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_model_server_result.job_id            S1ExjPaFts-HnKmW9bKe5w 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-25 20:19:13' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          4bem 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"NA","auth_seq_id":201}' 
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_entry.id    4BEM 
#
_exptl.entry_id    4BEM 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              22.99 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'SODIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    10 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            4BEM 
_cell.length_a            121.17 
_cell.length_b            121.17 
_cell.length_c            150.57 
_cell.Z_PDB               72 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4BEM 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        96 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 43 21 2' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    decameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      10 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 K N N 
? 3 L N N 
? 3 N N N 
? 3 Q N N 
? 3 R N N 
? 3 V N N 
? 3 Y N N 
? 3 DA N N 
? 3 GA N N 
? 3 NA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A C FME 1 A FME 1 1_555 A N GLU 2 A GLU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale2 B C FME 1 B FME 1 1_555 B N GLU 2 B GLU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale3 C C FME 1 C FME 1 1_555 C N GLU 2 C GLU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale4 D C FME 1 D FME 1 1_555 D N GLU 2 D GLU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale5 E C FME 1 E FME 1 1_555 E N GLU 2 E GLU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale6 F C FME 1 F FME 1 1_555 F N GLU 2 F GLU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale7 G C FME 1 G FME 1 1_555 G N GLU 2 G GLU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale8 H C FME 1 H FME 1 1_555 H N GLU 2 H GLU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale9 I C FME 1 I FME 1 1_555 I N GLU 2 I GLU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale10 J C FME 1 J FME 1 1_555 J N ILE 2 J ILE 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
metalc ? metalc1 A OE1 GLN 29 A GLN 29 1_555 K NA NA . A NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? 
metalc ? metalc2 A O VAL 60 A VAL 60 1_555 L NA NA . B NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? 
metalc ? metalc3 A OE1 GLU 62 A GLU 62 1_555 K NA NA . A NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? 
metalc ? metalc4 A OG1 THR 63 A THR 63 1_555 L NA NA . B NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? 
metalc ? metalc5 K NA NA . A NA 201 1_555 UA O HOH . A HOH 2008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? 
metalc ? metalc6 K NA NA . A NA 201 1_555 J O VAL 160 J VAL 160 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? 
metalc ? metalc7 K NA NA . A NA 201 1_555 J OG1 THR 163 J THR 163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? 
metalc ? metalc8 UA O HOH . A HOH 2017 1_555 L NA NA . B NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? 
metalc ? metalc9 B OE1 GLN 29 B GLN 29 1_555 L NA NA . B NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? 
metalc ? metalc10 B O VAL 60 B VAL 60 1_555 N NA NA . C NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? 
metalc ? metalc11 B OE1 GLU 62 B GLU 62 1_555 L NA NA . B NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.391 ? 
metalc ? metalc12 B OG1 THR 63 B THR 63 1_555 N NA NA . C NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? 
metalc ? metalc13 VA O HOH . B HOH 2010 1_555 N NA NA . C NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? 
metalc ? metalc14 C OE1 GLU 2 C GLU 2 1_555 O MN MN . C MN 1083 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.986 ? 
metalc ? metalc15 C OE1 GLN 29 C GLN 29 1_555 N NA NA . C NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? 
metalc ? metalc16 C O VAL 60 C VAL 60 1_555 Q NA NA . D NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? 
metalc ? metalc17 C OE1 GLU 62 C GLU 62 1_555 N NA NA . C NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? 
metalc ? metalc18 C OG1 THR 63 C THR 63 1_555 Q NA NA . D NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? 
metalc ? metalc19 O MN MN . C MN 1083 1_555 WA O HOH . C HOH 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.116 ? 
metalc ? metalc20 O MN MN . C MN 1083 1_555 D O1 FME 1 D FME 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? 
metalc ? metalc21 O MN MN . C MN 1083 1_555 E OD1 ASP 49 E ASP 49 5_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? 
metalc ? metalc22 O MN MN . C MN 1083 1_555 YA O HOH . E HOH 2009 5_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.492 ? 
metalc ? metalc23 O MN MN . C MN 1083 1_555 F OE1 GLN 47 F GLN 47 5_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? 
metalc ? metalc24 WA O HOH . C HOH 2009 1_555 Q NA NA . D NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc25 D OE1 GLN 29 D GLN 29 1_555 Q NA NA . D NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? 
metalc ? metalc26 D O VAL 60 D VAL 60 1_555 R NA NA . E NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? 
metalc ? metalc27 D OE1 GLU 62 D GLU 62 1_555 Q NA NA . D NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? 
metalc ? metalc28 D OG1 THR 63 D THR 63 1_555 R NA NA . E NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.341 ? 
metalc ? metalc29 XA O HOH . D HOH 2010 1_555 R NA NA . E NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? 
metalc ? metalc30 E OE1 GLN 29 E GLN 29 1_555 R NA NA . E NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? 
metalc ? metalc31 E O VAL 60 E VAL 60 1_555 V NA NA . F NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? 
metalc ? metalc32 E OE1 GLU 62 E GLU 62 1_555 R NA NA . E NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? 
metalc ? metalc33 E OG1 THR 63 E THR 63 1_555 V NA NA . F NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? 
metalc ? metalc34 YA O HOH . E HOH 2010 1_555 V NA NA . F NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.491 ? 
metalc ? metalc35 F OE1 GLN 29 F GLN 29 1_555 V NA NA . F NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? 
metalc ? metalc36 F O VAL 60 F VAL 60 1_555 Y NA NA . G NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? 
metalc ? metalc37 F OE1 GLU 62 F GLU 62 1_555 V NA NA . F NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? 
metalc ? metalc38 F OG1 THR 63 F THR 63 1_555 Y NA NA . G NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? 
metalc ? metalc39 ZA O HOH . F HOH 2009 1_555 Y NA NA . G NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? 
metalc ? metalc40 G OE1 GLN 29 G GLN 29 1_555 Y NA NA . G NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? 
metalc ? metalc41 G O VAL 60 G VAL 60 1_555 DA NA NA . H NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? 
metalc ? metalc42 G OE1 GLU 62 G GLU 62 1_555 Y NA NA . G NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.411 ? 
metalc ? metalc43 G OG1 THR 63 G THR 63 1_555 DA NA NA . H NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? 
metalc ? metalc44 AB O HOH . G HOH 2010 1_555 DA NA NA . H NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? 
metalc ? metalc45 H OE1 GLN 29 H GLN 29 1_555 DA NA NA . H NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? 
metalc ? metalc46 H O VAL 60 H VAL 60 1_555 GA NA NA . I NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? 
metalc ? metalc47 H OE1 GLU 62 H GLU 62 1_555 DA NA NA . H NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? 
metalc ? metalc48 H OG1 THR 63 H THR 63 1_555 GA NA NA . I NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? 
metalc ? metalc49 BB O HOH . H HOH 2015 1_555 GA NA NA . I NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? 
metalc ? metalc50 I OE1 GLN 29 I GLN 29 1_555 GA NA NA . I NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? 
metalc ? metalc51 I O VAL 60 I VAL 60 1_555 NA NA NA . J NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? 
metalc ? metalc52 I OE1 GLU 62 I GLU 62 1_555 GA NA NA . I NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? 
metalc ? metalc53 I OG1 THR 63 I THR 63 1_555 NA NA NA . J NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? 
metalc ? metalc54 CB O HOH . I HOH 2011 1_555 NA NA NA . J NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? 
metalc ? metalc55 J OE1 GLN 46 J GLN 46 1_555 NA NA NA . J NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? 
metalc ? metalc56 J OE1 GLU 79 J GLU 79 1_555 NA NA NA . J NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? 
#
_chem_comp.formula           'Na 1' 
_chem_comp.formula_weight    22.99 
_chem_comp.id                NA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'SODIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     4BEM 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.008253 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.008253 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.006641 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
K 3 NA A 1 201 201 NA NA . 
L 3 NA B 1 201 201 NA NA . 
M 4 HTG B 1 1084 1084 HTG HTG . 
N 3 NA C 1 201 201 NA NA . 
O 5 MN C 1 1083 1083 MN MN . 
P 6 TAM C 1 1084 1084 TAM TAM . 
Q 3 NA D 1 201 201 NA NA . 
R 3 NA E 1 201 201 NA NA . 
S 7 P6G E 1 1083 1083 P6G P6G . 
T 4 HTG E 1 1084 1084 HTG HTG . 
U 4 HTG E 1 1085 1085 HTG HTG . 
V 3 NA F 1 201 201 NA NA . 
W 4 HTG F 1 1083 1083 HTG HTG . 
X 8 ACT F 1 1084 1084 ACT ACT . 
Y 3 NA G 1 201 201 NA NA . 
Z 8 ACT G 1 1083 1083 ACT ACT . 
AA 4 HTG G 1 1084 1084 HTG HTG . 
BA 4 HTG G 1 1085 1085 HTG HTG . 
CA 4 HTG G 1 1086 1086 HTG HTG . 
DA 3 NA H 1 201 201 NA NA . 
EA 4 HTG H 1 1083 1083 HTG HTG . 
FA 4 HTG H 1 1084 1084 HTG HTG . 
GA 3 NA I 1 201 201 NA NA . 
HA 8 ACT I 1 1083 1083 ACT ACT . 
IA 8 ACT I 1 1084 1084 ACT ACT . 
JA 4 HTG I 1 1085 1085 HTG HTG . 
KA 4 HTG I 1 1086 1086 HTG HTG . 
LA 4 HTG I 1 1087 1087 HTG HTG . 
MA 4 HTG I 1 1088 1088 HTG HTG . 
NA 3 NA J 1 201 201 NA NA . 
OA 4 HTG J 1 1183 1183 HTG HTG . 
PA 4 HTG J 1 1184 1184 HTG HTG . 
QA 4 HTG J 1 1185 1185 HTG HTG . 
RA 4 HTG J 1 1186 1186 HTG HTG . 
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