data_4AVT # _model_server_result.job_id npb3wWI-CRkqcROjtzA0Mw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-16 18:27:20' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4avt # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"M","auth_seq_id":1207}' # _entry.id 4AVT # _exptl.entry_id 4AVT _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 3 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 10 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4AVT _cell.length_a 230.864 _cell.length_b 230.864 _cell.length_c 281.393 _cell.Z_PDB 80 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4AVT _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 96 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 43 21 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA pentameric 5 author_and_software_defined_assembly 1 PISA pentameric 5 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,E,G,I,K,L,M,R,S,T,U,Y,Z,AA,BA,FA,GA,HA,IA,MA,NA,OA 1 1 B,D,F,H,J,N,O,P,Q,V,W,X,CA,DA,EA,JA,KA,LA,PA,QA,RA,SA 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 M N N ? 3 Q N N ? 3 U N N ? 3 X N N ? 3 BA N N ? 3 EA N N ? 3 IA N N ? 3 LA N N ? 3 OA N N ? 3 SA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A ND2 ASN 32 A ASN 32 1_555 M C1 NAG . A NAG 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale ? covale2 B ND2 ASN 32 B ASN 32 1_555 Q C1 NAG . B NAG 1208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.486 ? covale ? covale3 C ND2 ASN 32 C ASN 32 1_555 U C1 NAG . C NAG 1208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? covale ? covale4 D ND2 ASN 32 D ASN 32 1_555 X C1 NAG . D NAG 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? covale ? covale5 E ND2 ASN 32 E ASN 32 1_555 BA C1 NAG . E NAG 1208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale6 F ND2 ASN 32 F ASN 32 1_555 EA C1 NAG . F NAG 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale7 G ND2 ASN 32 G ASN 32 1_555 IA C1 NAG . G NAG 1208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale8 H ND2 ASN 32 H ASN 32 1_555 LA C1 NAG . H NAG 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.476 ? covale ? covale9 I ND2 ASN 32 I ASN 32 1_555 OA C1 NAG . I NAG 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale10 J ND2 ASN 32 J ASN 32 1_555 SA C1 NAG . J NAG 1208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 58 A ASP 58 1_555 K CA CA . A CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 58 A ASP 58 1_555 K CA CA . A CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.476 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASN 59 A ASN 59 1_555 K CA CA . A CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLU 136 A GLU 136 1_555 K CA CA . A CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.016 ? metalc ? metalc5 A OE2 GLU 136 A GLU 136 1_555 K CA CA . A CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc6 A OE1 GLU 136 A GLU 136 1_555 L CA CA . A CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.587 ? metalc ? metalc7 A O GLN 137 A GLN 137 1_555 K CA CA . A CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.412 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASP 138 A ASP 138 1_555 K CA CA . A CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 138 A ASP 138 1_555 L CA CA . A CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? metalc ? metalc10 A OD2 ASP 138 A ASP 138 1_555 L CA CA . A CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? metalc ? metalc11 A OE1 GLN 148 A GLN 148 1_555 L CA CA . A CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? metalc ? metalc12 K CA CA . A CA 1205 1_555 P O2 GHE . B GHE 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? metalc ? metalc13 L CA CA . A CA 1206 1_555 P O1 GHE . B GHE 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.586 ? metalc ? metalc14 B OD2 ASP 58 B ASP 58 1_555 N CA CA . B CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? metalc ? metalc15 B OD1 ASP 58 B ASP 58 1_555 N CA CA . B CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? metalc ? metalc16 B OD1 ASN 59 B ASN 59 1_555 N CA CA . B CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? metalc ? metalc17 B OE1 GLU 136 B GLU 136 1_555 N CA CA . B CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.93 ? metalc ? metalc18 B OE2 GLU 136 B GLU 136 1_555 N CA CA . B CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.127 ? metalc ? metalc19 B OE1 GLU 136 B GLU 136 1_555 O CA CA . B CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? metalc ? metalc20 B O GLN 137 B GLN 137 1_555 N CA CA . B CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? metalc ? metalc21 B OD1 ASP 138 B ASP 138 1_555 N CA CA . B CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? metalc ? metalc22 B OD2 ASP 138 B ASP 138 1_555 O CA CA . B CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? metalc ? metalc23 B OD1 ASP 138 B ASP 138 1_555 O CA CA . B CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.65 ? metalc ? metalc24 B OE1 GLN 148 B GLN 148 1_555 O CA CA . B CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? metalc ? metalc25 N CA CA . B CA 1205 1_555 P O16 GHE . B GHE 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? metalc ? metalc26 O CA CA . B CA 1206 1_555 P O17 GHE . B GHE 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.733 ? metalc ? metalc27 C OD1 ASP 58 C ASP 58 1_555 R CA CA . C CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? metalc ? metalc28 C OD2 ASP 58 C ASP 58 1_555 R CA CA . C CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.619 ? metalc ? metalc29 C OD1 ASN 59 C ASN 59 1_555 R CA CA . C CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc30 C OE2 GLU 136 C GLU 136 1_555 R CA CA . C CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.108 ? metalc ? metalc31 C OE1 GLU 136 C GLU 136 1_555 R CA CA . C CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.889 ? metalc ? metalc32 C OE1 GLU 136 C GLU 136 1_555 S CA CA . C CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? metalc ? metalc33 C O GLN 137 C GLN 137 1_555 R CA CA . C CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? metalc ? metalc34 C OD1 ASP 138 C ASP 138 1_555 R CA CA . C CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.492 ? metalc ? metalc35 C OD1 ASP 138 C ASP 138 1_555 S CA CA . C CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.622 ? metalc ? metalc36 C OD2 ASP 138 C ASP 138 1_555 S CA CA . C CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.108 ? metalc ? metalc37 C OE1 GLN 148 C GLN 148 1_555 S CA CA . C CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.119 ? metalc ? metalc38 R CA CA . C CA 1205 1_555 T O2 GHE . C GHE 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc39 S CA CA . C CA 1206 1_555 T O1 GHE . C GHE 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.451 ? metalc ? metalc40 T O16 GHE . C GHE 1207 1_555 V CA CA . D CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? metalc ? metalc41 T O17 GHE . C GHE 1207 1_555 W CA CA . D CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.529 ? metalc ? metalc42 D OD1 ASP 58 D ASP 58 1_555 V CA CA . D CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc43 D OD2 ASP 58 D ASP 58 1_555 V CA CA . D CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.658 ? metalc ? metalc44 D OD1 ASN 59 D ASN 59 1_555 V CA CA . D CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc ? metalc45 D OE2 GLU 136 D GLU 136 1_555 V CA CA . D CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? metalc ? metalc46 D OE1 GLU 136 D GLU 136 1_555 V CA CA . D CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.895 ? metalc ? metalc47 D OE1 GLU 136 D GLU 136 1_555 W CA CA . D CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? metalc ? metalc48 D O GLN 137 D GLN 137 1_555 V CA CA . D CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? metalc ? metalc49 D OD1 ASP 138 D ASP 138 1_555 V CA CA . D CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? metalc ? metalc50 D OD2 ASP 138 D ASP 138 1_555 W CA CA . D CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? metalc ? metalc51 D OD1 ASP 138 D ASP 138 1_555 W CA CA . D CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.576 ? metalc ? metalc52 D OE1 GLN 148 D GLN 148 1_555 W CA CA . D CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.15 ? metalc ? metalc53 E OD2 ASP 58 E ASP 58 1_555 Y CA CA . E CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.559 ? metalc ? metalc54 E OD1 ASP 58 E ASP 58 1_555 Y CA CA . E CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? metalc ? metalc55 E OD1 ASN 59 E ASN 59 1_555 Y CA CA . E CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc56 E OE2 GLU 136 E GLU 136 1_555 Y CA CA . E CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.13 ? metalc ? metalc57 E OE1 GLU 136 E GLU 136 1_555 Y CA CA . E CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.92 ? metalc ? metalc58 E OE1 GLU 136 E GLU 136 1_555 Z CA CA . E CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? metalc ? metalc59 E O GLN 137 E GLN 137 1_555 Y CA CA . E CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.411 ? metalc ? metalc60 E OD1 ASP 138 E ASP 138 1_555 Y CA CA . E CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.351 ? metalc ? metalc61 E OD2 ASP 138 E ASP 138 1_555 Z CA CA . E CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? metalc ? metalc62 E OD1 ASP 138 E ASP 138 1_555 Z CA CA . E CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? metalc ? metalc63 E OE1 GLN 148 E GLN 148 1_555 Z CA CA . E CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.113 ? metalc ? metalc64 Y CA CA . E CA 1205 1_555 AA O2 GHE . E GHE 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? metalc ? metalc65 Z CA CA . E CA 1206 1_555 AA O1 GHE . E GHE 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.476 ? metalc ? metalc66 AA O16 GHE . E GHE 1207 1_555 CA CA CA . F CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.486 ? metalc ? metalc67 AA O17 GHE . E GHE 1207 1_555 DA CA CA . F CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.472 ? metalc ? metalc68 F OD2 ASP 58 F ASP 58 1_555 CA CA CA . F CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? metalc ? metalc69 F OD1 ASP 58 F ASP 58 1_555 CA CA CA . F CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc70 F OD1 ASN 59 F ASN 59 1_555 CA CA CA . F CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc71 F OE2 GLU 136 F GLU 136 1_555 CA CA CA . F CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.24 ? metalc ? metalc72 F OE1 GLU 136 F GLU 136 1_555 CA CA CA . F CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.009 ? metalc ? metalc73 F OE1 GLU 136 F GLU 136 1_555 DA CA CA . F CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? metalc ? metalc74 F O GLN 137 F GLN 137 1_555 CA CA CA . F CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? metalc ? metalc75 F OD1 ASP 138 F ASP 138 1_555 CA CA CA . F CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? metalc ? metalc76 F OD1 ASP 138 F ASP 138 1_555 DA CA CA . F CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc77 F OD2 ASP 138 F ASP 138 1_555 DA CA CA . F CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? metalc ? metalc78 F OE1 GLN 148 F GLN 148 1_555 DA CA CA . F CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? metalc ? metalc79 G OD2 ASP 58 G ASP 58 1_555 FA CA CA . G CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? metalc ? metalc80 G OD1 ASP 58 G ASP 58 1_555 FA CA CA . G CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? metalc ? metalc81 G OD1 ASN 59 G ASN 59 1_555 FA CA CA . G CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc ? metalc82 G OE2 GLU 136 G GLU 136 1_555 FA CA CA . G CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.125 ? metalc ? metalc83 G OE1 GLU 136 G GLU 136 1_555 FA CA CA . G CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.931 ? metalc ? metalc84 G OE1 GLU 136 G GLU 136 1_555 GA CA CA . G CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.549 ? metalc ? metalc85 G O GLN 137 G GLN 137 1_555 FA CA CA . G CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? metalc ? metalc86 G OD1 ASP 138 G ASP 138 1_555 FA CA CA . G CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.37 ? metalc ? metalc87 G OD2 ASP 138 G ASP 138 1_555 GA CA CA . G CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.164 ? metalc ? metalc88 G OD1 ASP 138 G ASP 138 1_555 GA CA CA . G CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? metalc ? metalc89 G OE1 GLN 148 G GLN 148 1_555 GA CA CA . G CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc90 FA CA CA . G CA 1205 1_555 HA O2 GHE . G GHE 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.17 ? metalc ? metalc91 GA CA CA . G CA 1206 1_555 HA O1 GHE . G GHE 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.563 ? metalc ? metalc92 HA O16 GHE . G GHE 1207 1_555 JA CA CA . H CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? metalc ? metalc93 HA O17 GHE . G GHE 1207 1_555 KA CA CA . H CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? metalc ? metalc94 H OD1 ASP 58 H ASP 58 1_555 JA CA CA . H CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? metalc ? metalc95 H OD2 ASP 58 H ASP 58 1_555 JA CA CA . H CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.556 ? metalc ? metalc96 H OD1 ASN 59 H ASN 59 1_555 JA CA CA . H CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc97 H OE2 GLU 136 H GLU 136 1_555 JA CA CA . H CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.16 ? metalc ? metalc98 H OE1 GLU 136 H GLU 136 1_555 JA CA CA . H CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.02 ? metalc ? metalc99 H OE1 GLU 136 H GLU 136 1_555 KA CA CA . H CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.565 ? metalc ? metalc100 H O GLN 137 H GLN 137 1_555 JA CA CA . H CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? metalc ? metalc101 H OD1 ASP 138 H ASP 138 1_555 JA CA CA . H CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? metalc ? metalc102 H OD2 ASP 138 H ASP 138 1_555 KA CA CA . H CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? metalc ? metalc103 H OD1 ASP 138 H ASP 138 1_555 KA CA CA . H CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? metalc ? metalc104 H OE1 GLN 148 H GLN 148 1_555 KA CA CA . H CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? metalc ? metalc105 I OD2 ASP 58 I ASP 58 1_555 MA CA CA . I CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? metalc ? metalc106 I OD1 ASP 58 I ASP 58 1_555 MA CA CA . I CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc107 I OD1 ASN 59 I ASN 59 1_555 MA CA CA . I CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc ? metalc108 I OE2 GLU 136 I GLU 136 1_555 MA CA CA . I CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.212 ? metalc ? metalc109 I OE1 GLU 136 I GLU 136 1_555 MA CA CA . I CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.007 ? metalc ? metalc110 I OE1 GLU 136 I GLU 136 1_555 NA CA CA . I CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? metalc ? metalc111 I O GLN 137 I GLN 137 1_555 MA CA CA . I CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? metalc ? metalc112 I OD1 ASP 138 I ASP 138 1_555 MA CA CA . I CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? metalc ? metalc113 I OD2 ASP 138 I ASP 138 1_555 NA CA CA . I CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? metalc ? metalc114 I OD1 ASP 138 I ASP 138 1_555 NA CA CA . I CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? metalc ? metalc115 I OE1 GLN 148 I GLN 148 1_555 NA CA CA . I CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc116 MA CA CA . I CA 1205 1_555 RA O2 GHE . J GHE 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.445 ? metalc ? metalc117 NA CA CA . I CA 1206 1_555 RA O1 GHE . J GHE 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc ? metalc118 J OD2 ASP 58 J ASP 58 1_555 PA CA CA . J CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc119 J OD1 ASP 58 J ASP 58 1_555 PA CA CA . J CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.212 ? metalc ? metalc120 J OD1 ASN 59 J ASN 59 1_555 PA CA CA . J CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc121 J OE1 GLU 136 J GLU 136 1_555 PA CA CA . J CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.035 ? metalc ? metalc122 J OE2 GLU 136 J GLU 136 1_555 PA CA CA . J CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? metalc ? metalc123 J OE1 GLU 136 J GLU 136 1_555 QA CA CA . J CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? metalc ? metalc124 J O GLN 137 J GLN 137 1_555 PA CA CA . J CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc125 J OD1 ASP 138 J ASP 138 1_555 PA CA CA . J CA 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc126 J OD2 ASP 138 J ASP 138 1_555 QA CA CA . J CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.13 ? metalc ? metalc127 J OD1 ASP 138 J ASP 138 1_555 QA CA CA . J CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.68 ? metalc ? metalc128 J OE1 GLN 148 J GLN 148 1_555 QA CA CA . J CA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? metalc ? metalc129 PA CA CA . J CA 1205 1_555 RA O16 GHE . J GHE 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? metalc ? metalc130 QA CA CA . J CA 1206 1_555 RA O17 GHE . J GHE 1207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 284 n n C1 O1 NAG sing 285 n n C1 O5 NAG sing 286 n n C1 H1 NAG sing 287 n n C2 C3 NAG sing 288 n n C2 N2 NAG sing 289 n n C2 H2 NAG sing 290 n n C3 C4 NAG sing 291 n n C3 O3 NAG sing 292 n n C3 H3 NAG sing 293 n n C4 C5 NAG sing 294 n n C4 O4 NAG sing 295 n n C4 H4 NAG sing 296 n n C5 C6 NAG sing 297 n n C5 O5 NAG sing 298 n n C5 H5 NAG sing 299 n n C6 O6 NAG sing 300 n n C6 H61 NAG sing 301 n n C6 H62 NAG sing 302 n n C7 C8 NAG sing 303 n n C7 N2 NAG sing 304 n n C7 O7 NAG doub 305 n n C8 H81 NAG sing 306 n n C8 H82 NAG sing 307 n n C8 H83 NAG sing 308 n n N2 HN2 NAG sing 309 n n O1 HO1 NAG sing 310 n n O3 HO3 NAG sing 311 n n O4 HO4 NAG sing 312 n n O6 HO6 NAG sing 313 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 4AVT _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.004332 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.004332 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.003554 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code K 2 CA A 1 1205 1205 CA CA . L 2 CA A 1 1206 1206 CA CA . M 3 NAG A 1 1207 1207 NAG NAG . N 2 CA B 1 1205 1205 CA CA . O 2 CA B 1 1206 1206 CA CA . P 4 GHE B 1 1207 1207 GHE GHE . Q 3 NAG B 1 1208 1208 NAG NAG . R 2 CA C 1 1205 1205 CA CA . S 2 CA C 1 1206 1206 CA CA . T 4 GHE C 1 1207 1207 GHE GHE . U 3 NAG C 1 1208 1208 NAG NAG . V 2 CA D 1 1205 1205 CA CA . W 2 CA D 1 1206 1206 CA CA . X 3 NAG D 1 1207 1207 NAG NAG . Y 2 CA E 1 1205 1205 CA CA . Z 2 CA E 1 1206 1206 CA CA . AA 4 GHE E 1 1207 1207 GHE GHE . BA 3 NAG E 1 1208 1208 NAG NAG . CA 2 CA F 1 1205 1205 CA CA . DA 2 CA F 1 1206 1206 CA CA . EA 3 NAG F 1 1207 1207 NAG NAG . FA 2 CA G 1 1205 1205 CA CA . GA 2 CA G 1 1206 1206 CA CA . HA 4 GHE G 1 1207 1207 GHE GHE . IA 3 NAG G 1 1208 1208 NAG NAG . JA 2 CA H 1 1205 1205 CA CA . KA 2 CA H 1 1206 1206 CA CA . LA 3 NAG H 1 1207 1207 NAG NAG . MA 2 CA I 1 1205 1205 CA CA . NA 2 CA I 1 1206 1206 CA CA . OA 3 NAG I 1 1207 1207 NAG NAG . PA 2 CA J 1 1205 1205 CA CA . QA 2 CA J 1 1206 1206 CA CA . RA 4 GHE J 1 1207 1207 GHE GHE . SA 3 NAG J 1 1208 1208 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . M 3 53.91 204.925 137.396 1 54.98 ? C1 NAG 1207 A 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . M 3 53.191 204.457 138.656 1 54.98 ? C2 NAG 1207 A 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . M 3 53.563 205.321 139.854 1 54.98 ? C3 NAG 1207 A 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . M 3 55.075 205.487 139.963 1 54.98 ? C4 NAG 1207 A 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . M 3 55.679 205.893 138.625 1 54.98 ? C5 NAG 1207 A 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . M 3 57.198 205.986 138.714 1 54.98 ? C6 NAG 1207 A 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . M 3 51.106 203.444 137.937 1 54.98 ? C7 NAG 1207 A 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . M 3 49.624 203.616 137.779 1 54.98 ? C8 NAG 1207 A 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . M 3 51.756 204.486 138.448 1 54.98 ? N2 NAG 1207 A 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . M 3 53.059 204.722 141.053 1 54.98 ? O3 NAG 1207 A 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . M 3 55.378 206.48 140.949 1 54.98 ? O4 NAG 1207 A 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . M 3 55.317 204.939 137.628 1 54.98 ? O5 NAG 1207 A 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . M 3 57.778 204.703 138.454 1 54.98 ? O6 NAG 1207 A 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . M 3 51.678 202.415 137.617 1 54.98 ? O7 NAG 1207 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 54 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 48 _model_server_stats.query_time_ms 303 _model_server_stats.encode_time_ms 7 _model_server_stats.element_count 14 #