data_3ZX0
#
_model_server_result.job_id            7nNCpOCGKVqFSA8NBFaqig 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-08 13:02:41' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          3zx0 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"S","auth_seq_id":531}' 
#
_entry.id    3ZX0 
#
_exptl.entry_id    3ZX0 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              1055.566 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'bis(mu4-oxo)-bis(mu3-oxo)-octakis(mu2-oxo)-dodecaoxo-heptamolybdenum (VI)' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          117.92 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            3ZX0 
_cell.length_a            163.807 
_cell.length_b            80.267 
_cell.length_c            164.921 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 3ZX0 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        5 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'C 1 2 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S 1 1 
C,D,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 J N N 
? 4 S N N 
? 4 T N N 
? 4 OA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 70 A CYS 84 1_555 A SG CYS 94 A CYS 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 229 A CYS 254 1_555 A SG CYS 275 A CYS 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? 
disulf ? disulf3 A SG CYS 256 A CYS 281 1_555 A SG CYS 299 A CYS 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? 
disulf ? disulf4 A SG CYS 312 A CYS 337 1_555 A SG CYS 317 A CYS 342 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
disulf ? disulf5 A SG CYS 366 A CYS 391 1_555 A SG CYS 389 A CYS 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? 
disulf ? disulf6 B SG CYS 70 B CYS 84 1_555 B SG CYS 94 B CYS 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
disulf ? disulf7 B SG CYS 229 B CYS 254 1_555 B SG CYS 275 B CYS 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? 
disulf ? disulf8 B SG CYS 256 B CYS 281 1_555 B SG CYS 299 B CYS 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.01 ? 
disulf ? disulf9 B SG CYS 312 B CYS 337 1_555 B SG CYS 317 B CYS 342 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf10 B SG CYS 366 B CYS 391 1_555 B SG CYS 389 B CYS 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? 
disulf ? disulf11 C SG CYS 70 C CYS 84 1_555 C SG CYS 94 C CYS 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? 
disulf ? disulf12 C SG CYS 229 C CYS 254 1_555 C SG CYS 275 C CYS 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? 
disulf ? disulf13 C SG CYS 256 C CYS 281 1_555 C SG CYS 299 C CYS 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? 
disulf ? disulf14 C SG CYS 312 C CYS 337 1_555 C SG CYS 317 C CYS 342 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.987 ? 
disulf ? disulf15 C SG CYS 366 C CYS 391 1_555 C SG CYS 389 C CYS 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? 
disulf ? disulf16 D SG CYS 70 D CYS 84 1_555 D SG CYS 94 D CYS 108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? 
disulf ? disulf17 D SG CYS 229 D CYS 254 1_555 D SG CYS 275 D CYS 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? 
disulf ? disulf18 D SG CYS 256 D CYS 281 1_555 D SG CYS 299 D CYS 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? 
disulf ? disulf19 D SG CYS 312 D CYS 337 1_555 D SG CYS 317 D CYS 342 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
disulf ? disulf20 D SG CYS 366 D CYS 391 1_555 D SG CYS 389 D CYS 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? 
metalc ? metalc1 B O CYS 317 B CYS 342 1_555 R NA NA . B NA 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.96 ? 
metalc ? metalc2 B O ALA 318 B ALA 343 1_555 R NA NA . B NA 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.576 ? 
metalc ? metalc3 B OE2 GLU 382 B GLU 407 1_555 T MO6 MO7 . C MO7 531 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? 
metalc ? metalc4 B O GLN 401 B GLN 426 1_555 R NA NA . B NA 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? 
metalc ? metalc5 B OD1 ASN 404 B ASN 429 1_555 R NA NA . B NA 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? 
metalc ? metalc6 C O LEU 304 C LEU 329 1_555 BA NA NA . C NA 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.975 ? 
metalc ? metalc7 C O PHE 307 C PHE 332 1_555 BA NA NA . C NA 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.19 ? 
metalc ? metalc8 C O CYS 317 C CYS 342 1_555 CA NA NA . C NA 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? 
metalc ? metalc9 C O ALA 318 C ALA 343 1_555 CA NA NA . C NA 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? 
metalc ? metalc10 C O GLN 401 C GLN 426 1_555 CA NA NA . C NA 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.586 ? 
metalc ? metalc11 C O GLY 402 C GLY 427 1_555 CA NA NA . C NA 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? 
metalc ? metalc12 C OD1 ASN 404 C ASN 429 1_555 CA NA NA . C NA 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? 
metalc ? metalc13 D O CYS 317 D CYS 342 1_555 NA NA NA . D NA 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.568 ? 
metalc ? metalc14 D O ALA 318 D ALA 343 1_555 NA NA NA . D NA 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.622 ? 
metalc ? metalc15 D O GLN 401 D GLN 426 1_555 NA NA NA . D NA 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.655 ? 
metalc ? metalc16 D O GLY 402 D GLY 427 1_555 NA NA NA . D NA 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.158 ? 
metalc ? metalc17 D OD1 ASN 404 D ASN 429 1_555 NA NA NA . D NA 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.58 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mo7 O24 -6' 
_chem_comp.formula_weight    1055.566 
_chem_comp.id                MO7 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'bis(mu4-oxo)-bis(mu3-oxo)-octakis(mu2-oxo)-dodecaoxo-heptamolybdenum (VI)' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     'HEPTAMOLYBDATE [Mo(VI)7O24]6-' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
MO1 O1 MO7 sing 242 n n 
MO1 O2 MO7 sing 243 n n 
MO1 O3 MO7 sing 244 n n 
MO1 O4 MO7 sing 245 n n 
MO1 O5 MO7 sing 246 n n 
MO1 O17 MO7 sing 247 n n 
O1 MO5 MO7 sing 248 n n 
O2 MO2 MO7 sing 249 n n 
O2 MO3 MO7 sing 250 n n 
O2 MO6 MO7 sing 251 n n 
O3 MO3 MO7 sing 252 n n 
O3 MO4 MO7 sing 253 n n 
O4 MO2 MO7 sing 254 n n 
O5 MO4 MO7 sing 255 n n 
O5 MO5 MO7 sing 256 n n 
O5 MO7 MO7 sing 257 n n 
MO2 O6 MO7 sing 258 n n 
MO2 O7 MO7 sing 259 n n 
MO2 O8 MO7 doub 260 n n 
MO2 O18 MO7 sing 261 n n 
O7 MO3 MO7 sing 262 n n 
MO3 O9 MO7 sing 263 n n 
MO3 O10 MO7 sing 264 n n 
MO3 O11 MO7 doub 265 n n 
O9 MO4 MO7 sing 266 n n 
MO4 O12 MO7 sing 267 n n 
MO4 O13 MO7 doub 268 n n 
MO4 O14 MO7 sing 269 n n 
O12 MO5 MO7 sing 270 n n 
MO5 O15 MO7 doub 271 n n 
MO5 O16 MO7 sing 272 n n 
MO5 O19 MO7 sing 273 n n 
O17 MO6 MO7 sing 274 n n 
O17 MO7 MO7 sing 275 n n 
O18 MO6 MO7 sing 276 n n 
O19 MO7 MO7 sing 277 n n 
MO6 O20 MO7 sing 278 n n 
MO6 O21 MO7 sing 279 n n 
MO6 O22 MO7 doub 280 n n 
MO7 O20 MO7 sing 281 n n 
MO7 O23 MO7 doub 282 n n 
MO7 O24 MO7 sing 283 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     3ZX0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.006105 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.003235 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.012458 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.006862 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 CL A 1 501 501 CL CL . 
F 2 CL A 1 502 502 CL CL . 
G 2 CL A 1 503 503 CL CL . 
H 2 CL A 1 505 505 CL CL . 
I 3 ACY A 1 511 511 ACY ACY . 
J 4 MO7 A 1 531 531 MO7 MO7 . 
K 2 CL B 1 501 501 CL CL . 
L 2 CL B 1 502 502 CL CL . 
M 2 CL B 1 503 503 CL CL . 
N 2 CL B 1 505 505 CL CL . 
O 2 CL B 1 506 506 CL CL . 
P 3 ACY B 1 511 511 ACY ACY . 
Q 3 ACY B 1 512 512 ACY ACY . 
R 5 NA B 1 521 521 NA NA . 
S 4 MO7 B 1 531 531 MO7 MO7 . 
T 4 MO7 C 1 531 531 MO7 MO7 . 
U 2 CL C 1 501 501 CL CL . 
V 2 CL C 1 502 502 CL CL . 
W 2 CL C 1 503 503 CL CL . 
X 2 CL C 1 505 505 CL CL . 
Y 2 CL C 1 506 506 CL CL . 
Z 3 ACY C 1 511 511 ACY ACY . 
AA 3 ACY C 1 512 512 ACY ACY . 
BA 5 NA C 1 521 521 NA NA . 
CA 5 NA C 1 522 522 NA NA . 
DA 2 CL D 1 501 501 CL CL . 
EA 2 CL D 1 502 502 CL CL . 
FA 2 CL D 1 503 503 CL CL . 
GA 2 CL D 1 505 505 CL CL . 
HA 2 CL D 1 506 506 CL CL . 
IA 2 CL D 1 507 507 CL CL . 
JA 2 CL D 1 508 508 CL CL . 
KA 2 CL D 1 509 509 CL CL . 
LA 3 ACY D 1 511 511 ACY ACY . 
MA 3 ACY D 1 512 512 ACY ACY . 
NA 5 NA D 1 521 521 NA NA . 
OA 4 MO7 D 1 531 531 MO7 MO7 . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 MO MO1 MO7 . A . S 4 9.327 20.205 46.942 0.5 77.41 ? MO1 MO7 531 B 1 
HETATM 2 O O1 MO7 . A . S 4 10.441 19.841 45.663 0.5 64.18 ? O1 MO7 531 B 1 
HETATM 3 O O2 MO7 . A . S 4 7.378 19.947 45.908 0.5 70.2 ? O2 MO7 531 B 1 
HETATM 4 O O3 MO7 . A . S 4 8.555 21.972 46.965 0.5 72.39 ? O3 MO7 531 B 1 
HETATM 5 O O4 MO7 . A . S 4 10.278 20.872 48.26 0.5 65.13 ? O4 MO7 531 B 1 
HETATM 6 O O5 MO7 . A . S 4 7.686 20.282 48.489 0.5 67.38 ? O5 MO7 531 B 1 
HETATM 7 MO MO2 MO7 . A . S 4 8.571 19.224 44.288 0.5 70.86 ? MO2 MO7 531 B 1 
HETATM 8 O O6 MO7 . A . S 4 7.195 18.579 43.454 0.5 56.96 ? O6 MO7 531 B 1 
HETATM 9 O O7 MO7 . A . S 4 8.406 21.169 44.307 0.5 78.89 ? O7 MO7 531 B 1 
HETATM 10 O O8 MO7 . A . S 4 9.802 19.184 43.06 0.5 56.72 ? O8 MO7 531 B 1 
HETATM 11 MO MO3 MO7 . A . S 4 7.028 22.105 45.418 0.5 94.82 ? MO3 MO7 531 B 1 
HETATM 12 O O9 MO7 . A . S 4 5.765 21.975 46.884 0.5 74.65 ? O9 MO7 531 B 1 
HETATM 13 O O10 MO7 . A . S 4 5.84 22.373 44.168 0.5 74.64 ? O10 MO7 531 B 1 
HETATM 14 O O11 MO7 . A . S 4 7.43 23.777 45.557 0.5 70.74 ? O11 MO7 531 B 1 
HETATM 15 MO MO4 MO7 . A . S 4 6.912 22.382 48.386 0.5 88.31 ? MO4 MO7 531 B 1 
HETATM 16 O O12 MO7 . A . S 4 5.701 22.156 49.61 0.5 82.95 ? O12 MO7 531 B 1 
HETATM 17 O O13 MO7 . A . S 4 8.153 22.604 49.888 0.5 66.44 ? O13 MO7 531 B 1 
HETATM 18 O O14 MO7 . A . S 4 6.923 24.082 48.11 0.5 67.65 ? O14 MO7 531 B 1 
HETATM 19 MO MO5 MO7 . A . S 4 8.827 20.838 50.207 0.5 64.19 ? MO5 MO7 531 B 1 
HETATM 20 O O15 MO7 . A . S 4 10.249 21.753 50.697 0.5 53.34 ? O15 MO7 531 B 1 
HETATM 21 O O16 MO7 . A . S 4 7.615 20.531 51.417 0.5 56.73 ? O16 MO7 531 B 1 
HETATM 22 O O17 MO7 . A . S 4 9.096 18.337 47.151 0.5 55.09 ? O17 MO7 531 B 1 
HETATM 23 O O18 MO7 . A . S 4 7.491 16.167 46.749 0.5 57.58 ? O18 MO7 531 B 1 
HETATM 24 O O19 MO7 . A . S 4 9.657 19.164 49.687 0.5 45.33 ? O19 MO7 531 B 1 
HETATM 25 MO MO6 MO7 . A . S 4 7.277 17.755 46.136 0.5 72.45 ? MO6 MO7 531 B 1 
HETATM 26 MO MO7 MO7 . A . S 4 8.077 18.181 49.059 0.5 52.53 ? MO7 MO7 531 B 1 
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