data_4FME
#
_model_server_result.job_id            KL2I19fl152P4Ujvap6Q6w 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-04 23:42:23' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4fme 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":201}' 
#
_entry.id    4FME 
#
_exptl.entry_id    4FME 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              523.18 
_entity.id                          7 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            4FME 
_cell.length_a            137.222 
_cell.length_b            137.222 
_cell.length_c            126.503 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4FME 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        78 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 43' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,G,H,I,J,K,Q,R 1 1 
D,E,F,L,M,N,O,P,S,T 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 7 J N N 
? 7 O N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 Q O HOH . A HOH 401 1_555 G AL AF3 . B AF3 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.949 ? 
metalc ? metalc2 B OG SER 20 B SER 25 1_555 I MG MG . B MG 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? 
metalc ? metalc3 B OG1 THR 38 B THR 43 1_555 I MG MG . B MG 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.627 ? 
metalc ? metalc4 B OD2 ASP 61 B ASP 66 1_555 I MG MG . B MG 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? 
metalc ? metalc5 G AL AF3 . B AF3 201 1_555 H O1B GDP . B GDP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.956 ? 
metalc ? metalc6 I MG MG . B MG 203 1_555 R O HOH . B HOH 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.448 ? 
metalc ? metalc7 C OG1 THR 14 C THR 27 1_555 K MG MG . C MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? 
metalc ? metalc8 C OG1 THR 31 C THR 44 1_555 K MG MG . C MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.522 ? 
metalc ? metalc9 J O2B GTP . C GTP 201 1_555 K MG MG . C MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? 
metalc ? metalc10 J O3B GTP . C GTP 201 1_555 K MG MG . C MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.559 ? 
metalc ? metalc11 J O3G GTP . C GTP 201 1_555 K MG MG . C MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.706 ? 
metalc ? metalc12 J O2G GTP . C GTP 201 1_555 K MG MG . C MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.861 ? 
metalc ? metalc13 S O HOH . D HOH 401 1_555 L AL AF3 . E AF3 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.949 ? 
metalc ? metalc14 E OG SER 20 E SER 25 1_555 N MG MG . E MG 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.629 ? 
metalc ? metalc15 E OG1 THR 38 E THR 43 1_555 N MG MG . E MG 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.709 ? 
metalc ? metalc16 E OD2 ASP 61 E ASP 66 1_555 N MG MG . E MG 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.83 ? 
metalc ? metalc17 L AL AF3 . E AF3 201 1_555 M O1B GDP . E GDP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.957 ? 
metalc ? metalc18 M O3B GDP . E GDP 202 1_555 N MG MG . E MG 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.95 ? 
metalc ? metalc19 N MG MG . E MG 203 1_555 T O HOH . E HOH 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? 
metalc ? metalc20 F OG1 THR 14 F THR 27 1_555 P MG MG . F MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.517 ? 
metalc ? metalc21 F OG1 THR 31 F THR 44 1_555 P MG MG . F MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? 
metalc ? metalc22 O O2B GTP . F GTP 201 1_555 P MG MG . F MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.505 ? 
metalc ? metalc23 O O3B GTP . F GTP 201 1_555 P MG MG . F MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? 
metalc ? metalc24 O O3G GTP . F GTP 201 1_555 P MG MG . F MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.723 ? 
metalc ? metalc25 O O2G GTP . F GTP 201 1_555 P MG MG . F MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.894 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H16 N5 O14 P3' 
_chem_comp.formula_weight    523.18 
_chem_comp.id                GTP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G GTP doub 177 n n 
PG O2G GTP sing 178 n n 
PG O3G GTP sing 179 n n 
PG O3B GTP sing 180 n n 
O2G HOG2 GTP sing 181 n n 
O3G HOG3 GTP sing 182 n n 
O3B PB GTP sing 183 n n 
PB O1B GTP doub 184 n n 
PB O2B GTP sing 185 n n 
PB O3A GTP sing 186 n n 
O2B HOB2 GTP sing 187 n n 
O3A PA GTP sing 188 n n 
PA O1A GTP doub 189 n n 
PA O2A GTP sing 190 n n 
PA O5' GTP sing 191 n n 
O2A HOA2 GTP sing 192 n n 
O5' C5' GTP sing 193 n n 
C5' C4' GTP sing 194 n n 
C5' H5' GTP sing 195 n n 
C5' "H5''" GTP sing 196 n n 
C4' O4' GTP sing 197 n n 
C4' C3' GTP sing 198 n n 
C4' H4' GTP sing 199 n n 
O4' C1' GTP sing 200 n n 
C3' O3' GTP sing 201 n n 
C3' C2' GTP sing 202 n n 
C3' H3' GTP sing 203 n n 
O3' HO3' GTP sing 204 n n 
C2' O2' GTP sing 205 n n 
C2' C1' GTP sing 206 n n 
C2' H2' GTP sing 207 n n 
O2' HO2' GTP sing 208 n n 
C1' N9 GTP sing 209 n n 
C1' H1' GTP sing 210 n n 
N9 C8 GTP sing 211 n y 
N9 C4 GTP sing 212 n y 
C8 N7 GTP doub 213 n y 
C8 H8 GTP sing 214 n n 
N7 C5 GTP sing 215 n y 
C5 C6 GTP sing 216 n n 
C5 C4 GTP doub 217 n y 
C6 O6 GTP doub 218 n n 
C6 N1 GTP sing 219 n n 
N1 C2 GTP sing 220 n n 
N1 HN1 GTP sing 221 n n 
C2 N2 GTP sing 222 n n 
C2 N3 GTP doub 223 n n 
N2 HN21 GTP sing 224 n n 
N2 HN22 GTP sing 225 n n 
N3 C4 GTP sing 226 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     4FME 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.007287 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.007287 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007905 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
G 4 AF3 B 1 201 505 AF3 AF3 . 
H 5 GDP B 1 202 501 GDP GDP . 
I 6 MG B 1 203 502 MG MG . 
J 7 GTP C 1 201 1230 GTP GTP . 
K 6 MG C 1 202 1231 MG MG . 
L 4 AF3 E 1 201 505 AF3 AF3 . 
M 5 GDP E 1 202 501 GDP GDP . 
N 6 MG E 1 203 502 MG MG . 
O 7 GTP F 1 201 1230 GTP GTP . 
P 6 MG F 1 202 1231 MG MG . 
Q 8 HOH A 1 401 503 HOH HOH . 
R 8 HOH B 1 301 504 HOH HOH . 
S 8 HOH D 1 401 503 HOH HOH . 
T 8 HOH E 1 301 504 HOH HOH . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 P PG GTP . . . J 7 1.352 62.64 -0.883 1 138.38 ? PG GTP 201 C 1 
HETATM 2 O O1G GTP . . . J 7 0.717 63.399 -1.982 1 139.47 ? O1G GTP 201 C 1 
HETATM 3 O O2G GTP . . . J 7 0.621 62.692 0.403 1 115.64 ? O2G GTP 201 C 1 
HETATM 4 O O3G GTP . . . J 7 2.815 62.832 -0.768 1 113.8 ? O3G GTP 201 C 1 
HETATM 5 O O3B GTP . . . J 7 1.208 61.104 -1.34 1 154.56 ? O3B GTP 201 C 1 
HETATM 6 P PB GTP . . . J 7 2.297 60.444 -2.325 1 146.42 ? PB GTP 201 C 1 
HETATM 7 O O1B GTP . . . J 7 2.499 61.343 -3.483 1 120.35 ? O1B GTP 201 C 1 
HETATM 8 O O2B GTP . . . J 7 3.475 60.027 -1.533 1 137.78 ? O2B GTP 201 C 1 
HETATM 9 O O3A GTP . . . J 7 1.543 59.117 -2.834 1 147.06 ? O3A GTP 201 C 1 
HETATM 10 P PA GTP . . . J 7 1.612 57.763 -1.968 1 106.27 ? PA GTP 201 C 1 
HETATM 11 O O1A GTP . . . J 7 3.027 57.35 -1.836 1 140.06 ? O1A GTP 201 C 1 
HETATM 12 O O2A GTP . . . J 7 0.805 57.935 -0.74 1 84.64 ? O2A GTP 201 C 1 
HETATM 13 O O5' GTP . . . J 7 0.856 56.712 -2.925 1 138.51 ? O5' GTP 201 C 1 
HETATM 14 C C5' GTP . . . J 7 -0.426 57.05 -3.46 1 111.78 ? C5' GTP 201 C 1 
HETATM 15 C C4' GTP . . . J 7 -1.068 55.834 -4.132 1 122.15 ? C4' GTP 201 C 1 
HETATM 16 O O4' GTP . . . J 7 -0.209 55.385 -5.197 1 121.21 ? O4' GTP 201 C 1 
HETATM 17 C C3' GTP . . . J 7 -1.144 54.681 -3.143 1 111.87 ? C3' GTP 201 C 1 
HETATM 18 O O3' GTP . . . J 7 -2.351 53.932 -3.349 1 124.38 ? O3' GTP 201 C 1 
HETATM 19 C C2' GTP . . . J 7 0.05 53.845 -3.56 1 126 ? C2' GTP 201 C 1 
HETATM 20 O O2' GTP . . . J 7 -0.128 52.481 -3.15 1 118.02 ? O2' GTP 201 C 1 
HETATM 21 C C1' GTP . . . J 7 -0.122 53.957 -5.062 1 117.83 ? C1' GTP 201 C 1 
HETATM 22 N N9 GTP . . . J 7 1.015 53.382 -5.815 1 146.47 ? N9 GTP 201 C 1 
HETATM 23 C C8 GTP . . . J 7 2.303 53.595 -5.564 1 142.91 ? C8 GTP 201 C 1 
HETATM 24 N N7 GTP . . . J 7 3.005 53.01 -6.531 1 80.62 ? N7 GTP 201 C 1 
HETATM 25 C C5 GTP . . . J 7 2.153 52.429 -7.37 1 133.65 ? C5 GTP 201 C 1 
HETATM 26 C C6 GTP . . . J 7 2.362 51.67 -8.443 1 121.19 ? C6 GTP 201 C 1 
HETATM 27 O O6 GTP . . . J 7 3.503 51.459 -8.85 1 131.57 ? O6 GTP 201 C 1 
HETATM 28 N N1 GTP . . . J 7 1.274 51.106 -9.118 1 106.37 ? N1 GTP 201 C 1 
HETATM 29 C C2 GTP . . . J 7 -0.012 51.369 -8.633 1 147.21 ? C2 GTP 201 C 1 
HETATM 30 N N2 GTP . . . J 7 -1.075 50.813 -9.206 1 172.07 ? N2 GTP 201 C 1 
HETATM 31 N N3 GTP . . . J 7 -0.152 52.15 -7.553 1 169.59 ? N3 GTP 201 C 1 
HETATM 32 C C4 GTP . . . J 7 0.919 52.666 -6.931 1 153.15 ? C4 GTP 201 C 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              10 
_model_server_stats.parse_time_ms           16 
_model_server_stats.create_model_time_ms    25 
_model_server_stats.query_time_ms           273 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           32 
#