data_4A55
#
_model_server_result.job_id            n6oOP1fpvkkwhTL-snqLxw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-23 02:00:47' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4a55 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":2063}' 
#
_entry.id    4A55 
#
_exptl.entry_id    4A55 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              364.438 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            PIK-108 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            4A55 
_cell.length_a            136.092 
_cell.length_b            147.184 
_cell.length_c            226.478 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4A55 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        23 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'I 2 2 2' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 C N N 
? 3 D N N 
#
_chem_comp.formula           'C22 H24 N2 O3' 
_chem_comp.formula_weight    364.438 
_chem_comp.id                P08 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              PIK-108 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
CAN CAL P08 sing 235 n n 
CAN NBA P08 sing 236 n n 
CAL OAQ P08 sing 237 n n 
OAQ CAM P08 sing 238 n n 
CAM CAO P08 sing 239 n n 
CAO NBA P08 sing 240 n n 
NBA CAU P08 sing 241 n n 
CAU CAJ P08 doub 242 n n 
CAU OAR P08 sing 243 n n 
CAJ CAW P08 sing 244 n n 
CAW OAC P08 doub 245 n n 
CAW CAX P08 sing 246 n n 
OAR CAY P08 sing 247 n n 
CAY CAX P08 sing 248 n y 
CAY CAV P08 doub 249 n y 
CAX CAK P08 doub 250 n y 
CAK CAS P08 sing 251 n y 
CAS CAA P08 sing 252 n n 
CAS CAI P08 doub 253 n y 
CAI CAV P08 sing 254 n y 
CAV CAZ P08 sing 255 n n 
CAZ CAB P08 sing 256 n n 
CAZ NAP P08 sing 257 n n 
NAP CAT P08 sing 258 n n 
CAT CAG P08 sing 259 n y 
CAT CAH P08 doub 260 n y 
CAG CAE P08 doub 261 n y 
CAE CAD P08 sing 262 n y 
CAD CAF P08 doub 263 n y 
CAF CAH P08 sing 264 n y 
CAN HAN1 P08 sing 265 n n 
CAN HAN2 P08 sing 266 n n 
CAL HAL1 P08 sing 267 n n 
CAL HAL2 P08 sing 268 n n 
CAM HAM1 P08 sing 269 n n 
CAM HAM2 P08 sing 270 n n 
CAO HAO1 P08 sing 271 n n 
CAO HAO2 P08 sing 272 n n 
CAJ HAJ P08 sing 273 n n 
CAK HAK P08 sing 274 n n 
CAA HAA1 P08 sing 275 n n 
CAA HAA2 P08 sing 276 n n 
CAA HAA3 P08 sing 277 n n 
CAI HAI P08 sing 278 n n 
CAZ HAZ P08 sing 279 n n 
CAB HAB1 P08 sing 280 n n 
CAB HAB2 P08 sing 281 n n 
CAB HAB3 P08 sing 282 n n 
NAP HAP P08 sing 283 n n 
CAG HAG P08 sing 284 n n 
CAH HAH P08 sing 285 n n 
CAE HAE P08 sing 286 n n 
CAD HAD P08 sing 287 n n 
CAF HAF P08 sing 288 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     4A55 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.007348 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.006794 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.004415 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 3 P08 A 1 2062 2062 P08 P08 . 
D 3 P08 A 1 2063 2063 P08 P08 . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C CAN P08 . . . D 3 -36.947 -24.862 47.736 1 125.64 ? CAN P08 2063 A 1 
HETATM 2 C CAL P08 . . . D 3 -37.55 -24.761 46.321 1 127.18 ? CAL P08 2063 A 1 
HETATM 3 O OAQ P08 . . . D 3 -37.13 -23.535 45.707 1 119.98 ? OAQ P08 2063 A 1 
HETATM 4 C CAM P08 . . . D 3 -37.452 -22.372 46.518 1 109.02 ? CAM P08 2063 A 1 
HETATM 5 C CAO P08 . . . D 3 -36.811 -22.465 47.918 1 107.46 ? CAO P08 2063 A 1 
HETATM 6 N NBA P08 . . . D 3 -37.277 -23.671 48.594 1 115.23 ? NBA P08 2063 A 1 
HETATM 7 C CAU P08 . . . D 3 -36.91 -23.733 49.892 1 110.51 ? CAU P08 2063 A 1 
HETATM 8 C CAJ P08 . . . D 3 -36.233 -24.85 50.385 1 114.7 ? CAJ P08 2063 A 1 
HETATM 9 C CAW P08 . . . D 3 -35.897 -24.953 51.725 1 116.4 ? CAW P08 2063 A 1 
HETATM 10 O OAC P08 . . . D 3 -35.288 -25.965 52.123 1 113.68 ? OAC P08 2063 A 1 
HETATM 11 O OAR P08 . . . D 3 -37.291 -22.713 50.743 1 116.1 ? OAR P08 2063 A 1 
HETATM 12 C CAY P08 . . . D 3 -36.987 -22.795 52.101 1 119.24 ? CAY P08 2063 A 1 
HETATM 13 C CAX P08 . . . D 3 -36.292 -23.919 52.575 1 116.04 ? CAX P08 2063 A 1 
HETATM 14 C CAK P08 . . . D 3 -36.001 -24.008 53.928 1 113.87 ? CAK P08 2063 A 1 
HETATM 15 C CAS P08 . . . D 3 -36.367 -23.004 54.802 1 109.01 ? CAS P08 2063 A 1 
HETATM 16 C CAA P08 . . . D 3 -36.053 -23.102 56.145 1 108.49 ? CAA P08 2063 A 1 
HETATM 17 C CAI P08 . . . D 3 -37.039 -21.897 54.337 1 111.92 ? CAI P08 2063 A 1 
HETATM 18 C CAV P08 . . . D 3 -37.367 -21.76 52.997 1 119.14 ? CAV P08 2063 A 1 
HETATM 19 C CAZ P08 . . . D 3 -38.094 -20.586 52.686 1 124.06 ? CAZ P08 2063 A 1 
HETATM 20 C CAB P08 . . . D 3 -39.458 -20.923 52.099 1 142.57 ? CAB P08 2063 A 1 
HETATM 21 N NAP P08 . . . D 3 -37.444 -19.791 51.697 1 127.45 ? NAP P08 2063 A 1 
HETATM 22 C CAT P08 . . . D 3 -36.887 -18.669 52.018 1 122.55 ? CAT P08 2063 A 1 
HETATM 23 C CAG P08 . . . D 3 -37.628 -17.517 51.969 1 137.06 ? CAG P08 2063 A 1 
HETATM 24 C CAE P08 . . . D 3 -37.012 -16.311 52.275 1 148.98 ? CAE P08 2063 A 1 
HETATM 25 C CAD P08 . . . D 3 -35.672 -16.281 52.622 1 134.7 ? CAD P08 2063 A 1 
HETATM 26 C CAF P08 . . . D 3 -34.94 -17.456 52.664 1 127.24 ? CAF P08 2063 A 1 
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