data_4G1M # _model_server_result.job_id DkqiPWtSD6rKwXfSn8KnZQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-26 21:18:19' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4g1m # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"Y","auth_seq_id":3099}' # _entry.id 4G1M # _exptl.entry_id 4G1M _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 8 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 4G1M _cell.length_a 129.87 _cell.length_b 129.87 _cell.length_c 305.9 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4G1M _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 154 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 32 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 T N N ? 8 U N N ? 8 Y N N ? 8 Z N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 3 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 3 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 4 ? 3 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 5 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 7 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 8 ? 5 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 9 ? 5 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 10 ? 5 6 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 11 ? 5 7 6 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 12 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 13 ? 6 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n C NAG 1 C 1 NAG A 3044 NAG 3 n C NAG 2 C 2 NAG A 3045 NAG 3 n C BMA 3 C 3 BMA A 3046 BMA 3 n C MAN 4 C 4 MAN A 3048 MAN 3 n C MAN 5 C 5 MAN A 3047 MAN 4 n D NAG 1 D 1 NAG A 3260 NAG 4 n D NAG 2 D 2 NAG A 3261 NAG 5 n E NAG 1 E 1 NAG A 3266 NAG 5 n E NAG 2 E 2 NAG A 3267 NAG 5 n E BMA 3 E 3 BMA A 3268 BMA 5 n E MAN 4 E 4 MAN A 3269 MAN 5 n E MAN 5 E 5 MAN A 3272 MAN 5 n E MAN 6 E 6 MAN A 3270 MAN 5 n E MAN 7 E 7 MAN A 3271 MAN 4 n F NAG 1 F 1 NAG A 3458 NAG 4 n F NAG 2 F 2 NAG A 3459 NAG 4 n G NAG 1 G 1 NAG A 3524 NAG 4 n G NAG 2 G 2 NAG A 3525 NAG 4 n H NAG 1 H 1 NAG A 3585 NAG 4 n H NAG 2 H 2 NAG A 3586 NAG 4 n I NAG 1 I 1 NAG A 3821 NAG 4 n I NAG 2 I 2 NAG A 3822 NAG 4 n J NAG 1 J 1 NAG A 3943 NAG 4 n J NAG 2 J 2 NAG A 3944 NAG 4 n K NAG 1 K 1 NAG A 3950 NAG 4 n K NAG 2 K 2 NAG A 3951 NAG 4 n L NAG 1 L 1 NAG B 3320 NAG 4 n L NAG 2 L 2 NAG B 3321 NAG 4 n M NAG 1 M 1 NAG B 3371 NAG 4 n M NAG 2 M 2 NAG B 3372 NAG 6 n N NAG 1 N 1 NAG B 3559 NAG 6 n N NAG 2 N 2 NAG B 3560 NAG 6 n N BMA 3 N 3 BMA B 3561 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 59 A CYS 59 1_555 A SG CYS 67 A CYS 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 108 A CYS 108 1_555 A SG CYS 128 A CYS 128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 142 A CYS 142 1_555 A SG CYS 155 A CYS 155 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 461 A CYS 461 1_555 A SG CYS 472 A CYS 472 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 478 A CYS 478 1_555 A SG CYS 535 A CYS 535 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 596 A CYS 596 1_555 A SG CYS 602 A CYS 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 668 A CYS 668 1_555 A SG CYS 681 A CYS 681 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 822 A CYS 822 1_555 A SG CYS 884 A CYS 884 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 874 A CYS 874 1_555 A SG CYS 879 A CYS 879 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 5 B CYS 5 1_555 B SG CYS 23 B CYS 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 13 B CYS 13 1_555 B SG CYS 435 B CYS 435 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 16 B CYS 16 1_555 B SG CYS 38 B CYS 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 26 B CYS 26 1_555 B SG CYS 49 B CYS 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 177 B CYS 177 1_555 B SG CYS 184 B CYS 184 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 232 B CYS 232 1_555 B SG CYS 273 B CYS 273 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 374 B CYS 374 1_555 B SG CYS 386 B CYS 386 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf17 B SG CYS 406 B CYS 406 1_555 B SG CYS 433 B CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 437 B CYS 437 1_555 B SG CYS 457 B CYS 457 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 448 B CYS 448 1_555 B SG CYS 460 B CYS 460 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 462 B CYS 462 1_555 B SG CYS 471 B CYS 471 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 473 B CYS 473 1_555 B SG CYS 503 B CYS 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 486 B CYS 486 1_555 B SG CYS 501 B CYS 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 495 B CYS 495 1_555 B SG CYS 506 B CYS 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 508 B CYS 508 1_555 B SG CYS 521 B CYS 521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 523 B CYS 523 1_555 B SG CYS 544 B CYS 544 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 528 B CYS 528 1_555 B SG CYS 542 B CYS 542 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf27 B SG CYS 536 B CYS 536 1_555 B SG CYS 547 B CYS 547 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf28 B SG CYS 549 B CYS 549 1_555 B SG CYS 558 B CYS 558 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf29 B SG CYS 560 B CYS 560 1_555 B SG CYS 583 B CYS 583 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf30 B SG CYS 567 B CYS 567 1_555 B SG CYS 581 B CYS 581 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf31 B SG CYS 575 B CYS 575 1_555 B SG CYS 586 B CYS 586 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf32 B SG CYS 588 B CYS 588 1_555 B SG CYS 598 B CYS 598 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf33 B SG CYS 601 B CYS 601 1_555 B SG CYS 604 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf34 B SG CYS 608 B CYS 608 1_555 B SG CYS 655 B CYS 655 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf35 B SG CYS 614 B CYS 614 1_555 B SG CYS 635 B CYS 635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf36 B SG CYS 617 B CYS 617 1_555 B SG CYS 631 B CYS 631 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf37 B SG CYS 663 B CYS 663 1_555 B SG CYS 687 B CYS 687 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 44 A ASN 44 1_555 C C1 NAG . C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 260 A ASN 260 1_555 D C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 266 A ASN 266 1_555 E C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 458 A ASN 458 1_555 F C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 524 A ASN 524 1_555 G C1 NAG . G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale6 A ND2 ASN 585 A ASN 585 1_555 H C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale7 A ND2 ASN 674 A ASN 674 1_555 T C1 NAG . A NAG 3674 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale8 A ND2 ASN 805 A ASN 805 1_555 U C1 NAG . A NAG 3805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 821 A ASN 821 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 943 A ASN 943 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale11 A ND2 ASN 950 A ASN 950 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 99 B ASN 99 1_555 Y C1 NAG . B NAG 3099 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale13 B ND2 ASN 320 B ASN 320 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 371 B ASN 371 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 452 B ASN 452 1_555 Z C1 NAG . B NAG 3452 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale16 B ND2 ASN 559 B ASN 559 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale17 C O4 NAG . C NAG 1 1_555 C C1 NAG . C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale18 C O4 NAG . C NAG 2 1_555 C C1 BMA . C BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale19 C O3 BMA . C BMA 3 1_555 C C1 MAN . C MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale20 C O6 BMA . C BMA 3 1_555 C C1 MAN . C MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale21 D O4 NAG . D NAG 1 1_555 D C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale22 E O4 NAG . E NAG 1 1_555 E C1 NAG . E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale23 E O4 NAG . E NAG 2 1_555 E C1 BMA . E BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale24 E O3 BMA . E BMA 3 1_555 E C1 MAN . E MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale25 E O6 BMA . E BMA 3 1_555 E C1 MAN . E MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale26 E O2 MAN . E MAN 4 1_555 E C1 MAN . E MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale27 E O3 MAN . E MAN 6 1_555 E C1 MAN . E MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale28 F O4 NAG . F NAG 1 1_555 F C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale29 G O4 NAG . G NAG 1 1_555 G C1 NAG . G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale30 H O4 NAG . H NAG 1 1_555 H C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale31 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale32 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale33 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale34 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale35 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale36 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale37 N O4 NAG . N NAG 2 1_555 N C1 BMA . N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? metalc ? metalc1 A OD2 ASP 230 A ASP 230 1_555 O CA CA . A CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASN 232 A ASN 232 1_555 O CA CA . A CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 234 A ASP 234 1_555 O CA CA . A CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? metalc ? metalc4 A O ILE 236 A ILE 236 1_555 O CA CA . A CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.141 ? metalc ? metalc5 A OD1 ASP 238 A ASP 238 1_555 O CA CA . A CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? metalc ? metalc6 A OD2 ASP 238 A ASP 238 1_555 O CA CA . A CA 2004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.939 ? metalc ? metalc7 A OD2 ASP 284 A ASP 284 1_555 P CA CA . A CA 2005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASN 286 A ASN 286 1_555 P CA CA . A CA 2005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 288 A ASP 288 1_555 P CA CA . A CA 2005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? metalc ? metalc10 A O TYR 290 A TYR 290 1_555 P CA CA . A CA 2005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? metalc ? metalc11 A OD2 ASP 292 A ASP 292 1_555 P CA CA . A CA 2005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 292 A ASP 292 1_555 P CA CA . A CA 2005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? metalc ? metalc13 A OD2 ASP 349 A ASP 349 1_555 Q CA CA . A CA 2006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc14 A OD1 ASP 351 A ASP 351 1_555 Q CA CA . A CA 2006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc15 A OD1 ASP 353 A ASP 353 1_555 Q CA CA . A CA 2006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc16 A O PHE 355 A PHE 355 1_555 Q CA CA . A CA 2006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.281 ? metalc ? metalc17 A OD2 ASP 357 A ASP 357 1_555 Q CA CA . A CA 2006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.416 ? metalc ? metalc18 A OD1 ASP 357 A ASP 357 1_555 Q CA CA . A CA 2006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.452 ? metalc ? metalc19 A OD1 ASP 413 A ASP 413 1_555 R CA CA . A CA 2007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc20 A OD1 ASP 415 A ASP 415 1_555 R CA CA . A CA 2007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc ? metalc21 A OD1 ASN 417 A ASN 417 1_555 R CA CA . A CA 2007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? metalc ? metalc22 A O TYR 419 A TYR 419 1_555 R CA CA . A CA 2007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? metalc ? metalc23 A OD2 ASP 421 A ASP 421 1_555 R CA CA . A CA 2007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.405 ? metalc ? metalc24 A OD1 ASP 421 A ASP 421 1_555 R CA CA . A CA 2007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.542 ? metalc ? metalc25 A O CYS 596 A CYS 596 1_555 S CA CA . A CA 2008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? metalc ? metalc26 A OD1 ASP 599 A ASP 599 1_555 S CA CA . A CA 2008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? metalc ? metalc27 A O VAL 601 A VAL 601 1_555 S CA CA . A CA 2008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.23 ? metalc ? metalc28 A OE2 GLU 636 A GLU 636 1_555 S CA CA . A CA 2008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.388 ? metalc ? metalc29 A OE1 GLU 636 A GLU 636 1_555 S CA CA . A CA 2008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc30 A O SER 705 A SER 705 1_555 V NA NA . A NA 3000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? metalc ? metalc31 A O MET 707 A MET 707 1_555 V NA NA . A NA 3000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.624 ? metalc ? metalc32 A OD1 ASP 708 A ASP 708 1_555 V NA NA . A NA 3000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.669 ? metalc ? metalc33 O CA CA . A CA 2004 1_555 AA O HOH . A HOH 4001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? metalc ? metalc34 P CA CA . A CA 2005 1_555 AA O HOH . A HOH 4002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc35 Q CA CA . A CA 2006 1_555 AA O HOH . A HOH 4003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc ? metalc36 R CA CA . A CA 2007 1_555 AA O HOH . A HOH 4004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc ? metalc37 S CA CA . A CA 2008 1_555 AA O HOH . A HOH 4005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? metalc ? metalc38 S CA CA . A CA 2008 1_555 AA O HOH . A HOH 4006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? metalc ? metalc39 B OG SER 121 B SER 121 1_555 W CA CA . B CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? metalc ? metalc40 B OG SER 123 B SER 123 1_555 W CA CA . B CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc41 B O SER 123 B SER 123 1_555 X CA CA . B CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc42 B OD1 ASP 126 B ASP 126 1_555 X CA CA . B CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? metalc ? metalc43 B OD1 ASP 127 B ASP 127 1_555 X CA CA . B CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? metalc ? metalc44 B OE2 GLU 220 B GLU 220 1_555 W CA CA . B CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.019 ? metalc ? metalc45 B OD1 ASP 251 B ASP 251 1_555 W CA CA . B CA 2001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? metalc ? metalc46 B O MET 335 B MET 335 1_555 X CA CA . B CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? metalc ? metalc47 BA O HOH . B HOH 1033 1_555 X CA CA . B CA 2002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 285 n n C1 O1 NAG sing 286 n n C1 O5 NAG sing 287 n n C1 H1 NAG sing 288 n n C2 C3 NAG sing 289 n n C2 N2 NAG sing 290 n n C2 H2 NAG sing 291 n n C3 C4 NAG sing 292 n n C3 O3 NAG sing 293 n n C3 H3 NAG sing 294 n n C4 C5 NAG sing 295 n n C4 O4 NAG sing 296 n n C4 H4 NAG sing 297 n n C5 C6 NAG sing 298 n n C5 O5 NAG sing 299 n n C5 H5 NAG sing 300 n n C6 O6 NAG sing 301 n n C6 H61 NAG sing 302 n n C6 H62 NAG sing 303 n n C7 C8 NAG sing 304 n n C7 N2 NAG sing 305 n n C7 O7 NAG doub 306 n n C8 H81 NAG sing 307 n n C8 H82 NAG sing 308 n n C8 H83 NAG sing 309 n n N2 HN2 NAG sing 310 n n O1 HO1 NAG sing 311 n n O3 HO3 NAG sing 312 n n O4 HO4 NAG sing 313 n n O6 HO6 NAG sing 314 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 4G1M _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.0077 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.004446 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008891 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.003269 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code O 7 CA A 1 2004 2004 CA CA . P 7 CA A 1 2005 2005 CA CA . Q 7 CA A 1 2006 2006 CA CA . R 7 CA A 1 2007 2007 CA CA . S 7 CA A 1 2008 2008 CA CA . T 8 NAG A 1 3674 3674 NAG NAG . U 8 NAG A 1 3805 3805 NAG NAG . V 9 NA A 1 3000 3000 NA NA . W 7 CA B 1 2001 2001 CA CA . X 7 CA B 1 2002 2002 CA CA . Y 8 NAG B 1 3099 3099 NAG NAG . Z 8 NAG B 1 3452 3452 NAG NAG . AA 10 HOH A 1 4001 4001 HOH HOH . AA 10 HOH A 2 4002 4002 HOH HOH . AA 10 HOH A 3 4003 4003 HOH HOH . AA 10 HOH A 4 4004 4004 HOH HOH . AA 10 HOH A 5 4005 4005 HOH HOH . AA 10 HOH A 6 4006 4006 HOH HOH . AA 10 HOH A 7 1000 1000 HOH HOH . AA 10 HOH A 8 1003 1003 HOH HOH . AA 10 HOH A 9 1004 1004 HOH HOH . AA 10 HOH A 10 1006 1006 HOH HOH . AA 10 HOH A 11 1008 1008 HOH HOH . AA 10 HOH A 12 1009 1009 HOH HOH . AA 10 HOH A 13 1011 1011 HOH HOH . AA 10 HOH A 14 1012 1012 HOH HOH . AA 10 HOH A 15 1013 1013 HOH HOH . AA 10 HOH A 16 1015 1015 HOH HOH . AA 10 HOH A 17 1016 1016 HOH HOH . AA 10 HOH A 18 1018 1018 HOH HOH . AA 10 HOH A 19 1019 1019 HOH HOH . AA 10 HOH A 20 1020 1020 HOH HOH . AA 10 HOH A 21 1021 1021 HOH HOH . AA 10 HOH A 22 1022 1022 HOH HOH . AA 10 HOH A 23 1023 1023 HOH HOH . AA 10 HOH A 24 1024 1024 HOH HOH . AA 10 HOH A 25 1025 1025 HOH HOH . AA 10 HOH A 26 1027 1027 HOH HOH . AA 10 HOH A 27 1028 1028 HOH HOH . AA 10 HOH A 28 1029 1029 HOH HOH . AA 10 HOH A 29 1030 1030 HOH HOH . AA 10 HOH A 30 1031 1031 HOH HOH . AA 10 HOH A 31 1032 1032 HOH HOH . AA 10 HOH A 32 1041 1041 HOH HOH . AA 10 HOH A 33 1042 1042 HOH HOH . AA 10 HOH A 34 1049 1049 HOH HOH . AA 10 HOH A 35 1050 1050 HOH HOH . AA 10 HOH A 36 1051 1051 HOH HOH . AA 10 HOH A 37 1052 1052 HOH HOH . AA 10 HOH A 38 1057 1057 HOH HOH . AA 10 HOH A 39 1058 1058 HOH HOH . AA 10 HOH A 40 1059 1059 HOH HOH . AA 10 HOH A 41 1060 1060 HOH HOH . AA 10 HOH A 42 1061 1061 HOH HOH . AA 10 HOH A 43 1062 1062 HOH HOH . AA 10 HOH A 44 1063 1063 HOH HOH . AA 10 HOH A 45 1064 1064 HOH HOH . AA 10 HOH A 46 1065 1065 HOH HOH . AA 10 HOH A 47 1068 1068 HOH HOH . AA 10 HOH A 48 1071 1071 HOH HOH . AA 10 HOH A 49 1072 1072 HOH HOH . AA 10 HOH A 50 1076 1076 HOH HOH . AA 10 HOH A 51 1077 1077 HOH HOH . AA 10 HOH A 52 1078 1078 HOH HOH . AA 10 HOH A 53 1079 1079 HOH HOH . AA 10 HOH A 54 1080 1080 HOH HOH . AA 10 HOH A 55 1081 1081 HOH HOH . AA 10 HOH A 56 1082 1082 HOH HOH . AA 10 HOH A 57 1086 1086 HOH HOH . AA 10 HOH A 58 1087 1087 HOH HOH . AA 10 HOH A 59 1092 1092 HOH HOH . AA 10 HOH A 60 1093 1093 HOH HOH . AA 10 HOH A 61 1094 1094 HOH HOH . AA 10 HOH A 62 1095 1095 HOH HOH . AA 10 HOH A 63 1096 1096 HOH HOH . AA 10 HOH A 64 1097 1097 HOH HOH . AA 10 HOH A 65 1098 1098 HOH HOH . AA 10 HOH A 66 1099 1099 HOH HOH . BA 10 HOH B 1 1001 1001 HOH HOH . BA 10 HOH B 2 1002 1002 HOH HOH . BA 10 HOH B 3 1005 1005 HOH HOH . BA 10 HOH B 4 1007 1007 HOH HOH . BA 10 HOH B 5 1010 1010 HOH HOH . BA 10 HOH B 6 1014 1014 HOH HOH . BA 10 HOH B 7 1017 1017 HOH HOH . BA 10 HOH B 8 1026 1026 HOH HOH . BA 10 HOH B 9 1033 1033 HOH HOH . BA 10 HOH B 10 1034 1034 HOH HOH . BA 10 HOH B 11 1035 1035 HOH HOH . BA 10 HOH B 12 1036 1036 HOH HOH . BA 10 HOH B 13 1037 1037 HOH HOH . BA 10 HOH B 14 1038 1038 HOH HOH . BA 10 HOH B 15 1039 1039 HOH HOH . BA 10 HOH B 16 1040 1040 HOH HOH . BA 10 HOH B 17 1043 1043 HOH HOH . BA 10 HOH B 18 1044 1044 HOH HOH . BA 10 HOH B 19 1045 1045 HOH HOH . BA 10 HOH B 20 1046 1046 HOH HOH . BA 10 HOH B 21 1047 1047 HOH HOH . BA 10 HOH B 22 1048 1048 HOH HOH . BA 10 HOH B 23 1053 1053 HOH HOH . BA 10 HOH B 24 1054 1054 HOH HOH . BA 10 HOH B 25 1055 1055 HOH HOH . BA 10 HOH B 26 1056 1056 HOH HOH . BA 10 HOH B 27 1066 1066 HOH HOH . BA 10 HOH B 28 1067 1067 HOH HOH . BA 10 HOH B 29 1069 1069 HOH HOH . BA 10 HOH B 30 1070 1070 HOH HOH . BA 10 HOH B 31 1073 1073 HOH HOH . BA 10 HOH B 32 1074 1074 HOH HOH . BA 10 HOH B 33 1075 1075 HOH HOH . BA 10 HOH B 34 1083 1083 HOH HOH . BA 10 HOH B 35 1084 1084 HOH HOH . BA 10 HOH B 36 1085 1085 HOH HOH . BA 10 HOH B 37 1088 1088 HOH HOH . BA 10 HOH B 38 1089 1089 HOH HOH . BA 10 HOH B 39 1090 1090 HOH HOH . BA 10 HOH B 40 1091 1091 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . Y 8 -25.677 4.068 29.747 1 151.63 ? C1 NAG 3099 B 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . Y 8 -25.469 2.653 30.276 1 160.85 ? C2 NAG 3099 B 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . Y 8 -26.724 2.068 30.913 1 169.52 ? C3 NAG 3099 B 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . Y 8 -27.423 3.094 31.794 1 173 ? C4 NAG 3099 B 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . Y 8 -27.613 4.391 31.027 1 175.09 ? C5 NAG 3099 B 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . Y 8 -28.415 5.4 31.825 1 185.98 ? C6 NAG 3099 B 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . Y 8 -23.787 1.479 29.045 1 149.75 ? C7 NAG 3099 B 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . Y 8 -23.494 0.262 28.228 1 138.77 ? C8 NAG 3099 B 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . Y 8 -25.062 1.803 29.181 1 153.78 ? N2 NAG 3099 B 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . Y 8 -26.371 0.93 31.672 1 171.94 ? O3 NAG 3099 B 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . Y 8 -28.662 2.579 32.204 1 175.09 ? O4 NAG 3099 B 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . Y 8 -26.354 4.902 30.664 1 164.59 ? O5 NAG 3099 B 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . Y 8 -28.564 6.587 31.092 1 190.17 ? O6 NAG 3099 B 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . Y 8 -22.875 2.122 29.56 1 156.76 ? O7 NAG 3099 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 30 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 25 _model_server_stats.query_time_ms 283 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 14 #