data_3USK # _model_server_result.job_id UlnEKSgXHH_wYiSjteRYtg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-24 18:35:15' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3usk # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":601}' # _entry.id 3USK # _exptl.entry_id 3USK _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 131.173 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description LEUCINE _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 97.57 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3USK _cell.length_a 70.16 _cell.length_b 112.483 _cell.length_c 165.32 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3USK _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 ? monomeric 1 author_defined_assembly 3 ? monomeric 1 author_defined_assembly 4 PISA dimeric 2 software_defined_assembly 5 PISA dimeric 2 software_defined_assembly 6 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,E,F,G 1 1 B,H,I,J 2 1 C,K,L,M 3 1 D,N,O,P 4 1 A,E,F,G 5 1 C,K,L,M 5 2 B,H,I,J 6 1 D,N,O,P 6 3 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_656 -x+1,y+1/2,-z+1 -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 48.381178 56.2415 163.879179 3 'crystal symmetry operation' 2_655 -x+1,y+1/2,-z -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 70.16 56.2415 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 E N N ? 2 H N N ? 2 K N N ? 2 N N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O GLY 20 A GLY 20 1_555 F NA NA . A NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.198 ? metalc ? metalc2 A O ALA 22 A ALA 22 1_555 G NA NA . A NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? metalc ? metalc3 A O VAL 23 A VAL 23 1_555 F NA NA . A NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASN 27 A ASN 27 1_555 G NA NA . A NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? metalc ? metalc5 A O THR 254 A THR 254 1_555 G NA NA . A NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? metalc ? metalc6 A OG1 THR 254 A THR 254 1_555 G NA NA . A NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASN 286 A ASN 286 1_555 G NA NA . A NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.416 ? metalc ? metalc8 A O ALA 351 A ALA 351 1_555 F NA NA . A NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? metalc ? metalc9 A OG1 THR 354 A THR 354 1_555 F NA NA . A NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc10 A OG SER 355 A SER 355 1_555 F NA NA . A NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc ? metalc11 E O LEU . A LEU 601 1_555 G NA NA . A NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? metalc ? metalc12 B O GLY 20 B GLY 20 1_555 I NA NA . B NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? metalc ? metalc13 B O ALA 22 B ALA 22 1_555 J NA NA . B NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? metalc ? metalc14 B O VAL 23 B VAL 23 1_555 I NA NA . B NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? metalc ? metalc15 B OD1 ASN 27 B ASN 27 1_555 J NA NA . B NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? metalc ? metalc16 B O THR 254 B THR 254 1_555 J NA NA . B NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? metalc ? metalc17 B OG1 THR 254 B THR 254 1_555 J NA NA . B NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? metalc ? metalc18 B OD1 ASN 286 B ASN 286 1_555 J NA NA . B NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.417 ? metalc ? metalc19 B O ALA 351 B ALA 351 1_555 I NA NA . B NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? metalc ? metalc20 B OG1 THR 354 B THR 354 1_555 I NA NA . B NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc21 B OG SER 355 B SER 355 1_555 I NA NA . B NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc22 H O LEU . B LEU 601 1_555 J NA NA . B NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? metalc ? metalc23 C O GLY 20 C GLY 20 1_555 L NA NA . C NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? metalc ? metalc24 C O ALA 22 C ALA 22 1_555 M NA NA . C NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? metalc ? metalc25 C O VAL 23 C VAL 23 1_555 L NA NA . C NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? metalc ? metalc26 C OD1 ASN 27 C ASN 27 1_555 M NA NA . C NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? metalc ? metalc27 C O THR 254 C THR 254 1_555 M NA NA . C NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? metalc ? metalc28 C OG1 THR 254 C THR 254 1_555 M NA NA . C NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? metalc ? metalc29 C OD1 ASN 286 C ASN 286 1_555 M NA NA . C NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? metalc ? metalc30 C O ALA 351 C ALA 351 1_555 L NA NA . C NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc31 C OG1 THR 354 C THR 354 1_555 L NA NA . C NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? metalc ? metalc32 C OG SER 355 C SER 355 1_555 L NA NA . C NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc ? metalc33 K O LEU . C LEU 601 1_555 M NA NA . C NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.648 ? metalc ? metalc34 D O GLY 20 D GLY 20 1_555 O NA NA . D NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? metalc ? metalc35 D O ALA 22 D ALA 22 1_555 P NA NA . D NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc36 D O VAL 23 D VAL 23 1_555 O NA NA . D NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? metalc ? metalc37 D OD1 ASN 27 D ASN 27 1_555 P NA NA . D NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? metalc ? metalc38 D O THR 254 D THR 254 1_555 P NA NA . D NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? metalc ? metalc39 D OG1 THR 254 D THR 254 1_555 P NA NA . D NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? metalc ? metalc40 D OD1 ASN 286 D ASN 286 1_555 P NA NA . D NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.417 ? metalc ? metalc41 D O ALA 351 D ALA 351 1_555 O NA NA . D NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc42 D OG1 THR 354 D THR 354 1_555 O NA NA . D NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? metalc ? metalc43 D OG SER 355 D SER 355 1_555 O NA NA . D NA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc44 N O LEU . D LEU 601 1_555 P NA NA . D NA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.644 ? # _chem_comp.formula 'C6 H13 N O2' _chem_comp.formula_weight 131.173 _chem_comp.id LEU _chem_comp.mon_nstd_flag y _chem_comp.name LEUCINE _chem_comp.type 'l-peptide linking' _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag N CA LEU sing 158 n n N H LEU sing 159 n n N H2 LEU sing 160 n n CA C LEU sing 161 n n CA CB LEU sing 162 n n CA HA LEU sing 163 n n C O LEU doub 164 n n C OXT LEU sing 165 n n CB CG LEU sing 166 n n CB HB2 LEU sing 167 n n CB HB3 LEU sing 168 n n CG CD1 LEU sing 169 n n CG CD2 LEU sing 170 n n CG HG LEU sing 171 n n CD1 HD11 LEU sing 172 n n CD1 HD12 LEU sing 173 n n CD1 HD13 LEU sing 174 n n CD2 HD21 LEU sing 175 n n CD2 HD22 LEU sing 176 n n CD2 HD23 LEU sing 177 n n OXT HXT LEU sing 178 n n # _atom_sites.entry_id 3USK _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014253 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.001894 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.00889 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006102 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 LEU A 1 601 601 LEU LEU . F 3 NA A 1 751 751 NA NA . G 3 NA A 1 752 752 NA NA . H 2 LEU B 1 601 601 LEU LEU . I 3 NA B 1 751 751 NA NA . J 3 NA B 1 752 752 NA NA . K 2 LEU C 1 601 601 LEU LEU . L 3 NA C 1 751 751 NA NA . M 3 NA C 1 752 752 NA NA . N 2 LEU D 1 601 601 LEU LEU . O 3 NA D 1 751 751 NA NA . P 3 NA D 1 752 752 NA NA . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N LEU . . . H 2 35.56 9.398 22.694 1 69.02 ? N LEU 601 B 1 HETATM 2 C CA LEU . . . H 2 36.835 10.1 22.763 1 73.25 ? CA LEU 601 B 1 HETATM 3 C C LEU . . . H 2 36.743 11.315 23.68 1 75.86 ? C LEU 601 B 1 HETATM 4 O O LEU . . . H 2 35.702 11.577 24.282 1 74.79 ? O LEU 601 B 1 HETATM 5 C CB LEU . . . H 2 37.288 10.529 21.366 1 75.7 ? CB LEU 601 B 1 HETATM 6 C CG LEU . . . H 2 37.407 9.412 20.327 1 74.62 ? CG LEU 601 B 1 HETATM 7 C CD1 LEU . . . H 2 37.904 9.969 19.004 1 76.15 ? CD1 LEU 601 B 1 HETATM 8 C CD2 LEU . . . H 2 38.326 8.307 20.824 1 64.37 ? CD2 LEU 601 B 1 HETATM 9 O OXT LEU . . . H 2 37.711 12.058 23.844 1 77.05 ? OXT LEU 601 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 12 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 30 _model_server_stats.query_time_ms 280 _model_server_stats.encode_time_ms 9 _model_server_stats.element_count 9 #