data_4EA0 # _model_server_result.job_id eDtd7XpOV-nPUQiZNFEV-g _model_server_result.datetime_utc '2024-11-02 05:28:50' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4ea0 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"I","auth_seq_id":301}' # _entry.id 4EA0 # _exptl.entry_id 4EA0 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 4EA0 _cell.length_a 80.324 _cell.length_b 80.324 _cell.length_c 180.822 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4EA0 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 152 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 31 2 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,D,E,F,G,H,N 1 1 B,I,J,K,L,M,O 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 K N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASP 48 A ASP 48 1_555 C MG MG . A MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.951 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 48 A ASP 48 1_555 E MG MG . A MG 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.995 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 52 A ASP 52 1_555 C MG MG . A MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 52 A ASP 52 1_555 E MG MG . A MG 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? metalc ? metalc5 A OD1 ASN 168 A ASN 168 1_555 D MG MG . A MG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? metalc ? metalc6 A OD2 ASP 172 A ASP 172 1_555 D MG MG . A MG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.927 ? metalc ? metalc7 C MG MG . A MG 301 1_555 F O2 POP . A POP 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? metalc ? metalc8 C MG MG . A MG 301 1_555 F O5 POP . A POP 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? metalc ? metalc9 C MG MG . A MG 301 1_555 N O HOH . A HOH 422 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.947 ? metalc ? metalc10 C MG MG . A MG 301 1_555 N O HOH . A HOH 427 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.213 ? metalc ? metalc11 D MG MG . A MG 302 1_555 F O6 POP . A POP 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.161 ? metalc ? metalc12 D MG MG . A MG 302 1_555 F O1 POP . A POP 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? metalc ? metalc13 D MG MG . A MG 302 1_555 N O HOH . A HOH 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? metalc ? metalc14 D MG MG . A MG 302 1_555 N O HOH . A HOH 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc15 E MG MG . A MG 303 1_555 F O5 POP . A POP 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.866 ? metalc ? metalc16 E MG MG . A MG 303 1_555 N O HOH . A HOH 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.91 ? metalc ? metalc17 E MG MG . A MG 303 1_555 N O HOH . A HOH 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.166 ? metalc ? metalc18 E MG MG . A MG 303 1_555 N O HOH . A HOH 487 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? metalc ? metalc19 B OD2 ASP 48 B ASP 48 1_555 J MG MG . B MG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? metalc ? metalc20 B OD1 ASP 48 B ASP 48 1_555 K MG MG . B MG 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.99 ? metalc ? metalc21 B OD2 ASP 52 B ASP 52 1_555 J MG MG . B MG 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.133 ? metalc ? metalc22 B OD2 ASP 52 B ASP 52 1_555 K MG MG . B MG 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? metalc ? metalc23 B OD1 ASN 168 B ASN 168 1_555 I MG MG . B MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.921 ? metalc ? metalc24 B OD2 ASP 172 B ASP 172 1_555 I MG MG . B MG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc25 I MG MG . B MG 301 1_555 L O3 POP . B POP 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? metalc ? metalc26 I MG MG . B MG 301 1_555 L O5 POP . B POP 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.411 ? metalc ? metalc27 I MG MG . B MG 301 1_555 O O HOH . B HOH 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? metalc ? metalc28 I MG MG . B MG 301 1_555 O O HOH . B HOH 444 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.615 ? metalc ? metalc29 J MG MG . B MG 302 1_555 L O2 POP . B POP 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.975 ? metalc ? metalc30 J MG MG . B MG 302 1_555 O O HOH . B HOH 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? metalc ? metalc31 J MG MG . B MG 302 1_555 O O HOH . B HOH 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.869 ? metalc ? metalc32 J MG MG . B MG 302 1_555 O O HOH . B HOH 424 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? metalc ? metalc33 K MG MG . B MG 303 1_555 L O6 POP . B POP 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.892 ? metalc ? metalc34 K MG MG . B MG 303 1_555 L O2 POP . B POP 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? metalc ? metalc35 K MG MG . B MG 303 1_555 O O HOH . B HOH 429 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.993 ? metalc ? metalc36 K MG MG . B MG 303 1_555 O O HOH . B HOH 482 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 4EA0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.01245 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.007188 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.014376 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00553 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 MG A 1 301 288 MG MG . D 2 MG A 1 302 289 MG MG . E 2 MG A 1 303 290 MG MG . F 3 POP A 1 304 291 POP POP . G 4 TLA A 1 305 292 TLA TLA . H 5 651 A 1 306 293 651 651 . I 2 MG B 1 301 288 MG MG . J 2 MG B 1 302 289 MG MG . K 2 MG B 1 303 290 MG MG . L 3 POP B 1 304 291 POP POP . M 5 651 B 1 305 292 651 651 . N 6 HOH A 1 401 294 HOH HOH . N 6 HOH A 2 402 295 HOH HOH . N 6 HOH A 3 403 296 HOH HOH . N 6 HOH A 4 404 297 HOH HOH . N 6 HOH A 5 405 298 HOH HOH . N 6 HOH A 6 406 299 HOH HOH . N 6 HOH A 7 407 300 HOH HOH . N 6 HOH A 8 408 301 HOH HOH . N 6 HOH A 9 409 302 HOH HOH . N 6 HOH A 10 410 303 HOH HOH . N 6 HOH A 11 411 304 HOH HOH . N 6 HOH A 12 412 305 HOH HOH . N 6 HOH A 13 413 306 HOH HOH . N 6 HOH A 14 414 307 HOH HOH . N 6 HOH A 15 415 308 HOH HOH . N 6 HOH A 16 416 309 HOH HOH . N 6 HOH A 17 417 310 HOH HOH . N 6 HOH A 18 418 311 HOH HOH . N 6 HOH A 19 419 312 HOH HOH . N 6 HOH A 20 420 313 HOH HOH . N 6 HOH A 21 421 314 HOH HOH . N 6 HOH A 22 422 315 HOH HOH . N 6 HOH A 23 423 316 HOH HOH . N 6 HOH A 24 424 317 HOH HOH . N 6 HOH A 25 425 318 HOH HOH . N 6 HOH A 26 426 319 HOH HOH . N 6 HOH A 27 427 320 HOH HOH . N 6 HOH A 28 428 321 HOH HOH . N 6 HOH A 29 429 322 HOH HOH . N 6 HOH A 30 430 323 HOH HOH . N 6 HOH A 31 431 324 HOH HOH . N 6 HOH A 32 432 325 HOH HOH . N 6 HOH A 33 433 326 HOH HOH . N 6 HOH A 34 434 327 HOH HOH . N 6 HOH A 35 435 328 HOH HOH . N 6 HOH A 36 436 329 HOH HOH . N 6 HOH A 37 437 330 HOH HOH . N 6 HOH A 38 438 331 HOH HOH . N 6 HOH A 39 439 332 HOH HOH . N 6 HOH A 40 440 333 HOH HOH . N 6 HOH A 41 441 334 HOH HOH . N 6 HOH A 42 442 335 HOH HOH . N 6 HOH A 43 443 336 HOH HOH . N 6 HOH A 44 444 337 HOH HOH . N 6 HOH A 45 445 338 HOH HOH . N 6 HOH A 46 446 339 HOH HOH . N 6 HOH A 47 447 340 HOH HOH . N 6 HOH A 48 448 341 HOH HOH . N 6 HOH A 49 449 342 HOH HOH . N 6 HOH A 50 450 343 HOH HOH . N 6 HOH A 51 451 344 HOH HOH . N 6 HOH A 52 452 345 HOH HOH . N 6 HOH A 53 453 346 HOH HOH . N 6 HOH A 54 454 347 HOH HOH . N 6 HOH A 55 455 348 HOH HOH . N 6 HOH A 56 456 349 HOH HOH . N 6 HOH A 57 457 350 HOH HOH . N 6 HOH A 58 458 351 HOH HOH . N 6 HOH A 59 459 352 HOH HOH . N 6 HOH A 60 460 353 HOH HOH . N 6 HOH A 61 461 354 HOH HOH . N 6 HOH A 62 462 355 HOH HOH . N 6 HOH A 63 463 356 HOH HOH . N 6 HOH A 64 464 357 HOH HOH . N 6 HOH A 65 465 358 HOH HOH . N 6 HOH A 66 466 359 HOH HOH . N 6 HOH A 67 467 360 HOH HOH . N 6 HOH A 68 468 361 HOH HOH . N 6 HOH A 69 469 362 HOH HOH . N 6 HOH A 70 470 363 HOH HOH . N 6 HOH A 71 471 364 HOH HOH . N 6 HOH A 72 472 365 HOH HOH . N 6 HOH A 73 473 366 HOH HOH . N 6 HOH A 74 474 367 HOH HOH . N 6 HOH A 75 475 368 HOH HOH . N 6 HOH A 76 476 369 HOH HOH . N 6 HOH A 77 477 370 HOH HOH . N 6 HOH A 78 478 371 HOH HOH . N 6 HOH A 79 479 372 HOH HOH . N 6 HOH A 80 480 373 HOH HOH . N 6 HOH A 81 481 374 HOH HOH . N 6 HOH A 82 482 375 HOH HOH . N 6 HOH A 83 483 376 HOH HOH . N 6 HOH A 84 484 377 HOH HOH . N 6 HOH A 85 485 378 HOH HOH . N 6 HOH A 86 486 379 HOH HOH . N 6 HOH A 87 487 380 HOH HOH . N 6 HOH A 88 488 381 HOH HOH . N 6 HOH A 89 489 382 HOH HOH . N 6 HOH A 90 490 383 HOH HOH . N 6 HOH A 91 491 384 HOH HOH . N 6 HOH A 92 492 385 HOH HOH . N 6 HOH A 93 493 386 HOH HOH . N 6 HOH A 94 494 387 HOH HOH . N 6 HOH A 95 495 388 HOH HOH . N 6 HOH A 96 496 389 HOH HOH . N 6 HOH A 97 497 390 HOH HOH . N 6 HOH A 98 498 391 HOH HOH . N 6 HOH A 99 499 392 HOH HOH . N 6 HOH A 100 500 393 HOH HOH . N 6 HOH A 101 501 394 HOH HOH . N 6 HOH A 102 502 395 HOH HOH . N 6 HOH A 103 503 396 HOH HOH . O 6 HOH B 1 401 294 HOH HOH . O 6 HOH B 2 402 295 HOH HOH . O 6 HOH B 3 403 296 HOH HOH . O 6 HOH B 4 404 297 HOH HOH . O 6 HOH B 5 405 298 HOH HOH . O 6 HOH B 6 406 299 HOH HOH . O 6 HOH B 7 407 300 HOH HOH . O 6 HOH B 8 408 301 HOH HOH . O 6 HOH B 9 409 302 HOH HOH . O 6 HOH B 10 410 303 HOH HOH . O 6 HOH B 11 411 304 HOH HOH . O 6 HOH B 12 412 305 HOH HOH . O 6 HOH B 13 413 306 HOH HOH . O 6 HOH B 14 414 307 HOH HOH . O 6 HOH B 15 415 308 HOH HOH . O 6 HOH B 16 416 309 HOH HOH . O 6 HOH B 17 417 310 HOH HOH . O 6 HOH B 18 418 311 HOH HOH . O 6 HOH B 19 419 312 HOH HOH . O 6 HOH B 20 420 313 HOH HOH . O 6 HOH B 21 421 314 HOH HOH . O 6 HOH B 22 422 315 HOH HOH . O 6 HOH B 23 423 316 HOH HOH . O 6 HOH B 24 424 317 HOH HOH . O 6 HOH B 25 425 318 HOH HOH . O 6 HOH B 26 426 319 HOH HOH . O 6 HOH B 27 427 320 HOH HOH . O 6 HOH B 28 428 321 HOH HOH . O 6 HOH B 29 429 322 HOH HOH . O 6 HOH B 30 430 323 HOH HOH . O 6 HOH B 31 431 324 HOH HOH . O 6 HOH B 32 432 325 HOH HOH . O 6 HOH B 33 433 326 HOH HOH . O 6 HOH B 34 434 327 HOH HOH . O 6 HOH B 35 435 328 HOH HOH . O 6 HOH B 36 436 329 HOH HOH . O 6 HOH B 37 437 330 HOH HOH . O 6 HOH B 38 438 331 HOH HOH . O 6 HOH B 39 439 332 HOH HOH . O 6 HOH B 40 440 333 HOH HOH . O 6 HOH B 41 441 334 HOH HOH . O 6 HOH B 42 442 335 HOH HOH . O 6 HOH B 43 443 336 HOH HOH . O 6 HOH B 44 444 337 HOH HOH . O 6 HOH B 45 445 338 HOH HOH . O 6 HOH B 46 446 339 HOH HOH . O 6 HOH B 47 447 340 HOH HOH . O 6 HOH B 48 448 341 HOH HOH . O 6 HOH B 49 449 342 HOH HOH . O 6 HOH B 50 450 343 HOH HOH . O 6 HOH B 51 451 344 HOH HOH . O 6 HOH B 52 452 345 HOH HOH . O 6 HOH B 53 453 346 HOH HOH . O 6 HOH B 54 454 347 HOH HOH . O 6 HOH B 55 455 348 HOH HOH . O 6 HOH B 56 456 349 HOH HOH . O 6 HOH B 57 457 350 HOH HOH . O 6 HOH B 58 458 351 HOH HOH . O 6 HOH B 59 459 352 HOH HOH . O 6 HOH B 60 460 353 HOH HOH . O 6 HOH B 61 461 354 HOH HOH . O 6 HOH B 62 462 355 HOH HOH . O 6 HOH B 63 463 356 HOH HOH . O 6 HOH B 64 464 357 HOH HOH . O 6 HOH B 65 465 358 HOH HOH . O 6 HOH B 66 466 359 HOH HOH . O 6 HOH B 67 467 360 HOH HOH . O 6 HOH B 68 468 361 HOH HOH . O 6 HOH B 69 469 362 HOH HOH . O 6 HOH B 70 470 363 HOH HOH . O 6 HOH B 71 471 364 HOH HOH . O 6 HOH B 72 472 365 HOH HOH . O 6 HOH B 73 473 366 HOH HOH . O 6 HOH B 74 474 367 HOH HOH . O 6 HOH B 75 475 368 HOH HOH . O 6 HOH B 76 476 369 HOH HOH . O 6 HOH B 77 477 370 HOH HOH . O 6 HOH B 78 478 371 HOH HOH . O 6 HOH B 79 479 372 HOH HOH . O 6 HOH B 80 480 373 HOH HOH . O 6 HOH B 81 481 374 HOH HOH . O 6 HOH B 82 482 375 HOH HOH . O 6 HOH B 83 483 376 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id I _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 21.654 _atom_site.Cartn_y 5.263 _atom_site.Cartn_z 25.244 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 29.56 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 301 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 10 _model_server_stats.query_time_ms 274 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 1 #