data_4E5J # _model_server_result.job_id uBPbjGAkb6UuaO5MtyZNGA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-28 07:02:15' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4e5j # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":301}' # _entry.id 4E5J # _exptl.entry_id 4E5J _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 96.063 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'SULFATE ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4E5J _cell.length_a 126.098 _cell.length_b 134.087 _cell.length_c 126.64 _cell.Z_PDB 32 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4E5J _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 20 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 2 2 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 ? monomeric 1 author_defined_assembly 3 ? monomeric 1 author_defined_assembly 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,E,F,G,H,I,J,CA 1 1 B,K,L,M,N,O,P,DA 2 1 C,Q,R,S,T,U,V,EA 3 1 D,W,X,Y,Z,AA,BA,FA 4 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 K N N ? 2 L N N ? 2 Q N N ? 2 R N N ? 2 W N N ? 2 X N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A NE2 HIS 41 A HIS 41 1_555 I MN MN . A MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLU 61 A GLU 80 1_555 J MN MN . A MN 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 89 A ASP 108 1_555 I MN MN . A MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.166 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 89 A ASP 108 1_555 J MN MN . A MN 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? metalc ? metalc5 A OE2 GLU 100 A GLU 119 1_555 I MN MN . A MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? metalc ? metalc6 A O ILE 101 A ILE 120 1_555 I MN MN . A MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.2 ? metalc ? metalc7 G O2 581 . A 581 303 1_555 I MN MN . A MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? metalc ? metalc8 G O1 581 . A 581 303 1_555 I MN MN . A MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? metalc ? metalc9 G O3 581 . A 581 303 1_555 J MN MN . A MN 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.993 ? metalc ? metalc10 G O2 581 . A 581 303 1_555 J MN MN . A MN 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.209 ? metalc ? metalc11 B NE2 HIS 41 B HIS 41 1_555 O MN MN . B MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc12 B OE1 GLU 61 B GLU 80 1_555 P MN MN . B MN 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.207 ? metalc ? metalc13 B OD2 ASP 89 B ASP 108 1_555 O MN MN . B MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? metalc ? metalc14 B OD1 ASP 89 B ASP 108 1_555 P MN MN . B MN 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.17 ? metalc ? metalc15 B OE1 GLU 100 B GLU 119 1_555 O MN MN . B MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? metalc ? metalc16 B O ILE 101 B ILE 120 1_555 O MN MN . B MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.13 ? metalc ? metalc17 M O2 581 . B 581 303 1_555 O MN MN . B MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? metalc ? metalc18 M O1 581 . B 581 303 1_555 O MN MN . B MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.206 ? metalc ? metalc19 M O3 581 . B 581 303 1_555 P MN MN . B MN 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.819 ? metalc ? metalc20 M O2 581 . B 581 303 1_555 P MN MN . B MN 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? metalc ? metalc21 C NE2 HIS 41 C HIS 41 1_555 U MN MN . C MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? metalc ? metalc22 C OE1 GLU 61 C GLU 80 1_555 V MN MN . C MN 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.127 ? metalc ? metalc23 C OD2 ASP 89 C ASP 108 1_555 U MN MN . C MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.221 ? metalc ? metalc24 C OD1 ASP 89 C ASP 108 1_555 V MN MN . C MN 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? metalc ? metalc25 C OE1 GLU 100 C GLU 119 1_555 U MN MN . C MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc26 C O ILE 101 C ILE 120 1_555 U MN MN . C MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.145 ? metalc ? metalc27 S O1 581 . C 581 303 1_555 U MN MN . C MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? metalc ? metalc28 S O2 581 . C 581 303 1_555 U MN MN . C MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? metalc ? metalc29 S O2 581 . C 581 303 1_555 V MN MN . C MN 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? metalc ? metalc30 S O4 581 . C 581 303 1_555 V MN MN . C MN 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? metalc ? metalc31 D NE2 HIS 41 D HIS 41 1_555 AA MN MN . D MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? metalc ? metalc32 D OE1 GLU 61 D GLU 80 1_555 BA MN MN . D MN 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc33 D OD2 ASP 89 D ASP 108 1_555 AA MN MN . D MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? metalc ? metalc34 D OD1 ASP 89 D ASP 108 1_555 BA MN MN . D MN 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? metalc ? metalc35 D OE1 GLU 100 D GLU 119 1_555 AA MN MN . D MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? metalc ? metalc36 D O ILE 101 D ILE 120 1_555 AA MN MN . D MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.207 ? metalc ? metalc37 Y O2 581 . D 581 303 1_555 AA MN MN . D MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.15 ? metalc ? metalc38 Y O1 581 . D 581 303 1_555 AA MN MN . D MN 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? metalc ? metalc39 Y O4 581 . D 581 303 1_555 BA MN MN . D MN 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? metalc ? metalc40 Y O2 581 . D 581 303 1_555 BA MN MN . D MN 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.13 ? # _chem_comp.formula 'O4 S -2' _chem_comp.formula_weight 96.063 _chem_comp.id SO4 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'SULFATE ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag S O1 SO4 doub 323 n n S O2 SO4 doub 324 n n S O3 SO4 sing 325 n n S O4 SO4 sing 326 n n # _atom_sites.entry_id 4E5J _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.00793 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.007458 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007896 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 SO4 A 1 301 4 SO4 SO4 . F 2 SO4 A 1 302 5 SO4 SO4 . G 3 581 A 1 303 1 581 581 . H 3 581 A 1 304 7 581 581 . I 4 MN A 1 305 1 MN MN . J 4 MN A 1 306 2 MN MN . K 2 SO4 B 1 301 2 SO4 SO4 . L 2 SO4 B 1 302 6 SO4 SO4 . M 3 581 B 1 303 2 581 581 . N 3 581 B 1 304 8 581 581 . O 4 MN B 1 305 3 MN MN . P 4 MN B 1 306 4 MN MN . Q 2 SO4 C 1 301 1 SO4 SO4 . R 2 SO4 C 1 302 7 SO4 SO4 . S 3 581 C 1 303 3 581 581 . T 3 581 C 1 304 5 581 581 . U 4 MN C 1 305 5 MN MN . V 4 MN C 1 306 6 MN MN . W 2 SO4 D 1 301 3 SO4 SO4 . X 2 SO4 D 1 302 8 SO4 SO4 . Y 3 581 D 1 303 4 581 581 . Z 3 581 D 1 304 6 581 581 . AA 4 MN D 1 305 7 MN MN . BA 4 MN D 1 306 8 MN MN . CA 5 HOH A 1 401 1 HOH HOH . CA 5 HOH A 2 402 5 HOH HOH . CA 5 HOH A 3 403 6 HOH HOH . CA 5 HOH A 4 404 7 HOH HOH . CA 5 HOH A 5 405 13 HOH HOH . CA 5 HOH A 6 406 16 HOH HOH . CA 5 HOH A 7 407 25 HOH HOH . CA 5 HOH A 8 408 26 HOH HOH . CA 5 HOH A 9 409 32 HOH HOH . CA 5 HOH A 10 410 44 HOH HOH . CA 5 HOH A 11 411 48 HOH HOH . DA 5 HOH B 1 401 2 HOH HOH . DA 5 HOH B 2 402 8 HOH HOH . DA 5 HOH B 3 403 14 HOH HOH . DA 5 HOH B 4 404 17 HOH HOH . DA 5 HOH B 5 405 21 HOH HOH . DA 5 HOH B 6 406 22 HOH HOH . DA 5 HOH B 7 407 33 HOH HOH . DA 5 HOH B 8 408 34 HOH HOH . DA 5 HOH B 9 409 35 HOH HOH . DA 5 HOH B 10 410 38 HOH HOH . DA 5 HOH B 11 411 45 HOH HOH . EA 5 HOH C 1 401 3 HOH HOH . EA 5 HOH C 2 402 9 HOH HOH . EA 5 HOH C 3 403 15 HOH HOH . EA 5 HOH C 4 404 18 HOH HOH . EA 5 HOH C 5 405 23 HOH HOH . EA 5 HOH C 6 406 27 HOH HOH . EA 5 HOH C 7 407 29 HOH HOH . EA 5 HOH C 8 408 30 HOH HOH . EA 5 HOH C 9 409 36 HOH HOH . EA 5 HOH C 10 410 42 HOH HOH . EA 5 HOH C 11 411 47 HOH HOH . FA 5 HOH D 1 401 4 HOH HOH . FA 5 HOH D 2 402 10 HOH HOH . FA 5 HOH D 3 403 11 HOH HOH . FA 5 HOH D 4 404 12 HOH HOH . FA 5 HOH D 5 405 19 HOH HOH . FA 5 HOH D 6 406 20 HOH HOH . FA 5 HOH D 7 407 24 HOH HOH . FA 5 HOH D 8 408 28 HOH HOH . FA 5 HOH D 9 409 31 HOH HOH . FA 5 HOH D 10 410 37 HOH HOH . FA 5 HOH D 11 411 39 HOH HOH . FA 5 HOH D 12 412 40 HOH HOH . FA 5 HOH D 13 413 41 HOH HOH . FA 5 HOH D 14 414 46 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 S S SO4 . . . E 2 -24.287 -29.839 -5.99 1 89.69 ? S SO4 301 A 1 HETATM 2 O O1 SO4 . . . E 2 -23.459 -28.842 -6.663 1 89.32 ? O1 SO4 301 A 1 HETATM 3 O O2 SO4 . . . E 2 -24.994 -30.637 -6.988 1 89.57 ? O2 SO4 301 A 1 HETATM 4 O O3 SO4 . . . E 2 -23.433 -30.701 -5.172 1 89.17 ? O3 SO4 301 A 1 HETATM 5 O O4 SO4 . . . E 2 -25.268 -29.157 -5.151 1 89.09 ? O4 SO4 301 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 10 _model_server_stats.query_time_ms 320 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 5 #