data_3VD0 # _model_server_result.job_id ny-ajfZOdsgVahm37cyggw _model_server_result.datetime_utc '2024-10-12 04:23:43' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3vd0 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"R","auth_seq_id":401}' # _entry.id 3VD0 # _exptl.entry_id 3VD0 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 96.18 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3VD0 _cell.length_a 82.09 _cell.length_b 104.521 _cell.length_c 122.994 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3VD0 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? octameric 8 author_defined_assembly 1 ? octameric 8 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,I,J,K,L,Q,R,S,T,Y,Z,AA,BA,GA 1 1 E,F,G,H,M,N,O,P,U,V,W,X,CA,DA,EA,FA,HA,IA 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 Q N N ? 3 R N N ? 3 S N N ? 3 T N N ? 3 U N N ? 3 V N N ? 3 W N N ? 3 X N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 92 A CYS 194 1_555 Q ZN ZN . A ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? metalc ? metalc2 A ND1 HIS 95 A HIS 197 1_555 Q ZN ZN . A ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 156 A CYS 258 1_555 Q ZN ZN . A ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc4 A SG CYS 160 A CYS 262 1_555 Q ZN ZN . A ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc5 B SG CYS 92 B CYS 194 1_555 R ZN ZN . B ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc6 B ND1 HIS 95 B HIS 197 1_555 R ZN ZN . B ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.961 ? metalc ? metalc7 B SG CYS 156 B CYS 258 1_555 R ZN ZN . B ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc8 B SG CYS 160 B CYS 262 1_555 R ZN ZN . B ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? metalc ? metalc9 C SG CYS 92 C CYS 194 1_555 S ZN ZN . C ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? metalc ? metalc10 C ND1 HIS 95 C HIS 197 1_555 S ZN ZN . C ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? metalc ? metalc11 C SG CYS 156 C CYS 258 1_555 S ZN ZN . C ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc12 C SG CYS 160 C CYS 262 1_555 S ZN ZN . C ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc13 D SG CYS 92 D CYS 194 1_555 T ZN ZN . D ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? metalc ? metalc14 D ND1 HIS 95 D HIS 197 1_555 T ZN ZN . D ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? metalc ? metalc15 D SG CYS 156 D CYS 258 1_555 T ZN ZN . D ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc16 D SG CYS 160 D CYS 262 1_555 T ZN ZN . D ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc17 E SG CYS 92 I CYS 194 1_555 U ZN ZN . I ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? metalc ? metalc18 E ND1 HIS 95 I HIS 197 1_555 U ZN ZN . I ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? metalc ? metalc19 E SG CYS 156 I CYS 258 1_555 U ZN ZN . I ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc20 E SG CYS 160 I CYS 262 1_555 U ZN ZN . I ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc21 F SG CYS 92 J CYS 194 1_555 V ZN ZN . J ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc22 F ND1 HIS 95 J HIS 197 1_555 V ZN ZN . J ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.971 ? metalc ? metalc23 F SG CYS 156 J CYS 258 1_555 V ZN ZN . J ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc ? metalc24 F SG CYS 160 J CYS 262 1_555 V ZN ZN . J ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc25 G SG CYS 92 K CYS 194 1_555 W ZN ZN . K ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc26 G ND1 HIS 95 K HIS 197 1_555 W ZN ZN . K ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? metalc ? metalc27 G SG CYS 156 K CYS 258 1_555 W ZN ZN . K ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? metalc ? metalc28 G SG CYS 160 K CYS 262 1_555 W ZN ZN . K ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc29 H SG CYS 92 L CYS 194 1_555 X ZN ZN . L ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc30 H ND1 HIS 95 L HIS 197 1_555 X ZN ZN . L ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.998 ? metalc ? metalc31 H SG CYS 156 L CYS 258 1_555 X ZN ZN . L ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc ? metalc32 H SG CYS 160 L CYS 262 1_555 X ZN ZN . L ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 I N3 DC 1 E DC 398 1_555 J N1 DG 12 F DG 421 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 I N4 DC 1 E DC 398 1_555 J O6 DG 12 F DG 421 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 I O2 DC 1 E DC 398 1_555 J N2 DG 12 F DG 421 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 I N1 DA 2 E DA 399 1_555 J N3 DT 11 F DT 420 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 I N6 DA 2 E DA 399 1_555 J O4 DT 11 F DT 420 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 I N1 DG 3 E DG 400 1_555 J N3 DC 10 F DC 419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 I N2 DG 3 E DG 400 1_555 J O2 DC 10 F DC 419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 I O6 DG 3 E DG 400 1_555 J N4 DC 10 F DC 419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 I N1 DG 4 E DG 401 1_555 J N3 DC 9 F DC 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 I N2 DG 4 E DG 401 1_555 J O2 DC 9 F DC 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 I O6 DG 4 E DG 401 1_555 J N4 DC 9 F DC 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 I N3 DC 5 E DC 402 1_555 J N1 DG 8 F DG 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 I N4 DC 5 E DC 402 1_555 J O6 DG 8 F DG 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 I O2 DC 5 E DC 402 1_555 J N2 DG 8 F DG 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 I N1 DA 6 E DA 403 1_555 J N3 DT 7 F DT 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 I N6 DA 6 E DA 403 1_555 J O4 DT 7 F DT 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 I N3 DT 7 E DT 404 1_555 J N1 DA 6 F DA 415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 I O4 DT 7 E DT 404 1_555 J N6 DA 6 F DA 415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 I N1 DG 8 E DG 405 1_555 J N3 DC 5 F DC 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 I N2 DG 8 E DG 405 1_555 J O2 DC 5 F DC 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 I O6 DG 8 E DG 405 1_555 J N4 DC 5 F DC 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 I N3 DC 9 E DC 406 1_555 J N1 DG 4 F DG 413 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 I N4 DC 9 E DC 406 1_555 J O6 DG 4 F DG 413 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 I O2 DC 9 E DC 406 1_555 J N2 DG 4 F DG 413 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 I N3 DC 10 E DC 407 1_555 J N1 DG 3 F DG 412 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 I N4 DC 10 E DC 407 1_555 J O6 DG 3 F DG 412 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 I O2 DC 10 E DC 407 1_555 J N2 DG 3 F DG 412 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 I N3 DT 11 E DT 408 1_555 J N1 DA 2 F DA 411 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 I O4 DT 11 E DT 408 1_555 J N6 DA 2 F DA 411 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 K N1 DA 2 G DA 501 1_555 L N3 DT 11 H DT 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 K N6 DA 2 G DA 501 1_555 L O4 DT 11 H DT 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 K N1 DG 3 G DG 502 1_555 L N3 DC 10 H DC 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 K N2 DG 3 G DG 502 1_555 L O2 DC 10 H DC 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 K O6 DG 3 G DG 502 1_555 L N4 DC 10 H DC 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 K N1 DG 4 G DG 503 1_555 L N3 DC 9 H DC 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 K N2 DG 4 G DG 503 1_555 L O2 DC 9 H DC 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 K O6 DG 4 G DG 503 1_555 L N4 DC 9 H DC 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 K N3 DC 5 G DC 504 1_555 L N1 DG 8 H DG 519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 K N4 DC 5 G DC 504 1_555 L O6 DG 8 H DG 519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 K O2 DC 5 G DC 504 1_555 L N2 DG 8 H DG 519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 K N1 DA 6 G DA 505 1_555 L N3 DT 7 H DT 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 K N6 DA 6 G DA 505 1_555 L O4 DT 7 H DT 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 K N3 DT 7 G DT 506 1_555 L N1 DA 6 H DA 517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 K O4 DT 7 G DT 506 1_555 L N6 DA 6 H DA 517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 K N1 DG 8 G DG 507 1_555 L N3 DC 5 H DC 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 K N2 DG 8 G DG 507 1_555 L O2 DC 5 H DC 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 K O6 DG 8 G DG 507 1_555 L N4 DC 5 H DC 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 K N3 DC 9 G DC 508 1_555 L N1 DG 4 H DG 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 K N4 DC 9 G DC 508 1_555 L O6 DG 4 H DG 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 K O2 DC 9 G DC 508 1_555 L N2 DG 4 H DG 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 K N3 DC 10 G DC 509 1_555 L N1 DG 3 H DG 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 K N4 DC 10 G DC 509 1_555 L O6 DG 3 H DG 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 K O2 DC 10 G DC 509 1_555 L N2 DG 3 H DG 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 K N3 DT 11 G DT 510 1_555 L N1 DA 2 H DA 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 K O4 DT 11 G DT 510 1_555 L N6 DA 2 H DA 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 K N1 DG 12 G DG 511 1_555 L N3 DC 1 H DC 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 K N2 DG 12 G DG 511 1_555 L O2 DC 1 H DC 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 K O6 DG 12 G DG 511 1_555 L N4 DC 1 H DC 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 M N3 DC 1 M DC 410 1_555 N N1 DG 12 N DG 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 M N4 DC 1 M DC 410 1_555 N O6 DG 12 N DG 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 M O2 DC 1 M DC 410 1_555 N N2 DG 12 N DG 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 M N1 DA 2 M DA 411 1_555 N N3 DT 11 N DT 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 M N6 DA 2 M DA 411 1_555 N O4 DT 11 N DT 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 M N1 DG 3 M DG 412 1_555 N N3 DC 10 N DC 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 M N2 DG 3 M DG 412 1_555 N O2 DC 10 N DC 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 M O6 DG 3 M DG 412 1_555 N N4 DC 10 N DC 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 M N1 DG 4 M DG 413 1_555 N N3 DC 9 N DC 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 M N2 DG 4 M DG 413 1_555 N O2 DC 9 N DC 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 M O6 DG 4 M DG 413 1_555 N N4 DC 9 N DC 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 M N3 DC 5 M DC 414 1_555 N N1 DG 8 N DG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 M N4 DC 5 M DC 414 1_555 N O6 DG 8 N DG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 M O2 DC 5 M DC 414 1_555 N N2 DG 8 N DG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 M N1 DA 6 M DA 415 1_555 N N3 DT 7 N DT 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 M N6 DA 6 M DA 415 1_555 N O4 DT 7 N DT 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 M N3 DT 7 M DT 416 1_555 N N1 DA 6 N DA 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 M O4 DT 7 M DT 416 1_555 N N6 DA 6 N DA 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 M N1 DG 8 M DG 417 1_555 N N3 DC 5 N DC 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 M N2 DG 8 M DG 417 1_555 N O2 DC 5 N DC 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 M O6 DG 8 M DG 417 1_555 N N4 DC 5 N DC 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 M N3 DC 9 M DC 418 1_555 N N1 DG 4 N DG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 M N4 DC 9 M DC 418 1_555 N O6 DG 4 N DG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog82 M O2 DC 9 M DC 418 1_555 N N2 DG 4 N DG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog83 M N3 DC 10 M DC 419 1_555 N N1 DG 3 N DG 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog84 M N4 DC 10 M DC 419 1_555 N O6 DG 3 N DG 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog85 M O2 DC 10 M DC 419 1_555 N N2 DG 3 N DG 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog86 M N3 DT 11 M DT 420 1_555 N N1 DA 2 N DA 399 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog87 M O4 DT 11 M DT 420 1_555 N N6 DA 2 N DA 399 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog88 M N1 DG 12 M DG 421 1_555 N N3 DC 1 N DC 398 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog89 M N2 DG 12 M DG 421 1_555 N O2 DC 1 N DC 398 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog90 M O6 DG 12 M DG 421 1_555 N N4 DC 1 N DC 398 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog91 O N3 DC 1 O DC 410 1_555 P N1 DG 12 P DG 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog92 O N4 DC 1 O DC 410 1_555 P O6 DG 12 P DG 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog93 O O2 DC 1 O DC 410 1_555 P N2 DG 12 P DG 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog94 O N1 DA 2 O DA 411 1_555 P N3 DT 11 P DT 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog95 O N6 DA 2 O DA 411 1_555 P O4 DT 11 P DT 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog96 O N1 DG 3 O DG 412 1_555 P N3 DC 10 P DC 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog97 O N2 DG 3 O DG 412 1_555 P O2 DC 10 P DC 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog98 O O6 DG 3 O DG 412 1_555 P N4 DC 10 P DC 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog99 O N1 DG 4 O DG 413 1_555 P N3 DC 9 P DC 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog100 O N2 DG 4 O DG 413 1_555 P O2 DC 9 P DC 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog101 O O6 DG 4 O DG 413 1_555 P N4 DC 9 P DC 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog102 O N3 DC 5 O DC 414 1_555 P N1 DG 8 P DG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog103 O N4 DC 5 O DC 414 1_555 P O6 DG 8 P DG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog104 O O2 DC 5 O DC 414 1_555 P N2 DG 8 P DG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog105 O N1 DA 6 O DA 415 1_555 P N3 DT 7 P DT 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog106 O N6 DA 6 O DA 415 1_555 P O4 DT 7 P DT 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog107 O N3 DT 7 O DT 416 1_555 P N1 DA 6 P DA 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog108 O O4 DT 7 O DT 416 1_555 P N6 DA 6 P DA 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog109 O N1 DG 8 O DG 417 1_555 P N3 DC 5 P DC 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog110 O N2 DG 8 O DG 417 1_555 P O2 DC 5 P DC 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog111 O O6 DG 8 O DG 417 1_555 P N4 DC 5 P DC 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog112 O N3 DC 9 O DC 418 1_555 P N1 DG 4 P DG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog113 O N4 DC 9 O DC 418 1_555 P O6 DG 4 P DG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog114 O O2 DC 9 O DC 418 1_555 P N2 DG 4 P DG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog115 O N3 DC 10 O DC 419 1_555 P N1 DG 3 P DG 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog116 O N4 DC 10 O DC 419 1_555 P O6 DG 3 P DG 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog117 O O2 DC 10 O DC 419 1_555 P N2 DG 3 P DG 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog118 O N3 DT 11 O DT 420 1_555 P N1 DA 2 P DA 399 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog119 O O4 DT 11 O DT 420 1_555 P N6 DA 2 P DA 399 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog120 O N1 DG 12 O DG 421 1_555 P N3 DC 1 P DC 398 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog121 O N2 DG 12 O DG 421 1_555 P O2 DC 1 P DC 398 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog122 O O6 DG 12 O DG 421 1_555 P N4 DC 1 P DC 398 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 3VD0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.012182 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.001319 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009567 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008178 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Q 3 ZN A 1 401 319 ZN ZN . R 3 ZN B 1 401 319 ZN ZN . S 3 ZN C 1 401 319 ZN ZN . T 3 ZN D 1 401 319 ZN ZN . U 3 ZN I 1 401 319 ZN ZN . V 3 ZN J 1 401 319 ZN ZN . W 3 ZN K 1 401 319 ZN ZN . X 3 ZN L 1 401 319 ZN ZN . Y 4 HOH A 1 501 1 HOH HOH . Y 4 HOH A 2 502 3 HOH HOH . Y 4 HOH A 3 503 5 HOH HOH . Y 4 HOH A 4 504 63 HOH HOH . Y 4 HOH A 5 505 66 HOH HOH . Y 4 HOH A 6 506 67 HOH HOH . Y 4 HOH A 7 507 69 HOH HOH . Y 4 HOH A 8 508 70 HOH HOH . Y 4 HOH A 9 509 71 HOH HOH . Y 4 HOH A 10 510 74 HOH HOH . Y 4 HOH A 11 511 75 HOH HOH . Y 4 HOH A 12 512 512 HOH HOH . Y 4 HOH A 13 513 114 HOH HOH . Y 4 HOH A 14 514 514 HOH HOH . Y 4 HOH A 15 515 150 HOH HOH . Y 4 HOH A 16 516 222 HOH HOH . Y 4 HOH A 17 517 223 HOH HOH . Y 4 HOH A 18 518 225 HOH HOH . Z 4 HOH B 1 501 2 HOH HOH . Z 4 HOH B 2 502 4 HOH HOH . Z 4 HOH B 3 503 503 HOH HOH . Z 4 HOH B 4 504 47 HOH HOH . Z 4 HOH B 5 505 49 HOH HOH . Z 4 HOH B 6 506 76 HOH HOH . Z 4 HOH B 7 507 77 HOH HOH . Z 4 HOH B 8 508 78 HOH HOH . Z 4 HOH B 9 509 79 HOH HOH . Z 4 HOH B 10 510 80 HOH HOH . Z 4 HOH B 11 511 81 HOH HOH . Z 4 HOH B 12 512 84 HOH HOH . Z 4 HOH B 13 513 85 HOH HOH . Z 4 HOH B 14 514 87 HOH HOH . Z 4 HOH B 15 515 88 HOH HOH . Z 4 HOH B 16 516 89 HOH HOH . Z 4 HOH B 17 517 135 HOH HOH . Z 4 HOH B 18 518 152 HOH HOH . Z 4 HOH B 19 519 229 HOH HOH . AA 4 HOH C 1 501 7 HOH HOH . AA 4 HOH C 2 502 8 HOH HOH . AA 4 HOH C 3 503 9 HOH HOH . AA 4 HOH C 4 504 10 HOH HOH . AA 4 HOH C 5 505 11 HOH HOH . AA 4 HOH C 6 506 12 HOH HOH . AA 4 HOH C 7 507 507 HOH HOH . AA 4 HOH C 8 508 51 HOH HOH . AA 4 HOH C 9 509 90 HOH HOH . AA 4 HOH C 10 510 95 HOH HOH . AA 4 HOH C 11 511 96 HOH HOH . AA 4 HOH C 12 512 100 HOH HOH . AA 4 HOH C 13 513 101 HOH HOH . AA 4 HOH C 14 514 103 HOH HOH . AA 4 HOH C 15 515 515 HOH HOH . AA 4 HOH C 16 516 109 HOH HOH . AA 4 HOH C 17 517 164 HOH HOH . AA 4 HOH C 18 518 232 HOH HOH . AA 4 HOH C 19 519 233 HOH HOH . BA 4 HOH D 1 501 38 HOH HOH . BA 4 HOH D 2 502 68 HOH HOH . BA 4 HOH D 3 503 106 HOH HOH . BA 4 HOH D 4 504 110 HOH HOH . BA 4 HOH D 5 505 112 HOH HOH . BA 4 HOH D 6 506 113 HOH HOH . BA 4 HOH D 7 507 116 HOH HOH . BA 4 HOH D 8 508 117 HOH HOH . BA 4 HOH D 9 509 118 HOH HOH . BA 4 HOH D 10 510 119 HOH HOH . BA 4 HOH D 11 511 156 HOH HOH . BA 4 HOH D 12 512 157 HOH HOH . BA 4 HOH D 13 513 175 HOH HOH . CA 4 HOH I 1 501 501 HOH HOH . CA 4 HOH I 2 502 18 HOH HOH . CA 4 HOH I 3 503 503 HOH HOH . CA 4 HOH I 4 504 32 HOH HOH . CA 4 HOH I 5 505 104 HOH HOH . CA 4 HOH I 6 506 120 HOH HOH . CA 4 HOH I 7 507 122 HOH HOH . CA 4 HOH I 8 508 125 HOH HOH . CA 4 HOH I 9 509 509 HOH HOH . CA 4 HOH I 10 510 130 HOH HOH . CA 4 HOH I 11 511 131 HOH HOH . CA 4 HOH I 12 512 133 HOH HOH . CA 4 HOH I 13 513 166 HOH HOH . CA 4 HOH I 14 514 176 HOH HOH . CA 4 HOH I 15 515 178 HOH HOH . CA 4 HOH I 16 516 194 HOH HOH . CA 4 HOH I 17 517 197 HOH HOH . CA 4 HOH I 18 518 202 HOH HOH . CA 4 HOH I 19 519 227 HOH HOH . DA 4 HOH J 1 501 52 HOH HOH . DA 4 HOH J 2 502 53 HOH HOH . DA 4 HOH J 3 503 59 HOH HOH . DA 4 HOH J 4 504 158 HOH HOH . DA 4 HOH J 5 505 162 HOH HOH . DA 4 HOH J 6 506 163 HOH HOH . DA 4 HOH J 7 507 169 HOH HOH . DA 4 HOH J 8 508 177 HOH HOH . DA 4 HOH J 9 509 185 HOH HOH . DA 4 HOH J 10 510 189 HOH HOH . DA 4 HOH J 11 511 204 HOH HOH . DA 4 HOH J 12 512 205 HOH HOH . DA 4 HOH J 13 513 207 HOH HOH . DA 4 HOH J 14 514 226 HOH HOH . EA 4 HOH K 1 501 20 HOH HOH . EA 4 HOH K 2 502 21 HOH HOH . EA 4 HOH K 3 503 22 HOH HOH . EA 4 HOH K 4 504 23 HOH HOH . EA 4 HOH K 5 505 24 HOH HOH . EA 4 HOH K 6 506 29 HOH HOH . EA 4 HOH K 7 507 30 HOH HOH . EA 4 HOH K 8 508 34 HOH HOH . EA 4 HOH K 9 509 35 HOH HOH . EA 4 HOH K 10 510 37 HOH HOH . EA 4 HOH K 11 511 39 HOH HOH . EA 4 HOH K 12 512 40 HOH HOH . EA 4 HOH K 13 513 41 HOH HOH . EA 4 HOH K 14 514 42 HOH HOH . EA 4 HOH K 15 515 43 HOH HOH . EA 4 HOH K 16 516 55 HOH HOH . EA 4 HOH K 17 517 56 HOH HOH . EA 4 HOH K 18 518 57 HOH HOH . EA 4 HOH K 19 519 58 HOH HOH . EA 4 HOH K 20 520 60 HOH HOH . EA 4 HOH K 21 521 137 HOH HOH . EA 4 HOH K 22 522 139 HOH HOH . EA 4 HOH K 23 523 140 HOH HOH . EA 4 HOH K 24 524 141 HOH HOH . EA 4 HOH K 25 525 142 HOH HOH . EA 4 HOH K 26 526 143 HOH HOH . EA 4 HOH K 27 527 146 HOH HOH . EA 4 HOH K 28 528 161 HOH HOH . EA 4 HOH K 29 529 171 HOH HOH . EA 4 HOH K 30 530 179 HOH HOH . EA 4 HOH K 31 531 181 HOH HOH . EA 4 HOH K 32 532 182 HOH HOH . EA 4 HOH K 33 533 190 HOH HOH . EA 4 HOH K 34 534 210 HOH HOH . FA 4 HOH L 1 501 14 HOH HOH . FA 4 HOH L 2 502 16 HOH HOH . FA 4 HOH L 3 503 17 HOH HOH . FA 4 HOH L 4 504 25 HOH HOH . FA 4 HOH L 5 505 26 HOH HOH . FA 4 HOH L 6 506 27 HOH HOH . FA 4 HOH L 7 507 28 HOH HOH . FA 4 HOH L 8 508 31 HOH HOH . FA 4 HOH L 9 509 44 HOH HOH . FA 4 HOH L 10 510 45 HOH HOH . FA 4 HOH L 11 511 46 HOH HOH . FA 4 HOH L 12 512 126 HOH HOH . FA 4 HOH L 13 513 128 HOH HOH . FA 4 HOH L 14 514 144 HOH HOH . FA 4 HOH L 15 515 145 HOH HOH . FA 4 HOH L 16 516 149 HOH HOH . FA 4 HOH L 17 517 183 HOH HOH . FA 4 HOH L 18 518 184 HOH HOH . FA 4 HOH L 19 519 187 HOH HOH . FA 4 HOH L 20 520 188 HOH HOH . FA 4 HOH L 21 521 192 HOH HOH . FA 4 HOH L 22 522 193 HOH HOH . FA 4 HOH L 23 523 211 HOH HOH . FA 4 HOH L 24 524 212 HOH HOH . FA 4 HOH L 25 525 213 HOH HOH . FA 4 HOH L 26 526 214 HOH HOH . FA 4 HOH L 27 527 216 HOH HOH . FA 4 HOH L 28 528 217 HOH HOH . FA 4 HOH L 29 529 219 HOH HOH . FA 4 HOH L 30 530 530 HOH HOH . GA 4 HOH E 1 501 36 HOH HOH . HA 4 HOH N 1 501 209 HOH HOH . IA 4 HOH O 1 501 215 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id R _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 24.488 _atom_site.Cartn_y -21.289 _atom_site.Cartn_z 2.508 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 49.26 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 401 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 11 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 14 _model_server_stats.query_time_ms 270 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #