data_4KAO # _model_server_result.job_id i3C7FWkSfqPWTnenyr-6NQ _model_server_result.datetime_utc '2024-12-22 03:43:58' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4kao # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":701}' # _entry.id 4KAO # _exptl.entry_id 4KAO _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 425.525 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 1-[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]-3-[4-(pyridin-3-yl)phenyl]urea _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 96.51 _cell.angle_beta 103.12 _cell.angle_gamma 89.44 _cell.entry_id 4KAO _cell.length_a 46.43 _cell.length_b 52.29 _cell.length_c 65.2 _cell.Z_PDB 2 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4KAO _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,D,F 1 1 B,E,G 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 E N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 49 A CYS 456 1_555 A SG CYS 52 A CYS 459 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 49 B CYS 456 1_555 B SG CYS 52 B CYS 459 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? # _chem_comp.formula 'C26 H27 N5 O' _chem_comp.formula_weight 425.525 _chem_comp.id KAO _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 1-[3-tert-butyl-1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]-3-[4-(pyridin-3-yl)phenyl]urea _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C10 C8 KAO sing 173 n n C9 C8 KAO sing 174 n n C11 C8 KAO sing 175 n n C8 C4 KAO sing 176 n n C4 C3 KAO sing 177 n y C4 N5 KAO doub 178 n y C3 C2 KAO doub 179 n y N5 N1 KAO sing 180 n y C2 N1 KAO sing 181 n y C2 N6 KAO sing 182 n n N1 C12 KAO sing 183 n n O19 C7 KAO doub 184 n n C13 C12 KAO doub 185 n y C13 C14 KAO sing 186 n y C26 C25 KAO doub 187 n y C26 C21 KAO sing 188 n y N6 C7 KAO sing 189 n n C7 N20 KAO sing 190 n n C25 C24 KAO sing 191 n y C12 C17 KAO sing 192 n y C32 N31 KAO doub 193 n y C32 C27 KAO sing 194 n y N31 C30 KAO sing 195 n y N20 C21 KAO sing 196 n n C14 C15 KAO doub 197 n y C21 C22 KAO doub 198 n y C24 C27 KAO sing 199 n n C24 C23 KAO doub 200 n y C17 C16 KAO doub 201 n y C27 C28 KAO doub 202 n y C30 C29 KAO doub 203 n y C15 C16 KAO sing 204 n y C15 C18 KAO sing 205 n n C22 C23 KAO sing 206 n y C28 C29 KAO sing 207 n y C3 H1 KAO sing 208 n n N6 H2 KAO sing 209 n n C9 H3 KAO sing 210 n n C9 H4 KAO sing 211 n n C9 H5 KAO sing 212 n n C10 H6 KAO sing 213 n n C10 H7 KAO sing 214 n n C10 H8 KAO sing 215 n n C11 H9 KAO sing 216 n n C11 H10 KAO sing 217 n n C11 H11 KAO sing 218 n n C13 H12 KAO sing 219 n n C14 H13 KAO sing 220 n n C16 H14 KAO sing 221 n n C17 H15 KAO sing 222 n n C18 H16 KAO sing 223 n n C18 H17 KAO sing 224 n n C18 H18 KAO sing 225 n n N20 H19 KAO sing 226 n n C22 H20 KAO sing 227 n n C23 H21 KAO sing 228 n n C25 H22 KAO sing 229 n n C26 H23 KAO sing 230 n n C28 H24 KAO sing 231 n n C29 H25 KAO sing 232 n n C30 H26 KAO sing 233 n n C32 H27 KAO sing 234 n n # _atom_sites.entry_id 4KAO _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.021538 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] -0.000211 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.005029 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.019125 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.002197 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.015852 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 KAO A 1 701 1 KAO KAO . D 3 SO4 A 1 702 1 SO4 SO4 . E 2 KAO B 1 701 1 KAO KAO . F 4 HOH A 1 801 3 HOH HOH . F 4 HOH A 2 802 9 HOH HOH . F 4 HOH A 3 803 10 HOH HOH . F 4 HOH A 4 804 12 HOH HOH . F 4 HOH A 5 805 13 HOH HOH . F 4 HOH A 6 806 15 HOH HOH . F 4 HOH A 7 807 16 HOH HOH . F 4 HOH A 8 808 19 HOH HOH . F 4 HOH A 9 809 21 HOH HOH . F 4 HOH A 10 810 27 HOH HOH . F 4 HOH A 11 811 28 HOH HOH . F 4 HOH A 12 812 30 HOH HOH . F 4 HOH A 13 813 32 HOH HOH . F 4 HOH A 14 814 33 HOH HOH . F 4 HOH A 15 815 34 HOH HOH . F 4 HOH A 16 816 35 HOH HOH . F 4 HOH A 17 817 36 HOH HOH . F 4 HOH A 18 818 37 HOH HOH . F 4 HOH A 19 819 39 HOH HOH . F 4 HOH A 20 820 40 HOH HOH . F 4 HOH A 21 821 41 HOH HOH . F 4 HOH A 22 822 45 HOH HOH . F 4 HOH A 23 823 48 HOH HOH . F 4 HOH A 24 824 49 HOH HOH . F 4 HOH A 25 825 52 HOH HOH . F 4 HOH A 26 826 55 HOH HOH . F 4 HOH A 27 827 56 HOH HOH . F 4 HOH A 28 828 57 HOH HOH . F 4 HOH A 29 829 58 HOH HOH . F 4 HOH A 30 830 59 HOH HOH . G 4 HOH B 1 801 1 HOH HOH . G 4 HOH B 2 802 2 HOH HOH . G 4 HOH B 3 803 4 HOH HOH . G 4 HOH B 4 804 5 HOH HOH . G 4 HOH B 5 805 6 HOH HOH . G 4 HOH B 6 806 7 HOH HOH . G 4 HOH B 7 807 8 HOH HOH . G 4 HOH B 8 808 11 HOH HOH . G 4 HOH B 9 809 14 HOH HOH . G 4 HOH B 10 810 17 HOH HOH . G 4 HOH B 11 811 18 HOH HOH . G 4 HOH B 12 812 20 HOH HOH . G 4 HOH B 13 813 22 HOH HOH . G 4 HOH B 14 814 23 HOH HOH . G 4 HOH B 15 815 24 HOH HOH . G 4 HOH B 16 816 25 HOH HOH . G 4 HOH B 17 817 26 HOH HOH . G 4 HOH B 18 818 29 HOH HOH . G 4 HOH B 19 819 31 HOH HOH . G 4 HOH B 20 820 38 HOH HOH . G 4 HOH B 21 821 42 HOH HOH . G 4 HOH B 22 822 43 HOH HOH . G 4 HOH B 23 823 44 HOH HOH . G 4 HOH B 24 824 46 HOH HOH . G 4 HOH B 25 825 47 HOH HOH . G 4 HOH B 26 826 50 HOH HOH . G 4 HOH B 27 827 51 HOH HOH . G 4 HOH B 28 828 53 HOH HOH . G 4 HOH B 29 829 54 HOH HOH . G 4 HOH B 30 830 60 HOH HOH . G 4 HOH B 31 831 61 HOH HOH . G 4 HOH B 32 832 62 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N1 KAO . . . E 2 0.684 7.67 -9.402 1 45.39 ? N1 KAO 701 B 1 HETATM 2 C C2 KAO . . . E 2 0.413 7.799 -10.755 1 43.17 ? C2 KAO 701 B 1 HETATM 3 C C3 KAO . . . E 2 0.113 9.129 -10.913 1 43.74 ? C3 KAO 701 B 1 HETATM 4 C C4 KAO . . . E 2 0.22 9.735 -9.653 1 43.9 ? C4 KAO 701 B 1 HETATM 5 N N5 KAO . . . E 2 0.568 8.863 -8.721 1 45.41 ? N5 KAO 701 B 1 HETATM 6 N N6 KAO . . . E 2 0.466 6.761 -11.671 1 41.66 ? N6 KAO 701 B 1 HETATM 7 C C7 KAO . . . E 2 0.68 6.935 -13.023 1 46.1 ? C7 KAO 701 B 1 HETATM 8 C C8 KAO . . . E 2 -0.013 11.19 -9.291 1 46 ? C8 KAO 701 B 1 HETATM 9 C C9 KAO . . . E 2 0.396 12.08 -10.458 1 48.58 ? C9 KAO 701 B 1 HETATM 10 C C10 KAO . . . E 2 -1.489 11.412 -8.98 1 45.65 ? C10 KAO 701 B 1 HETATM 11 C C11 KAO . . . E 2 0.821 11.557 -8.069 1 46.41 ? C11 KAO 701 B 1 HETATM 12 C C12 KAO . . . E 2 1.029 6.497 -8.669 1 46.82 ? C12 KAO 701 B 1 HETATM 13 C C13 KAO . . . E 2 0.486 6.27 -7.417 1 47.58 ? C13 KAO 701 B 1 HETATM 14 C C14 KAO . . . E 2 0.818 5.129 -6.714 1 49.73 ? C14 KAO 701 B 1 HETATM 15 C C15 KAO . . . E 2 1.692 4.192 -7.235 1 51.07 ? C15 KAO 701 B 1 HETATM 16 C C16 KAO . . . E 2 2.229 4.432 -8.488 1 47.12 ? C16 KAO 701 B 1 HETATM 17 C C17 KAO . . . E 2 1.907 5.569 -9.201 1 45.75 ? C17 KAO 701 B 1 HETATM 18 C C18 KAO . . . E 2 2.049 2.947 -6.462 1 51.28 ? C18 KAO 701 B 1 HETATM 19 O O19 KAO . . . E 2 1.171 7.969 -13.456 1 48.99 ? O19 KAO 701 B 1 HETATM 20 N N20 KAO . . . E 2 0.302 5.886 -13.814 1 44.47 ? N20 KAO 701 B 1 HETATM 21 C C21 KAO . . . E 2 0.326 5.85 -15.226 1 48.69 ? C21 KAO 701 B 1 HETATM 22 C C22 KAO . . . E 2 1.178 4.993 -15.904 1 53.42 ? C22 KAO 701 B 1 HETATM 23 C C23 KAO . . . E 2 1.213 4.995 -17.285 1 54.35 ? C23 KAO 701 B 1 HETATM 24 C C24 KAO . . . E 2 0.406 5.849 -18.029 1 53.09 ? C24 KAO 701 B 1 HETATM 25 C C25 KAO . . . E 2 -0.453 6.691 -17.332 1 49.67 ? C25 KAO 701 B 1 HETATM 26 C C26 KAO . . . E 2 -0.494 6.697 -15.952 1 48.68 ? C26 KAO 701 B 1 HETATM 27 C C27 KAO . . . E 2 0.494 5.897 -19.509 1 52.07 ? C27 KAO 701 B 1 HETATM 28 C C28 KAO . . . E 2 1.543 5.288 -20.187 1 49.63 ? C28 KAO 701 B 1 HETATM 29 C C29 KAO . . . E 2 1.629 5.387 -21.558 1 51.81 ? C29 KAO 701 B 1 HETATM 30 C C30 KAO . . . E 2 0.66 6.093 -22.227 1 53.09 ? C30 KAO 701 B 1 HETATM 31 N N31 KAO . . . E 2 -0.366 6.686 -21.616 1 52.6 ? N31 KAO 701 B 1 HETATM 32 C C32 KAO . . . E 2 -0.433 6.578 -20.285 1 53.37 ? C32 KAO 701 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 55 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 19 _model_server_stats.query_time_ms 225 _model_server_stats.encode_time_ms 6 _model_server_stats.element_count 32 #