data_3WMM # _model_server_result.job_id LQyVXPgcsaf2AvTgCYrkzA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-13 04:26:44' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 3wmm # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"KA","auth_seq_id":501}' # _entry.id 3WMM # _exptl.entry_id 3WMM _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 616.487 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 117.59 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 3WMM _cell.length_a 227.341 _cell.length_b 148.238 _cell.length_c 161.792 _cell.Z_PDB 64 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 3WMM _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 36-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 36 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 KA N N ? 7 LA N N ? 7 MA N N ? 7 NA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SD MET 94 C MET 94 1_555 KA FE HEM . C HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? metalc ? metalc2 A NE2 HIS 111 C HIS 111 1_555 KA FE HEM . C HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? metalc ? metalc3 A SD MET 130 C MET 130 1_555 LA FE HEM . C HEM 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? metalc ? metalc4 A NE2 HIS 144 C HIS 144 1_555 NA FE HEM . C HEM 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? metalc ? metalc5 A NE2 HIS 156 C HIS 156 1_555 LA FE HEM . C HEM 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? metalc ? metalc6 A OE1 GLN 183 C GLN 183 1_555 OA CA CA . C CA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? metalc ? metalc7 A OE1 GLU 230 C GLU 230 1_555 OA CA CA . C CA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? metalc ? metalc8 A OE2 GLU 230 C GLU 230 1_555 OA CA CA . C CA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.89 ? metalc ? metalc9 A SD MET 236 C MET 236 1_555 MA FE HEM . C HEM 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.115 ? metalc ? metalc10 A NE2 HIS 251 C HIS 251 1_555 MA FE HEM . C HEM 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? metalc ? metalc11 A NE2 HIS 311 C HIS 311 1_555 NA FE HEM . C HEM 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? metalc ? metalc12 B NE2 HIS 199 L HIS 199 1_555 XA FE FE . M FE 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.985 ? metalc ? metalc13 B NE2 HIS 239 L HIS 239 1_555 XA FE FE . M FE 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.977 ? metalc ? metalc14 C NE2 HIS 219 M HIS 219 1_555 XA FE FE . M FE 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? metalc ? metalc15 C OE2 GLU 234 M GLU 234 1_555 XA FE FE . M FE 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? metalc ? metalc16 C OE1 GLU 234 M GLU 234 1_555 XA FE FE . M FE 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? metalc ? metalc17 C NE2 HIS 266 M HIS 266 1_555 XA FE FE . M FE 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? metalc ? metalc18 E O TRP 46 A TRP 46 1_555 JB CA CA . A CA 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.396 ? metalc ? metalc19 E OD1 ASP 49 A ASP 49 1_555 JB CA CA . A CA 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? metalc ? metalc20 E OD1 ASN 50 A ASN 50 1_555 JB CA CA . A CA 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc21 E O ILE 51 A ILE 51 1_555 JB CA CA . A CA 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.568 ? metalc ? metalc22 JB CA CA . A CA 104 1_555 JA O LEU 47 0 LEU 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.159 ? metalc ? metalc23 JB CA CA . A CA 104 1_555 JA OXT LEU 47 0 LEU 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.62 ? metalc ? metalc24 F O LEU 47 B LEU 46 1_555 MB CA CA . D CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? metalc ? metalc25 F OXT LEU 47 B LEU 46 1_555 MB CA CA . D CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? metalc ? metalc26 G O TRP 46 D TRP 46 1_555 MB CA CA . D CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? metalc ? metalc27 G OD1 ASP 49 D ASP 49 1_555 MB CA CA . D CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc28 G OD1 ASN 50 D ASN 50 1_555 MB CA CA . D CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc ? metalc29 G O ILE 51 D ILE 51 1_555 MB CA CA . D CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.475 ? metalc ? metalc30 H O LEU 47 E LEU 46 1_555 PB CA CA . F CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? metalc ? metalc31 H OXT LEU 47 E LEU 46 1_555 PB CA CA . F CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.598 ? metalc ? metalc32 I O TRP 46 F TRP 46 1_555 PB CA CA . F CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.52 ? metalc ? metalc33 I OD1 ASP 49 F ASP 49 1_555 PB CA CA . F CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.614 ? metalc ? metalc34 I OD1 ASN 50 F ASN 50 1_555 PB CA CA . F CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc ? metalc35 I O ILE 51 F ILE 51 1_555 PB CA CA . F CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.896 ? metalc ? metalc36 J O LEU 47 G LEU 46 1_555 TB CA CA . I CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc ? metalc37 J OXT LEU 47 G LEU 46 1_555 TB CA CA . I CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? metalc ? metalc38 K O TRP 46 I TRP 46 1_555 TB CA CA . I CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.442 ? metalc ? metalc39 K OD1 ASP 49 I ASP 49 1_555 TB CA CA . I CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc40 K OD1 ASN 50 I ASN 50 1_555 TB CA CA . I CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc ? metalc41 K O ILE 51 I ILE 51 1_555 TB CA CA . I CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.472 ? metalc ? metalc42 L O LEU 47 J LEU 46 1_555 XB CA CA . K CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.159 ? metalc ? metalc43 L OXT LEU 47 J LEU 46 1_555 XB CA CA . K CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.633 ? metalc ? metalc44 M O TRP 46 K TRP 46 1_555 XB CA CA . K CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? metalc ? metalc45 M OD1 ASP 49 K ASP 49 1_555 XB CA CA . K CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? metalc ? metalc46 M OD1 ASN 50 K ASN 50 1_555 XB CA CA . K CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? metalc ? metalc47 M O ILE 51 K ILE 51 1_555 XB CA CA . K CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.655 ? metalc ? metalc48 N O LEU 47 N LEU 46 1_555 BC CA CA . O CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.787 ? metalc ? metalc49 O O TRP 46 O TRP 46 1_555 BC CA CA . O CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? metalc ? metalc50 O OD1 ASP 49 O ASP 49 1_555 BC CA CA . O CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? metalc ? metalc51 O OD1 ASN 50 O ASN 50 1_555 BC CA CA . O CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.391 ? metalc ? metalc52 O O ILE 51 O ILE 51 1_555 BC CA CA . O CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? metalc ? metalc53 P OXT LEU 47 P LEU 46 1_555 FC CA CA . Q CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? metalc ? metalc54 P O LEU 47 P LEU 46 1_555 FC CA CA . Q CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc55 Q O TRP 46 Q TRP 46 1_555 FC CA CA . Q CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.388 ? metalc ? metalc56 Q OD1 ASP 49 Q ASP 49 1_555 FC CA CA . Q CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc57 Q OD1 ASN 50 Q ASN 50 1_555 FC CA CA . Q CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? metalc ? metalc58 Q O ILE 51 Q ILE 51 1_555 FC CA CA . Q CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.428 ? metalc ? metalc59 R O LEU 47 R LEU 46 1_555 JC CA CA . S CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc60 R OXT LEU 47 R LEU 46 1_555 JC CA CA . S CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? metalc ? metalc61 S O TRP 46 S TRP 46 1_555 JC CA CA . S CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? metalc ? metalc62 S OD1 ASP 49 S ASP 49 1_555 JC CA CA . S CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? metalc ? metalc63 S OD1 ASN 50 S ASN 50 1_555 JC CA CA . S CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? metalc ? metalc64 S O ILE 51 S ILE 51 1_555 JC CA CA . S CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc65 T O LEU 47 T LEU 46 1_555 NC CA CA . U CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc66 T OXT LEU 47 T LEU 46 1_555 NC CA CA . U CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc67 U O TRP 46 U TRP 46 1_555 NC CA CA . U CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? metalc ? metalc68 U OD1 ASP 49 U ASP 49 1_555 NC CA CA . U CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.396 ? metalc ? metalc69 U OD1 ASN 50 U ASN 50 1_555 NC CA CA . U CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? metalc ? metalc70 U O ILE 51 U ILE 51 1_555 NC CA CA . U CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? metalc ? metalc71 V O LEU 47 V LEU 46 1_555 RC CA CA . W CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? metalc ? metalc72 V OXT LEU 47 V LEU 46 1_555 RC CA CA . W CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? metalc ? metalc73 W O TRP 46 W TRP 46 1_555 RC CA CA . W CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc74 W OD1 ASP 49 W ASP 49 1_555 RC CA CA . W CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.477 ? metalc ? metalc75 W OD1 ASN 50 W ASN 50 1_555 RC CA CA . W CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? metalc ? metalc76 W O ASN 50 W ASN 50 1_555 RC CA CA . W CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.087 ? metalc ? metalc77 W O ILE 51 W ILE 51 1_555 RC CA CA . W CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.539 ? metalc ? metalc78 X O LEU 47 X LEU 46 1_555 WC CA CA . Y CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? metalc ? metalc79 X OXT LEU 47 X LEU 46 1_555 WC CA CA . Y CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? metalc ? metalc80 Y O TRP 46 Y TRP 46 1_555 WC CA CA . Y CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? metalc ? metalc81 Y OD1 ASP 49 Y ASP 49 1_555 WC CA CA . Y CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc82 Y OD2 ASP 49 Y ASP 49 1_555 WC CA CA . Y CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.015 ? metalc ? metalc83 Y OD1 ASN 50 Y ASN 50 1_555 WC CA CA . Y CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? metalc ? metalc84 Y O ILE 51 Y ILE 51 1_555 WC CA CA . Y CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? metalc ? metalc85 Z O LEU 47 Z LEU 46 1_555 ZC CA CA . 1 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? metalc ? metalc86 Z OXT LEU 47 Z LEU 46 1_555 ZC CA CA . 1 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? metalc ? metalc87 AA O TRP 46 1 TRP 46 1_555 ZC CA CA . 1 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? metalc ? metalc88 AA OD1 ASP 49 1 ASP 49 1_555 ZC CA CA . 1 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? metalc ? metalc89 AA OD1 ASN 50 1 ASN 50 1_555 ZC CA CA . 1 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc ? metalc90 AA O ILE 51 1 ILE 51 1_555 ZC CA CA . 1 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.674 ? metalc ? metalc91 BA O LEU 47 2 LEU 46 1_555 DD CA CA . 3 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? metalc ? metalc92 BA OXT LEU 47 2 LEU 46 1_555 DD CA CA . 3 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? metalc ? metalc93 CA O TRP 46 3 TRP 46 1_555 DD CA CA . 3 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.59 ? metalc ? metalc94 CA OD1 ASP 49 3 ASP 49 1_555 DD CA CA . 3 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? metalc ? metalc95 CA OD1 ASN 50 3 ASN 50 1_555 DD CA CA . 3 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc96 CA O ILE 51 3 ILE 51 1_555 DD CA CA . 3 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.741 ? metalc ? metalc97 DA O LEU 47 4 LEU 46 1_555 ID CA CA . 5 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? metalc ? metalc98 DA OXT LEU 47 4 LEU 46 1_555 ID CA CA . 5 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? metalc ? metalc99 EA O TRP 46 5 TRP 46 1_555 ID CA CA . 5 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? metalc ? metalc100 EA OD1 ASP 49 5 ASP 49 1_555 ID CA CA . 5 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.491 ? metalc ? metalc101 EA OD1 ASN 50 5 ASN 50 1_555 ID CA CA . 5 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.38 ? metalc ? metalc102 EA O ILE 51 5 ILE 51 1_555 ID CA CA . 5 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.627 ? metalc ? metalc103 FA O LEU 47 6 LEU 46 1_555 LD CA CA . 7 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.988 ? metalc ? metalc104 FA OXT LEU 47 6 LEU 46 1_555 LD CA CA . 7 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.83 ? metalc ? metalc105 GA O TRP 46 7 TRP 46 1_555 LD CA CA . 7 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc106 GA OD1 ASP 49 7 ASP 49 1_555 LD CA CA . 7 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc107 GA OD1 ASN 50 7 ASN 50 1_555 LD CA CA . 7 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? metalc ? metalc108 GA O ILE 51 7 ILE 51 1_555 LD CA CA . 7 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.439 ? metalc ? metalc109 HA O LEU 47 8 LEU 46 1_555 PD CA CA . 9 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? metalc ? metalc110 HA OXT LEU 47 8 LEU 46 1_555 PD CA CA . 9 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? metalc ? metalc111 IA O TRP 46 9 TRP 46 1_555 PD CA CA . 9 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.431 ? metalc ? metalc112 IA OD1 ASP 49 9 ASP 49 1_555 PD CA CA . 9 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc113 IA OD1 ASN 50 9 ASN 50 1_555 PD CA CA . 9 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? metalc ? metalc114 IA O ILE 51 9 ILE 51 1_555 PD CA CA . 9 CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.584 ? # _chem_comp.formula 'C34 H32 Fe N4 O4' _chem_comp.formula_weight 616.487 _chem_comp.id HEM _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms HEME # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag CHA C1A HEM sing 526 n n CHA C4D HEM doub 527 n n CHA HHA HEM sing 528 n n CHB C4A HEM sing 529 n n CHB C1B HEM doub 530 n n CHB HHB HEM sing 531 n n CHC C4B HEM sing 532 n n CHC C1C HEM doub 533 n n CHC HHC HEM sing 534 n n CHD C4C HEM doub 535 n n CHD C1D HEM sing 536 n n CHD HHD HEM sing 537 n n C1A C2A HEM doub 538 n y C1A NA HEM sing 539 n y C2A C3A HEM sing 540 n y C2A CAA HEM sing 541 n n C3A C4A HEM doub 542 n y C3A CMA HEM sing 543 n n C4A NA HEM sing 544 n y CMA HMA HEM sing 545 n n CMA HMAA HEM sing 546 n n CMA HMAB HEM sing 547 n n CAA CBA HEM sing 548 n n CAA HAA HEM sing 549 n n CAA HAAA HEM sing 550 n n CBA CGA HEM sing 551 n n CBA HBA HEM sing 552 n n CBA HBAA HEM sing 553 n n CGA O1A HEM doub 554 n n CGA O2A HEM sing 555 n n C1B C2B HEM sing 556 n n C1B NB HEM sing 557 n n C2B C3B HEM doub 558 n n C2B CMB HEM sing 559 n n C3B C4B HEM sing 560 n n C3B CAB HEM sing 561 n n C4B NB HEM doub 562 n n CMB HMB HEM sing 563 n n CMB HMBA HEM sing 564 n n CMB HMBB HEM sing 565 n n CAB CBB HEM doub 566 n n CAB HAB HEM sing 567 n n CBB HBB HEM sing 568 n n CBB HBBA HEM sing 569 n n C1C C2C HEM sing 570 n y C1C NC HEM sing 571 n y C2C C3C HEM doub 572 n y C2C CMC HEM sing 573 n n C3C C4C HEM sing 574 n y C3C CAC HEM sing 575 n n C4C NC HEM sing 576 n y CMC HMC HEM sing 577 n n CMC HMCA HEM sing 578 n n CMC HMCB HEM sing 579 n n CAC CBC HEM doub 580 n n CAC HAC HEM sing 581 n n CBC HBC HEM sing 582 n n CBC HBCA HEM sing 583 n n C1D C2D HEM sing 584 n n C1D ND HEM doub 585 n n C2D C3D HEM doub 586 n n C2D CMD HEM sing 587 n n C3D C4D HEM sing 588 n n C3D CAD HEM sing 589 n n C4D ND HEM sing 590 n n CMD HMD HEM sing 591 n n CMD HMDA HEM sing 592 n n CMD HMDB HEM sing 593 n n CAD CBD HEM sing 594 n n CAD HAD HEM sing 595 n n CAD HADA HEM sing 596 n n CBD CGD HEM sing 597 n n CBD HBD HEM sing 598 n n CBD HBDA HEM sing 599 n n CGD O1D HEM doub 600 n n CGD O2D HEM sing 601 n n O2A H2A HEM sing 602 n n O2D H2D HEM sing 603 n n FE NA HEM sing 604 n n FE NB HEM sing 605 n n FE NC HEM sing 606 n n FE ND HEM sing 607 n n # _atom_sites.entry_id 3WMM _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.004399 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.002299 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006746 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006974 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code KA 7 HEM C 1 501 609 HEM HEM . LA 7 HEM C 1 502 610 HEM HEM . MA 7 HEM C 1 503 611 HEM HEM . NA 7 HEM C 1 504 612 HEM HEM . OA 8 CA C 1 505 615 CA CA . PA 9 BCL L 1 301 602 BCL BCL . QA 10 BPH L 1 302 606 BPH BPH . RA 11 UQ8 L 1 304 614 UQ8 UQ8 . SA 12 PO4 L 1 305 901 PO4 PO4 . TA 9 BCL L 1 303 604 BCL BCL . UA 9 BCL M 1 401 601 BCL BCL . VA 9 BCL M 1 402 603 BCL BCL . WA 10 BPH M 1 403 605 BPH BPH . XA 13 FE M 1 404 607 FE FE . YA 14 MQ8 M 1 405 608 MQ8 MQ8 . ZA 15 CRT M 1 406 613 CRT CRT . AB 16 PGW M 1 407 709 PGW PGW . BB 12 PO4 M 1 408 904 PO4 PO4 . CB 17 PEF H 1 301 708 PEF PEF . DB 16 PGW H 1 302 710 PGW PGW . EB 12 PO4 H 1 303 902 PO4 PO4 . FB 12 PO4 H 1 304 903 PO4 PO4 . GB 15 CRT A 1 101 97 CRT CRT . HB 9 BCL A 1 102 99 BCL BCL . IB 15 CRT A 1 103 97 CRT CRT . JB 8 CA A 1 104 98 CA CA . KB 9 BCL B 1 101 99 BCL BCL . LB 15 CRT B 1 102 97 CRT CRT . MB 8 CA D 1 101 98 CA CA . NB 9 BCL D 1 102 99 BCL BCL . OB 9 BCL E 1 101 99 BCL BCL . PB 8 CA F 1 101 98 CA CA . QB 9 BCL F 1 102 99 BCL BCL . RB 9 BCL G 1 101 99 BCL BCL . SB 15 CRT G 1 102 97 CRT CRT . TB 8 CA I 1 101 98 CA CA . UB 9 BCL I 1 102 99 BCL BCL . VB 9 BCL I 1 103 99 BCL BCL . WB 15 CRT J 1 101 97 CRT CRT . XB 8 CA K 1 101 98 CA CA . YB 9 BCL K 1 102 99 BCL BCL . ZB 9 BCL N 1 101 99 BCL BCL . AC 15 CRT N 1 102 97 CRT CRT . BC 8 CA O 1 101 98 CA CA . CC 9 BCL O 1 102 99 BCL BCL . DC 9 BCL P 1 101 99 BCL BCL . EC 15 CRT P 1 102 97 CRT CRT . FC 8 CA Q 1 101 98 CA CA . GC 9 BCL Q 1 102 99 BCL BCL . HC 9 BCL R 1 101 99 BCL BCL . IC 15 CRT R 1 102 97 CRT CRT . JC 8 CA S 1 101 98 CA CA . KC 9 BCL S 1 102 99 BCL BCL . LC 9 BCL T 1 101 99 BCL BCL . MC 15 CRT T 1 102 97 CRT CRT . NC 8 CA U 1 101 98 CA CA . OC 9 BCL U 1 102 99 BCL BCL . PC 9 BCL V 1 101 99 BCL BCL . QC 15 CRT V 1 102 97 CRT CRT . RC 8 CA W 1 101 98 CA CA . SC 9 BCL W 1 102 99 BCL BCL . TC 15 CRT W 1 103 97 CRT CRT . UC 9 BCL X 1 101 99 BCL BCL . VC 15 CRT X 1 102 97 CRT CRT . WC 8 CA Y 1 101 98 CA CA . XC 9 BCL Y 1 102 99 BCL BCL . YC 9 BCL Z 1 101 99 BCL BCL . ZC 8 CA 1 1 101 98 CA CA . AD 9 BCL 1 1 102 99 BCL BCL . BD 9 BCL 2 1 101 99 BCL BCL . CD 15 CRT 2 1 102 97 CRT CRT . DD 8 CA 3 1 101 98 CA CA . ED 9 BCL 3 1 102 99 BCL BCL . FD 15 CRT 3 1 103 97 CRT CRT . GD 9 BCL 4 1 101 99 BCL BCL . HD 15 CRT 4 1 102 97 CRT CRT . ID 8 CA 5 1 101 98 CA CA . JD 9 BCL 5 1 102 99 BCL BCL . KD 9 BCL 6 1 101 99 BCL BCL . LD 8 CA 7 1 101 98 CA CA . MD 9 BCL 7 1 102 99 BCL BCL . ND 9 BCL 7 1 103 99 BCL BCL . OD 15 CRT 8 1 101 97 CRT CRT . PD 8 CA 9 1 101 98 CA CA . QD 9 BCL 9 1 102 99 BCL BCL . RD 9 BCL 0 1 101 99 BCL BCL . SD 18 HOH L 1 401 802 HOH HOH . SD 18 HOH L 2 402 806 HOH HOH . SD 18 HOH L 3 403 807 HOH HOH . SD 18 HOH L 4 404 810 HOH HOH . TD 18 HOH H 1 401 804 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C CHA HEM . . . KA 7 -7.562 -13.93 15.451 1 63.07 ? CHA HEM 501 C 1 HETATM 2 C CHB HEM . . . KA 7 -3.925 -16.544 13.886 1 75.61 ? CHB HEM 501 C 1 HETATM 3 C CHC HEM . . . KA 7 -5.346 -15.988 9.305 1 70.5 ? CHC HEM 501 C 1 HETATM 4 C CHD HEM . . . KA 7 -8.951 -13.27 10.954 1 65.07 ? CHD HEM 501 C 1 HETATM 5 C C1A HEM . . . KA 7 -6.441 -14.698 15.441 1 66.32 ? C1A HEM 501 C 1 HETATM 6 C C2A HEM . . . KA 7 -5.749 -15.059 16.604 1 67.91 ? C2A HEM 501 C 1 HETATM 7 C C3A HEM . . . KA 7 -4.717 -15.814 16.172 1 73.37 ? C3A HEM 501 C 1 HETATM 8 C C4A HEM . . . KA 7 -4.769 -15.903 14.709 1 73.63 ? C4A HEM 501 C 1 HETATM 9 C CMA HEM . . . KA 7 -3.624 -16.494 17.03 1 72.6 ? CMA HEM 501 C 1 HETATM 10 C CAA HEM . . . KA 7 -6.071 -14.684 18.047 1 67 ? CAA HEM 501 C 1 HETATM 11 C CBA HEM . . . KA 7 -4.977 -13.79 18.637 1 65.61 ? CBA HEM 501 C 1 HETATM 12 C CGA HEM . . . KA 7 -5.439 -12.646 19.48 1 65.11 ? CGA HEM 501 C 1 HETATM 13 O O1A HEM . . . KA 7 -6.32 -11.844 19.028 1 61.69 ? O1A HEM 501 C 1 HETATM 14 O O2A HEM . . . KA 7 -4.943 -12.518 20.569 1 65.18 ? O2A HEM 501 C 1 HETATM 15 C C1B HEM . . . KA 7 -3.964 -16.653 12.491 1 69.94 ? C1B HEM 501 C 1 HETATM 16 C C2B HEM . . . KA 7 -3.008 -17.409 11.706 1 69.88 ? C2B HEM 501 C 1 HETATM 17 C C3B HEM . . . KA 7 -3.457 -17.272 10.362 1 68.19 ? C3B HEM 501 C 1 HETATM 18 C C4B HEM . . . KA 7 -4.597 -16.421 10.427 1 68.27 ? C4B HEM 501 C 1 HETATM 19 C CMB HEM . . . KA 7 -1.847 -18.174 12.217 1 75.33 ? CMB HEM 501 C 1 HETATM 20 C CAB HEM . . . KA 7 -2.824 -17.923 9.262 1 72.83 ? CAB HEM 501 C 1 HETATM 21 C CBB HEM . . . KA 7 -2.904 -19.231 9.083 1 73.05 ? CBB HEM 501 C 1 HETATM 22 C C1C HEM . . . KA 7 -6.475 -15.167 9.372 1 66.11 ? C1C HEM 501 C 1 HETATM 23 C C2C HEM . . . KA 7 -7.226 -14.718 8.163 1 62.04 ? C2C HEM 501 C 1 HETATM 24 C C3C HEM . . . KA 7 -8.271 -13.93 8.608 1 63.97 ? C3C HEM 501 C 1 HETATM 25 C C4C HEM . . . KA 7 -8.104 -13.934 10.128 1 64.56 ? C4C HEM 501 C 1 HETATM 26 C CMC HEM . . . KA 7 -6.906 -15.063 6.705 1 57.03 ? CMC HEM 501 C 1 HETATM 27 C CAC HEM . . . KA 7 -9.215 -13.309 7.851 1 64.46 ? CAC HEM 501 C 1 HETATM 28 C CBC HEM . . . KA 7 -10.299 -13.612 7.242 1 64.2 ? CBC HEM 501 C 1 HETATM 29 C C1D HEM . . . KA 7 -8.888 -13.228 12.342 1 59.46 ? C1D HEM 501 C 1 HETATM 30 C C2D HEM . . . KA 7 -9.877 -12.494 13.182 1 57.14 ? C2D HEM 501 C 1 HETATM 31 C C3D HEM . . . KA 7 -9.472 -12.705 14.456 1 54.35 ? C3D HEM 501 C 1 HETATM 32 C C4D HEM . . . KA 7 -8.266 -13.527 14.384 1 57.55 ? C4D HEM 501 C 1 HETATM 33 C CMD HEM . . . KA 7 -11.06 -11.722 12.628 1 62.32 ? CMD HEM 501 C 1 HETATM 34 C CAD HEM . . . KA 7 -10.154 -12.202 15.735 1 56.53 ? CAD HEM 501 C 1 HETATM 35 C CBD HEM . . . KA 7 -11.314 -13.128 16.086 1 58.33 ? CBD HEM 501 C 1 HETATM 36 C CGD HEM . . . KA 7 -12.316 -12.647 17.093 1 61.76 ? CGD HEM 501 C 1 HETATM 37 O O1D HEM . . . KA 7 -12.815 -13.495 17.917 1 63.24 ? O1D HEM 501 C 1 HETATM 38 O O2D HEM . . . KA 7 -12.683 -11.431 17.096 1 57.87 ? O2D HEM 501 C 1 HETATM 39 N NA HEM . . . KA 7 -5.843 -15.215 14.264 1 65.04 ? NA HEM 501 C 1 HETATM 40 N NB HEM . . . KA 7 -4.911 -16.069 11.779 1 65.64 ? NB HEM 501 C 1 HETATM 41 N NC HEM . . . KA 7 -7.061 -14.657 10.523 1 63.84 ? NC HEM 501 C 1 HETATM 42 N ND HEM . . . KA 7 -7.969 -13.825 13.097 1 60.26 ? ND HEM 501 C 1 HETATM 43 FE FE HEM . . . KA 7 -6.447 -14.968 12.423 1 61.95 ? FE HEM 501 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 53 _model_server_stats.parse_time_ms 21 _model_server_stats.create_model_time_ms 75 _model_server_stats.query_time_ms 320 _model_server_stats.encode_time_ms 15 _model_server_stats.element_count 43 #