data_4FZZ
#
_model_server_result.job_id            d3f9XIfXcYt_NoHXnxQKTw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-24 22:07:11' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4fzz 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":101}' 
#
_entry.id    4FZZ 
#
_exptl.entry_id    4FZZ 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              22.99 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'SODIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            4FZZ 
_cell.length_a            37.192 
_cell.length_b            79.009 
_cell.length_c            156.012 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4FZZ 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 E N N 
? 3 F N N 
? 3 G N N 
? 3 H N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A O3' DA 16 D DA 11 1_555 E NA NA . D NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? 
metalc ? metalc2 A OP1 DG 17 D DG 12 1_555 E NA NA . D NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.653 ? 
metalc ? metalc3 A OP1 DG 17 D DG 12 1_555 H NA NA . B NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.445 ? 
metalc ? metalc4 E NA NA . D NA 101 1_555 D OD2 ASP 6 B ASP 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.195 ? 
metalc ? metalc5 E NA NA . D NA 101 1_555 L O HOH . B HOH 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? 
metalc ? metalc6 E NA NA . D NA 101 1_555 L O HOH . B HOH 317 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? 
metalc ? metalc7 E NA NA . D NA 101 1_555 L O HOH . B HOH 319 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.614 ? 
metalc ? metalc8 B O3' DA 16 C DA 11 1_555 F NA NA . C NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? 
metalc ? metalc9 B OP1 DG 17 C DG 12 1_555 F NA NA . C NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? 
metalc ? metalc10 B OP1 DG 17 C DG 12 1_555 G NA NA . A NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? 
metalc ? metalc11 F NA NA . C NA 101 1_555 C OD1 ASP 6 A ASP 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? 
metalc ? metalc12 F NA NA . C NA 101 1_555 K O HOH . A HOH 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? 
metalc ? metalc13 F NA NA . C NA 101 1_555 K O HOH . A HOH 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? 
metalc ? metalc14 F NA NA . C NA 101 1_555 K O HOH . A HOH 307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc15 C OD2 ASP 6 A ASP 6 1_555 G NA NA . A NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? 
metalc ? metalc16 C OE2 GLU 8 A GLU 8 1_555 G NA NA . A NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? 
metalc ? metalc17 C OD2 ASP 139 A ASP 139 1_555 G NA NA . A NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? 
metalc ? metalc18 D OD1 ASP 6 B ASP 6 1_555 H NA NA . B NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.699 ? 
metalc ? metalc19 D OE2 GLU 8 B GLU 8 1_555 H NA NA . B NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? 
metalc ? metalc20 D OD2 ASP 139 B ASP 139 1_555 H NA NA . B NA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? 
hydrog TYPE_8_PAIR hydrog1 A N1 DG 7 D DG 2 1_555 B N1 DA 16 C DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_8_PAIR hydrog2 A O6 DG 7 D DG 2 1_555 B N6 DA 16 C DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'DT-DG MISPAIR' hydrog3 A O4 DT 8 D DT 3 1_555 B N1 DG 15 C DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N1 DG 9 D DG 4 1_555 B N3 DC 14 C DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N2 DG 9 D DG 4 1_555 B O2 DC 14 C DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O6 DG 9 D DG 4 1_555 B N4 DC 14 C DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N1 DG 10 D DG 5 1_555 B N3 DC 13 C DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N2 DG 10 D DG 5 1_555 B O2 DC 13 C DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A O6 DG 10 D DG 5 1_555 B N4 DC 13 C DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N1 DA 11 D DA 6 1_555 B N3 DT 12 C DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N6 DA 11 D DA 6 1_555 B O4 DT 12 C DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A N3 DT 12 D DT 7 1_555 B N1 DA 11 C DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A O4 DT 12 D DT 7 1_555 B N6 DA 11 C DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A N3 DC 13 D DC 8 1_555 B N1 DG 10 C DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N4 DC 13 D DC 8 1_555 B O6 DG 10 C DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A O2 DC 13 D DC 8 1_555 B N2 DG 10 C DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N3 DC 14 D DC 9 1_555 B N1 DG 9 C DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A N4 DC 14 D DC 9 1_555 B O6 DG 9 C DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A O2 DC 14 D DC 9 1_555 B N2 DG 9 C DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_28_PAIR hydrog20 A N1 DG 15 D DG 10 1_555 B O2 DT 8 C DT 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog TYPE_28_PAIR hydrog21 A O6 DG 15 D DG 10 1_555 B N3 DT 8 C DT 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'DA-DG MISPAIR' hydrog22 A N1 DA 16 D DA 11 1_555 B N1 DG 7 C DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
#
_chem_comp.formula           'Na 1' 
_chem_comp.formula_weight    22.99 
_chem_comp.id                NA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'SODIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     4FZZ 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.026888 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.012657 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.00641 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 3 NA D 1 101 2 NA NA . 
F 3 NA C 1 101 4 NA NA . 
G 3 NA A 1 201 3 NA NA . 
H 3 NA B 1 201 1 NA NA . 
I 4 HOH D 1 201 21 HOH HOH . 
I 4 HOH D 2 202 27 HOH HOH . 
J 4 HOH C 1 201 6 HOH HOH . 
J 4 HOH C 2 202 15 HOH HOH . 
K 4 HOH A 1 301 1 HOH HOH . 
K 4 HOH A 2 302 5 HOH HOH . 
K 4 HOH A 3 303 7 HOH HOH . 
K 4 HOH A 4 304 19 HOH HOH . 
K 4 HOH A 5 305 20 HOH HOH . 
K 4 HOH A 6 306 29 HOH HOH . 
K 4 HOH A 7 307 30 HOH HOH . 
L 4 HOH B 1 301 2 HOH HOH . 
L 4 HOH B 2 302 3 HOH HOH . 
L 4 HOH B 3 303 4 HOH HOH . 
L 4 HOH B 4 304 8 HOH HOH . 
L 4 HOH B 5 305 9 HOH HOH . 
L 4 HOH B 6 306 10 HOH HOH . 
L 4 HOH B 7 307 11 HOH HOH . 
L 4 HOH B 8 308 12 HOH HOH . 
L 4 HOH B 9 309 13 HOH HOH . 
L 4 HOH B 10 310 14 HOH HOH . 
L 4 HOH B 11 311 16 HOH HOH . 
L 4 HOH B 12 312 17 HOH HOH . 
L 4 HOH B 13 313 18 HOH HOH . 
L 4 HOH B 14 314 22 HOH HOH . 
L 4 HOH B 15 315 23 HOH HOH . 
L 4 HOH B 16 316 24 HOH HOH . 
L 4 HOH B 17 317 25 HOH HOH . 
L 4 HOH B 18 318 26 HOH HOH . 
L 4 HOH B 19 319 28 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           NA 
_atom_site.label_atom_id         NA 
_atom_site.label_comp_id         NA 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         F 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               -17.86 
_atom_site.Cartn_y               1.296 
_atom_site.Cartn_z               -15.552 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        29.45 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          NA 
_atom_site.auth_comp_id          NA 
_atom_site.auth_seq_id           101 
_atom_site.auth_asym_id          C 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              9 
_model_server_stats.parse_time_ms           8 
_model_server_stats.create_model_time_ms    9 
_model_server_stats.query_time_ms           285 
_model_server_stats.encode_time_ms          4 
_model_server_stats.element_count           1 
#