data_4KAO # _model_server_result.job_id MKT5ETaU4cPY_mWS17-xYA _model_server_result.datetime_utc '2025-08-04 19:43:13' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4kao # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":701}' # _entry.id 4KAO # _exptl.entry_id 4KAO _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 425.525 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 1-[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]-3-[4-(pyridin-3-yl)phenyl]urea _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 96.51 _cell.angle_beta 103.12 _cell.angle_gamma 89.44 _cell.entry_id 4KAO _cell.length_a 46.43 _cell.length_b 52.29 _cell.length_c 65.2 _cell.Z_PDB 2 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4KAO _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,D,F 1 1 B,E,G 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 E N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 49 A CYS 456 1_555 A SG CYS 52 A CYS 459 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 49 B CYS 456 1_555 B SG CYS 52 B CYS 459 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? # _chem_comp.formula 'C26 H27 N5 O' _chem_comp.formula_weight 425.525 _chem_comp.id KAO _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 1-[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]-3-[4-(pyridin-3-yl)phenyl]urea _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C10 C8 KAO sing 173 n n C9 C8 KAO sing 174 n n C11 C8 KAO sing 175 n n C8 C4 KAO sing 176 n n C4 C3 KAO sing 177 n y C4 N5 KAO doub 178 n y C3 C2 KAO doub 179 n y N5 N1 KAO sing 180 n y C2 N1 KAO sing 181 n y C2 N6 KAO sing 182 n n N1 C12 KAO sing 183 n n O19 C7 KAO doub 184 n n C13 C12 KAO doub 185 n y C13 C14 KAO sing 186 n y C26 C25 KAO doub 187 n y C26 C21 KAO sing 188 n y N6 C7 KAO sing 189 n n C7 N20 KAO sing 190 n n C25 C24 KAO sing 191 n y C12 C17 KAO sing 192 n y C32 N31 KAO doub 193 n y C32 C27 KAO sing 194 n y N31 C30 KAO sing 195 n y N20 C21 KAO sing 196 n n C14 C15 KAO doub 197 n y C21 C22 KAO doub 198 n y C24 C27 KAO sing 199 n n C24 C23 KAO doub 200 n y C17 C16 KAO doub 201 n y C27 C28 KAO doub 202 n y C30 C29 KAO doub 203 n y C15 C16 KAO sing 204 n y C15 C18 KAO sing 205 n n C22 C23 KAO sing 206 n y C28 C29 KAO sing 207 n y C3 H1 KAO sing 208 n n N6 H2 KAO sing 209 n n C9 H3 KAO sing 210 n n C9 H4 KAO sing 211 n n C9 H5 KAO sing 212 n n C10 H6 KAO sing 213 n n C10 H7 KAO sing 214 n n C10 H8 KAO sing 215 n n C11 H9 KAO sing 216 n n C11 H10 KAO sing 217 n n C11 H11 KAO sing 218 n n C13 H12 KAO sing 219 n n C14 H13 KAO sing 220 n n C16 H14 KAO sing 221 n n C17 H15 KAO sing 222 n n C18 H16 KAO sing 223 n n C18 H17 KAO sing 224 n n C18 H18 KAO sing 225 n n N20 H19 KAO sing 226 n n C22 H20 KAO sing 227 n n C23 H21 KAO sing 228 n n C25 H22 KAO sing 229 n n C26 H23 KAO sing 230 n n C28 H24 KAO sing 231 n n C29 H25 KAO sing 232 n n C30 H26 KAO sing 233 n n C32 H27 KAO sing 234 n n # _atom_sites.entry_id 4KAO _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.021538 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] -0.000211 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.005029 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.019125 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.002197 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.015852 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 KAO A 1 701 1 KAO KAO . D 3 SO4 A 1 702 1 SO4 SO4 . E 2 KAO B 1 701 1 KAO KAO . F 4 HOH A 1 801 3 HOH HOH . F 4 HOH A 2 802 9 HOH HOH . F 4 HOH A 3 803 10 HOH HOH . F 4 HOH A 4 804 12 HOH HOH . F 4 HOH A 5 805 13 HOH HOH . F 4 HOH A 6 806 15 HOH HOH . F 4 HOH A 7 807 16 HOH HOH . F 4 HOH A 8 808 19 HOH HOH . F 4 HOH A 9 809 21 HOH HOH . F 4 HOH A 10 810 27 HOH HOH . F 4 HOH A 11 811 28 HOH HOH . F 4 HOH A 12 812 30 HOH HOH . F 4 HOH A 13 813 32 HOH HOH . F 4 HOH A 14 814 33 HOH HOH . F 4 HOH A 15 815 34 HOH HOH . F 4 HOH A 16 816 35 HOH HOH . F 4 HOH A 17 817 36 HOH HOH . F 4 HOH A 18 818 37 HOH HOH . F 4 HOH A 19 819 39 HOH HOH . F 4 HOH A 20 820 40 HOH HOH . F 4 HOH A 21 821 41 HOH HOH . F 4 HOH A 22 822 45 HOH HOH . F 4 HOH A 23 823 48 HOH HOH . F 4 HOH A 24 824 49 HOH HOH . F 4 HOH A 25 825 52 HOH HOH . F 4 HOH A 26 826 55 HOH HOH . F 4 HOH A 27 827 56 HOH HOH . F 4 HOH A 28 828 57 HOH HOH . F 4 HOH A 29 829 58 HOH HOH . F 4 HOH A 30 830 59 HOH HOH . G 4 HOH B 1 801 1 HOH HOH . G 4 HOH B 2 802 2 HOH HOH . G 4 HOH B 3 803 4 HOH HOH . G 4 HOH B 4 804 5 HOH HOH . G 4 HOH B 5 805 6 HOH HOH . G 4 HOH B 6 806 7 HOH HOH . G 4 HOH B 7 807 8 HOH HOH . G 4 HOH B 8 808 11 HOH HOH . G 4 HOH B 9 809 14 HOH HOH . G 4 HOH B 10 810 17 HOH HOH . G 4 HOH B 11 811 18 HOH HOH . G 4 HOH B 12 812 20 HOH HOH . G 4 HOH B 13 813 22 HOH HOH . G 4 HOH B 14 814 23 HOH HOH . G 4 HOH B 15 815 24 HOH HOH . G 4 HOH B 16 816 25 HOH HOH . G 4 HOH B 17 817 26 HOH HOH . G 4 HOH B 18 818 29 HOH HOH . G 4 HOH B 19 819 31 HOH HOH . G 4 HOH B 20 820 38 HOH HOH . G 4 HOH B 21 821 42 HOH HOH . G 4 HOH B 22 822 43 HOH HOH . G 4 HOH B 23 823 44 HOH HOH . G 4 HOH B 24 824 46 HOH HOH . G 4 HOH B 25 825 47 HOH HOH . G 4 HOH B 26 826 50 HOH HOH . G 4 HOH B 27 827 51 HOH HOH . G 4 HOH B 28 828 53 HOH HOH . G 4 HOH B 29 829 54 HOH HOH . G 4 HOH B 30 830 60 HOH HOH . G 4 HOH B 31 831 61 HOH HOH . G 4 HOH B 32 832 62 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N1 KAO . . . C 2 4.626 -13.095 15.883 1 45.58 ? N1 KAO 701 A 1 HETATM 2 C C2 KAO . . . C 2 3.828 -11.972 15.777 1 45.56 ? C2 KAO 701 A 1 HETATM 3 C C3 KAO . . . C 2 3.113 -12.171 14.626 1 45.89 ? C3 KAO 701 A 1 HETATM 4 C C4 KAO . . . C 2 3.514 -13.405 14.094 1 47.5 ? C4 KAO 701 A 1 HETATM 5 N N5 KAO . . . C 2 4.436 -13.982 14.846 1 47.44 ? N5 KAO 701 A 1 HETATM 6 N N6 KAO . . . C 2 3.811 -10.931 16.682 1 43.41 ? N6 KAO 701 A 1 HETATM 7 C C7 KAO . . . C 2 2.771 -10.031 16.783 1 45.61 ? C7 KAO 701 A 1 HETATM 8 C C8 KAO . . . C 2 3.022 -14.085 12.829 1 46.31 ? C8 KAO 701 A 1 HETATM 9 C C9 KAO . . . C 2 1.499 -14.02 12.77 1 42.06 ? C9 KAO 701 A 1 HETATM 10 C C10 KAO . . . C 2 3.602 -13.38 11.607 1 47.29 ? C10 KAO 701 A 1 HETATM 11 C C11 KAO . . . C 2 3.463 -15.544 12.824 1 44.77 ? C11 KAO 701 A 1 HETATM 12 C C12 KAO . . . C 2 5.572 -13.423 16.896 1 46.11 ? C12 KAO 701 A 1 HETATM 13 C C13 KAO . . . C 2 6.857 -13.805 16.556 1 46.08 ? C13 KAO 701 A 1 HETATM 14 C C14 KAO . . . C 2 7.758 -14.157 17.54 1 45.49 ? C14 KAO 701 A 1 HETATM 15 C C15 KAO . . . C 2 7.407 -14.135 18.879 1 47.97 ? C15 KAO 701 A 1 HETATM 16 C C16 KAO . . . C 2 6.12 -13.742 19.206 1 45.66 ? C16 KAO 701 A 1 HETATM 17 C C17 KAO . . . C 2 5.209 -13.389 18.231 1 46.77 ? C17 KAO 701 A 1 HETATM 18 C C18 KAO . . . C 2 8.392 -14.535 19.947 1 49.5 ? C18 KAO 701 A 1 HETATM 19 O O19 KAO . . . C 2 1.691 -10.25 16.252 1 47.2 ? O19 KAO 701 A 1 HETATM 20 N N20 KAO . . . C 2 3.044 -8.906 17.51 1 46.05 ? N20 KAO 701 A 1 HETATM 21 C C21 KAO . . . C 2 2.175 -7.811 17.712 1 45.86 ? C21 KAO 701 A 1 HETATM 22 C C22 KAO . . . C 2 1.947 -7.304 18.981 1 47.37 ? C22 KAO 701 A 1 HETATM 23 C C23 KAO . . . C 2 1.063 -6.259 19.162 1 49.08 ? C23 KAO 701 A 1 HETATM 24 C C24 KAO . . . C 2 0.382 -5.692 18.091 1 50.46 ? C24 KAO 701 A 1 HETATM 25 C C25 KAO . . . C 2 0.635 -6.204 16.824 1 49.3 ? C25 KAO 701 A 1 HETATM 26 C C26 KAO . . . C 2 1.517 -7.247 16.633 1 47.11 ? C26 KAO 701 A 1 HETATM 27 C C27 KAO . . . C 2 -0.608 -4.611 18.297 1 54.74 ? C27 KAO 701 A 1 HETATM 28 C C28 KAO . . . C 2 -1.189 -4.394 19.539 1 55.66 ? C28 KAO 701 A 1 HETATM 29 C C29 KAO . . . C 2 -2.143 -3.414 19.694 1 53.19 ? C29 KAO 701 A 1 HETATM 30 C C30 KAO . . . C 2 -2.497 -2.665 18.601 1 54.05 ? C30 KAO 701 A 1 HETATM 31 N N31 KAO . . . C 2 -1.959 -2.835 17.393 1 55.2 ? N31 KAO 701 A 1 HETATM 32 C C32 KAO . . . C 2 -1.034 -3.791 17.262 1 54.8 ? C32 KAO 701 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 69 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 248 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 32 #