data_4ECO
#
_model_server_result.job_id            zX-AHDogELd8aG3vcleLMw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-20 03:31:57' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4eco 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":1001}' 
#
_entry.id    4ECO 
#
_exptl.entry_id    4ECO 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              22.99 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'SODIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            4ECO 
_cell.length_a            125.843 
_cell.length_b            193.663 
_cell.length_c            68.192 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4ECO 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        18 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 2' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,C,D 1 1 
B,E 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      2 
_struct_asym.id                             C 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 608 A CYS 876 1_555 A SG CYS 629 A CYS 897 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.734 ? 
disulf ? disulf2 B SG CYS 608 B CYS 876 1_555 B SG CYS 629 B CYS 897 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.736 ? 
covale ? covale1 A C ASP 67 A ASP 335 1_555 A N MSE 68 A MSE 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
covale ? covale2 A C MSE 68 A MSE 336 1_555 A N TRP 69 A TRP 337 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? 
covale ? covale3 A C ASN 132 A ASN 400 1_555 A N MSE 133 A MSE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.355 ? 
covale ? covale4 A C MSE 133 A MSE 401 1_555 A N SER 134 A SER 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.352 ? 
covale ? covale5 A C LYS 140 A LYS 408 1_555 A N MSE 141 A MSE 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale6 A C MSE 141 A MSE 409 1_555 A N ARG 142 A ARG 410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? 
covale ? covale7 A C ARG 142 A ARG 410 1_555 A N MSE 143 A MSE 411 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.346 ? 
covale ? covale8 A C MSE 143 A MSE 411 1_555 A N HIS 144 A HIS 412 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.35 ? 
covale ? covale9 A C VAL 202 A VAL 470 1_555 A N MSE 203 A MSE 471 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.367 ? 
covale ? covale10 A C MSE 203 A MSE 471 1_555 A N ARG 204 A ARG 472 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? 
covale ? covale11 A C TYR 212 A TYR 480 1_555 A N MSE 213 A MSE 481 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? 
covale ? covale12 A C MSE 213 A MSE 481 1_555 A N GLY 214 A GLY 482 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale13 A C GLU 274 A GLU 542 1_555 A N MSE 275 A MSE 543 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? 
covale ? covale14 A C MSE 275 A MSE 543 1_555 A N GLN 276 A GLN 544 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.348 ? 
covale ? covale15 A C LYS 328 A LYS 596 1_555 A N MSE 329 A MSE 597 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale16 A C MSE 329 A MSE 597 1_555 A N LYS 330 A LYS 598 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? 
covale ? covale17 A C GLY 333 A GLY 601 1_555 A N MSE 334 A MSE 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale18 A C MSE 334 A MSE 602 1_555 A N LEU 335 A LEU 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.352 ? 
covale ? covale19 A C VAL 403 A VAL 671 1_555 A N MSE 404 A MSE 672 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? 
covale ? covale20 A C MSE 404 A MSE 672 1_555 A N SER 405 A SER 673 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale21 A C LEU 464 A LEU 732 1_555 A N MSE 465 A MSE 733 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.347 ? 
covale ? covale22 A C MSE 465 A MSE 733 1_555 A N GLY 466 A GLY 734 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale23 A C ASN 467 A ASN 735 1_555 A N MSE 468 A MSE 736 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale24 A C MSE 468 A MSE 736 1_555 A N LEU 469 A LEU 737 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale25 A C GLY 614 A GLY 882 1_555 A N MSE 615 A MSE 883 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? 
covale ? covale26 A C MSE 615 A MSE 883 1_555 A N TYR 616 A TYR 884 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? 
covale ? covale27 A C TYR 616 A TYR 884 1_555 A N MSE 617 A MSE 885 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.348 ? 
covale ? covale28 A C MSE 617 A MSE 885 1_555 A N LEU 618 A LEU 886 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? 
covale ? covale29 B C ASP 67 B ASP 335 1_555 B N MSE 68 B MSE 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.356 ? 
covale ? covale30 B C MSE 68 B MSE 336 1_555 B N TRP 69 B TRP 337 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? 
covale ? covale31 B C ASN 132 B ASN 400 1_555 B N MSE 133 B MSE 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.354 ? 
covale ? covale32 B C MSE 133 B MSE 401 1_555 B N SER 134 B SER 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.352 ? 
covale ? covale33 B C LYS 140 B LYS 408 1_555 B N MSE 141 B MSE 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale34 B C MSE 141 B MSE 409 1_555 B N ARG 142 B ARG 410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale35 B C ARG 142 B ARG 410 1_555 B N MSE 143 B MSE 411 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.348 ? 
covale ? covale36 B C MSE 143 B MSE 411 1_555 B N HIS 144 B HIS 412 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.36 ? 
covale ? covale37 B C VAL 202 B VAL 470 1_555 B N MSE 203 B MSE 471 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? 
covale ? covale38 B C MSE 203 B MSE 471 1_555 B N ARG 204 B ARG 472 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.352 ? 
covale ? covale39 B C TYR 212 B TYR 480 1_555 B N MSE 213 B MSE 481 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale40 B C MSE 213 B MSE 481 1_555 B N GLY 214 B GLY 482 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale41 B C GLU 274 B GLU 542 1_555 B N MSE 275 B MSE 543 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.357 ? 
covale ? covale42 B C MSE 275 B MSE 543 1_555 B N GLN 276 B GLN 544 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.356 ? 
covale ? covale43 B C LYS 328 B LYS 596 1_555 B N MSE 329 B MSE 597 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? 
covale ? covale44 B C MSE 329 B MSE 597 1_555 B N LYS 330 B LYS 598 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.355 ? 
covale ? covale45 B C GLY 333 B GLY 601 1_555 B N MSE 334 B MSE 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? 
covale ? covale46 B C MSE 334 B MSE 602 1_555 B N LEU 335 B LEU 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? 
covale ? covale47 B C VAL 403 B VAL 671 1_555 B N MSE 404 B MSE 672 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.346 ? 
covale ? covale48 B C MSE 404 B MSE 672 1_555 B N SER 405 B SER 673 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? 
covale ? covale49 B C LEU 464 B LEU 732 1_555 B N MSE 465 B MSE 733 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale50 B C MSE 465 B MSE 733 1_555 B N GLY 466 B GLY 734 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale51 B C ASN 467 B ASN 735 1_555 B N MSE 468 B MSE 736 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? 
covale ? covale52 B C MSE 468 B MSE 736 1_555 B N LEU 469 B LEU 737 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale53 B C GLY 614 B GLY 882 1_555 B N MSE 615 B MSE 883 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? 
covale ? covale54 B C MSE 615 B MSE 883 1_555 B N TYR 616 B TYR 884 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.349 ? 
covale ? covale55 B C TYR 616 B TYR 884 1_555 B N MSE 617 B MSE 885 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale56 B C MSE 617 B MSE 885 1_555 B N LEU 618 B LEU 886 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? 
metalc ? metalc1 A OE2 GLU 117 A GLU 385 1_555 C NA NA . A NA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.821 ? 
metalc ? metalc2 A O SER 192 A SER 460 1_555 C NA NA . A NA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? 
#
_chem_comp.formula           'Na 1' 
_chem_comp.formula_weight    22.99 
_chem_comp.id                NA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'SODIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     4ECO 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.007946 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.005164 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.014664 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 NA A 1 1001 905 NA NA . 
D 3 HOH A 1 1101 906 HOH HOH . 
D 3 HOH A 2 1102 907 HOH HOH . 
D 3 HOH A 3 1103 908 HOH HOH . 
D 3 HOH A 4 1104 909 HOH HOH . 
D 3 HOH A 5 1105 913 HOH HOH . 
D 3 HOH A 6 1106 914 HOH HOH . 
D 3 HOH A 7 1107 916 HOH HOH . 
D 3 HOH A 8 1108 917 HOH HOH . 
D 3 HOH A 9 1109 919 HOH HOH . 
D 3 HOH A 10 1110 921 HOH HOH . 
D 3 HOH A 11 1111 923 HOH HOH . 
D 3 HOH A 12 1112 925 HOH HOH . 
D 3 HOH A 13 1113 929 HOH HOH . 
D 3 HOH A 14 1114 930 HOH HOH . 
D 3 HOH A 15 1115 932 HOH HOH . 
D 3 HOH A 16 1116 935 HOH HOH . 
D 3 HOH A 17 1117 936 HOH HOH . 
D 3 HOH A 18 1118 938 HOH HOH . 
D 3 HOH A 19 1119 939 HOH HOH . 
D 3 HOH A 20 1120 940 HOH HOH . 
D 3 HOH A 21 1121 941 HOH HOH . 
D 3 HOH A 22 1122 942 HOH HOH . 
D 3 HOH A 23 1123 944 HOH HOH . 
D 3 HOH A 24 1124 945 HOH HOH . 
D 3 HOH A 25 1125 946 HOH HOH . 
D 3 HOH A 26 1126 948 HOH HOH . 
D 3 HOH A 27 1127 949 HOH HOH . 
D 3 HOH A 28 1128 950 HOH HOH . 
D 3 HOH A 29 1129 951 HOH HOH . 
D 3 HOH A 30 1130 952 HOH HOH . 
D 3 HOH A 31 1131 953 HOH HOH . 
D 3 HOH A 32 1132 957 HOH HOH . 
D 3 HOH A 33 1133 958 HOH HOH . 
D 3 HOH A 34 1134 960 HOH HOH . 
D 3 HOH A 35 1135 961 HOH HOH . 
D 3 HOH A 36 1136 964 HOH HOH . 
D 3 HOH A 37 1137 965 HOH HOH . 
D 3 HOH A 38 1138 966 HOH HOH . 
D 3 HOH A 39 1139 967 HOH HOH . 
D 3 HOH A 40 1140 968 HOH HOH . 
D 3 HOH A 41 1141 969 HOH HOH . 
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