data_3TZL
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_model_server_result.job_id            vfq_CXmjxq2jJkG0k798mA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-25 20:31:56' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3tzl 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"L","auth_seq_id":333}' 
#
_entry.id    3TZL 
#
_exptl.entry_id    3TZL 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              22.99 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'SODIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            3TZL 
_cell.length_a            66.777 
_cell.length_b            50.629 
_cell.length_c            105.915 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3TZL 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 H N N 
? 5 L N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A C MSE 4 A MSE 1 1_555 A N ARG 5 A ARG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale2 A C GLN 27 A GLN 24 1_555 A N MSE 28 A MSE 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale3 A C MSE 28 A MSE 25 1_555 A N VAL 29 A VAL 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? 
covale ? covale4 A C GLN 36 A GLN 33 1_555 A N MSE 37 A MSE 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? 
covale ? covale5 A C MSE 37 A MSE 34 1_555 A N PHE 38 A PHE 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale6 A C PHE 38 A PHE 35 1_555 A N MSE 39 A MSE 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale7 A C MSE 39 A MSE 36 1_555 A N PHE 40 A PHE 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale8 A C ALA 46 A ALA 43 1_555 A N MSE 47 A MSE 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale9 A C MSE 47 A MSE 44 1_555 A N THR 48 A THR 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale10 A C VAL 88 A VAL 85 1_555 A N MSE 89 A MSE 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale11 A C MSE 89 A MSE 86 1_555 A N GLU 90 A GLU 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.319 ? 
covale ? covale12 A C PRO 100 A PRO 97 1_555 A N MSE 101 A MSE 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale13 A C MSE 101 A MSE 98 1_555 A N GLY 102 A GLY 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale14 A C LEU 130 A LEU 127 1_555 A N MSE 131 A MSE 128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale15 A C MSE 131 A MSE 128 1_555 A N ALA 132 A ALA 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale16 A C LYS 192 A LYS 189 1_555 A N MSE 193 A MSE 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale17 A C MSE 193 A MSE 190 1_555 A N SER 194 A SER 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale18 A C LYS 312 A LYS 309 1_555 A N MSE 313 A MSE 310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale19 A C MSE 313 A MSE 310 1_555 A N GLN 314 A GLN 311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale20 B C ALA 3 B ALA 0 1_555 B N MSE 4 B MSE 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale21 B C MSE 4 B MSE 1 1_555 B N ARG 5 B ARG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale22 B C GLN 27 B GLN 24 1_555 B N MSE 28 B MSE 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale23 B C MSE 28 B MSE 25 1_555 B N VAL 29 B VAL 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale24 B C GLN 36 B GLN 33 1_555 B N MSE 37 B MSE 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale25 B C MSE 37 B MSE 34 1_555 B N PHE 38 B PHE 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale26 B C PHE 38 B PHE 35 1_555 B N MSE 39 B MSE 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale27 B C MSE 39 B MSE 36 1_555 B N PHE 40 B PHE 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale28 B C ALA 46 B ALA 43 1_555 B N MSE 47 B MSE 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale29 B C MSE 47 B MSE 44 1_555 B N THR 48 B THR 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale30 B C VAL 88 B VAL 85 1_555 B N MSE 89 B MSE 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale31 B C MSE 89 B MSE 86 1_555 B N GLU 90 B GLU 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
covale ? covale32 B C PRO 100 B PRO 97 1_555 B N MSE 101 B MSE 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale33 B C MSE 101 B MSE 98 1_555 B N GLY 102 B GLY 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale34 B C LEU 130 B LEU 127 1_555 B N MSE 131 B MSE 128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale35 B C MSE 131 B MSE 128 1_555 B N ALA 132 B ALA 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale36 B C LYS 192 B LYS 189 1_555 B N MSE 193 B MSE 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale37 B C MSE 193 B MSE 190 1_555 B N SER 194 B SER 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale38 B C LYS 312 B LYS 309 1_555 B N MSE 313 B MSE 310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale39 B C MSE 313 B MSE 310 1_555 B N GLN 314 B GLN 311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
metalc ? metalc1 B OG SER 196 B SER 193 1_555 L NA NA . B NA 333 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? 
metalc ? metalc2 C O3B ADP . A ADP 330 1_555 H NA NA . A NA 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? 
metalc ? metalc3 I O3B ADP . B ADP 330 1_555 L NA NA . B NA 333 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? 
metalc ? metalc4 I O2B ADP . B ADP 330 1_555 L NA NA . B NA 333 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.852 ? 
#
_chem_comp.formula           'Na 1' 
_chem_comp.formula_weight    22.99 
_chem_comp.id                NA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'SODIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     3TZL 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.014975 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.00458 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.019752 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.009873 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
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loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 ADP A 1 330 330 ADP ADP . 
D 3 TRP A 1 331 331 TRP LTR . 
E 4 PO4 A 1 332 332 PO4 PO4 . 
F 4 PO4 A 1 333 333 PO4 PO4 . 
G 4 PO4 A 1 335 335 PO4 PO4 . 
H 5 NA A 1 336 336 NA NA . 
I 2 ADP B 1 330 330 ADP ADP . 
J 3 TRP B 1 331 331 TRP LTR . 
K 4 PO4 B 1 332 332 PO4 PO4 . 
L 5 NA B 1 333 333 NA NA . 
M 6 HOH A 1 320 3 HOH HOH . 
M 6 HOH A 2 321 6 HOH HOH . 
M 6 HOH A 3 322 7 HOH HOH . 
M 6 HOH A 4 323 9 HOH HOH . 
M 6 HOH A 5 324 10 HOH HOH . 
M 6 HOH A 6 325 13 HOH HOH . 
M 6 HOH A 7 326 14 HOH HOH . 
M 6 HOH A 8 327 15 HOH HOH . 
M 6 HOH A 9 328 16 HOH HOH . 
M 6 HOH A 10 329 17 HOH HOH . 
M 6 HOH A 11 334 18 HOH HOH . 
M 6 HOH A 12 337 19 HOH HOH . 
M 6 HOH A 13 338 22 HOH HOH . 
M 6 HOH A 14 339 25 HOH HOH . 
M 6 HOH A 15 340 27 HOH HOH . 
M 6 HOH A 16 341 28 HOH HOH . 
M 6 HOH A 17 342 30 HOH HOH . 
M 6 HOH A 18 343 33 HOH HOH . 
M 6 HOH A 19 344 34 HOH HOH . 
M 6 HOH A 20 345 35 HOH HOH . 
M 6 HOH A 21 346 36 HOH HOH . 
M 6 HOH A 22 347 38 HOH HOH . 
M 6 HOH A 23 348 41 HOH HOH . 
M 6 HOH A 24 349 42 HOH HOH . 
M 6 HOH A 25 350 43 HOH HOH . 
M 6 HOH A 26 351 46 HOH HOH . 
M 6 HOH A 27 352 47 HOH HOH . 
M 6 HOH A 28 353 48 HOH HOH . 
M 6 HOH A 29 354 50 HOH HOH . 
M 6 HOH A 30 355 52 HOH HOH . 
M 6 HOH A 31 356 53 HOH HOH . 
M 6 HOH A 32 357 54 HOH HOH . 
M 6 HOH A 33 358 56 HOH HOH . 
M 6 HOH A 34 359 57 HOH HOH . 
M 6 HOH A 35 360 58 HOH HOH . 
M 6 HOH A 36 361 62 HOH HOH . 
M 6 HOH A 37 362 66 HOH HOH . 
M 6 HOH A 38 363 67 HOH HOH . 
M 6 HOH A 39 364 69 HOH HOH . 
M 6 HOH A 40 365 70 HOH HOH . 
M 6 HOH A 41 366 71 HOH HOH . 
M 6 HOH A 42 367 73 HOH HOH . 
M 6 HOH A 43 368 75 HOH HOH . 
M 6 HOH A 44 369 78 HOH HOH . 
M 6 HOH A 45 370 79 HOH HOH . 
M 6 HOH A 46 371 80 HOH HOH . 
M 6 HOH A 47 372 81 HOH HOH . 
M 6 HOH A 48 373 83 HOH HOH . 
M 6 HOH A 49 374 84 HOH HOH . 
M 6 HOH A 50 375 86 HOH HOH . 
M 6 HOH A 51 376 87 HOH HOH . 
M 6 HOH A 52 377 88 HOH HOH . 
M 6 HOH A 53 378 89 HOH HOH . 
M 6 HOH A 54 379 90 HOH HOH . 
M 6 HOH A 55 380 91 HOH HOH . 
M 6 HOH A 56 381 94 HOH HOH . 
M 6 HOH A 57 382 96 HOH HOH . 
M 6 HOH A 58 383 97 HOH HOH . 
M 6 HOH A 59 384 98 HOH HOH . 
M 6 HOH A 60 385 99 HOH HOH . 
M 6 HOH A 61 386 100 HOH HOH . 
M 6 HOH A 62 387 104 HOH HOH . 
M 6 HOH A 63 388 107 HOH HOH . 
M 6 HOH A 64 389 108 HOH HOH . 
M 6 HOH A 65 390 109 HOH HOH . 
M 6 HOH A 66 391 111 HOH HOH . 
M 6 HOH A 67 392 112 HOH HOH . 
M 6 HOH A 68 393 113 HOH HOH . 
M 6 HOH A 69 394 114 HOH HOH . 
M 6 HOH A 70 395 115 HOH HOH . 
M 6 HOH A 71 396 116 HOH HOH . 
M 6 HOH A 72 397 119 HOH HOH . 
M 6 HOH A 73 398 120 HOH HOH . 
M 6 HOH A 74 399 121 HOH HOH . 
M 6 HOH A 75 400 124 HOH HOH . 
M 6 HOH A 76 401 126 HOH HOH . 
M 6 HOH A 77 402 127 HOH HOH . 
M 6 HOH A 78 403 129 HOH HOH . 
M 6 HOH A 79 404 131 HOH HOH . 
M 6 HOH A 80 405 132 HOH HOH . 
M 6 HOH A 81 406 136 HOH HOH . 
M 6 HOH A 82 407 138 HOH HOH . 
M 6 HOH A 83 408 139 HOH HOH . 
M 6 HOH A 84 409 140 HOH HOH . 
M 6 HOH A 85 410 141 HOH HOH . 
M 6 HOH A 86 411 142 HOH HOH . 
M 6 HOH A 87 412 143 HOH HOH . 
M 6 HOH A 88 413 146 HOH HOH . 
M 6 HOH A 89 414 147 HOH HOH . 
M 6 HOH A 90 415 148 HOH HOH . 
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