data_4L5S # _model_server_result.job_id rdsvyRnYy7z4pxn0jWM6OA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 10:24:38' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 4l5s # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":302}' # _entry.id 4L5S # _exptl.entry_id 4L5S _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 96.063 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'SULFATE ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 5 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 4L5S _cell.length_a 111.309 _cell.length_b 156.118 _cell.length_c 117.614 _cell.Z_PDB 56 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 4L5S _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 20 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 2 2 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? octameric 8 author_defined_assembly 1 ? hexameric 6 author_defined_assembly 2 ? dimeric 2 author_defined_assembly 3 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,D,E,J,K,M,N,O 1 1,2 B,F,G,L,P 2 1,2 H,I,Q 3 1 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 3_554 -x,y,-z-1/2 -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 0 0 -58.807 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 J N N ? 3 K N N ? 3 L N N ? 3 M N N ? 3 N N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order hydrog WATSON-CRICK hydrog1 C N1 DG 1 C DG 1 1_555 E N3 DC 10 E DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 C N2 DG 1 C DG 1 1_555 E O2 DC 10 E DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 C O6 DG 1 C DG 1 1_555 E N4 DC 10 E DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog4 C N4 DC 2 C DC 2 1_555 E O6 DG 9 E DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 C N1 DG 3 C DG 3 1_555 E N3 DC 8 E DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 C N2 DG 3 C DG 3 1_555 E O2 DC 8 E DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 C O6 DG 3 C DG 3 1_555 E N4 DC 8 E DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 C N1 DA 4 C DA 4 1_555 E N3 DT 7 E DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 C N6 DA 4 C DA 4 1_555 E O4 DT 7 E DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 C N3 DT 5 C DT 5 1_555 E N1 DA 6 E DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 C O4 DT 5 C DT 5 1_555 E N6 DA 6 E DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 C N1 DA 6 C DA 6 1_555 E N3 DT 5 E DT 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 C N6 DA 6 C DA 6 1_555 E O4 DT 5 E DT 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 C N3 DT 7 C DT 7 1_555 E N1 DA 4 E DA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 C O4 DT 7 C DT 7 1_555 E N6 DA 4 E DA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 C N3 DC 8 C DC 8 1_555 E N1 DG 3 E DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 C N4 DC 8 C DC 8 1_555 E O6 DG 3 E DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 C O2 DC 8 C DC 8 1_555 E N2 DG 3 E DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DG-DC PAIR' hydrog19 C O6 DG 9 C DG 9 1_555 E N4 DC 2 E DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'DC-DG PAIR' hydrog20 C N4 DC 10 C DC 10 1_555 E O6 DG 1 E DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 H N1 DG 1 H DG 1 1_555 I N3 DC 10 I DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 H N2 DG 1 H DG 1 1_555 I O2 DC 10 I DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 H O6 DG 1 H DG 1 1_555 I N4 DC 10 I DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 H N3 DC 2 H DC 2 1_555 I N1 DG 9 I DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 H N4 DC 2 H DC 2 1_555 I O6 DG 9 I DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 H O2 DC 2 H DC 2 1_555 I N2 DG 9 I DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 H N1 DG 3 H DG 3 1_555 I N3 DC 8 I DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 H N2 DG 3 H DG 3 1_555 I O2 DC 8 I DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 H O6 DG 3 H DG 3 1_555 I N4 DC 8 I DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 H N1 DA 4 H DA 4 1_555 I N3 DT 7 I DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 H N6 DA 4 H DA 4 1_555 I O4 DT 7 I DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 H N3 DT 5 H DT 5 1_555 I N1 DA 6 I DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 H O4 DT 5 H DT 5 1_555 I N6 DA 6 I DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 H N1 DA 6 H DA 6 1_555 I N3 DT 5 I DT 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 H N6 DA 6 H DA 6 1_555 I O4 DT 5 I DT 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 H N3 DT 7 H DT 7 1_555 I N1 DA 4 I DA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 H O4 DT 7 H DT 7 1_555 I N6 DA 4 I DA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 H N3 DC 8 H DC 8 1_555 I N1 DG 3 I DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 H N4 DC 8 H DC 8 1_555 I O6 DG 3 I DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 H O2 DC 8 H DC 8 1_555 I N2 DG 3 I DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 H N1 DG 9 H DG 9 1_555 I N3 DC 2 I DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 H N2 DG 9 H DG 9 1_555 I O2 DC 2 I DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 H O6 DG 9 H DG 9 1_555 I N4 DC 2 I DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 H N3 DC 10 H DC 10 1_555 I N1 DG 1 I DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 H N4 DC 10 H DC 10 1_555 I O6 DG 1 I DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 H O2 DC 10 H DC 10 1_555 I N2 DG 1 I DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 D N1 DG 1 D DG 1 1_555 D N3 DC 10 D DC 10 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 D N2 DG 1 D DG 1 1_555 D O2 DC 10 D DC 10 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 D O6 DG 1 D DG 1 1_555 D N4 DC 10 D DC 10 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 D N3 DC 2 D DC 2 1_555 D N1 DG 9 D DG 9 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 D N4 DC 2 D DC 2 1_555 D O6 DG 9 D DG 9 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 D O2 DC 2 D DC 2 1_555 D N2 DG 9 D DG 9 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 D N1 DG 3 D DG 3 1_555 D N3 DC 8 D DC 8 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 D N2 DG 3 D DG 3 1_555 D O2 DC 8 D DC 8 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 D O6 DG 3 D DG 3 1_555 D N4 DC 8 D DC 8 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 D N1 DA 4 D DA 4 1_555 D N3 DT 7 D DT 7 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 D N6 DA 4 D DA 4 1_555 D O4 DT 7 D DT 7 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 D N3 DT 5 D DT 5 1_555 D N1 DA 6 D DA 6 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 D O4 DT 5 D DT 5 1_555 D N6 DA 6 D DA 6 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 D N1 DA 6 D DA 6 1_555 D N3 DT 5 D DT 5 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 D N6 DA 6 D DA 6 1_555 D O4 DT 5 D DT 5 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 D N3 DT 7 D DT 7 1_555 D N1 DA 4 D DA 4 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 D O4 DT 7 D DT 7 1_555 D N6 DA 4 D DA 4 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 D N3 DC 8 D DC 8 1_555 D N1 DG 3 D DG 3 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 D N4 DC 8 D DC 8 1_555 D O6 DG 3 D DG 3 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 D O2 DC 8 D DC 8 1_555 D N2 DG 3 D DG 3 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 D N1 DG 9 D DG 9 1_555 D N3 DC 2 D DC 2 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 D N2 DG 9 D DG 9 1_555 D O2 DC 2 D DC 2 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 D O6 DG 9 D DG 9 1_555 D N4 DC 2 D DC 2 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 D N3 DC 10 D DC 10 1_555 D N1 DG 1 D DG 1 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 D N4 DC 10 D DC 10 1_555 D O6 DG 1 D DG 1 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 D O2 DC 10 D DC 10 1_555 D N2 DG 1 D DG 1 3_554 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'O4 S -2' _chem_comp.formula_weight 96.063 _chem_comp.id SO4 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'SULFATE ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag S O1 SO4 doub 426 n n S O2 SO4 doub 427 n n S O3 SO4 sing 428 n n S O4 SO4 sing 429 n n # _atom_sites.entry_id 4L5S _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.008984 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006405 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008502 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code J 3 SO4 A 1 301 2 SO4 SO4 . K 3 SO4 A 1 302 5 SO4 SO4 . L 3 SO4 B 1 301 3 SO4 SO4 . M 3 SO4 C 1 101 1 SO4 SO4 . N 3 SO4 D 1 101 4 SO4 SO4 . O 4 HOH A 1 401 2 HOH HOH . O 4 HOH A 2 402 4 HOH HOH . O 4 HOH A 3 403 6 HOH HOH . P 4 HOH B 1 401 1 HOH HOH . P 4 HOH B 2 402 5 HOH HOH . P 4 HOH B 3 403 7 HOH HOH . Q 4 HOH I 1 101 3 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 S S SO4 . . . K 3 -8.906 61.931 1.719 1 30 ? S SO4 302 A 1 HETATM 2 O O1 SO4 . . . K 3 -7.679 61.931 0.818 1 30 ? O1 SO4 302 A 1 HETATM 3 O O2 SO4 . . . K 3 -10.133 61.931 0.818 1 30 ? O2 SO4 302 A 1 HETATM 4 O O3 SO4 . . . K 3 -8.906 60.668 2.371 1 30 ? O3 SO4 302 A 1 HETATM 5 O O4 SO4 . . . K 3 -8.906 63.194 2.371 1 30 ? O4 SO4 302 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 13 _model_server_stats.create_model_time_ms 5 _model_server_stats.query_time_ms 289 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 5 #