data_4A3K # _model_server_result.job_id O6vYmMKHhLyoBCwTA3h9ig _model_server_result.datetime_utc '2024-11-14 18:12:27' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4a3k # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"T","auth_seq_id":1269}' # _entry.id 4A3K # _exptl.entry_id 4A3K _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 65.409 _entity.id 16 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ZINC ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4A3K _cell.length_a 221.91 _cell.length_b 391.36 _cell.length_c 283.92 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4A3K _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 20 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 2 2 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 15 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 16 P N N ? 16 Q N N ? 16 S N N ? 16 T N N ? 16 U N N ? 16 V N N ? 16 W N N ? 16 X N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 O O3' DC 18 T DC 21 1_555 O P BRU 19 T BRU 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.598 ? covale ? covale2 O O3' BRU 19 T BRU 22 1_555 O P DG 20 T DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.589 ? metalc ? metalc1 A SG CYS 67 A CYS 67 1_555 Q ZN ZN . A ZN 2457 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 70 A CYS 70 1_555 Q ZN ZN . A ZN 2457 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 77 A CYS 77 1_555 Q ZN ZN . A ZN 2457 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.451 ? metalc ? metalc4 A NE2 HIS 80 A HIS 80 1_555 Q ZN ZN . A ZN 2457 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? metalc ? metalc5 A SG CYS 107 A CYS 107 1_555 P ZN ZN . A ZN 2456 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? metalc ? metalc6 A SG CYS 110 A CYS 110 1_555 P ZN ZN . A ZN 2456 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? metalc ? metalc7 A SG CYS 148 A CYS 148 1_555 P ZN ZN . A ZN 2456 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc8 A SG CYS 167 A CYS 167 1_555 P ZN ZN . A ZN 2456 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 481 A ASP 481 1_555 R MG MG . A MG 2458 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? metalc ? metalc10 A OD2 ASP 481 A ASP 481 1_555 R MG MG . A MG 2458 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.968 ? metalc ? metalc11 A OD1 ASP 483 A ASP 483 1_555 R MG MG . A MG 2458 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.97 ? metalc ? metalc12 A OD2 ASP 483 A ASP 483 1_555 R MG MG . A MG 2458 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc13 A OD1 ASP 485 A ASP 485 1_555 R MG MG . A MG 2458 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? metalc ? metalc14 R MG MG . A MG 2458 1_555 N O3' A 7 P A 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.933 ? metalc ? metalc15 B SG CYS 1163 B CYS 1163 1_555 S ZN ZN . B ZN 2225 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? metalc ? metalc16 B SG CYS 1166 B CYS 1166 1_555 S ZN ZN . B ZN 2225 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.23 ? metalc ? metalc17 B SG CYS 1182 B CYS 1182 1_555 S ZN ZN . B ZN 2225 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc18 B SG CYS 1185 B CYS 1185 1_555 S ZN ZN . B ZN 2225 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.359 ? metalc ? metalc19 C SG CYS 86 C CYS 86 1_555 T ZN ZN . C ZN 1269 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? metalc ? metalc20 C SG CYS 88 C CYS 88 1_555 T ZN ZN . C ZN 1269 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc ? metalc21 C SG CYS 92 C CYS 92 1_555 T ZN ZN . C ZN 1269 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? metalc ? metalc22 C SG CYS 95 C CYS 95 1_555 T ZN ZN . C ZN 1269 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc23 I SG CYS 7 I CYS 7 1_555 U ZN ZN . I ZN 1121 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc24 I SG CYS 10 I CYS 10 1_555 U ZN ZN . I ZN 1121 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.208 ? metalc ? metalc25 I SG CYS 29 I CYS 29 1_555 U ZN ZN . I ZN 1121 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc ? metalc26 I SG CYS 32 I CYS 32 1_555 U ZN ZN . I ZN 1121 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? metalc ? metalc27 I SG CYS 75 I CYS 75 1_555 V ZN ZN . I ZN 1122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? metalc ? metalc28 I SG CYS 78 I CYS 78 1_555 V ZN ZN . I ZN 1122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc29 I SG CYS 103 I CYS 103 1_555 V ZN ZN . I ZN 1122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? metalc ? metalc30 I SG CYS 106 I CYS 106 1_555 V ZN ZN . I ZN 1122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc ? metalc31 J SG CYS 7 J CYS 7 1_555 W ZN ZN . J ZN 1066 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.225 ? metalc ? metalc32 J SG CYS 10 J CYS 10 1_555 W ZN ZN . J ZN 1066 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc33 J SG CYS 45 J CYS 45 1_555 W ZN ZN . J ZN 1066 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? metalc ? metalc34 J SG CYS 46 J CYS 46 1_555 W ZN ZN . J ZN 1066 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc35 L SG CYS 31 L CYS 31 1_555 X ZN ZN . L ZN 1071 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.462 ? metalc ? metalc36 L SG CYS 34 L CYS 34 1_555 X ZN ZN . L ZN 1071 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? metalc ? metalc37 L SG CYS 48 L CYS 48 1_555 X ZN ZN . L ZN 1071 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? metalc ? metalc38 L SG CYS 51 L CYS 51 1_555 X ZN ZN . L ZN 1071 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 M N1 DA 2 N DA 2 1_555 O N3 DT 13 T DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 M N6 DA 2 N DA 2 1_555 O O4 DT 13 T DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 M N1 DA 3 N DA 3 1_555 O N3 DT 12 T DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 M N6 DA 3 N DA 3 1_555 O O4 DT 12 T DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 M N1 DG 4 N DG 4 1_555 O N3 DC 11 T DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 M N2 DG 4 N DG 4 1_555 O O2 DC 11 T DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 M O6 DG 4 N DG 4 1_555 O N4 DC 11 T DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 M N3 DT 5 N DT 5 1_555 O N1 DA 10 T DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 M O4 DT 5 N DT 5 1_555 O N6 DA 10 T DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 M N1 DA 6 N DA 6 1_555 O N3 DT 9 T DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 M N6 DA 6 N DA 6 1_555 O O4 DT 9 T DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 M N3 DC 7 N DC 7 1_555 O N1 DG 8 T DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 M N4 DC 7 N DC 7 1_555 O O6 DG 8 T DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 M O2 DC 7 N DC 7 1_555 O N2 DG 8 T DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 M N3 DT 8 N DT 8 1_555 O N1 DA 7 T DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 M O4 DT 8 N DT 8 1_555 O N6 DA 7 T DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 M N3 DT 9 N DT 9 1_555 O N1 DA 6 T DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 M O4 DT 9 N DT 9 1_555 O N6 DA 6 T DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog19 M N1 DG 10 N DG 10 1_555 O O2 DT 4 T DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog20 M O6 DG 10 N DG 10 1_555 O N3 DT 4 T DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 M N1 DG 10 N DG 10 1_555 O N3 DC 5 T DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 M N2 DG 10 N DG 10 1_555 O O2 DC 5 T DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 M O6 DG 10 N DG 10 1_555 O N4 DC 5 T DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 M N1 DA 11 N DA 11 1_555 O N3 DT 4 T DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 M N6 DA 11 N DA 11 1_555 O O4 DT 4 T DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 N N1 A 1 P A 4 1_555 O N3 DT 22 T DT 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 N N6 A 1 P A 4 1_555 O O4 DT 22 T DT 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 N N3 C 2 P C 5 1_555 O N1 DG 21 T DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 N N4 C 2 P C 5 1_555 O O6 DG 21 T DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 N O2 C 2 P C 5 1_555 O N2 DG 21 T DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 N N3 C 3 P C 6 1_555 O N1 DG 20 T DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 N N4 C 3 P C 6 1_555 O O6 DG 20 T DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 N O2 C 3 P C 6 1_555 O N2 DG 20 T DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 N N1 A 4 P A 7 1_555 O N3 BRU 19 T BRU 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 N N6 A 4 P A 7 1_555 O O4 BRU 19 T BRU 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 N N1 G 5 P G 8 1_555 O N3 DC 18 T DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 N N2 G 5 P G 8 1_555 O O2 DC 18 T DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 N O6 G 5 P G 8 1_555 O N4 DC 18 T DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 N N1 G 6 P G 9 1_555 O N3 DC 17 T DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 N N2 G 6 P G 9 1_555 O O2 DC 17 T DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 N O6 G 6 P G 9 1_555 O N4 DC 17 T DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 N N1 A 7 P A 10 1_555 O N3 DT 16 T DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 N N6 A 7 P A 10 1_555 O O4 DT 16 T DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Zn 2' _chem_comp.formula_weight 65.409 _chem_comp.id ZN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ZINC ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 4A3K _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.004506 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.002555 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.003522 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code P 16 ZN A 1 2456 2456 ZN ZN . Q 16 ZN A 1 2457 2457 ZN ZN . R 17 MG A 1 2458 2458 MG MG . S 16 ZN B 1 2225 2225 ZN ZN . T 16 ZN C 1 1269 1269 ZN ZN . U 16 ZN I 1 1121 1121 ZN ZN . V 16 ZN I 1 1122 1122 ZN ZN . W 16 ZN J 1 1066 1066 ZN ZN . X 16 ZN L 1 1071 1071 ZN ZN . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol ZN _atom_site.label_atom_id ZN _atom_site.label_comp_id ZN _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id T _atom_site.label_entity_id 16 _atom_site.Cartn_x 108.193 _atom_site.Cartn_y -4.375 _atom_site.Cartn_z 22.401 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 84.18 _atom_site.pdbx_formal_charge 2 _atom_site.auth_atom_id ZN _atom_site.auth_comp_id ZN _atom_site.auth_seq_id 1269 _atom_site.auth_asym_id C _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 64 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 36 _model_server_stats.query_time_ms 315 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #