data_4J9U
#
_model_server_result.job_id            AV4AvtfhRBtaow0AiZpmTQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-03-04 23:23:13' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4j9u 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"O","auth_seq_id":503}' 
#
_entry.id    4J9U 
#
_exptl.entry_id    4J9U 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              39.098 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'POTASSIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          99.32 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            4J9U 
_cell.length_a            133.725 
_cell.length_b            146.627 
_cell.length_c            163.672 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4J9U 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? hexameric 6 author_defined_assembly 1 
? hexameric 6 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA 1 1 
C,D,E,F,G,H,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 L N N 
? 4 O N N 
? 4 R N N 
? 4 V N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 251 A CYS 251 1_555 A SG CYS 348 A CYS 348 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? 
disulf ? disulf2 B SG CYS 251 B CYS 251 1_555 B SG CYS 348 B CYS 348 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? 
disulf ? disulf3 C SG CYS 251 C CYS 251 1_555 C SG CYS 348 C CYS 348 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? 
disulf ? disulf4 D SG CYS 251 D CYS 251 1_555 D SG CYS 348 D CYS 348 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? 
metalc ? metalc1 A O THR 111 A THR 111 1_555 L K K . A K 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.89 ? 
metalc ? metalc2 A O THR 112 A THR 112 1_555 L K K . A K 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.794 ? 
metalc ? metalc3 A O ILE 220 A ILE 220 1_555 L K K . A K 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.264 ? 
metalc ? metalc4 A O GLY 221 A GLY 221 1_555 L K K . A K 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.599 ? 
metalc ? metalc5 A O THR 320 A THR 320 1_555 L K K . A K 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.742 ? 
metalc ? metalc6 A O ALA 321 A ALA 321 1_555 L K K . A K 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.764 ? 
metalc ? metalc7 A O ASN 437 A ASN 437 1_555 L K K . A K 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.887 ? 
metalc ? metalc8 A O LEU 438 A LEU 438 1_555 L K K . A K 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.708 ? 
metalc ? metalc9 B O THR 111 B THR 111 1_555 O K K . B K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.102 ? 
metalc ? metalc10 B O THR 112 B THR 112 1_555 O K K . B K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.661 ? 
metalc ? metalc11 B O GLY 221 B GLY 221 1_555 O K K . B K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.708 ? 
metalc ? metalc12 B O THR 320 B THR 320 1_555 O K K . B K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.633 ? 
metalc ? metalc13 B O ALA 321 B ALA 321 1_555 O K K . B K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.825 ? 
metalc ? metalc14 B O ASN 437 B ASN 437 1_555 O K K . B K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.681 ? 
metalc ? metalc15 B O LEU 438 B LEU 438 1_555 O K K . B K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.931 ? 
metalc ? metalc16 C O THR 111 C THR 111 1_555 R K K . C K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.911 ? 
metalc ? metalc17 C O THR 112 C THR 112 1_555 R K K . C K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.83 ? 
metalc ? metalc18 C O ILE 220 C ILE 220 1_555 R K K . C K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.267 ? 
metalc ? metalc19 C O GLY 221 C GLY 221 1_555 R K K . C K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.636 ? 
metalc ? metalc20 C O THR 320 C THR 320 1_555 R K K . C K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.661 ? 
metalc ? metalc21 C O ALA 321 C ALA 321 1_555 R K K . C K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.814 ? 
metalc ? metalc22 C O ASN 437 C ASN 437 1_555 R K K . C K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.85 ? 
metalc ? metalc23 C O LEU 438 C LEU 438 1_555 R K K . C K 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.726 ? 
metalc ? metalc24 D O THR 111 D THR 111 1_555 V K K . D K 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.881 ? 
metalc ? metalc25 D O THR 112 D THR 112 1_555 V K K . D K 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.905 ? 
metalc ? metalc26 D O ILE 220 D ILE 220 1_555 V K K . D K 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.3 ? 
metalc ? metalc27 D O GLY 221 D GLY 221 1_555 V K K . D K 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? 
metalc ? metalc28 D O THR 320 D THR 320 1_555 V K K . D K 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.675 ? 
metalc ? metalc29 D O ALA 321 D ALA 321 1_555 V K K . D K 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.857 ? 
metalc ? metalc30 D O ASN 437 D ASN 437 1_555 V K K . D K 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.996 ? 
metalc ? metalc31 D O LEU 438 D LEU 438 1_555 V K K . D K 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.686 ? 
#
_chem_comp.formula           'K 1' 
_chem_comp.formula_weight    39.098 
_chem_comp.id                K 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'POTASSIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     4J9U 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.007478 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.001227 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.00682 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.006191 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
I 3 TBR A 1 501 501 TBR TBR . 
J 3 TBR A 1 502 502 TBR TBR . 
K 3 TBR A 1 503 503 TBR TBR . 
L 4 K A 1 504 601 K K . 
M 3 TBR B 1 501 501 TBR TBR . 
N 3 TBR B 1 502 502 TBR TBR . 
O 4 K B 1 503 601 K K . 
P 3 TBR C 1 501 501 TBR TBR . 
Q 3 TBR C 1 502 502 TBR TBR . 
R 4 K C 1 503 601 K K . 
S 3 TBR D 1 501 501 TBR TBR . 
T 3 TBR D 1 502 502 TBR TBR . 
U 3 TBR D 1 503 503 TBR TBR . 
V 4 K D 1 504 601 K K . 
W 5 NAD E 1 501 501 NAD NAD . 
X 3 TBR E 1 502 601 TBR TBR . 
Y 3 TBR E 1 503 602 TBR TBR . 
Z 5 NAD F 1 501 501 NAD NAD . 
AA 3 TBR F 1 502 601 TBR TBR . 
BA 3 TBR F 1 503 602 TBR TBR . 
CA 5 NAD G 1 501 501 NAD NAD . 
DA 3 TBR G 1 502 601 TBR TBR . 
EA 3 TBR G 1 503 602 TBR TBR . 
FA 5 NAD H 1 501 501 NAD NAD . 
GA 3 TBR H 1 502 601 TBR TBR . 
HA 3 TBR H 1 503 602 TBR TBR . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           K 
_atom_site.label_atom_id         K 
_atom_site.label_comp_id         K 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         O 
_atom_site.label_entity_id       4 
_atom_site.Cartn_x               -5.091 
_atom_site.Cartn_y               15.234 
_atom_site.Cartn_z               117.242 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        73.39 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          K 
_atom_site.auth_comp_id          K 
_atom_site.auth_seq_id           503 
_atom_site.auth_asym_id          B 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              53 
_model_server_stats.parse_time_ms           13 
_model_server_stats.create_model_time_ms    43 
_model_server_stats.query_time_ms           264 
_model_server_stats.encode_time_ms          4 
_model_server_stats.element_count           1 
#