data_4KT0
#
_model_server_result.job_id            8Lju-oa2TnPJiAbokeY3sA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-28 10:07:51' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4kt0 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"TA","auth_seq_id":1128}' 
#
_entry.id    4KT0 
#
_exptl.entry_id    4KT0 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              893.489 
_entity.id                          15 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CHLOROPHYLL A' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    90 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.length_c            179.136 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4KT0 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    nonameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      9 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 15 U N N 
? 15 V N N 
? 15 W N N 
? 15 X N N 
? 15 Y N N 
? 15 Z N N 
? 15 AA N N 
? 15 BA N N 
? 15 CA N N 
? 15 EA N N 
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? 15 GA N N 
? 15 HA N N 
? 15 IA N N 
? 15 JA N N 
? 15 KA N N 
? 15 LA N N 
? 15 MA N N 
? 15 NA N N 
? 15 OA N N 
? 15 PA N N 
? 15 QA N N 
? 15 RA N N 
? 15 SA N N 
? 15 TA N N 
? 15 UA N N 
? 15 VA N N 
? 15 WA N N 
? 15 XA N N 
? 15 YA N N 
? 15 ZA N N 
? 15 AB N N 
? 15 BB N N 
? 15 CB N N 
? 15 DB N N 
? 15 EB N N 
? 15 FB N N 
? 15 GB N N 
? 15 HB N N 
? 15 IB N N 
? 15 JB N N 
? 15 LB N N 
? 15 YB N N 
? 15 ZB N N 
? 15 AC N N 
? 15 BC N N 
? 15 CC N N 
? 15 DC N N 
? 15 EC N N 
? 15 FC N N 
? 15 GC N N 
? 15 HC N N 
? 15 IC N N 
? 15 JC N N 
? 15 KC N N 
? 15 LC N N 
? 15 MC N N 
? 15 NC N N 
? 15 OC N N 
? 15 PC N N 
? 15 QC N N 
? 15 RC N N 
? 15 SC N N 
? 15 TC N N 
? 15 UC N N 
? 15 VC N N 
? 15 WC N N 
? 15 XC N N 
? 15 YC N N 
? 15 ZC N N 
? 15 AD N N 
? 15 BD N N 
? 15 CD N N 
? 15 DD N N 
? 15 ED N N 
? 15 FD N N 
? 15 GD N N 
? 15 HD N N 
? 15 ID N N 
? 15 JD N N 
? 15 KD N N 
? 15 LD N N 
? 15 MD N N 
? 15 QD N N 
? 15 TD N N 
? 15 UD N N 
? 15 VD N N 
? 15 YD N N 
? 15 ZD N N 
? 15 AE N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 F SG CYS 32 F CYS 10 1_555 F SG CYS 67 F CYS 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
metalc ? metalc1 A OE1 GLN 115 A GLN 115 1_555 BA MG CLA . A CLA 1106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.729 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLN 123 A GLN 123 1_555 CA MG CLA . A CLA 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.68 ? 
metalc ? metalc3 A O THR 497 A THR 497 1_555 IB MG CLA . A CLA 1134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.997 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 574 A CYS 574 1_555 K FE4 SF4 . A SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? 
metalc ? metalc5 A SG CYS 583 A CYS 583 1_555 K FE2 SF4 . A SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? 
metalc ? metalc6 YA MG CLA . A CLA 1012 1_555 CE O HOH . B HOH 9102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.74 ? 
metalc ? metalc7 V MG CLA . A CLA 1022 1_555 BE O HOH . A HOH 9101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? 
metalc ? metalc8 X O1A CLA . A CLA 1102 1_555 EA MG CLA . A CLA 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.963 ? 
metalc ? metalc9 U MG CLA . A CLA 1801 1_555 N O5 LHG . A LHG 5003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.949 ? 
metalc ? metalc10 K FE1 SF4 . A SF4 3001 1_555 B SG CYS 556 B CYS 556 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? 
metalc ? metalc11 K FE3 SF4 . A SF4 3001 1_555 B SG CYS 565 B CYS 565 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? 
metalc ? metalc12 BE O HOH . A HOH 9107 1_555 TD MG CLA . F CLA 1139 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? 
metalc ? metalc13 B OD2 ASP 93 B ASP 93 1_555 ID MG CLA . B CLA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.998 ? 
metalc ? metalc14 KD MG CLA . B CLA 1237 1_555 CE O HOH . B HOH 9101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.827 ? 
metalc ? metalc15 LD MG CLA . B CLA 1238 1_555 CE O HOH . B HOH 9110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.886 ? 
metalc ? metalc16 LB MG CLA . B CLA 1240 1_555 PB O5 LHG . B LHG 5004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.891 ? 
metalc ? metalc17 C SG CYS 11 C CYS 11 1_555 PD FE3 SF4 . C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? 
metalc ? metalc18 C SG CYS 14 C CYS 14 1_555 PD FE2 SF4 . C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? 
metalc ? metalc19 C SG CYS 17 C CYS 17 1_555 PD FE4 SF4 . C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.995 ? 
metalc ? metalc20 C SG CYS 21 C CYS 21 1_555 OD FE2 SF4 . C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? 
metalc ? metalc21 C SG CYS 48 C CYS 48 1_555 OD FE4 SF4 . C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? 
metalc ? metalc22 C SG CYS 51 C CYS 51 1_555 OD FE1 SF4 . C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.213 ? 
metalc ? metalc23 C SG CYS 54 C CYS 54 1_555 OD FE3 SF4 . C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? 
metalc ? metalc24 C SG CYS 58 C CYS 58 1_555 PD FE1 SF4 . C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? 
metalc ? metalc25 F O ASP 78 F ASP 56 1_555 QD MG CLA . F CLA 1410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.935 ? 
metalc ? metalc26 G OE2 GLU 28 J GLU 28 1_555 YD MG CLA . J CLA 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.908 ? 
#
_chem_comp.formula           'C55 H72 Mg N4 O5' 
_chem_comp.formula_weight    893.489 
_chem_comp.id                CLA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CHLOROPHYLL A' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
MG NA CLA sing 312 n n 
MG NB CLA sing 313 n n 
MG NC CLA sing 314 n n 
MG ND CLA sing 315 n n 
CHA C1A CLA sing 316 n n 
CHA C4D CLA doub 317 n n 
CHA CBD CLA sing 318 n n 
CHB C4A CLA doub 319 n n 
CHB C1B CLA sing 320 n n 
CHB HHB CLA sing 321 n n 
CHC C4B CLA sing 322 n n 
CHC C1C CLA doub 323 n n 
CHC HHC CLA sing 324 n n 
CHD C4C CLA sing 325 n n 
CHD C1D CLA doub 326 n n 
CHD HHD CLA sing 327 n n 
NA C1A CLA doub 328 n n 
NA C4A CLA sing 329 n n 
C1A C2A CLA sing 330 n n 
C2A C3A CLA sing 331 n n 
C2A CAA CLA sing 332 n n 
C2A H2A CLA sing 333 n n 
C3A C4A CLA sing 334 n n 
C3A CMA CLA sing 335 n n 
C3A H3A CLA sing 336 n n 
CMA HMA1 CLA sing 337 n n 
CMA HMA2 CLA sing 338 n n 
CMA HMA3 CLA sing 339 n n 
CAA CBA CLA sing 340 n n 
CAA HAA1 CLA sing 341 n n 
CAA HAA2 CLA sing 342 n n 
CBA CGA CLA sing 343 n n 
CBA HBA1 CLA sing 344 n n 
CBA HBA2 CLA sing 345 n n 
CGA O1A CLA doub 346 n n 
CGA O2A CLA sing 347 n n 
O2A C1 CLA sing 348 n n 
NB C1B CLA sing 349 n y 
NB C4B CLA sing 350 n y 
C1B C2B CLA doub 351 n y 
C2B C3B CLA sing 352 n y 
C2B CMB CLA sing 353 n n 
C3B C4B CLA doub 354 n y 
C3B CAB CLA sing 355 n n 
CMB HMB1 CLA sing 356 n n 
CMB HMB2 CLA sing 357 n n 
CMB HMB3 CLA sing 358 n n 
CAB CBB CLA doub 359 n n 
CAB HAB CLA sing 360 n n 
CBB HBB1 CLA sing 361 n n 
CBB HBB2 CLA sing 362 n n 
NC C1C CLA sing 363 n n 
NC C4C CLA doub 364 n n 
C1C C2C CLA sing 365 n n 
C2C C3C CLA doub 366 n n 
C2C CMC CLA sing 367 n n 
C3C C4C CLA sing 368 n n 
C3C CAC CLA sing 369 n n 
CMC HMC1 CLA sing 370 n n 
CMC HMC2 CLA sing 371 n n 
CMC HMC3 CLA sing 372 n n 
CAC CBC CLA sing 373 n n 
CAC HAC1 CLA sing 374 n n 
CAC HAC2 CLA sing 375 n n 
CBC HBC1 CLA sing 376 n n 
CBC HBC2 CLA sing 377 n n 
CBC HBC3 CLA sing 378 n n 
ND C1D CLA sing 379 n n 
ND C4D CLA sing 380 n n 
C1D C2D CLA sing 381 n n 
C2D C3D CLA doub 382 n n 
C2D CMD CLA sing 383 n n 
C3D C4D CLA sing 384 n n 
C3D CAD CLA sing 385 n n 
CMD HMD1 CLA sing 386 n n 
CMD HMD2 CLA sing 387 n n 
CMD HMD3 CLA sing 388 n n 
CAD OBD CLA doub 389 n n 
CAD CBD CLA sing 390 n n 
CBD CGD CLA sing 391 n n 
CBD HBD CLA sing 392 n n 
CGD O1D CLA doub 393 n n 
CGD O2D CLA sing 394 n n 
O2D CED CLA sing 395 n n 
CED HED1 CLA sing 396 n n 
CED HED2 CLA sing 397 n n 
CED HED3 CLA sing 398 n n 
C1 C2 CLA sing 399 n n 
C1 H11 CLA sing 400 n n 
C1 H12 CLA sing 401 n n 
C2 C3 CLA doub 402 e n 
C2 H2 CLA sing 403 n n 
C3 C4 CLA sing 404 n n 
C3 C5 CLA sing 405 n n 
C4 H41 CLA sing 406 n n 
C4 H42 CLA sing 407 n n 
C4 H43 CLA sing 408 n n 
C5 C6 CLA sing 409 n n 
C5 H51 CLA sing 410 n n 
C5 H52 CLA sing 411 n n 
C6 C7 CLA sing 412 n n 
C6 H61 CLA sing 413 n n 
C6 H62 CLA sing 414 n n 
C7 C8 CLA sing 415 n n 
C7 H71 CLA sing 416 n n 
C7 H72 CLA sing 417 n n 
C8 C9 CLA sing 418 n n 
C8 C10 CLA sing 419 n n 
C8 H8 CLA sing 420 n n 
C9 H91 CLA sing 421 n n 
C9 H92 CLA sing 422 n n 
C9 H93 CLA sing 423 n n 
C10 C11 CLA sing 424 n n 
C10 H101 CLA sing 425 n n 
C10 H102 CLA sing 426 n n 
C11 C12 CLA sing 427 n n 
C11 H111 CLA sing 428 n n 
C11 H112 CLA sing 429 n n 
C12 C13 CLA sing 430 n n 
C12 H121 CLA sing 431 n n 
C12 H122 CLA sing 432 n n 
C13 C14 CLA sing 433 n n 
C13 C15 CLA sing 434 n n 
C13 H13 CLA sing 435 n n 
C14 H141 CLA sing 436 n n 
C14 H142 CLA sing 437 n n 
C14 H143 CLA sing 438 n n 
C15 C16 CLA sing 439 n n 
C15 H151 CLA sing 440 n n 
C15 H152 CLA sing 441 n n 
C16 C17 CLA sing 442 n n 
C16 H161 CLA sing 443 n n 
C16 H162 CLA sing 444 n n 
C17 C18 CLA sing 445 n n 
C17 H171 CLA sing 446 n n 
C17 H172 CLA sing 447 n n 
C18 C19 CLA sing 448 n n 
C18 C20 CLA sing 449 n n 
C18 H18 CLA sing 450 n n 
C19 H191 CLA sing 451 n n 
C19 H192 CLA sing 452 n n 
C19 H193 CLA sing 453 n n 
C20 H201 CLA sing 454 n n 
C20 H202 CLA sing 455 n n 
C20 H203 CLA sing 456 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     4KT0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.008321 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.00577 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.005582 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
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J 10 PQN A 1 2001 2001 PQN PQN . 
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N 12 LHG A 1 5003 5003 LHG LHG . 
O 14 BCR A 1 4001 4001 BCR BCR . 
P 14 BCR A 1 4002 4002 BCR BCR . 
Q 14 BCR A 1 4003 4003 BCR BCR . 
R 14 BCR A 1 4007 4007 BCR BCR . 
S 14 BCR A 1 4008 4008 BCR BCR . 
T 14 BCR A 1 4012 4012 BCR BCR . 
U 15 CLA A 1 1801 1801 CLA CLA . 
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W 15 CLA A 1 1101 1101 CLA CLA . 
X 15 CLA A 1 1102 1102 CLA CLA . 
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AA 15 CLA A 1 1105 1105 CLA CLA . 
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DA 13 CL0 A 1 1108 1108 CL0 CL0 . 
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FA 15 CLA A 1 1110 1110 CLA CLA . 
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KA 15 CLA A 1 1117 1117 CLA CLA . 
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VA 15 CLA A 1 1137 1137 CLA CLA . 
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XA 15 CLA A 1 1140 1140 CLA CLA . 
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ZA 15 CLA A 1 1114 1114 CLA CLA . 
AB 15 CLA A 1 1115 1115 CLA CLA . 
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EB 15 CLA A 1 1130 1130 CLA CLA . 
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HB 15 CLA A 1 1133 1133 CLA CLA . 
IB 15 CLA A 1 1134 1134 CLA CLA . 
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KB 12 LHG A 1 5005 5005 LHG LHG . 
LB 15 CLA B 1 1240 1240 CLA CLA . 
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NB 10 PQN B 1 2002 2002 PQN PQN . 
OB 17 LMG B 1 5002 5002 LMG LMG . 
PB 12 LHG B 1 5004 5004 LHG LHG . 
QB 14 BCR B 1 4004 4004 BCR BCR . 
RB 14 BCR B 1 4005 4005 BCR BCR . 
SB 14 BCR B 1 4006 4006 BCR BCR . 
TB 14 BCR B 1 4009 4009 BCR BCR . 
UB 14 BCR B 1 4010 4010 BCR BCR . 
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YB 15 CLA B 1 1013 1013 CLA CLA . 
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ND 18 CL B 1 6000 6000 CL CL . 
OD 11 SF4 C 1 3002 3002 SF4 SF4 . 
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BE 19 HOH A 3 9103 5 HOH HOH . 
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BE 19 HOH A 5 9105 10 HOH HOH . 
BE 19 HOH A 6 9106 13 HOH HOH . 
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BE 19 HOH A 8 9108 25 HOH HOH . 
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CE 19 HOH B 1 9101 2 HOH HOH . 
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