data_4CYU
#
_model_server_result.job_id            RtcxFJEfSF2algAjF7DRkg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-27 03:05:23' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4cyu 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":171}' 
#
_entry.id    4CYU 
#
_exptl.entry_id    4CYU 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          112.44 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            4CYU 
_cell.length_a            62.002 
_cell.length_b            94.263 
_cell.length_c            62.989 
_cell.Z_PDB               6 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4CYU 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 3 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 4 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,E,F,G,H,S 1 1 
B,I,J,K,L,T 2 1 
C,M,N,O,U 3 1 
D,P,Q,R,V 4 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 E N N 
? 3 F N N 
? 3 I N N 
? 3 J N N 
? 3 M N N 
? 3 N N N 
? 3 P N N 
? 3 Q N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 B SG CYS 83 B CYS 80 1_555 D SG CYS 83 D CYS 80 2_746 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.961 ? 
metalc ? metalc1 A OD1 ASP 98 A ASP 95 1_555 E MG MG . A MG 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? 
metalc ? metalc2 A OD2 ASP 98 A ASP 95 1_555 F MG MG . A MG 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? 
metalc ? metalc3 A OD1 ASP 100 A ASP 97 1_555 E MG MG . A MG 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? 
metalc ? metalc4 A OD2 ASP 100 A ASP 97 1_555 F MG MG . A MG 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? 
metalc ? metalc5 E MG MG . A MG 170 1_555 G O1A APC . A APC 1158 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.997 ? 
metalc ? metalc6 E MG MG . A MG 170 1_555 G O1B APC . A APC 1158 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.152 ? 
metalc ? metalc7 E MG MG . A MG 170 1_555 S O HOH . A HOH 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? 
metalc ? metalc8 F MG MG . A MG 171 1_555 G O1B APC . A APC 1158 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? 
metalc ? metalc9 F MG MG . A MG 171 1_555 G O1G APC . A APC 1158 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? 
metalc ? metalc10 B OE2 GLU 81 B GLU 78 1_555 I MG MG . B MG 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.82 ? 
metalc ? metalc11 B OD1 ASP 98 B ASP 95 1_555 I MG MG . B MG 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? 
metalc ? metalc12 B OD2 ASP 98 B ASP 95 1_555 J MG MG . B MG 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? 
metalc ? metalc13 B OD1 ASP 100 B ASP 97 1_555 I MG MG . B MG 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? 
metalc ? metalc14 B OD2 ASP 100 B ASP 97 1_555 J MG MG . B MG 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.427 ? 
metalc ? metalc15 I MG MG . B MG 170 1_555 K O1A APC . B APC 1159 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc16 I MG MG . B MG 170 1_555 K O1A APC . B APC 1159 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.603 ? 
metalc ? metalc17 I MG MG . B MG 170 1_555 T O HOH . B HOH 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? 
metalc ? metalc18 J MG MG . B MG 171 1_555 K O1B APC . B APC 1159 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.813 ? 
metalc ? metalc19 J MG MG . B MG 171 1_555 K O2B APC . B APC 1159 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.641 ? 
metalc ? metalc20 J MG MG . B MG 171 1_555 K O1B APC . B APC 1159 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? 
metalc ? metalc21 J MG MG . B MG 171 1_555 K O1G APC . B APC 1159 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 1.858 ? 
metalc ? metalc22 C OD1 ASP 98 C ASP 95 1_555 M MG MG . C MG 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? 
metalc ? metalc23 C OD2 ASP 98 C ASP 95 1_555 N MG MG . C MG 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? 
metalc ? metalc24 C OD1 ASP 100 C ASP 97 1_555 M MG MG . C MG 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? 
metalc ? metalc25 C OD2 ASP 100 C ASP 97 1_555 N MG MG . C MG 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? 
metalc ? metalc26 M MG MG . C MG 170 1_555 O O1B APC . C APC 1158 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.155 ? 
metalc ? metalc27 M MG MG . C MG 170 1_555 O O1A APC . C APC 1158 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.93 ? 
metalc ? metalc28 M MG MG . C MG 170 1_555 U O HOH . C HOH 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.15 ? 
metalc ? metalc29 M MG MG . C MG 170 1_555 U O HOH . C HOH 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? 
metalc ? metalc30 N MG MG . C MG 171 1_555 O O1G APC . C APC 1158 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? 
metalc ? metalc31 N MG MG . C MG 171 1_555 O O1B APC . C APC 1158 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? 
metalc ? metalc32 D OD1 ASP 98 D ASP 95 1_555 P MG MG . D MG 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? 
metalc ? metalc33 D OD2 ASP 98 D ASP 95 1_555 Q MG MG . D MG 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? 
metalc ? metalc34 D OD1 ASP 100 D ASP 97 1_555 P MG MG . D MG 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.971 ? 
metalc ? metalc35 D OD2 ASP 100 D ASP 97 1_555 Q MG MG . D MG 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? 
metalc ? metalc36 P MG MG . D MG 170 1_555 R O1B APC . D APC 1158 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.207 ? 
metalc ? metalc37 P MG MG . D MG 170 1_555 R O1A APC . D APC 1158 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? 
metalc ? metalc38 P MG MG . D MG 170 1_555 R O2B APC . D APC 1158 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.438 ? 
metalc ? metalc39 P MG MG . D MG 170 1_555 R O1A APC . D APC 1158 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.877 ? 
metalc ? metalc40 P MG MG . D MG 170 1_555 V O HOH . D HOH 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? 
metalc ? metalc41 Q MG MG . D MG 171 1_555 R O1G APC . D APC 1158 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 1.841 ? 
metalc ? metalc42 Q MG MG . D MG 171 1_555 R O1B APC . D APC 1158 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? 
metalc ? metalc43 Q MG MG . D MG 171 1_555 R O2B APC . D APC 1158 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? 
metalc ? metalc44 Q MG MG . D MG 171 1_555 R O1B APC . D APC 1158 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.848 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     4CYU 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.016129 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.006661 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.010609 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.017176 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 3 MG A 1 170 170 MG MG . 
F 3 MG A 1 171 171 MG MG . 
G 4 APC A 1 1158 1158 APC APC . 
H 5 TRS A 1 1159 1159 TRS TRS . 
I 3 MG B 1 170 170 MG MG . 
J 3 MG B 1 171 171 MG MG . 
K 4 APC B 1 1159 1159 APC APC . 
L 5 TRS B 1 1160 1160 TRS TRS . 
M 3 MG C 1 170 170 MG MG . 
N 3 MG C 1 171 171 MG MG . 
O 4 APC C 1 1158 1158 APC APC . 
P 3 MG D 1 170 170 MG MG . 
Q 3 MG D 1 171 171 MG MG . 
R 4 APC D 1 1158 1158 APC APC . 
S 6 HOH A 1 2001 2001 HOH HOH . 
S 6 HOH A 2 2002 2002 HOH HOH . 
S 6 HOH A 3 2003 2003 HOH HOH . 
S 6 HOH A 4 2004 2004 HOH HOH . 
S 6 HOH A 5 2005 2005 HOH HOH . 
T 6 HOH B 1 2001 2001 HOH HOH . 
T 6 HOH B 2 2002 2002 HOH HOH . 
T 6 HOH B 3 2003 2003 HOH HOH . 
U 6 HOH C 1 2001 2001 HOH HOH . 
U 6 HOH C 2 2002 2002 HOH HOH . 
U 6 HOH C 3 2003 2003 HOH HOH . 
V 6 HOH D 1 2001 2001 HOH HOH . 
V 6 HOH D 2 2002 2002 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MG 
_atom_site.label_atom_id         MG 
_atom_site.label_comp_id         MG 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         J 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               57.156 
_atom_site.Cartn_y               -21.422 
_atom_site.Cartn_z               10.577 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        45.4 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MG 
_atom_site.auth_comp_id          MG 
_atom_site.auth_seq_id           171 
_atom_site.auth_asym_id          B 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              10 
_model_server_stats.parse_time_ms           8 
_model_server_stats.create_model_time_ms    10 
_model_server_stats.query_time_ms           263 
_model_server_stats.encode_time_ms          1 
_model_server_stats.element_count           1 
#