data_4IIJ
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_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-22 22:02:18' 
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_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          4iij 
#
_model_server_params.name     atom_site 
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#
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#
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
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_entity.id                          10 
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_entity.pdbx_description            '2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
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_entity.pdbx_ec                     ? 
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_cell.length_c            181.02 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
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_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    hexameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      6 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z 
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_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
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_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      10 
_struct_asym.id                             N 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
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_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASP 39 A ASP 39 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.823 ? 
metalc ? metalc2 A OD2 ASP 39 A ASP 39 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.986 ? 
metalc ? metalc3 A OG1 THR 41 A THR 41 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.695 ? 
metalc ? metalc4 A O GLY 44 A GLY 44 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.906 ? 
metalc ? metalc5 A OE2 GLU 55 A GLU 55 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.86 ? 
metalc ? metalc6 A OE1 GLU 55 A GLU 55 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.904 ? 
metalc ? metalc7 G O1G GTP . A GTP 501 1_555 H MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.476 ? 
metalc ? metalc8 G O1B GTP . A GTP 501 1_555 H MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.578 ? 
metalc ? metalc9 H MG MG . A MG 502 1_555 U O HOH . A HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.476 ? 
metalc ? metalc10 H MG MG . A MG 502 1_555 U O HOH . A HOH 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? 
metalc ? metalc11 H MG MG . A MG 502 1_555 U O HOH . A HOH 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.438 ? 
metalc ? metalc12 H MG MG . A MG 502 1_555 U O HOH . A HOH 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? 
metalc ? metalc13 B OE1 GLN 11 B GLN 11 1_555 L MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.608 ? 
metalc ? metalc14 B OE1 GLU 111 B GLU 113 1_555 M CA CA . B CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.789 ? 
metalc ? metalc15 K O1A GDP . B GDP 501 1_555 L MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? 
metalc ? metalc16 C OD2 ASP 39 C ASP 39 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.59 ? 
metalc ? metalc17 C OD1 ASP 39 C ASP 39 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.849 ? 
metalc ? metalc18 C O THR 41 C THR 41 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.615 ? 
metalc ? metalc19 C OG1 THR 41 C THR 41 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? 
metalc ? metalc20 C O GLY 44 C GLY 44 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.935 ? 
metalc ? metalc21 C OE2 GLU 55 C GLU 55 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.653 ? 
metalc ? metalc22 C OE1 GLU 55 C GLU 55 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.707 ? 
metalc ? metalc23 O O1G GTP . C GTP 501 1_555 P MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.584 ? 
metalc ? metalc24 O O1B GTP . C GTP 501 1_555 P MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.68 ? 
metalc ? metalc25 P MG MG . C MG 502 1_555 W O HOH . C HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.511 ? 
metalc ? metalc26 R O1A GDP . D GDP 600 1_555 S MG MG . D MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.808 ? 
#
_chem_comp.formula           'C6 H13 N O4 S' 
_chem_comp.formula_weight    195.237 
_chem_comp.id                MES 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              '2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
O1 C2 MES sing 313 n n 
O1 C6 MES sing 314 n n 
C2 C3 MES sing 315 n n 
C2 H21 MES sing 316 n n 
C2 H22 MES sing 317 n n 
C3 N4 MES sing 318 n n 
C3 H31 MES sing 319 n n 
C3 H32 MES sing 320 n n 
N4 C5 MES sing 321 n n 
N4 C7 MES sing 322 n n 
N4 HN4 MES sing 323 n n 
C5 C6 MES sing 324 n n 
C5 H51 MES sing 325 n n 
C5 H52 MES sing 326 n n 
C6 H61 MES sing 327 n n 
C6 H62 MES sing 328 n n 
C7 C8 MES sing 329 n n 
C7 H71 MES sing 330 n n 
C7 H72 MES sing 331 n n 
C8 S MES sing 332 n n 
C8 H81 MES sing 333 n n 
C8 H82 MES sing 334 n n 
S O1S MES doub 335 n n 
S O2S MES doub 336 n n 
S O3S MES sing 337 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     4IIJ 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.009659 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.005524 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
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loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
G 5 GTP A 1 501 600 GTP GTP . 
H 6 MG A 1 502 601 MG MG . 
I 7 CA A 1 503 700 CA CA . 
J 8 CL A 1 504 800 CL CL . 
K 9 GDP B 1 501 600 GDP GDP . 
L 6 MG B 1 502 601 MG MG . 
M 7 CA B 1 503 700 CA CA . 
N 10 MES B 1 504 1 MES MES . 
O 5 GTP C 1 501 600 GTP GTP . 
P 6 MG C 1 502 601 MG MG . 
Q 7 CA C 1 503 700 CA CA . 
R 9 GDP D 1 600 600 GDP GDP . 
S 6 MG D 1 601 601 MG MG . 
T 6 MG F 1 401 702 MG MG . 
U 11 HOH A 1 601 1 HOH HOH . 
U 11 HOH A 2 602 5 HOH HOH . 
U 11 HOH A 3 603 18 HOH HOH . 
U 11 HOH A 4 604 19 HOH HOH . 
U 11 HOH A 5 605 24 HOH HOH . 
U 11 HOH A 6 606 32 HOH HOH . 
U 11 HOH A 7 607 35 HOH HOH . 
U 11 HOH A 8 608 39 HOH HOH . 
U 11 HOH A 9 609 43 HOH HOH . 
U 11 HOH A 10 610 50 HOH HOH . 
U 11 HOH A 11 611 51 HOH HOH . 
U 11 HOH A 12 612 52 HOH HOH . 
U 11 HOH A 13 613 53 HOH HOH . 
U 11 HOH A 14 614 66 HOH HOH . 
U 11 HOH A 15 615 76 HOH HOH . 
U 11 HOH A 16 616 77 HOH HOH . 
U 11 HOH A 17 617 78 HOH HOH . 
U 11 HOH A 18 618 79 HOH HOH . 
U 11 HOH A 19 619 80 HOH HOH . 
U 11 HOH A 20 620 81 HOH HOH . 
U 11 HOH A 21 621 82 HOH HOH . 
U 11 HOH A 22 622 83 HOH HOH . 
U 11 HOH A 23 623 84 HOH HOH . 
U 11 HOH A 24 624 85 HOH HOH . 
U 11 HOH A 25 625 86 HOH HOH . 
U 11 HOH A 26 626 87 HOH HOH . 
U 11 HOH A 27 627 89 HOH HOH . 
U 11 HOH A 28 628 91 HOH HOH . 
U 11 HOH A 29 629 94 HOH HOH . 
U 11 HOH A 30 630 95 HOH HOH . 
U 11 HOH A 31 631 96 HOH HOH . 
U 11 HOH A 32 632 97 HOH HOH . 
U 11 HOH A 33 633 98 HOH HOH . 
V 11 HOH B 1 601 2 HOH HOH . 
V 11 HOH B 2 602 8 HOH HOH . 
V 11 HOH B 3 603 23 HOH HOH . 
V 11 HOH B 4 604 26 HOH HOH . 
V 11 HOH B 5 605 29 HOH HOH . 
V 11 HOH B 6 606 33 HOH HOH . 
V 11 HOH B 7 607 37 HOH HOH . 
V 11 HOH B 8 608 40 HOH HOH . 
V 11 HOH B 9 609 46 HOH HOH . 
V 11 HOH B 10 610 63 HOH HOH . 
V 11 HOH B 11 611 65 HOH HOH . 
V 11 HOH B 12 612 88 HOH HOH . 
V 11 HOH B 13 613 90 HOH HOH . 
V 11 HOH B 14 614 92 HOH HOH . 
V 11 HOH B 15 615 99 HOH HOH . 
W 11 HOH C 1 601 3 HOH HOH . 
W 11 HOH C 2 602 4 HOH HOH . 
W 11 HOH C 3 603 6 HOH HOH . 
W 11 HOH C 4 604 7 HOH HOH . 
W 11 HOH C 5 605 9 HOH HOH . 
W 11 HOH C 6 606 12 HOH HOH . 
W 11 HOH C 7 607 14 HOH HOH . 
W 11 HOH C 8 608 15 HOH HOH . 
W 11 HOH C 9 609 16 HOH HOH . 
W 11 HOH C 10 610 17 HOH HOH . 
W 11 HOH C 11 611 22 HOH HOH . 
W 11 HOH C 12 612 25 HOH HOH . 
W 11 HOH C 13 613 27 HOH HOH . 
W 11 HOH C 14 614 31 HOH HOH . 
W 11 HOH C 15 615 34 HOH HOH . 
W 11 HOH C 16 616 36 HOH HOH . 
W 11 HOH C 17 617 38 HOH HOH . 
W 11 HOH C 18 618 41 HOH HOH . 
W 11 HOH C 19 619 42 HOH HOH . 
W 11 HOH C 20 620 44 HOH HOH . 
W 11 HOH C 21 621 48 HOH HOH . 
W 11 HOH C 22 622 54 HOH HOH . 
W 11 HOH C 23 623 55 HOH HOH . 
W 11 HOH C 24 624 56 HOH HOH . 
W 11 HOH C 25 625 59 HOH HOH . 
W 11 HOH C 26 626 60 HOH HOH . 
W 11 HOH C 27 627 61 HOH HOH . 
W 11 HOH C 28 628 67 HOH HOH . 
W 11 HOH C 29 629 68 HOH HOH . 
W 11 HOH C 30 630 69 HOH HOH . 
X 11 HOH D 1 701 20 HOH HOH . 
X 11 HOH D 2 702 45 HOH HOH . 
X 11 HOH D 3 703 47 HOH HOH . 
X 11 HOH D 4 704 71 HOH HOH . 
X 11 HOH D 5 705 74 HOH HOH . 
X 11 HOH D 6 706 75 HOH HOH . 
Y 11 HOH E 1 201 49 HOH HOH . 
Y 11 HOH E 2 202 64 HOH HOH . 
Z 11 HOH F 1 501 13 HOH HOH . 
Z 11 HOH F 2 502 28 HOH HOH . 
Z 11 HOH F 3 503 58 HOH HOH . 
Z 11 HOH F 4 504 70 HOH HOH . 
Z 11 HOH F 5 505 72 HOH HOH . 
Z 11 HOH F 6 506 93 HOH HOH . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 O O1 MES . . . N 10 30.66 55.713 33.818 1 46.12 ? O1 MES 504 B 1 
HETATM 2 C C2 MES . . . N 10 30.506 55.494 35.222 1 44.95 ? C2 MES 504 B 1 
HETATM 3 C C3 MES . . . N 10 31.507 56.238 36.11 1 56.15 ? C3 MES 504 B 1 
HETATM 4 N N4 MES . . . N 10 31.695 57.613 35.666 1 51.33 ? N4 MES 504 B 1 
HETATM 5 C C5 MES . . . N 10 31.047 57.975 34.421 1 49.32 ? C5 MES 504 B 1 
HETATM 6 C C6 MES . . . N 10 31.432 56.857 33.479 1 53.93 ? C6 MES 504 B 1 
HETATM 7 C C7 MES . . . N 10 31.559 58.603 36.721 1 50.18 ? C7 MES 504 B 1 
HETATM 8 C C8 MES . . . N 10 32.699 59.588 36.491 1 72.54 ? C8 MES 504 B 1 
HETATM 9 S S MES . . . N 10 32.656 60.787 37.639 1 64 ? S MES 504 B 1 
HETATM 10 O O1S MES . . . N 10 32.04 60.258 38.88 1 52.9 ? O1S MES 504 B 1 
HETATM 11 O O2S MES . . . N 10 31.856 61.93 37.133 1 61.33 ? O2S MES 504 B 1 
HETATM 12 O O3S MES . . . N 10 34.04 61.243 37.899 1 86.8 ? O3S MES 504 B 1 
HETATM 13 H H21 MES . . . N 10 30.626 54.424 35.403 1 53.94 ? H21 MES 504 B 1 
HETATM 14 H H22 MES . . . N 10 29.491 55.759 35.525 1 53.94 ? H22 MES 504 B 1 
HETATM 15 H H31 MES . . . N 10 31.161 56.233 37.146 1 67.38 ? H31 MES 504 B 1 
HETATM 16 H H32 MES . . . N 10 32.467 55.719 36.083 1 67.38 ? H32 MES 504 B 1 
HETATM 17 H HN4 MES . . . N 10 32.676 57.65 35.435 1 61.59 ? HN4 MES 504 B 1 
HETATM 18 H H51 MES . . . N 10 29.963 58.028 34.546 1 59.18 ? H51 MES 504 B 1 
HETATM 19 H H52 MES . . . N 10 31.417 58.935 34.055 1 59.18 ? H52 MES 504 B 1 
HETATM 20 H H61 MES . . . N 10 31.242 57.155 32.446 1 64.72 ? H61 MES 504 B 1 
HETATM 21 H H62 MES . . . N 10 32.497 56.638 33.577 1 64.72 ? H62 MES 504 B 1 
HETATM 22 H H71 MES . . . N 10 31.648 58.134 37.703 1 60.22 ? H71 MES 504 B 1 
HETATM 23 H H72 MES . . . N 10 30.593 59.109 36.652 1 60.22 ? H72 MES 504 B 1 
HETATM 24 H H81 MES . . . N 10 33.655 59.062 36.544 1 87.05 ? H81 MES 504 B 1 
HETATM 25 H H82 MES . . . N 10 32.609 60.028 35.496 1 87.05 ? H82 MES 504 B 1 
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