data_4BXO # _model_server_result.job_id mxeIwc58T5siBmEe2bgysA _model_server_result.datetime_utc '2025-08-31 01:35:22' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4bxo # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":1215}' # _entry.id 4BXO # _exptl.entry_id 4BXO _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4BXO _cell.length_a 125.1 _cell.length_b 125.1 _cell.length_c 74.76 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4BXO _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 92 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 E N N ? 5 F N N ? 5 G N N ? 5 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD2 ASP 60 A ASP 1854 1_555 E CA CA . A CA 2050 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? metalc ? metalc2 A OE2 GLU 70 A GLU 1864 1_555 E CA CA . A CA 2050 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.68 ? metalc ? metalc3 A O ARG 71 A ARG 1865 1_555 E CA CA . A CA 2050 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? metalc ? metalc4 E CA CA . A CA 2050 1_555 I O HOH . A HOH 3017 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc ? metalc5 B OE2 GLU 46 B GLU 43 7_557 F CA CA . B CA 1215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? metalc ? metalc6 B OD1 ASP 47 B ASP 44 1_555 F CA CA . B CA 1215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.681 ? metalc ? metalc7 B OD2 ASP 47 B ASP 44 1_555 F CA CA . B CA 1215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? metalc ? metalc8 B O ASP 47 B ASP 44 7_557 F CA CA . B CA 1215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? metalc ? metalc9 B OD1 ASP 47 B ASP 44 7_557 F CA CA . B CA 1215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? metalc ? metalc10 B O GLN 167 B GLN 164 1_555 G CA CA . B CA 1216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? metalc ? metalc11 B O VAL 172 B VAL 169 1_555 G CA CA . B CA 1216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? metalc ? metalc12 B O GLU 199 B GLU 196 1_555 H CA CA . B CA 1217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc13 B O VAL 202 B VAL 199 1_555 H CA CA . B CA 1217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.492 ? metalc ? metalc14 F CA CA . B CA 1215 1_555 J O HOH . B HOH 2009 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.211 ? metalc ? metalc15 G CA CA . B CA 1216 1_555 J O HOH . B HOH 2031 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? metalc ? metalc16 G CA CA . B CA 1216 1_555 J O HOH . B HOH 2032 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc17 G CA CA . B CA 1216 1_555 D OP2 DT 7 I DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? metalc ? metalc18 H CA CA . B CA 1217 1_555 C OP1 DA 11 H DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 C N1 DG 1 H DG 1 1_555 D N3 DC 11 I DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 C N2 DG 1 H DG 1 1_555 D O2 DC 11 I DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 C O6 DG 1 H DG 1 1_555 D N4 DC 11 I DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 C N1 DA 2 H DA 2 1_555 D N3 DT 10 I DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 C N6 DA 2 H DA 2 1_555 D O4 DT 10 I DT 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 C N3 DT 3 H DT 3 1_555 D N1 DA 9 I DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 C O4 DT 3 H DT 3 1_555 D N6 DA 9 I DA 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 C N1 DG 4 H DG 4 1_555 D N3 DC 8 I DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 C N2 DG 4 H DG 4 1_555 D O2 DC 8 I DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 C O6 DG 4 H DG 4 1_555 D N4 DC 8 I DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 C N1 DA 5 H DA 5 1_555 D N3 DT 7 I DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 C N6 DA 5 H DA 5 1_555 D O4 DT 7 I DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 C N3 DT 6 H DT 6 1_555 D N1 DA 6 I DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 C O4 DT 6 H DT 6 1_555 D N6 DA 6 I DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 C N1 DG 7 H DG 7 1_555 D N3 DC 5 I DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 C N2 DG 7 H DG 7 1_555 D O2 DC 5 I DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 C O6 DG 7 H DG 7 1_555 D N4 DC 5 I DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 C N3 DC 8 H DC 8 1_555 D N1 DG 4 I DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 C N4 DC 8 H DC 8 1_555 D O6 DG 4 I DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 C O2 DC 8 H DC 8 1_555 D N2 DG 4 I DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 C N3 DT 9 H DT 9 1_555 D N1 DA 3 I DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 C O4 DT 9 H DT 9 1_555 D N6 DA 3 I DA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 C N1 DG 10 H DG 10 1_555 D N3 DC 2 I DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 C N2 DG 10 H DG 10 1_555 D O2 DC 2 I DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 C O6 DG 10 H DG 10 1_555 D N4 DC 2 I DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 C N1 DA 11 H DA 11 1_555 D N3 DT 1 I DT 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 C N6 DA 11 H DA 11 1_555 D O4 DT 1 I DT 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 4BXO _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007994 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.007994 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.013376 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 5 CA A 1 2050 2050 CA CA . F 5 CA B 1 1215 1215 CA CA . G 5 CA B 1 1216 1216 CA CA . H 5 CA B 1 1217 1217 CA CA . I 6 HOH A 1 3001 3001 HOH HOH . I 6 HOH A 2 3002 3002 HOH HOH . I 6 HOH A 3 3003 3003 HOH HOH . I 6 HOH A 4 3004 3004 HOH HOH . I 6 HOH A 5 3005 3005 HOH HOH . I 6 HOH A 6 3006 3006 HOH HOH . I 6 HOH A 7 3007 3007 HOH HOH . I 6 HOH A 8 3008 3008 HOH HOH . I 6 HOH A 9 3009 3009 HOH HOH . I 6 HOH A 10 3010 3010 HOH HOH . I 6 HOH A 11 3011 3011 HOH HOH . I 6 HOH A 12 3012 3012 HOH HOH . I 6 HOH A 13 3013 3013 HOH HOH . I 6 HOH A 14 3014 3014 HOH HOH . I 6 HOH A 15 3015 3015 HOH HOH . I 6 HOH A 16 3016 3016 HOH HOH . I 6 HOH A 17 3017 3017 HOH HOH . I 6 HOH A 18 3018 3018 HOH HOH . I 6 HOH A 19 3019 3019 HOH HOH . I 6 HOH A 20 3020 3020 HOH HOH . I 6 HOH A 21 3021 3021 HOH HOH . I 6 HOH A 22 3022 3022 HOH HOH . I 6 HOH A 23 3023 3023 HOH HOH . I 6 HOH A 24 3024 3024 HOH HOH . I 6 HOH A 25 3025 3025 HOH HOH . I 6 HOH A 26 3026 3026 HOH HOH . I 6 HOH A 27 3027 3027 HOH HOH . I 6 HOH A 28 3028 3028 HOH HOH . I 6 HOH A 29 3029 3029 HOH HOH . I 6 HOH A 30 3030 3030 HOH HOH . I 6 HOH A 31 3031 3031 HOH HOH . I 6 HOH A 32 3032 3032 HOH HOH . I 6 HOH A 33 3033 3033 HOH HOH . I 6 HOH A 34 3034 3034 HOH HOH . I 6 HOH A 35 3035 3035 HOH HOH . I 6 HOH A 36 3036 3036 HOH HOH . I 6 HOH A 37 3037 3037 HOH HOH . I 6 HOH A 38 3038 3038 HOH HOH . I 6 HOH A 39 3039 3039 HOH HOH . I 6 HOH A 40 3040 3040 HOH HOH . I 6 HOH A 41 3041 3041 HOH HOH . I 6 HOH A 42 3042 3042 HOH HOH . I 6 HOH A 43 3043 3043 HOH HOH . I 6 HOH A 44 3044 3044 HOH HOH . I 6 HOH A 45 3045 3045 HOH HOH . I 6 HOH A 46 3046 3046 HOH HOH . I 6 HOH A 47 3047 3047 HOH HOH . I 6 HOH A 48 3048 3048 HOH HOH . J 6 HOH B 1 2001 2001 HOH HOH . J 6 HOH B 2 2002 2002 HOH HOH . J 6 HOH B 3 2003 2003 HOH HOH . J 6 HOH B 4 2004 2004 HOH HOH . J 6 HOH B 5 2005 2005 HOH HOH . J 6 HOH B 6 2006 2006 HOH HOH . J 6 HOH B 7 2007 2007 HOH HOH . J 6 HOH B 8 2008 2008 HOH HOH . J 6 HOH B 9 2009 2009 HOH HOH . J 6 HOH B 10 2010 2010 HOH HOH . J 6 HOH B 11 2011 2011 HOH HOH . J 6 HOH B 12 2012 2012 HOH HOH . J 6 HOH B 13 2013 2013 HOH HOH . J 6 HOH B 14 2014 2014 HOH HOH . J 6 HOH B 15 2015 2015 HOH HOH . J 6 HOH B 16 2016 2016 HOH HOH . J 6 HOH B 17 2017 2017 HOH HOH . J 6 HOH B 18 2018 2018 HOH HOH . J 6 HOH B 19 2019 2019 HOH HOH . J 6 HOH B 20 2020 2020 HOH HOH . J 6 HOH B 21 2021 2021 HOH HOH . J 6 HOH B 22 2022 2022 HOH HOH . J 6 HOH B 23 2023 2023 HOH HOH . J 6 HOH B 24 2024 2024 HOH HOH . J 6 HOH B 25 2025 2025 HOH HOH . J 6 HOH B 26 2026 2026 HOH HOH . J 6 HOH B 27 2027 2027 HOH HOH . J 6 HOH B 28 2028 2028 HOH HOH . J 6 HOH B 29 2029 2029 HOH HOH . J 6 HOH B 30 2030 2030 HOH HOH . J 6 HOH B 31 2031 2031 HOH HOH . J 6 HOH B 32 2032 2032 HOH HOH . J 6 HOH B 33 2033 2033 HOH HOH . J 6 HOH B 34 2034 2034 HOH HOH . J 6 HOH B 35 2035 2035 HOH HOH . J 6 HOH B 36 2036 2036 HOH HOH . J 6 HOH B 37 2037 2037 HOH HOH . J 6 HOH B 38 2038 2038 HOH HOH . J 6 HOH B 39 2039 2039 HOH HOH . J 6 HOH B 40 2040 2040 HOH HOH . J 6 HOH B 41 2041 2041 HOH HOH . J 6 HOH B 42 2042 2042 HOH HOH . J 6 HOH B 43 2043 2043 HOH HOH . J 6 HOH B 44 2044 2044 HOH HOH . J 6 HOH B 45 2045 2045 HOH HOH . J 6 HOH B 46 2046 2046 HOH HOH . J 6 HOH B 47 2047 2047 HOH HOH . K 6 HOH H 1 2001 2001 HOH HOH . K 6 HOH H 2 2002 2002 HOH HOH . K 6 HOH H 3 2003 2003 HOH HOH . K 6 HOH H 4 2004 2004 HOH HOH . L 6 HOH I 1 2001 2001 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id F _atom_site.label_entity_id 5 _atom_site.Cartn_x 73.195 _atom_site.Cartn_y 70.637 _atom_site.Cartn_z 73.985 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 34.13 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 1215 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 6 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 385 _model_server_stats.encode_time_ms 1 _model_server_stats.element_count 1 #