data_4GTW # _model_server_result.job_id rgnttZEJkGPkZ2yytD_a0Q _model_server_result.datetime_utc '2024-11-17 03:28:53' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4gtw # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":1009}' # _entry.id 4GTW # _exptl.entry_id 4GTW _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 347.221 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'ADENOSINE MONOPHOSPHATE' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 4GTW _cell.length_a 105.283 _cell.length_b 105.283 _cell.length_c 173.685 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4GTW _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 144 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 31' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,E,F,G,H,I,J,Q 1 1 B,D,K,L,M,N,O,P,R 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 G N N ? 5 M N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 2 oligosaccharide 3 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 2 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 2 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 2 4 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 4 ? 2 5 4 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 5 ? 2 6 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 6 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 2 n C NAG 1 C 1 NAG A 2000 NAG 2 n C NAG 2 C 2 NAG A 2001 NAG 2 n C BMA 3 C 3 BMA A 2002 MAN 2 n C MAN 4 C 4 MAN A 2004 MAN 2 n C MAN 5 C 5 MAN A 2005 MAN 2 n C MAN 6 C 6 MAN A 2003 MAN 3 n D NAG 1 D 1 NAG B 2000 NAG 3 n D NAG 2 D 2 NAG B 2001 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 95 A CYS 177 1_555 A SG CYS 141 A CYS 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 103 A CYS 185 1_555 A SG CYS 315 A CYS 397 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 331 A CYS 413 1_555 A SG CYS 430 A CYS 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 380 A CYS 462 1_555 A SG CYS 766 A CYS 848 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 514 A CYS 596 1_555 A SG CYS 570 A CYS 652 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 525 A CYS 607 1_555 A SG CYS 624 A CYS 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 527 A CYS 609 1_555 A SG CYS 609 A CYS 691 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 736 A CYS 818 1_555 A SG CYS 746 A CYS 828 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 95 B CYS 177 1_555 B SG CYS 141 B CYS 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 103 B CYS 185 1_555 B SG CYS 315 B CYS 397 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 331 B CYS 413 1_555 B SG CYS 430 B CYS 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 380 B CYS 462 1_555 B SG CYS 766 B CYS 848 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 514 B CYS 596 1_555 B SG CYS 570 B CYS 652 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 525 B CYS 607 1_555 B SG CYS 624 B CYS 706 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf15 B SG CYS 527 B CYS 609 1_555 B SG CYS 609 B CYS 691 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf16 B SG CYS 736 B CYS 818 1_555 B SG CYS 746 B CYS 828 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? covale ? covale1 A C ASN 147 A ASN 229 1_555 A N MSE 148 A MSE 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale2 A C MSE 148 A MSE 230 1_555 A N ARG 149 A ARG 231 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale3 A C PRO 150 A PRO 232 1_555 A N MSE 151 A MSE 233 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale4 A C MSE 151 A MSE 233 1_555 A N TYR 152 A TYR 234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale5 A C LYS 178 A LYS 260 1_555 A N MSE 179 A MSE 261 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale6 A C MSE 179 A MSE 261 1_555 A N TYR 180 A TYR 262 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale7 A C LYS 183 A LYS 265 1_555 A N MSE 184 A MSE 266 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale8 A C MSE 184 A MSE 266 1_555 A N ASN 185 A ASN 267 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale9 A ND2 ASN 185 A ASN 267 1_555 E C1 NAG . A NAG 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale10 A ND2 ASN 241 A ASN 323 1_555 F C1 NAG . A NAG 1008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale11 A C GLY 301 A GLY 383 1_555 A N MSE 302 A MSE 384 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale12 A C MSE 302 A MSE 384 1_555 A N LEU 303 A LEU 385 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale13 A C LEU 303 A LEU 385 1_555 A N MSE 304 A MSE 386 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale14 A C MSE 304 A MSE 386 1_555 A N ASP 305 A ASP 387 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale15 A C GLY 325 A GLY 407 1_555 A N MSE 326 A MSE 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale16 A C MSE 326 A MSE 408 1_555 A N GLU 327 A GLU 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale17 A C ASN 443 A ASN 525 1_555 A N MSE 444 A MSE 526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale18 A C MSE 444 A MSE 526 1_555 A N GLN 445 A GLN 527 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale19 A C LEU 472 A LEU 554 1_555 A N MSE 473 A MSE 555 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale20 A C MSE 473 A MSE 555 1_555 A N CYS 474 A CYS 556 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale21 A ND2 ASN 485 A ASN 567 1_555 C C1 NAG . C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale22 A C HIS 552 A HIS 634 1_555 A N MSE 553 A MSE 635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale23 A C MSE 553 A MSE 635 1_555 A N THR 554 A THR 636 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale24 A C LEU 586 A LEU 668 1_555 A N MSE 587 A MSE 669 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale25 A C MSE 587 A MSE 669 1_555 A N PRO 588 A PRO 670 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? covale ? covale26 A C PRO 662 A PRO 744 1_555 A N MSE 663 A MSE 745 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale27 A C MSE 663 A MSE 745 1_555 A N TYR 664 A TYR 746 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale28 B C ASN 147 B ASN 229 1_555 B N MSE 148 B MSE 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale29 B C MSE 148 B MSE 230 1_555 B N ARG 149 B ARG 231 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale30 B C PRO 150 B PRO 232 1_555 B N MSE 151 B MSE 233 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale31 B C MSE 151 B MSE 233 1_555 B N TYR 152 B TYR 234 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale32 B C LYS 178 B LYS 260 1_555 B N MSE 179 B MSE 261 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale33 B C MSE 179 B MSE 261 1_555 B N TYR 180 B TYR 262 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale34 B C LYS 183 B LYS 265 1_555 B N MSE 184 B MSE 266 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale35 B C MSE 184 B MSE 266 1_555 B N ASN 185 B ASN 267 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale36 B ND2 ASN 185 B ASN 267 1_555 K C1 NAG . B NAG 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale37 B ND2 ASN 241 B ASN 323 1_555 L C1 NAG . B NAG 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale38 B C GLY 301 B GLY 383 1_555 B N MSE 302 B MSE 384 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale39 B C MSE 302 B MSE 384 1_555 B N LEU 303 B LEU 385 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale40 B C LEU 303 B LEU 385 1_555 B N MSE 304 B MSE 386 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale41 B C MSE 304 B MSE 386 1_555 B N ASP 305 B ASP 387 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale42 B C GLY 325 B GLY 407 1_555 B N MSE 326 B MSE 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale43 B C MSE 326 B MSE 408 1_555 B N GLU 327 B GLU 409 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale44 B C ASN 443 B ASN 525 1_555 B N MSE 444 B MSE 526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale45 B C MSE 444 B MSE 526 1_555 B N GLN 445 B GLN 527 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale46 B C LEU 472 B LEU 554 1_555 B N MSE 473 B MSE 555 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale47 B C MSE 473 B MSE 555 1_555 B N CYS 474 B CYS 556 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale48 B ND2 ASN 485 B ASN 567 1_555 D C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale49 B C HIS 552 B HIS 634 1_555 B N MSE 553 B MSE 635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale50 B C MSE 553 B MSE 635 1_555 B N THR 554 B THR 636 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale51 B C LEU 586 B LEU 668 1_555 B N MSE 587 B MSE 669 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale52 B C MSE 587 B MSE 669 1_555 B N PRO 588 B PRO 670 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? covale ? covale53 B C PRO 662 B PRO 744 1_555 B N MSE 663 B MSE 745 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale54 B C MSE 663 B MSE 745 1_555 B N TYR 664 B TYR 746 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale55 C O4 NAG . C NAG 1 1_555 C C1 NAG . C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale56 C O4 NAG . C NAG 2 1_555 C C1 BMA . C BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale57 C O6 BMA . C BMA 3 1_555 C C1 MAN . C MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale58 C O3 BMA . C BMA 3 1_555 C C1 MAN . C MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale59 C O3 MAN . C MAN 4 1_555 C C1 MAN . C MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale60 D O4 NAG . D NAG 1 1_555 D C1 NAG . D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 118 A ASP 200 1_555 H ZN ZN . A ZN 1010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? metalc ? metalc2 A OG1 THR 156 A THR 238 1_555 H ZN ZN . A ZN 1010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.993 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 276 A ASP 358 1_555 I ZN ZN . A ZN 1011 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.137 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 276 A ASP 358 1_555 I ZN ZN . A ZN 1011 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.156 ? metalc ? metalc5 A NE2 HIS 280 A HIS 362 1_555 I ZN ZN . A ZN 1011 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? metalc ? metalc6 A OD2 ASP 323 A ASP 405 1_555 H ZN ZN . A ZN 1010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? metalc ? metalc7 A NE2 HIS 324 A HIS 406 1_555 H ZN ZN . A ZN 1010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.98 ? metalc ? metalc8 A NE2 HIS 435 A HIS 517 1_555 I ZN ZN . A ZN 1011 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 698 A ASP 780 1_555 J CA CA . A CA 1012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASP 700 A ASP 782 1_555 J CA CA . A CA 1012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? metalc ? metalc11 A OD2 ASP 700 A ASP 782 1_555 J CA CA . A CA 1012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.811 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 702 A ASP 784 1_555 J CA CA . A CA 1012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc13 A OD2 ASP 702 A ASP 784 1_555 J CA CA . A CA 1012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.063 ? metalc ? metalc14 A O ARG 704 A ARG 786 1_555 J CA CA . A CA 1012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? metalc ? metalc15 A OD1 ASP 706 A ASP 788 1_555 J CA CA . A CA 1012 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc16 G O2P AMP . A AMP 1009 1_555 H ZN ZN . A ZN 1010 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? metalc ? metalc17 G O2P AMP . A AMP 1009 1_555 I ZN ZN . A ZN 1011 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? metalc ? metalc18 G O3P AMP . A AMP 1009 1_555 I ZN ZN . A ZN 1011 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? metalc ? metalc19 B OD1 ASP 118 B ASP 200 1_555 N ZN ZN . B ZN 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.963 ? metalc ? metalc20 B OD2 ASP 118 B ASP 200 1_555 N ZN ZN . B ZN 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.624 ? metalc ? metalc21 B OG1 THR 156 B THR 238 1_555 N ZN ZN . B ZN 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.95 ? metalc ? metalc22 B OD2 ASP 276 B ASP 358 1_555 O ZN ZN . B ZN 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? metalc ? metalc23 B OD1 ASP 276 B ASP 358 1_555 O ZN ZN . B ZN 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? metalc ? metalc24 B NE2 HIS 280 B HIS 362 1_555 O ZN ZN . B ZN 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? metalc ? metalc25 B OD2 ASP 323 B ASP 405 1_555 N ZN ZN . B ZN 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.087 ? metalc ? metalc26 B NE2 HIS 324 B HIS 406 1_555 N ZN ZN . B ZN 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.956 ? metalc ? metalc27 B NE2 HIS 435 B HIS 517 1_555 O ZN ZN . B ZN 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? metalc ? metalc28 B OD1 ASP 698 B ASP 780 1_555 P CA CA . B CA 1008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.396 ? metalc ? metalc29 B OD1 ASP 700 B ASP 782 1_555 P CA CA . B CA 1008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc30 B OD2 ASP 700 B ASP 782 1_555 P CA CA . B CA 1008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.724 ? metalc ? metalc31 B OD1 ASP 702 B ASP 784 1_555 P CA CA . B CA 1008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc32 B OD2 ASP 702 B ASP 784 1_555 P CA CA . B CA 1008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.083 ? metalc ? metalc33 B O ARG 704 B ARG 786 1_555 P CA CA . B CA 1008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc34 B OD1 ASP 706 B ASP 788 1_555 P CA CA . B CA 1008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc35 M O2P AMP . B AMP 1005 1_555 N ZN ZN . B ZN 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.086 ? metalc ? metalc36 M O2P AMP . B AMP 1005 1_555 O ZN ZN . B ZN 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? metalc ? metalc37 M O3P AMP . B AMP 1005 1_555 O ZN ZN . B ZN 1007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? # _chem_comp.formula 'C10 H14 N5 O7 P' _chem_comp.formula_weight 347.221 _chem_comp.id AMP _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'ADENOSINE MONOPHOSPHATE' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag P O1P AMP doub 13 n n P O2P AMP sing 14 n n P O3P AMP sing 15 n n P O5' AMP sing 16 n n O2P HOP2 AMP sing 17 n n O3P HOP3 AMP sing 18 n n O5' C5' AMP sing 19 n n C5' C4' AMP sing 20 n n C5' "H5'1" AMP sing 21 n n C5' "H5'2" AMP sing 22 n n C4' O4' AMP sing 23 n n C4' C3' AMP sing 24 n n C4' H4' AMP sing 25 n n O4' C1' AMP sing 26 n n C3' O3' AMP sing 27 n n C3' C2' AMP sing 28 n n C3' H3' AMP sing 29 n n O3' HO3' AMP sing 30 n n C2' O2' AMP sing 31 n n C2' C1' AMP sing 32 n n C2' H2' AMP sing 33 n n O2' HO2' AMP sing 34 n n C1' N9 AMP sing 35 n n C1' H1' AMP sing 36 n n N9 C8 AMP sing 37 n y N9 C4 AMP sing 38 n y C8 N7 AMP doub 39 n y C8 H8 AMP sing 40 n n N7 C5 AMP sing 41 n y C5 C6 AMP sing 42 n y C5 C4 AMP doub 43 n y C6 N6 AMP sing 44 n n C6 N1 AMP doub 45 n y N6 HN61 AMP sing 46 n n N6 HN62 AMP sing 47 n n N1 C2 AMP sing 48 n y C2 N3 AMP doub 49 n y C2 H2 AMP sing 50 n n N3 C4 AMP sing 51 n y # _atom_sites.entry_id 4GTW _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009498 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.005484 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010968 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.005758 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 4 NAG A 1 1007 3000 NAG NAG . F 4 NAG A 1 1008 4000 NAG NAG . G 5 AMP A 1 1009 5000 AMP AMP . H 6 ZN A 1 1010 5001 ZN ZN . I 6 ZN A 1 1011 5002 ZN ZN . J 7 CA A 1 1012 5003 CA CA . K 4 NAG B 1 1003 3000 NAG NAG . L 4 NAG B 1 1004 4000 NAG NAG . M 5 AMP B 1 1005 5000 AMP AMP . N 6 ZN B 1 1006 5001 ZN ZN . O 6 ZN B 1 1007 5002 ZN ZN . P 7 CA B 1 1008 5003 CA CA . Q 8 HOH A 1 1101 1 HOH HOH . Q 8 HOH A 2 1102 3 HOH HOH . Q 8 HOH A 3 1103 4 HOH HOH . Q 8 HOH A 4 1104 6 HOH HOH . Q 8 HOH A 5 1105 7 HOH HOH . Q 8 HOH A 6 1106 10 HOH HOH . Q 8 HOH A 7 1107 11 HOH HOH . Q 8 HOH A 8 1108 14 HOH HOH . Q 8 HOH A 9 1109 17 HOH HOH . Q 8 HOH A 10 1110 23 HOH HOH . Q 8 HOH A 11 1111 27 HOH HOH . Q 8 HOH A 12 1112 28 HOH HOH . Q 8 HOH A 13 1113 35 HOH HOH . Q 8 HOH A 14 1114 37 HOH HOH . Q 8 HOH A 15 1115 40 HOH HOH . Q 8 HOH A 16 1116 42 HOH HOH . Q 8 HOH A 17 1117 44 HOH HOH . Q 8 HOH A 18 1118 52 HOH HOH . Q 8 HOH A 19 1119 53 HOH HOH . Q 8 HOH A 20 1120 56 HOH HOH . Q 8 HOH A 21 1121 57 HOH HOH . Q 8 HOH A 22 1122 63 HOH HOH . Q 8 HOH A 23 1123 68 HOH HOH . Q 8 HOH A 24 1124 72 HOH HOH . Q 8 HOH A 25 1125 81 HOH HOH . Q 8 HOH A 26 1126 82 HOH HOH . Q 8 HOH A 27 1127 83 HOH HOH . Q 8 HOH A 28 1128 84 HOH HOH . Q 8 HOH A 29 1129 89 HOH HOH . Q 8 HOH A 30 1130 92 HOH HOH . Q 8 HOH A 31 1131 93 HOH HOH . Q 8 HOH A 32 1132 94 HOH HOH . Q 8 HOH A 33 1133 96 HOH HOH . Q 8 HOH A 34 1134 98 HOH HOH . Q 8 HOH A 35 1135 102 HOH HOH . Q 8 HOH A 36 1136 103 HOH HOH . Q 8 HOH A 37 1137 104 HOH HOH . Q 8 HOH A 38 1138 105 HOH HOH . Q 8 HOH A 39 1139 107 HOH HOH . Q 8 HOH A 40 1140 114 HOH HOH . Q 8 HOH A 41 1141 116 HOH HOH . Q 8 HOH A 42 1142 118 HOH HOH . Q 8 HOH A 43 1143 129 HOH HOH . Q 8 HOH A 44 1144 133 HOH HOH . Q 8 HOH A 45 1145 143 HOH HOH . Q 8 HOH A 46 1146 148 HOH HOH . Q 8 HOH A 47 1147 149 HOH HOH . Q 8 HOH A 48 1148 154 HOH HOH . Q 8 HOH A 49 1149 165 HOH HOH . Q 8 HOH A 50 1150 169 HOH HOH . Q 8 HOH A 51 1151 172 HOH HOH . Q 8 HOH A 52 1152 173 HOH HOH . Q 8 HOH A 53 1153 176 HOH HOH . Q 8 HOH A 54 1154 178 HOH HOH . Q 8 HOH A 55 1155 187 HOH HOH . Q 8 HOH A 56 1156 191 HOH HOH . Q 8 HOH A 57 1157 193 HOH HOH . Q 8 HOH A 58 1158 196 HOH HOH . Q 8 HOH A 59 1159 197 HOH HOH . Q 8 HOH A 60 1160 198 HOH HOH . Q 8 HOH A 61 1161 200 HOH HOH . Q 8 HOH A 62 1162 204 HOH HOH . Q 8 HOH A 63 1163 206 HOH HOH . Q 8 HOH A 64 1164 218 HOH HOH . Q 8 HOH A 65 1165 222 HOH HOH . Q 8 HOH A 66 1166 223 HOH HOH . Q 8 HOH A 67 1167 227 HOH HOH . Q 8 HOH A 68 1168 231 HOH HOH . Q 8 HOH A 69 1169 232 HOH HOH . Q 8 HOH A 70 1170 234 HOH HOH . R 8 HOH B 1 1101 2 HOH HOH . R 8 HOH B 2 1102 8 HOH HOH . R 8 HOH B 3 1103 15 HOH HOH . R 8 HOH B 4 1104 20 HOH HOH . R 8 HOH B 5 1105 31 HOH HOH . R 8 HOH B 6 1106 38 HOH HOH . R 8 HOH B 7 1107 39 HOH HOH . R 8 HOH B 8 1108 43 HOH HOH . R 8 HOH B 9 1109 48 HOH HOH . R 8 HOH B 10 1110 58 HOH HOH . R 8 HOH B 11 1111 59 HOH HOH . R 8 HOH B 12 1112 75 HOH HOH . R 8 HOH B 13 1113 100 HOH HOH . R 8 HOH B 14 1114 101 HOH HOH . R 8 HOH B 15 1115 106 HOH HOH . R 8 HOH B 16 1116 109 HOH HOH . R 8 HOH B 17 1117 110 HOH HOH . R 8 HOH B 18 1118 120 HOH HOH . R 8 HOH B 19 1119 121 HOH HOH . R 8 HOH B 20 1120 122 HOH HOH . R 8 HOH B 21 1121 123 HOH HOH . R 8 HOH B 22 1122 125 HOH HOH . R 8 HOH B 23 1123 126 HOH HOH . R 8 HOH B 24 1124 134 HOH HOH . R 8 HOH B 25 1125 140 HOH HOH . R 8 HOH B 26 1126 141 HOH HOH . R 8 HOH B 27 1127 152 HOH HOH . R 8 HOH B 28 1128 153 HOH HOH . R 8 HOH B 29 1129 155 HOH HOH . R 8 HOH B 30 1130 158 HOH HOH . R 8 HOH B 31 1131 161 HOH HOH . R 8 HOH B 32 1132 162 HOH HOH . R 8 HOH B 33 1133 174 HOH HOH . R 8 HOH B 34 1134 180 HOH HOH . R 8 HOH B 35 1135 181 HOH HOH . R 8 HOH B 36 1136 184 HOH HOH . R 8 HOH B 37 1137 185 HOH HOH . R 8 HOH B 38 1138 189 HOH HOH . R 8 HOH B 39 1139 199 HOH HOH . R 8 HOH B 40 1140 201 HOH HOH . R 8 HOH B 41 1141 207 HOH HOH . R 8 HOH B 42 1142 209 HOH HOH . R 8 HOH B 43 1143 213 HOH HOH . R 8 HOH B 44 1144 215 HOH HOH . R 8 HOH B 45 1145 217 HOH HOH . R 8 HOH B 46 1146 224 HOH HOH . R 8 HOH B 47 1147 226 HOH HOH . R 8 HOH B 48 1148 228 HOH HOH . R 8 HOH B 49 1149 233 HOH HOH . R 8 HOH B 50 1150 235 HOH HOH . R 8 HOH B 51 1151 236 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P P AMP . . . G 5 27.421 20.854 38.609 1 54.7 ? P AMP 1009 A 1 HETATM 2 O O1P AMP . . . G 5 26.995 22.277 38.34 1 49.76 ? O1P AMP 1009 A 1 HETATM 3 O O2P AMP . . . G 5 28.097 20.088 37.495 1 68.75 ? O2P AMP 1009 A 1 HETATM 4 O O3P AMP . . . G 5 28.302 20.828 39.834 1 55.15 ? O3P AMP 1009 A 1 HETATM 5 O O5' AMP . . . G 5 26.176 20.021 39.15 1 43.28 ? O5' AMP 1009 A 1 HETATM 6 C C5' AMP . . . G 5 26.319 18.659 39.54 1 44.91 ? C5' AMP 1009 A 1 HETATM 7 C C4' AMP . . . G 5 25.544 18.359 40.799 1 44.59 ? C4' AMP 1009 A 1 HETATM 8 O O4' AMP . . . G 5 24.137 18.645 40.573 1 31.69 ? O4' AMP 1009 A 1 HETATM 9 C C3' AMP . . . G 5 25.62 16.907 41.281 1 48.71 ? C3' AMP 1009 A 1 HETATM 10 O O3' AMP . . . G 5 25.759 16.885 42.701 1 48.44 ? O3' AMP 1009 A 1 HETATM 11 C C2' AMP . . . G 5 24.257 16.335 40.893 1 41.87 ? C2' AMP 1009 A 1 HETATM 12 O O2' AMP . . . G 5 23.813 15.271 41.707 1 46.01 ? O2' AMP 1009 A 1 HETATM 13 C C1' AMP . . . G 5 23.36 17.559 41.022 1 33.75 ? C1' AMP 1009 A 1 HETATM 14 N N9 AMP . . . G 5 22.14 17.496 40.213 1 39.75 ? N9 AMP 1009 A 1 HETATM 15 C C8 AMP . . . G 5 22.061 17.126 38.922 1 38.86 ? C8 AMP 1009 A 1 HETATM 16 N N7 AMP . . . G 5 20.778 17.165 38.477 1 35.1 ? N7 AMP 1009 A 1 HETATM 17 C C5 AMP . . . G 5 20.006 17.563 39.504 1 35.52 ? C5 AMP 1009 A 1 HETATM 18 C C6 AMP . . . G 5 18.562 17.813 39.722 1 38.53 ? C6 AMP 1009 A 1 HETATM 19 N N6 AMP . . . G 5 17.662 17.643 38.724 1 42.15 ? N6 AMP 1009 A 1 HETATM 20 N N1 AMP . . . G 5 18.173 18.22 40.95 1 44.64 ? N1 AMP 1009 A 1 HETATM 21 C C2 AMP . . . G 5 19.056 18.395 41.951 1 53.55 ? C2 AMP 1009 A 1 HETATM 22 N N3 AMP . . . G 5 20.378 18.185 41.824 1 53.69 ? N3 AMP 1009 A 1 HETATM 23 C C4 AMP . . . G 5 20.907 17.773 40.647 1 43.99 ? C4 AMP 1009 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 51 _model_server_stats.parse_time_ms 57 _model_server_stats.create_model_time_ms 49 _model_server_stats.query_time_ms 375 _model_server_stats.encode_time_ms 8 _model_server_stats.element_count 23 #