data_4KXZ
#
_model_server_result.job_id            fjcURRpuBis5CvFp2OWc8Q 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-21 11:37:07' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4kxz 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"M","auth_seq_id":201}' 
#
_entry.id    4KXZ 
#
_exptl.entry_id    4KXZ 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              195.237 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            '2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    5 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            4KXZ 
_cell.length_a            131.2 
_cell.length_b            359.68 
_cell.length_c            64.63 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4KXZ 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        18 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 2' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA hexameric 6 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA hexameric 6 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,F,I,J,M,O,S,T,W,X,AA,BA 1 1 
C,D,G,H,K,L,N,P,Q,R,U,V,Y,Z,CA,DA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 M N N 
? 4 N N N 
? 4 O N N 
? 4 P N N 
? 4 Q N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 7 A CYS 7 1_555 A SG CYS 16 A CYS 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 15 A CYS 15 1_555 A SG CYS 78 A CYS 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.06 ? 
disulf ? disulf3 A SG CYS 44 A CYS 44 1_555 A SG CYS 109 A CYS 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? 
disulf ? disulf4 A SG CYS 48 A CYS 48 1_555 A SG CYS 111 A CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? 
disulf ? disulf5 B SG CYS 7 B CYS 7 1_555 B SG CYS 16 B CYS 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? 
disulf ? disulf6 B SG CYS 15 B CYS 15 1_555 B SG CYS 78 B CYS 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf7 B SG CYS 44 B CYS 44 1_555 B SG CYS 109 B CYS 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? 
disulf ? disulf8 B SG CYS 48 B CYS 48 1_555 B SG CYS 111 B CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? 
disulf ? disulf9 C SG CYS 7 D CYS 7 1_555 C SG CYS 16 D CYS 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? 
disulf ? disulf10 C SG CYS 15 D CYS 15 1_555 C SG CYS 78 D CYS 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? 
disulf ? disulf11 C SG CYS 44 D CYS 44 1_555 C SG CYS 109 D CYS 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
disulf ? disulf12 C SG CYS 48 D CYS 48 1_555 C SG CYS 111 D CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? 
disulf ? disulf13 C SG CYS 77 D CYS 77 1_555 D SG CYS 77 E CYS 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? 
disulf ? disulf14 D SG CYS 7 E CYS 7 1_555 D SG CYS 16 E CYS 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? 
disulf ? disulf15 D SG CYS 15 E CYS 15 1_555 D SG CYS 78 E CYS 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? 
disulf ? disulf16 D SG CYS 44 E CYS 44 1_555 D SG CYS 109 E CYS 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? 
disulf ? disulf17 D SG CYS 48 E CYS 48 1_555 D SG CYS 111 E CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? 
disulf ? disulf18 E SG CYS 22 H CYS 22 1_555 E SG CYS 96 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? 
disulf ? disulf19 E SG CYS 147 H CYS 147 1_555 E SG CYS 203 H CYS 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? 
disulf ? disulf20 F SG CYS 22 J CYS 22 1_555 F SG CYS 96 J CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? 
disulf ? disulf21 F SG CYS 147 J CYS 147 1_555 F SG CYS 203 J CYS 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? 
disulf ? disulf22 G SG CYS 22 N CYS 22 1_555 G SG CYS 96 N CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? 
disulf ? disulf23 G SG CYS 147 N CYS 147 1_555 G SG CYS 203 N CYS 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? 
disulf ? disulf24 H SG CYS 22 Q CYS 22 1_555 H SG CYS 96 Q CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? 
disulf ? disulf25 H SG CYS 147 Q CYS 147 1_555 H SG CYS 203 Q CYS 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? 
disulf ? disulf26 I SG CYS 23 I CYS 23 1_555 I SG CYS 89 I CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.108 ? 
disulf ? disulf27 I SG CYS 135 I CYS 135 1_555 I SG CYS 195 I CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? 
disulf ? disulf28 J SG CYS 23 L CYS 23 1_555 J SG CYS 89 L CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.125 ? 
disulf ? disulf29 J SG CYS 135 L CYS 135 1_555 J SG CYS 195 L CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? 
disulf ? disulf30 K SG CYS 23 M CYS 23 1_555 K SG CYS 89 M CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? 
disulf ? disulf31 K SG CYS 135 M CYS 135 1_555 K SG CYS 195 M CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
disulf ? disulf32 L SG CYS 23 P CYS 23 1_555 L SG CYS 89 P CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? 
disulf ? disulf33 L SG CYS 135 P CYS 135 1_555 L SG CYS 195 P CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? 
#
_chem_comp.formula           'C6 H13 N O4 S' 
_chem_comp.formula_weight    195.237 
_chem_comp.id                MES 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              '2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
O1 C2 MES sing 218 n n 
O1 C6 MES sing 219 n n 
C2 C3 MES sing 220 n n 
C2 H21 MES sing 221 n n 
C2 H22 MES sing 222 n n 
C3 N4 MES sing 223 n n 
C3 H31 MES sing 224 n n 
C3 H32 MES sing 225 n n 
N4 C5 MES sing 226 n n 
N4 C7 MES sing 227 n n 
N4 HN4 MES sing 228 n n 
C5 C6 MES sing 229 n n 
C5 H51 MES sing 230 n n 
C5 H52 MES sing 231 n n 
C6 H61 MES sing 232 n n 
C6 H62 MES sing 233 n n 
C7 C8 MES sing 234 n n 
C7 H71 MES sing 235 n n 
C7 H72 MES sing 236 n n 
C8 S MES sing 237 n n 
C8 H81 MES sing 238 n n 
C8 H82 MES sing 239 n n 
S O1S MES doub 240 n n 
S O2S MES doub 241 n n 
S O3S MES sing 242 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     4KXZ 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.007622 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.00278 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.015473 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
M 4 MES A 1 201 5 MES MES . 
N 4 MES E 1 201 1 MES MES . 
O 4 MES J 1 301 2 MES MES . 
P 4 MES Q 1 801 7 MES MES . 
Q 4 MES M 1 301 4 MES MES . 
R 5 PE5 P 1 701 8 PE5 PE5 . 
S 6 HOH A 1 301 1 HOH HOH . 
S 6 HOH A 2 302 20 HOH HOH . 
S 6 HOH A 3 303 21 HOH HOH . 
S 6 HOH A 4 304 27 HOH HOH . 
S 6 HOH A 5 305 33 HOH HOH . 
S 6 HOH A 6 306 58 HOH HOH . 
S 6 HOH A 7 307 64 HOH HOH . 
S 6 HOH A 8 308 66 HOH HOH . 
S 6 HOH A 9 309 67 HOH HOH . 
S 6 HOH A 10 310 86 HOH HOH . 
S 6 HOH A 11 311 87 HOH HOH . 
S 6 HOH A 12 312 88 HOH HOH . 
S 6 HOH A 13 313 89 HOH HOH . 
S 6 HOH A 14 314 90 HOH HOH . 
S 6 HOH A 15 315 91 HOH HOH . 
S 6 HOH A 16 316 92 HOH HOH . 
S 6 HOH A 17 317 156 HOH HOH . 
T 6 HOH B 1 201 35 HOH HOH . 
T 6 HOH B 2 202 41 HOH HOH . 
T 6 HOH B 3 203 82 HOH HOH . 
T 6 HOH B 4 204 93 HOH HOH . 
T 6 HOH B 5 205 158 HOH HOH . 
U 6 HOH D 1 201 18 HOH HOH . 
U 6 HOH D 2 202 56 HOH HOH . 
U 6 HOH D 3 203 73 HOH HOH . 
U 6 HOH D 4 204 94 HOH HOH . 
U 6 HOH D 5 205 95 HOH HOH . 
U 6 HOH D 6 206 159 HOH HOH . 
U 6 HOH D 7 207 160 HOH HOH . 
U 6 HOH D 8 208 206 HOH HOH . 
U 6 HOH D 9 209 207 HOH HOH . 
U 6 HOH D 10 210 208 HOH HOH . 
U 6 HOH D 11 211 209 HOH HOH . 
U 6 HOH D 12 212 210 HOH HOH . 
V 6 HOH E 1 301 3 HOH HOH . 
V 6 HOH E 2 302 19 HOH HOH . 
V 6 HOH E 3 303 44 HOH HOH . 
V 6 HOH E 4 304 47 HOH HOH . 
V 6 HOH E 5 305 84 HOH HOH . 
V 6 HOH E 6 306 96 HOH HOH . 
V 6 HOH E 7 307 97 HOH HOH . 
V 6 HOH E 8 308 98 HOH HOH . 
V 6 HOH E 9 309 100 HOH HOH . 
V 6 HOH E 10 310 101 HOH HOH . 
V 6 HOH E 11 311 161 HOH HOH . 
V 6 HOH E 12 312 162 HOH HOH . 
V 6 HOH E 13 313 204 HOH HOH . 
V 6 HOH E 14 314 211 HOH HOH . 
W 6 HOH H 1 301 4 HOH HOH . 
W 6 HOH H 2 302 5 HOH HOH . 
W 6 HOH H 3 303 6 HOH HOH . 
W 6 HOH H 4 304 8 HOH HOH . 
W 6 HOH H 5 305 23 HOH HOH . 
W 6 HOH H 6 306 24 HOH HOH . 
W 6 HOH H 7 307 36 HOH HOH . 
W 6 HOH H 8 308 42 HOH HOH . 
W 6 HOH H 9 309 46 HOH HOH . 
W 6 HOH H 10 310 51 HOH HOH . 
W 6 HOH H 11 311 52 HOH HOH . 
W 6 HOH H 12 312 69 HOH HOH . 
W 6 HOH H 13 313 71 HOH HOH . 
W 6 HOH H 14 314 78 HOH HOH . 
W 6 HOH H 15 315 85 HOH HOH . 
W 6 HOH H 16 316 102 HOH HOH . 
W 6 HOH H 17 317 103 HOH HOH . 
W 6 HOH H 18 318 105 HOH HOH . 
W 6 HOH H 19 319 106 HOH HOH . 
W 6 HOH H 20 320 107 HOH HOH . 
W 6 HOH H 21 321 108 HOH HOH . 
W 6 HOH H 22 322 109 HOH HOH . 
W 6 HOH H 23 323 163 HOH HOH . 
W 6 HOH H 24 324 164 HOH HOH . 
W 6 HOH H 25 325 165 HOH HOH . 
W 6 HOH H 26 326 166 HOH HOH . 
W 6 HOH H 27 327 169 HOH HOH . 
W 6 HOH H 28 328 171 HOH HOH . 
W 6 HOH H 29 329 174 HOH HOH . 
W 6 HOH H 30 330 180 HOH HOH . 
W 6 HOH H 31 331 212 HOH HOH . 
X 6 HOH J 1 401 9 HOH HOH . 
X 6 HOH J 2 402 17 HOH HOH . 
X 6 HOH J 3 403 29 HOH HOH . 
X 6 HOH J 4 404 54 HOH HOH . 
X 6 HOH J 5 405 57 HOH HOH . 
X 6 HOH J 6 406 68 HOH HOH . 
X 6 HOH J 7 407 70 HOH HOH . 
X 6 HOH J 8 408 72 HOH HOH . 
X 6 HOH J 9 409 111 HOH HOH . 
X 6 HOH J 10 410 112 HOH HOH . 
X 6 HOH J 11 411 113 HOH HOH . 
X 6 HOH J 12 412 114 HOH HOH . 
X 6 HOH J 13 413 115 HOH HOH . 
X 6 HOH J 14 414 116 HOH HOH . 
X 6 HOH J 15 415 117 HOH HOH . 
X 6 HOH J 16 416 176 HOH HOH . 
X 6 HOH J 17 417 214 HOH HOH . 
Y 6 HOH N 1 301 13 HOH HOH . 
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