data_4GXU # _model_server_result.job_id BA8qIGjlK9bygsj5h6-KSQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-23 13:47:18' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4gxu # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"LA","auth_seq_id":201}' # _entry.id 4GXU # _exptl.entry_id 4GXU _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 6 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 12 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 92.14 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4GXU _cell.length_a 153.711 _cell.length_b 176.269 _cell.length_c 168.12 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4GXU _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dodecameric 12 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dodecameric 12 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,M,N,O,P,Q,R,Y,Z,AA,EA,FA,GA,HA,IA,JA 1 1 G,H,I,J,K,L,S,T,U,V,W,X,BA,CA,DA,KA,LA,MA,NA,OA,PA 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 6 EA N N ? 6 FA N N ? 6 GA N N ? 6 HA N N ? 6 IA N N ? 6 JA N N ? 6 KA N N ? 6 LA N N ? 6 MA N N ? 6 NA N N ? 6 OA N N ? 6 PA N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 5 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 5 n Y NAG 1 Y 1 NAG A 601 NAG 5 n Y NAG 2 Y 2 NAG A 602 NAG 5 n Y BMA 3 Y 3 BMA A 603 BMA 5 n Z NAG 1 Z 1 NAG C 601 NAG 5 n Z NAG 2 Z 2 NAG C 602 NAG 5 n Z BMA 3 Z 3 BMA C 603 BMA 5 n AA NAG 1 a 1 NAG E 601 NAG 5 n AA NAG 2 a 2 NAG E 602 NAG 5 n AA BMA 3 a 3 BMA E 603 BMA 5 n BA NAG 1 b 1 NAG G 601 NAG 5 n BA NAG 2 b 2 NAG G 602 NAG 5 n BA BMA 3 b 3 BMA G 603 BMA 5 n CA NAG 1 c 1 NAG I 601 NAG 5 n CA NAG 2 c 2 NAG I 602 NAG 5 n CA BMA 3 c 3 BMA I 603 BMA 5 n DA NAG 1 d 1 NAG K 601 NAG 5 n DA NAG 2 d 2 NAG K 602 NAG 5 n DA BMA 3 d 3 BMA K 603 BMA # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 8 A CYS 14 1_555 B SG CYS 137 B CYS 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 46 A CYS 52 1_555 A SG CYS 279 A CYS 277 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 59 A CYS 64 1_555 A SG CYS 71 A CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 94 A CYS 97 1_555 A SG CYS 140 A CYS 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 283 A CYS 281 1_555 A SG CYS 307 A CYS 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf6 B SG CYS 144 B CYS 144 1_555 B SG CYS 148 B CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf7 C SG CYS 8 C CYS 14 1_555 D SG CYS 137 D CYS 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf8 C SG CYS 46 C CYS 52 1_555 C SG CYS 279 C CYS 277 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf9 C SG CYS 59 C CYS 64 1_555 C SG CYS 71 C CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf10 C SG CYS 94 C CYS 97 1_555 C SG CYS 140 C CYS 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf11 C SG CYS 283 C CYS 281 1_555 C SG CYS 307 C CYS 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf12 D SG CYS 144 D CYS 144 1_555 D SG CYS 148 D CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf13 E SG CYS 8 E CYS 14 1_555 F SG CYS 137 F CYS 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf14 E SG CYS 46 E CYS 52 1_555 E SG CYS 279 E CYS 277 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf15 E SG CYS 59 E CYS 64 1_555 E SG CYS 71 E CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf16 E SG CYS 94 E CYS 97 1_555 E SG CYS 140 E CYS 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? disulf ? disulf17 E SG CYS 283 E CYS 281 1_555 E SG CYS 307 E CYS 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf18 F SG CYS 144 F CYS 144 1_555 F SG CYS 148 F CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf19 G SG CYS 8 G CYS 14 1_555 H SG CYS 137 H CYS 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf20 G SG CYS 46 G CYS 52 1_555 G SG CYS 279 G CYS 277 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf21 G SG CYS 59 G CYS 64 1_555 G SG CYS 71 G CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf22 G SG CYS 94 G CYS 97 1_555 G SG CYS 140 G CYS 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf23 G SG CYS 283 G CYS 281 1_555 G SG CYS 307 G CYS 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf24 H SG CYS 144 H CYS 144 1_555 H SG CYS 148 H CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf25 I SG CYS 8 I CYS 14 1_555 J SG CYS 137 J CYS 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf26 I SG CYS 46 I CYS 52 1_555 I SG CYS 279 I CYS 277 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf27 I SG CYS 59 I CYS 64 1_555 I SG CYS 71 I CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf28 I SG CYS 94 I CYS 97 1_555 I SG CYS 140 I CYS 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf29 I SG CYS 283 I CYS 281 1_555 I SG CYS 307 I CYS 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf30 J SG CYS 144 J CYS 144 1_555 J SG CYS 148 J CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf31 K SG CYS 8 K CYS 14 1_555 L SG CYS 137 L CYS 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf32 K SG CYS 46 K CYS 52 1_555 K SG CYS 279 K CYS 277 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf33 K SG CYS 59 K CYS 64 1_555 K SG CYS 71 K CYS 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf34 K SG CYS 94 K CYS 97 1_555 K SG CYS 140 K CYS 139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf35 K SG CYS 283 K CYS 281 1_555 K SG CYS 307 K CYS 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf36 L SG CYS 144 L CYS 144 1_555 L SG CYS 148 L CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf37 M SG CYS 22 M CYS 22 1_555 M SG CYS 96 M CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf38 M SG CYS 153 M CYS 140 1_555 M SG CYS 209 M CYS 196 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf39 M SG CYS 153 M CYS 140 1_555 M SG CYS 209 M CYS 196 1_555 ? B ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf40 N SG CYS 22 N CYS 23 1_555 N SG CYS 89 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf41 N SG CYS 139 N CYS 134 1_555 N SG CYS 198 N CYS 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf42 O SG CYS 22 O CYS 22 1_555 O SG CYS 96 O CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf43 P SG CYS 22 P CYS 23 1_555 P SG CYS 89 P CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf44 Q SG CYS 22 Q CYS 22 1_555 Q SG CYS 96 Q CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf45 Q SG CYS 153 Q CYS 140 1_555 Q SG CYS 209 Q CYS 196 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf46 Q SG CYS 153 Q CYS 140 1_555 Q SG CYS 209 Q CYS 196 1_555 ? B ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf47 R SG CYS 22 R CYS 23 1_555 R SG CYS 89 R CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf48 R SG CYS 139 R CYS 134 1_555 R SG CYS 198 R CYS 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf49 S SG CYS 22 S CYS 22 1_555 S SG CYS 96 S CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf50 T SG CYS 22 T CYS 23 1_555 T SG CYS 89 T CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf51 U SG CYS 22 U CYS 22 1_555 U SG CYS 96 U CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf52 V SG CYS 22 V CYS 23 1_555 V SG CYS 89 V CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf53 W SG CYS 22 W CYS 22 1_555 W SG CYS 96 W CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf54 X SG CYS 22 X CYS 23 1_555 X SG CYS 89 X CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 15 A ASN 21 1_555 EA C1 NAG . A NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 91 A ASN 95 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale3 B ND2 ASN 154 B ASN 154 1_555 FA C1 NAG . B NAG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale4 C ND2 ASN 15 C ASN 21 1_555 GA C1 NAG . C NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale5 C ND2 ASN 91 C ASN 95 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale6 D ND2 ASN 154 D ASN 154 1_555 HA C1 NAG . D NAG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale7 E ND2 ASN 15 E ASN 21 1_555 IA C1 NAG . E NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale8 E ND2 ASN 91 E ASN 95 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale9 F ND2 ASN 154 F ASN 154 1_555 JA C1 NAG . F NAG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale10 G ND2 ASN 15 G ASN 21 1_555 KA C1 NAG . G NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale11 G ND2 ASN 91 G ASN 95 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale12 H ND2 ASN 154 H ASN 154 1_555 LA C1 NAG . H NAG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale13 I ND2 ASN 15 I ASN 21 1_555 MA C1 NAG . I NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale14 I ND2 ASN 91 I ASN 95 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale15 J ND2 ASN 154 J ASN 154 1_555 NA C1 NAG . J NAG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale16 K ND2 ASN 15 K ASN 21 1_555 OA C1 NAG . K NAG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale17 K ND2 ASN 91 K ASN 95 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale18 L ND2 ASN 154 L ASN 154 1_555 PA C1 NAG . L NAG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale19 M C PCA 1 M PCA 1 1_555 M N VAL 2 M VAL 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale20 N C PCA 1 N PCA 1 1_555 N N PRO 2 N PRO 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale21 O C PCA 1 O PCA 1 1_555 O N VAL 2 O VAL 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? covale ? covale22 P C PCA 1 P PCA 1 1_555 P N PRO 2 P PRO 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? covale ? covale23 Q C PCA 1 Q PCA 1 1_555 Q N VAL 2 Q VAL 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale24 R C PCA 1 R PCA 1 1_555 R N PRO 2 R PRO 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? covale ? covale25 S C PCA 1 S PCA 1 1_555 S N VAL 2 S VAL 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale26 T C PCA 1 T PCA 1 1_555 T N PRO 2 T PRO 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? covale ? covale27 U C PCA 1 U PCA 1 1_555 U N VAL 2 U VAL 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale28 V C PCA 1 V PCA 1 1_555 V N PRO 2 V PRO 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? covale ? covale29 W C PCA 1 W PCA 1 1_555 W N VAL 2 W VAL 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale30 X C PCA 1 X PCA 1 1_555 X N PRO 2 X PRO 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? covale ? covale31 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale32 Y O4 NAG . Y NAG 2 1_555 Y C1 BMA . Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale33 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale34 Z O4 NAG . Z NAG 2 1_555 Z C1 BMA . Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale35 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale36 AA O4 NAG . a NAG 2 1_555 AA C1 BMA . a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale37 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale38 BA O4 NAG . b NAG 2 1_555 BA C1 BMA . b BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale39 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale40 CA O4 NAG . c NAG 2 1_555 CA C1 BMA . c BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale41 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale42 DA O4 NAG . d NAG 2 1_555 DA C1 BMA . d BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 259 n n C1 O1 NAG sing 260 n n C1 O5 NAG sing 261 n n C1 H1 NAG sing 262 n n C2 C3 NAG sing 263 n n C2 N2 NAG sing 264 n n C2 H2 NAG sing 265 n n C3 C4 NAG sing 266 n n C3 O3 NAG sing 267 n n C3 H3 NAG sing 268 n n C4 C5 NAG sing 269 n n C4 O4 NAG sing 270 n n C4 H4 NAG sing 271 n n C5 C6 NAG sing 272 n n C5 O5 NAG sing 273 n n C5 H5 NAG sing 274 n n C6 O6 NAG sing 275 n n C6 H61 NAG sing 276 n n C6 H62 NAG sing 277 n n C7 C8 NAG sing 278 n n C7 N2 NAG sing 279 n n C7 O7 NAG doub 280 n n C8 H81 NAG sing 281 n n C8 H82 NAG sing 282 n n C8 H83 NAG sing 283 n n N2 HN2 NAG sing 284 n n O1 HO1 NAG sing 285 n n O3 HO3 NAG sing 286 n n O4 HO4 NAG sing 287 n n O6 HO6 NAG sing 288 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 4GXU _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006506 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000243 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005673 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.005952 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code EA 6 NAG A 1 401 401 NAG NAG . FA 6 NAG B 1 201 201 NAG NAG . GA 6 NAG C 1 401 401 NAG NAG . HA 6 NAG D 1 201 201 NAG NAG . IA 6 NAG E 1 401 401 NAG NAG . JA 6 NAG F 1 201 201 NAG NAG . KA 6 NAG G 1 401 401 NAG NAG . LA 6 NAG H 1 201 201 NAG NAG . MA 6 NAG I 1 401 401 NAG NAG . NA 6 NAG J 1 201 201 NAG NAG . OA 6 NAG K 1 401 401 NAG NAG . PA 6 NAG L 1 201 201 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . LA 6 -63.366 -23.566 -137.437 1 152.6 ? C1 NAG 201 H 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . LA 6 -64.131 -22.455 -138.153 1 154.74 ? C2 NAG 201 H 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . LA 6 -63.32 -21.166 -138.234 1 161.06 ? C3 NAG 201 H 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . LA 6 -62.713 -20.819 -136.88 1 165.17 ? C4 NAG 201 H 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . LA 6 -61.946 -22.013 -136.325 1 160.05 ? C5 NAG 201 H 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . LA 6 -61.354 -21.706 -134.954 1 152.76 ? C6 NAG 201 H 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . LA 6 -65.774 -23.137 -139.799 1 145.63 ? C7 NAG 201 H 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . LA 6 -66.059 -24.412 -140.537 1 135.18 ? C8 NAG 201 H 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . LA 6 -64.505 -22.901 -139.482 1 149.14 ? N2 NAG 201 H 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . LA 6 -64.15 -20.11 -138.667 1 160.42 ? O3 NAG 201 H 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . LA 6 -61.846 -19.713 -137.008 1 168.38 ? O4 NAG 201 H 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . LA 6 -62.808 -23.127 -136.213 1 159.65 ? O5 NAG 201 H 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . LA 6 -62.386 -21.675 -133.993 1 147.47 ? O6 NAG 201 H 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . LA 6 -66.688 -22.366 -139.512 1 152.02 ? O7 NAG 201 H 1 # _model_server_stats.io_time_ms 66 _model_server_stats.parse_time_ms 13 _model_server_stats.create_model_time_ms 159 _model_server_stats.query_time_ms 289 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 14 #