data_4L6V
#
_model_server_result.job_id            6TtjQUww2aWlqJO4vGG2Kw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-28 13:08:28' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4l6v 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"NL","auth_seq_id":4014}' 
#
_entry.id    4L6V 
#
_exptl.entry_id    4L6V 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              536.873 
_entity.id                          14 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            BETA-CAROTENE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    57 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          111.14 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            4L6V 
_cell.length_a            214.619 
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_cell.length_c            219.846 
_cell.Z_PDB               6 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4L6V 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? decameric 10 author_defined_assembly 1 
? decameric 10 author_defined_assembly 2 
? decameric 10 author_defined_assembly 3 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,E,F,G,H,AA,BA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RN,SN 1 1 
I,J,K,L,M,N,O,P,Q,CA,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,NF,OF,PF,QF,RF,SF,TF,UF,VF,WF,XF,YF,ZF,AG,BG,CG,DG,EG,FG,GG,HG,IG,JG,KG,LG,MG,NG,OG,PG,QG,RG,SG,TG,UG,VG,WG,XG,YG,ZG,AH,BH,CH,DH,EH,FH,GH,HH,IH,JH,KH,LH,MH,NH,OH,PH,QH,RH,SH,TH,UH,VH,WH,XH,YH,ZH,AI,BI,CI,DI,EI,FI,GI,HI,II,JI,KI,LI,MI,NI,OI,PI,QI,RI,SI,TI,UI,VI,WI,XI,YI,ZI,AJ,BJ,CJ,DJ,TN,UN 2 1 
R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,DA,EJ,FJ,GJ,HJ,IJ,JJ,KJ,LJ,MJ,NJ,OJ,PJ,QJ,RJ,SJ,TJ,UJ,VJ,WJ,XJ,YJ,ZJ,AK,BK,CK,DK,EK,FK,GK,HK,IK,JK,KK,LK,MK,NK,OK,PK,QK,RK,SK,TK,UK,VK,WK,XK,YK,ZK,AL,BL,CL,DL,EL,FL,GL,HL,IL,JL,KL,LL,ML,NL,OL,PL,QL,RL,SL,TL,UL,VL,WL,XL,YL,ZL,AM,BM,CM,DM,EM,FM,GM,HM,IM,JM,KM,LM,MM,NM,OM,PM,QM,RM,SM,TM,UM,VM,WM,XM,YM,ZM,AN,BN,CN,DN,EN,FN,GN,HN,IN,JN,KN,LN,MN,NN,ON,PN,QN,VN,WN 3 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 14 HA N N 
? 14 IA N N 
? 14 JA N N 
? 14 KA N N 
? 14 LA N N 
? 14 HC N N 
? 14 IC N N 
? 14 JC N N 
? 14 KC N N 
? 14 LC N N 
? 14 MC N N 
? 14 NC N N 
? 14 OC N N 
? 14 IE N N 
? 14 JE N N 
? 14 KE N N 
? 14 OE N N 
? 14 PE N N 
? 14 QE N N 
? 14 UE N N 
? 14 VE N N 
? 14 WE N N 
? 14 XE N N 
? 14 YE N N 
? 14 UG N N 
? 14 VG N N 
? 14 WG N N 
? 14 XG N N 
? 14 YG N N 
? 14 ZG N N 
? 14 AH N N 
? 14 BH N N 
? 14 VI N N 
? 14 WI N N 
? 14 XI N N 
? 14 BJ N N 
? 14 CJ N N 
? 14 DJ N N 
? 14 HJ N N 
? 14 IJ N N 
? 14 JJ N N 
? 14 KJ N N 
? 14 LJ N N 
? 14 HL N N 
? 14 IL N N 
? 14 JL N N 
? 14 KL N N 
? 14 LL N N 
? 14 ML N N 
? 14 NL N N 
? 14 OL N N 
? 14 IN N N 
? 14 JN N N 
? 14 KN N N 
? 14 ON N N 
? 14 PN N N 
? 14 QN N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OE1 GLN 115 A GLN 115 1_555 VA MG CLA . A CLA 1106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.834 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLN 123 A GLN 123 1_555 WA MG CLA . A CLA 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.91 ? 
metalc ? metalc3 A O THR 497 A THR 497 1_555 DC MG CLA . A CLA 1134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.98 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 574 A CYS 574 1_555 GA FE4 SF4 . A SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? 
metalc ? metalc5 RA O1A CLA . A CLA 1102 1_555 YA MG CLA . A CLA 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.977 ? 
metalc ? metalc6 EA MG CLA . A CLA 1801 1_555 NA O5 LHG . A LHG 5003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.931 ? 
metalc ? metalc7 GA FE1 SF4 . A SF4 3001 1_555 B SG CYS 556 B CYS 556 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.958 ? 
metalc ? metalc8 B OD2 ASP 93 B ASP 93 1_555 CE MG CLA . B CLA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.904 ? 
metalc ? metalc9 BE MG CLA . B CLA 1240 1_555 QC O5 LHG . B LHG 5004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.88 ? 
metalc ? metalc10 C SG CYS 17 C CYS 17 1_555 HE FE4 SF4 . C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.925 ? 
metalc ? metalc11 C SG CYS 51 C CYS 51 1_555 GE FE1 SF4 . C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? 
metalc ? metalc12 G OE2 GLU 52 L GLU 52 1_555 LE MG CLA . L CLA 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.964 ? 
metalc ? metalc13 I OE1 GLN 115 a GLN 115 1_555 IF MG CLA . a CLA 1106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.815 ? 
metalc ? metalc14 I OE1 GLN 123 a GLN 123 1_555 JF MG CLA . a CLA 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.974 ? 
metalc ? metalc15 I SG CYS 583 a CYS 583 1_555 TE FE2 SF4 . a SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.125 ? 
metalc ? metalc16 EF O1A CLA . a CLA 1102 1_555 LF MG CLA . a CLA 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.909 ? 
metalc ? metalc17 RE MG CLA . a CLA 1801 1_555 AF O5 LHG . a LHG 5003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.935 ? 
metalc ? metalc18 TE FE1 SF4 . a SF4 3001 1_555 J SG CYS 556 b CYS 556 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? 
metalc ? metalc19 TE FE3 SF4 . a SF4 3001 1_555 J SG CYS 565 b CYS 565 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.941 ? 
metalc ? metalc20 J OD2 ASP 93 b ASP 93 1_555 PI MG CLA . b CLA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.97 ? 
metalc ? metalc21 K SG CYS 17 c CYS 17 1_555 UI FE4 SF4 . c SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.086 ? 
metalc ? metalc22 K SG CYS 54 c CYS 54 1_555 TI FE3 SF4 . c SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? 
metalc ? metalc23 P OE2 GLU 52 l GLU 52 1_555 YI MG CLA . l CLA 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.869 ? 
metalc ? metalc24 R OE1 GLN 115 1 GLN 115 1_555 VJ MG CLA . 1 CLA 1106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.856 ? 
metalc ? metalc25 R SG CYS 574 1 CYS 574 1_555 GJ FE4 SF4 . 1 SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.922 ? 
metalc ? metalc26 R SG CYS 583 1 CYS 583 1_555 GJ FE2 SF4 . 1 SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? 
metalc ? metalc27 EJ MG CLA . 1 CLA 1801 1_555 NJ O5 LHG . 1 LHG 5003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.947 ? 
metalc ? metalc28 GJ FE1 SF4 . 1 SF4 3001 1_555 S SG CYS 556 2 CYS 556 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.961 ? 
metalc ? metalc29 S OD2 ASP 93 2 ASP 93 1_555 ZL MG CLA . 2 CLA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.905 ? 
metalc ? metalc30 CN MG CLA . 2 CLA 1240 1_555 QL O5 LHG . 2 LHG 5004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.988 ? 
metalc ? metalc31 T SG CYS 54 3 CYS 54 1_555 GN FE3 SF4 . 3 SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
#
_chem_comp.formula           'C40 H56' 
_chem_comp.formula_weight    536.873 
_chem_comp.id                BCR 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              BETA-CAROTENE 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 BCR sing 70 n n 
C1 C6 BCR sing 71 n n 
C1 C31 BCR sing 72 n n 
C1 C32 BCR sing 73 n n 
C2 C3 BCR sing 74 n n 
C2 HC21 BCR sing 75 n n 
C2 HC22 BCR sing 76 n n 
C3 C4 BCR sing 77 n n 
C3 HC31 BCR sing 78 n n 
C3 HC32 BCR sing 79 n n 
C4 C5 BCR sing 80 n n 
C4 HC41 BCR sing 81 n n 
C4 HC42 BCR sing 82 n n 
C5 C6 BCR doub 83 n n 
C5 C33 BCR sing 84 n n 
C6 C7 BCR sing 85 n n 
C7 C8 BCR doub 86 e n 
C7 HC7 BCR sing 87 n n 
C8 C9 BCR sing 88 n n 
C8 HC8 BCR sing 89 n n 
C9 C10 BCR doub 90 e n 
C9 C34 BCR sing 91 n n 
C10 C11 BCR sing 92 n n 
C10 H10C BCR sing 93 n n 
C11 C12 BCR doub 94 e n 
C11 H11C BCR sing 95 n n 
C33 H331 BCR sing 96 n n 
C33 H332 BCR sing 97 n n 
C33 H333 BCR sing 98 n n 
C31 H311 BCR sing 99 n n 
C31 H312 BCR sing 100 n n 
C31 H313 BCR sing 101 n n 
C32 H321 BCR sing 102 n n 
C32 H322 BCR sing 103 n n 
C32 H323 BCR sing 104 n n 
C34 H341 BCR sing 105 n n 
C34 H342 BCR sing 106 n n 
C34 H343 BCR sing 107 n n 
C12 C13 BCR sing 108 n n 
C12 H12C BCR sing 109 n n 
C13 C14 BCR doub 110 e n 
C13 C35 BCR sing 111 n n 
C14 C15 BCR sing 112 n n 
C14 H14C BCR sing 113 n n 
C15 C16 BCR doub 114 e n 
C15 H15C BCR sing 115 n n 
C16 C17 BCR sing 116 n n 
C16 H16C BCR sing 117 n n 
C17 C18 BCR doub 118 e n 
C17 H17C BCR sing 119 n n 
C18 C19 BCR sing 120 n n 
C18 C36 BCR sing 121 n n 
C19 C20 BCR doub 122 e n 
C19 H19C BCR sing 123 n n 
C20 C21 BCR sing 124 n n 
C20 H20C BCR sing 125 n n 
C21 C22 BCR doub 126 e n 
C21 H21C BCR sing 127 n n 
C22 C23 BCR sing 128 n n 
C22 C37 BCR sing 129 n n 
C23 C24 BCR doub 130 e n 
C23 H23C BCR sing 131 n n 
C24 C25 BCR sing 132 n n 
C24 H24C BCR sing 133 n n 
C25 C26 BCR doub 134 n n 
C25 C30 BCR sing 135 n n 
C26 C27 BCR sing 136 n n 
C26 C38 BCR sing 137 n n 
C27 C28 BCR sing 138 n n 
C27 H271 BCR sing 139 n n 
C27 H272 BCR sing 140 n n 
C28 C29 BCR sing 141 n n 
C28 H281 BCR sing 142 n n 
C28 H282 BCR sing 143 n n 
C29 C30 BCR sing 144 n n 
C29 H291 BCR sing 145 n n 
C29 H292 BCR sing 146 n n 
C30 C39 BCR sing 147 n n 
C30 C40 BCR sing 148 n n 
C35 H351 BCR sing 149 n n 
C35 H352 BCR sing 150 n n 
C35 H353 BCR sing 151 n n 
C36 H361 BCR sing 152 n n 
C36 H362 BCR sing 153 n n 
C36 H363 BCR sing 154 n n 
C37 H371 BCR sing 155 n n 
C37 H372 BCR sing 156 n n 
C37 H373 BCR sing 157 n n 
C38 H381 BCR sing 158 n n 
C38 H382 BCR sing 159 n n 
C38 H383 BCR sing 160 n n 
C39 H391 BCR sing 161 n n 
C39 H392 BCR sing 162 n n 
C39 H393 BCR sing 163 n n 
C40 H401 BCR sing 164 n n 
C40 H402 BCR sing 165 n n 
C40 H403 BCR sing 166 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     4L6V 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.004659 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.001802 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.007481 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.004877 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
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VM 11 CLA 2 1 1229 1229 CLA CLA . 
WM 11 CLA 2 1 1230 1230 CLA CLA . 
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