data_3WSB
#
_model_server_result.job_id            N_7V-HQd8woh3GtvkaetHw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-02 11:23:04' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3wsb 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":502}' 
#
_entry.id    3WSB 
#
_exptl.entry_id    3WSB 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              330.551 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "N-[(2Z)-3,7-dimethylocta-2,6-dien-1-yl]-N'-[(1R,3S,5R,7R)-tricyclo[3.3.1.1~3,7~]dec-2-yl]ethane-1,2-diamine" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            3WSB 
_cell.length_a            79.361 
_cell.length_b            130.566 
_cell.length_c            144.63 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3WSB 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? tetrameric 4 author_defined_assembly 1 
PISA monomeric 1 software_defined_assembly 2 
PISA monomeric 1 software_defined_assembly 3 
PISA monomeric 1 software_defined_assembly 4 
PISA monomeric 1 software_defined_assembly 5 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P 1 1 
A,E,F,M 2 1 
B,G,H,N 3 1 
C,I,J,O 4 1 
D,K,L,P 5 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 F N N 
? 3 H N N 
? 3 J N N 
? 3 L N N 
#
_chem_comp.formula           'C22 H38 N2' 
_chem_comp.formula_weight    330.551 
_chem_comp.id                RWZ 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              "N-[(2Z)-3,7-dimethylocta-2,6-dien-1-yl]-N'-[(1R,3S,5R,7R)-tricyclo[3.3.1.1~3,7~]dec-2-yl]ethane-1,2-diamine" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
CAA CAR RWZ sing 328 n n 
CAA HAA RWZ sing 329 n n 
CAA HAAA RWZ sing 330 n n 
CAA HAAB RWZ sing 331 n n 
CAR CAB RWZ sing 332 n n 
CAB HAB RWZ sing 333 n n 
CAB HABA RWZ sing 334 n n 
CAB HABB RWZ sing 335 n n 
CAC CAS RWZ sing 336 n n 
CAC HAC RWZ sing 337 n n 
CAC HACA RWZ sing 338 n n 
CAC HACB RWZ sing 339 n n 
CAD CAF RWZ sing 340 n n 
CAD CAR RWZ doub 341 n n 
CAD HAD RWZ sing 342 n n 
CAE CAG RWZ sing 343 z n 
CAE CAS RWZ doub 344 n n 
CAE HAE RWZ sing 345 n n 
CAJ CAF RWZ sing 346 n n 
CAF HAF RWZ sing 347 n n 
CAF HAFA RWZ sing 348 n n 
CAG NAP RWZ sing 349 n n 
CAG HAG RWZ sing 350 n n 
CAG HAGA RWZ sing 351 n n 
CAH NAP RWZ sing 352 n n 
CAH CAI RWZ sing 353 n n 
CAH HAH RWZ sing 354 n n 
CAH HAHA RWZ sing 355 n n 
NAQ CAI RWZ sing 356 n n 
CAI HAI RWZ sing 357 n n 
CAI HAIA RWZ sing 358 n n 
CAS CAJ RWZ sing 359 n n 
CAJ HAJ RWZ sing 360 n n 
CAJ HAJA RWZ sing 361 n n 
CAU CAK RWZ sing 362 n n 
CAT CAK RWZ sing 363 n n 
CAK HAK RWZ sing 364 n n 
CAK HAKA RWZ sing 365 n n 
CAV CAL RWZ sing 366 n n 
CAL CAT RWZ sing 367 n n 
CAL HAL RWZ sing 368 n n 
CAL HALA RWZ sing 369 n n 
CAV CAM RWZ sing 370 n n 
CAM CAU RWZ sing 371 n n 
CAM HAM RWZ sing 372 n n 
CAM HAMA RWZ sing 373 n n 
CAW CAN RWZ sing 374 n n 
CAT CAN RWZ sing 375 n n 
CAN HAN RWZ sing 376 n n 
CAN HANA RWZ sing 377 n n 
CAW CAO RWZ sing 378 n n 
CAU CAO RWZ sing 379 n n 
CAO HAO RWZ sing 380 n n 
CAO HAOA RWZ sing 381 n n 
NAP HNAP RWZ sing 382 n n 
NAQ CAX RWZ sing 383 n n 
NAQ HNAQ RWZ sing 384 n n 
CAT HAT RWZ sing 385 n n 
CAU HAU RWZ sing 386 n n 
CAV CAX RWZ sing 387 n n 
CAV HAV RWZ sing 388 n n 
CAX CAW RWZ sing 389 n n 
CAW HAW RWZ sing 390 n n 
CAX HAX RWZ sing 391 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     3WSB 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.012601 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.007659 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.006914 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 FPS A 1 501 501 FPS FSP . 
F 3 RWZ A 1 502 601 RWZ RWZ . 
G 2 FPS B 1 401 502 FPS FSP . 
H 3 RWZ B 1 402 602 RWZ RWZ . 
I 2 FPS C 1 401 503 FPS FSP . 
J 3 RWZ C 1 402 603 RWZ RWZ . 
K 2 FPS D 1 401 504 FPS FSP . 
L 3 RWZ D 1 402 604 RWZ RWZ . 
M 4 HOH A 1 601 3 HOH WAT . 
M 4 HOH A 2 602 12 HOH WAT . 
M 4 HOH A 3 603 14 HOH WAT . 
M 4 HOH A 4 604 17 HOH WAT . 
M 4 HOH A 5 605 21 HOH WAT . 
M 4 HOH A 6 606 23 HOH WAT . 
M 4 HOH A 7 607 24 HOH WAT . 
M 4 HOH A 8 608 29 HOH WAT . 
M 4 HOH A 9 609 31 HOH WAT . 
M 4 HOH A 10 610 36 HOH WAT . 
M 4 HOH A 11 611 41 HOH WAT . 
M 4 HOH A 12 612 53 HOH WAT . 
M 4 HOH A 13 613 54 HOH WAT . 
M 4 HOH A 14 614 58 HOH WAT . 
M 4 HOH A 15 615 59 HOH WAT . 
M 4 HOH A 16 616 63 HOH WAT . 
M 4 HOH A 17 617 64 HOH WAT . 
M 4 HOH A 18 618 65 HOH WAT . 
M 4 HOH A 19 619 68 HOH WAT . 
M 4 HOH A 20 620 69 HOH WAT . 
M 4 HOH A 21 621 71 HOH WAT . 
M 4 HOH A 22 622 72 HOH WAT . 
M 4 HOH A 23 623 73 HOH WAT . 
M 4 HOH A 24 624 74 HOH WAT . 
M 4 HOH A 25 625 80 HOH WAT . 
M 4 HOH A 26 626 81 HOH WAT . 
M 4 HOH A 27 627 85 HOH WAT . 
M 4 HOH A 28 628 94 HOH WAT . 
M 4 HOH A 29 629 95 HOH WAT . 
M 4 HOH A 30 630 98 HOH WAT . 
M 4 HOH A 31 631 104 HOH WAT . 
M 4 HOH A 32 632 108 HOH WAT . 
M 4 HOH A 33 633 111 HOH WAT . 
M 4 HOH A 34 634 113 HOH WAT . 
M 4 HOH A 35 635 114 HOH WAT . 
M 4 HOH A 36 636 117 HOH WAT . 
M 4 HOH A 37 637 120 HOH WAT . 
M 4 HOH A 38 638 121 HOH WAT . 
M 4 HOH A 39 639 124 HOH WAT . 
M 4 HOH A 40 640 125 HOH WAT . 
M 4 HOH A 41 641 127 HOH WAT . 
M 4 HOH A 42 642 130 HOH WAT . 
M 4 HOH A 43 643 132 HOH WAT . 
M 4 HOH A 44 644 134 HOH WAT . 
M 4 HOH A 45 645 138 HOH WAT . 
M 4 HOH A 46 646 144 HOH WAT . 
M 4 HOH A 47 647 145 HOH WAT . 
M 4 HOH A 48 648 146 HOH WAT . 
M 4 HOH A 49 649 149 HOH WAT . 
M 4 HOH A 50 650 152 HOH WAT . 
M 4 HOH A 51 651 154 HOH WAT . 
M 4 HOH A 52 652 157 HOH WAT . 
M 4 HOH A 53 653 161 HOH WAT . 
M 4 HOH A 54 654 163 HOH WAT . 
M 4 HOH A 55 655 164 HOH WAT . 
M 4 HOH A 56 656 168 HOH WAT . 
M 4 HOH A 57 657 173 HOH WAT . 
M 4 HOH A 58 658 177 HOH WAT . 
M 4 HOH A 59 659 178 HOH WAT . 
M 4 HOH A 60 660 182 HOH WAT . 
M 4 HOH A 61 661 184 HOH WAT . 
M 4 HOH A 62 662 185 HOH WAT . 
M 4 HOH A 63 663 189 HOH WAT . 
M 4 HOH A 64 664 191 HOH WAT . 
M 4 HOH A 65 665 199 HOH WAT . 
M 4 HOH A 66 666 200 HOH WAT . 
M 4 HOH A 67 667 201 HOH WAT . 
M 4 HOH A 68 668 203 HOH WAT . 
M 4 HOH A 69 669 206 HOH WAT . 
M 4 HOH A 70 670 207 HOH WAT . 
M 4 HOH A 71 671 212 HOH WAT . 
M 4 HOH A 72 672 215 HOH WAT . 
M 4 HOH A 73 673 216 HOH WAT . 
M 4 HOH A 74 674 218 HOH WAT . 
M 4 HOH A 75 675 221 HOH WAT . 
M 4 HOH A 76 676 227 HOH WAT . 
M 4 HOH A 77 677 230 HOH WAT . 
M 4 HOH A 78 678 234 HOH WAT . 
M 4 HOH A 79 679 241 HOH WAT . 
M 4 HOH A 80 680 243 HOH WAT . 
M 4 HOH A 81 681 245 HOH WAT . 
M 4 HOH A 82 682 246 HOH WAT . 
M 4 HOH A 83 683 250 HOH WAT . 
M 4 HOH A 84 684 253 HOH WAT . 
M 4 HOH A 85 685 254 HOH WAT . 
M 4 HOH A 86 686 255 HOH WAT . 
M 4 HOH A 87 687 258 HOH WAT . 
M 4 HOH A 88 688 260 HOH WAT . 
M 4 HOH A 89 689 261 HOH WAT . 
M 4 HOH A 90 690 262 HOH WAT . 
M 4 HOH A 91 691 263 HOH WAT . 
M 4 HOH A 92 692 264 HOH WAT . 
M 4 HOH A 93 693 270 HOH WAT . 
M 4 HOH A 94 694 271 HOH WAT . 
M 4 HOH A 95 695 272 HOH WAT . 
M 4 HOH A 96 696 274 HOH WAT . 
M 4 HOH A 97 697 276 HOH WAT . 
M 4 HOH A 98 698 281 HOH WAT . 
M 4 HOH A 99 699 282 HOH WAT . 
M 4 HOH A 100 700 286 HOH WAT . 
M 4 HOH A 101 701 291 HOH WAT . 
M 4 HOH A 102 702 292 HOH WAT . 
M 4 HOH A 103 703 296 HOH WAT . 
M 4 HOH A 104 704 302 HOH WAT . 
M 4 HOH A 105 705 315 HOH WAT . 
M 4 HOH A 106 706 321 HOH WAT . 
M 4 HOH A 107 707 325 HOH WAT . 
M 4 HOH A 108 708 333 HOH WAT . 
M 4 HOH A 109 709 334 HOH WAT . 
M 4 HOH A 110 710 335 HOH WAT . 
M 4 HOH A 111 711 336 HOH WAT . 
M 4 HOH A 112 712 337 HOH WAT . 
M 4 HOH A 113 713 338 HOH WAT . 
M 4 HOH A 114 714 339 HOH WAT . 
M 4 HOH A 115 715 340 HOH WAT . 
M 4 HOH A 116 716 341 HOH WAT . 
M 4 HOH A 117 717 342 HOH WAT . 
M 4 HOH A 118 718 343 HOH WAT . 
M 4 HOH A 119 719 344 HOH WAT . 
M 4 HOH A 120 720 374 HOH WAT . 
M 4 HOH A 121 721 377 HOH WAT . 
M 4 HOH A 122 722 378 HOH WAT . 
M 4 HOH A 123 723 379 HOH WAT . 
M 4 HOH A 124 724 380 HOH WAT . 
M 4 HOH A 125 725 381 HOH WAT . 
M 4 HOH A 126 726 382 HOH WAT . 
M 4 HOH A 127 727 383 HOH WAT . 
M 4 HOH A 128 728 385 HOH WAT . 
M 4 HOH A 129 729 386 HOH WAT . 
M 4 HOH A 130 730 387 HOH WAT . 
M 4 HOH A 131 731 428 HOH WAT . 
M 4 HOH A 132 732 430 HOH WAT . 
M 4 HOH A 133 733 431 HOH WAT . 
M 4 HOH A 134 734 432 HOH WAT . 
N 4 HOH B 1 501 1 HOH WAT . 
N 4 HOH B 2 502 2 HOH WAT . 
N 4 HOH B 3 503 4 HOH WAT . 
N 4 HOH B 4 504 5 HOH WAT . 
N 4 HOH B 5 505 8 HOH WAT . 
N 4 HOH B 6 506 9 HOH WAT . 
N 4 HOH B 7 507 11 HOH WAT . 
N 4 HOH B 8 508 15 HOH WAT . 
N 4 HOH B 9 509 16 HOH WAT . 
N 4 HOH B 10 510 19 HOH WAT . 
N 4 HOH B 11 511 20 HOH WAT . 
N 4 HOH B 12 512 22 HOH WAT . 
N 4 HOH B 13 513 25 HOH WAT . 
N 4 HOH B 14 514 26 HOH WAT . 
N 4 HOH B 15 515 27 HOH WAT . 
N 4 HOH B 16 516 30 HOH WAT . 
N 4 HOH B 17 517 32 HOH WAT . 
N 4 HOH B 18 518 38 HOH WAT . 
N 4 HOH B 19 519 42 HOH WAT . 
N 4 HOH B 20 520 43 HOH WAT . 
N 4 HOH B 21 521 44 HOH WAT . 
N 4 HOH B 22 522 47 HOH WAT . 
N 4 HOH B 23 523 51 HOH WAT . 
N 4 HOH B 24 524 52 HOH WAT . 
N 4 HOH B 25 525 55 HOH WAT . 
N 4 HOH B 26 526 56 HOH WAT . 
N 4 HOH B 27 527 62 HOH WAT . 
N 4 HOH B 28 528 66 HOH WAT . 
N 4 HOH B 29 529 75 HOH WAT . 
N 4 HOH B 30 530 76 HOH WAT . 
N 4 HOH B 31 531 84 HOH WAT . 
N 4 HOH B 32 532 88 HOH WAT . 
N 4 HOH B 33 533 89 HOH WAT . 
N 4 HOH B 34 534 97 HOH WAT . 
N 4 HOH B 35 535 99 HOH WAT . 
N 4 HOH B 36 536 103 HOH WAT . 
N 4 HOH B 37 537 106 HOH WAT . 
N 4 HOH B 38 538 110 HOH WAT . 
N 4 HOH B 39 539 115 HOH WAT . 
N 4 HOH B 40 540 116 HOH WAT . 
N 4 HOH B 41 541 119 HOH WAT . 
N 4 HOH B 42 542 123 HOH WAT . 
N 4 HOH B 43 543 128 HOH WAT . 
N 4 HOH B 44 544 135 HOH WAT . 
N 4 HOH B 45 545 140 HOH WAT . 
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