data_4B8B # _model_server_result.job_id Ka89TSc3W3DV0OTXk-cE9g _model_server_result.datetime_utc '2024-10-20 19:13:53' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4b8b # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"N","auth_seq_id":1800}' # _entry.id 4B8B # _exptl.entry_id 4B8B _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 196.967 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'GOLD ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 29 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 100.05 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4B8B _cell.length_a 55.097 _cell.length_b 164.507 _cell.length_c 86.141 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4B8B _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 K N N ? 2 L N N ? 2 M N N ? 2 N N N ? 2 O N N ? 2 P N N ? 2 Q N N ? 2 R N N ? 2 S N N ? 2 T N N ? 2 U N N ? 2 V N N ? 2 W N N ? 2 X N N ? 2 Y N N ? 2 Z N N ? 2 AA N N ? 2 BA N N ? 2 CA N N ? 2 DA N N ? 2 EA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 336 A CYS 486 1_555 E AU AU . A AU 1749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 399 A CYS 549 1_555 D AU AU . A AU 1748 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 489 A CYS 639 1_555 G AU AU . A AU 1751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc4 B SG CYS 336 B CYS 486 1_555 T AU AU . B AU 1749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? metalc ? metalc5 B O LYS 466 B LYS 616 1_555 W AU AU . B AU 1752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? # _chem_comp.formula 'Au 1' _chem_comp.formula_weight 196.967 _chem_comp.id AU _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'GOLD ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 4B8B _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.01815 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.003217 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006079 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.01179 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 AU A 1 1747 1747 AU AU . D 2 AU A 1 1748 1748 AU AU . E 2 AU A 1 1749 1749 AU AU . F 2 AU A 1 1750 1750 AU AU . G 2 AU A 1 1751 1751 AU AU . H 2 AU A 1 1752 1752 AU AU . I 2 AU A 1 1753 1753 AU AU . J 2 AU A 1 1754 1754 AU AU . K 2 AU A 1 1755 1755 AU AU . L 2 AU A 1 1756 1756 AU AU . M 2 AU A 1 1757 1757 AU AU . N 2 AU A 1 1800 1800 AU AU . O 2 AU A 1 1801 1801 AU AU . P 2 AU A 1 1802 1802 AU AU . Q 2 AU A 1 1803 1803 AU AU . R 2 AU B 1 1747 1747 AU AU . S 2 AU B 1 1748 1748 AU AU . T 2 AU B 1 1749 1749 AU AU . U 2 AU B 1 1750 1750 AU AU . V 2 AU B 1 1751 1751 AU AU . W 2 AU B 1 1752 1752 AU AU . X 2 AU B 1 1753 1753 AU AU . Y 2 AU B 1 1754 1754 AU AU . Z 2 AU B 1 1755 1755 AU AU . AA 2 AU B 1 1756 1756 AU AU . BA 2 AU B 1 1800 1800 AU AU . CA 2 AU B 1 1801 1801 AU AU . DA 2 AU B 1 1802 1802 AU AU . EA 2 AU B 1 1803 1803 AU AU . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol AU _atom_site.label_atom_id AU _atom_site.label_comp_id AU _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id N _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x -2.809 _atom_site.Cartn_y -57.652 _atom_site.Cartn_z 56.541 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 76.74 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id AU _atom_site.auth_comp_id AU _atom_site.auth_seq_id 1800 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 22 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 16 _model_server_stats.query_time_ms 258 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #