA 5 DMS A 1 155 1 DMS DMS . 
KA 6 GOL A 1 156 801 GOL GOL . 
LA 6 GOL A 1 157 801 GOL GOL . 
MA 6 GOL A 1 158 801 GOL GOL . 
NA 6 GOL A 1 159 801 GOL GOL . 
OA 6 GOL A 1 160 801 GOL GOL . 
PA 6 GOL A 1 161 801 GOL GOL . 
QA 6 GOL A 1 162 801 GOL GOL . 
RA 6 GOL A 1 163 801 GOL GOL . 
SA 6 GOL A 1 164 801 GOL GOL . 
TA 6 GOL A 1 165 801 GOL GOL . 
UA 6 GOL A 1 166 801 GOL GOL . 
VA 7 HOH A 1 2001 2001 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 2 2003 2003 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 3 2004 2004 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 4 2006 2006 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 5 2008 2008 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 6 2009 2009 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 7 2010 2010 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 8 2011 2011 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 9 2012 2012 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 10 2013 2013 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 11 2015 2015 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 12 2018 2018 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 13 2020 2020 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 14 2021 2021 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 15 2024 2024 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 16 2025 2025 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 17 2027 2027 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 18 2028 2028 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 19 2029 2029 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 20 2030 2030 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 21 2031 2031 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 22 2032 2032 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 23 2033 2033 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 24 2034 2034 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 25 2035 2035 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 26 2036 2036 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 27 2037 2037 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 28 2038 2038 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 29 2039 2039 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 30 2041 2041 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 31 2042 2042 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 32 2043 2043 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 33 2044 2044 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 34 2045 2045 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 35 2046 2046 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 36 2047 2047 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 37 2048 2048 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 38 2049 2049 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 39 2050 2050 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 40 2051 2051 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 41 2055 2055 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 42 2057 2057 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 43 2058 2058 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 44 2062 2062 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 45 2064 2064 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 46 2065 2065 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 47 2066 2066 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 48 2067 2067 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 49 2068 2068 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 50 2069 2069 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 51 2072 2072 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 52 2073 2073 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 53 2074 2074 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 54 2075 2075 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 55 2076 2076 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 56 2078 2078 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 57 2079 2079 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 58 2081 2081 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 59 2083 2083 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 60 2084 2084 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 61 2085 2085 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 62 2086 2086 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 63 2087 2087 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 64 2088 2088 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 65 2090 2090 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 66 2091 2091 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 67 2092 2092 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 68 2093 2093 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 69 2094 2094 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 70 2095 2095 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 71 2096 2096 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 72 2097 2097 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 73 2098 2098 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 74 2099 2099 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 75 2101 2101 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 76 2102 2102 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 77 2103 2103 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 78 2108 2108 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 79 2109 2109 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 80 2110 2110 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 81 2111 2111 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 82 2112 2112 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 83 2113 2113 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 84 2114 2114 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 85 2115 2115 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 86 2116 2116 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 87 2117 2117 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 88 2118 2118 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 89 2119 2119 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 90 2120 2120 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 91 2121 2121 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 92 2122 2122 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 93 2123 2123 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 94 2124 2124 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 95 2125 2125 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 96 2127 2127 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 97 2128 2128 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 98 2129 2129 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 99 2130 2130 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 100 2131 2131 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 101 2133 2133 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 102 2134 2134 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 103 2135 2135 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 104 2136 2136 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 105 2138 2138 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 106 2139 2139 HOH HOH . 
VA 7 HOH A 107 2141 2141 HOH HOH . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 GOL . . . AA 6 -28.491 -15.952 -15.538 1 95.28 ? C1 GOL 146 A 1 
HETATM 2 O O1 GOL . . . AA 6 -27.796 -17.148 -15.243 1 95.46 ? O1 GOL 146 A 1 
HETATM 3 C C2 GOL . . . AA 6 -27.752 -15.068 -16.546 1 95.29 ? C2 GOL 146 A 1 
HETATM 4 O O2 GOL . . . AA 6 -27.174 -13.958 -15.889 1 94.22 ? O2 GOL 146 A 1 
HETATM 5 C C3 GOL . . . AA 6 -28.74 -14.537 -17.581 1 95.53 ? C3 GOL 146 A 1 
HETATM 6 O O3 GOL . . . AA 6 -28.343 -14.852 -18.901 1 96.36 ? O3 GOL 146 A 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              8 
_model_server_stats.parse_time_ms           7 
_model_server_stats.create_model_time_ms    8 
_model_server_stats.query_time_ms           306 
_model_server_stats.encode_time_ms          3 
_model_server_stats.element_count           6 
#