data_4L6V
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_model_server_result.job_id            iBNTYSpuG3gKo4v4P4S7Jg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-24 19:45:19' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4l6v 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"QL","auth_seq_id":5004}' 
#
_entry.id    4L6V 
#
_exptl.entry_id    4L6V 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              722.97 
_entity.id                          15 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    9 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
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_cell.entry_id            4L6V 
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_cell.length_c            219.846 
_cell.Z_PDB               6 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4L6V 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? decameric 10 author_defined_assembly 1 
? decameric 10 author_defined_assembly 2 
? decameric 10 author_defined_assembly 3 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,E,F,G,H,AA,BA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RN,SN 1 1 
I,J,K,L,M,N,O,P,Q,CA,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,NF,OF,PF,QF,RF,SF,TF,UF,VF,WF,XF,YF,ZF,AG,BG,CG,DG,EG,FG,GG,HG,IG,JG,KG,LG,MG,NG,OG,PG,QG,RG,SG,TG,UG,VG,WG,XG,YG,ZG,AH,BH,CH,DH,EH,FH,GH,HH,IH,JH,KH,LH,MH,NH,OH,PH,QH,RH,SH,TH,UH,VH,WH,XH,YH,ZH,AI,BI,CI,DI,EI,FI,GI,HI,II,JI,KI,LI,MI,NI,OI,PI,QI,RI,SI,TI,UI,VI,WI,XI,YI,ZI,AJ,BJ,CJ,DJ,TN,UN 2 1 
R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,DA,EJ,FJ,GJ,HJ,IJ,JJ,KJ,LJ,MJ,NJ,OJ,PJ,QJ,RJ,SJ,TJ,UJ,VJ,WJ,XJ,YJ,ZJ,AK,BK,CK,DK,EK,FK,GK,HK,IK,JK,KK,LK,MK,NK,OK,PK,QK,RK,SK,TK,UK,VK,WK,XK,YK,ZK,AL,BL,CL,DL,EL,FL,GL,HL,IL,JL,KL,LL,ML,NL,OL,PL,QL,RL,SL,TL,UL,VL,WL,XL,YL,ZL,AM,BM,CM,DM,EM,FM,GM,HM,IM,JM,KM,LM,MM,NM,OM,PM,QM,RM,SM,TM,UM,VM,WM,XM,YM,ZM,AN,BN,CN,DN,EN,FN,GN,HN,IN,JN,KN,LN,MN,NN,ON,PN,QN,VN,WN 3 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 15 MA N N 
? 15 NA N N 
? 15 QC N N 
? 15 ZE N N 
? 15 AF N N 
? 15 DH N N 
? 15 MJ N N 
? 15 NJ N N 
? 15 QL N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OE1 GLN 115 A GLN 115 1_555 VA MG CLA . A CLA 1106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.834 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLN 123 A GLN 123 1_555 WA MG CLA . A CLA 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.91 ? 
metalc ? metalc3 A O THR 497 A THR 497 1_555 DC MG CLA . A CLA 1134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.98 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 574 A CYS 574 1_555 GA FE4 SF4 . A SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? 
metalc ? metalc5 RA O1A CLA . A CLA 1102 1_555 YA MG CLA . A CLA 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.977 ? 
metalc ? metalc6 EA MG CLA . A CLA 1801 1_555 NA O5 LHG . A LHG 5003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.931 ? 
metalc ? metalc7 GA FE1 SF4 . A SF4 3001 1_555 B SG CYS 556 B CYS 556 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.958 ? 
metalc ? metalc8 B OD2 ASP 93 B ASP 93 1_555 CE MG CLA . B CLA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.904 ? 
metalc ? metalc9 BE MG CLA . B CLA 1240 1_555 QC O5 LHG . B LHG 5004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.88 ? 
metalc ? metalc10 C SG CYS 17 C CYS 17 1_555 HE FE4 SF4 . C SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.925 ? 
metalc ? metalc11 C SG CYS 51 C CYS 51 1_555 GE FE1 SF4 . C SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? 
metalc ? metalc12 G OE2 GLU 52 L GLU 52 1_555 LE MG CLA . L CLA 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.964 ? 
metalc ? metalc13 I OE1 GLN 115 a GLN 115 1_555 IF MG CLA . a CLA 1106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.815 ? 
metalc ? metalc14 I OE1 GLN 123 a GLN 123 1_555 JF MG CLA . a CLA 1107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.974 ? 
metalc ? metalc15 I SG CYS 583 a CYS 583 1_555 TE FE2 SF4 . a SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.125 ? 
metalc ? metalc16 EF O1A CLA . a CLA 1102 1_555 LF MG CLA . a CLA 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.909 ? 
metalc ? metalc17 RE MG CLA . a CLA 1801 1_555 AF O5 LHG . a LHG 5003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.935 ? 
metalc ? metalc18 TE FE1 SF4 . a SF4 3001 1_555 J SG CYS 556 b CYS 556 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? 
metalc ? metalc19 TE FE3 SF4 . a SF4 3001 1_555 J SG CYS 565 b CYS 565 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.941 ? 
metalc ? metalc20 J OD2 ASP 93 b ASP 93 1_555 PI MG CLA . b CLA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.97 ? 
metalc ? metalc21 K SG CYS 17 c CYS 17 1_555 UI FE4 SF4 . c SF4 3003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.086 ? 
metalc ? metalc22 K SG CYS 54 c CYS 54 1_555 TI FE3 SF4 . c SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? 
metalc ? metalc23 P OE2 GLU 52 l GLU 52 1_555 YI MG CLA . l CLA 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.869 ? 
metalc ? metalc24 R OE1 GLN 115 1 GLN 115 1_555 VJ MG CLA . 1 CLA 1106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.856 ? 
metalc ? metalc25 R SG CYS 574 1 CYS 574 1_555 GJ FE4 SF4 . 1 SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.922 ? 
metalc ? metalc26 R SG CYS 583 1 CYS 583 1_555 GJ FE2 SF4 . 1 SF4 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? 
metalc ? metalc27 EJ MG CLA . 1 CLA 1801 1_555 NJ O5 LHG . 1 LHG 5003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.947 ? 
metalc ? metalc28 GJ FE1 SF4 . 1 SF4 3001 1_555 S SG CYS 556 2 CYS 556 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.961 ? 
metalc ? metalc29 S OD2 ASP 93 2 ASP 93 1_555 ZL MG CLA . 2 CLA 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.905 ? 
metalc ? metalc30 CN MG CLA . 2 CLA 1240 1_555 QL O5 LHG . 2 LHG 5004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.988 ? 
metalc ? metalc31 T SG CYS 54 3 CYS 54 1_555 GN FE3 SF4 . 3 SF4 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
#
_chem_comp.formula           'C38 H75 O10 P' 
_chem_comp.formula_weight    722.97 
_chem_comp.id                LHG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
O1 C1 LHG sing 434 n n 
O1 HO1 LHG sing 435 n n 
C1 C2 LHG sing 436 n n 
C1 HC11 LHG sing 437 n n 
C1 HC12 LHG sing 438 n n 
C2 O2 LHG sing 439 n n 
C2 C3 LHG sing 440 n n 
C2 HC2 LHG sing 441 n n 
O2 H02 LHG sing 442 n n 
C3 O3 LHG sing 443 n n 
C3 HC31 LHG sing 444 n n 
C3 HC32 LHG sing 445 n n 
O3 P LHG sing 446 n n 
P O4 LHG sing 447 n n 
P O5 LHG doub 448 n n 
P O6 LHG sing 449 n n 
O4 HO4 LHG sing 450 n n 
O6 C4 LHG sing 451 n n 
C4 C5 LHG sing 452 n n 
C4 HC41 LHG sing 453 n n 
C4 HC42 LHG sing 454 n n 
C5 C6 LHG sing 455 n n 
C5 O7 LHG sing 456 n n 
C5 HC5 LHG sing 457 n n 
C6 O8 LHG sing 458 n n 
C6 HC61 LHG sing 459 n n 
C6 HC62 LHG sing 460 n n 
O7 C7 LHG sing 461 n n 
C7 O9 LHG doub 462 n n 
C7 C8 LHG sing 463 n n 
C8 C9 LHG sing 464 n n 
C8 HC81 LHG sing 465 n n 
C8 HC82 LHG sing 466 n n 
C9 C10 LHG sing 467 n n 
C9 HC91 LHG sing 468 n n 
C9 HC92 LHG sing 469 n n 
C10 C11 LHG sing 470 n n 
C10 H101 LHG sing 471 n n 
C10 H102 LHG sing 472 n n 
O8 C23 LHG sing 473 n n 
C23 O10 LHG doub 474 n n 
C23 C24 LHG sing 475 n n 
C24 C25 LHG sing 476 n n 
C24 H241 LHG sing 477 n n 
C24 H242 LHG sing 478 n n 
C11 C12 LHG sing 479 n n 
C11 H111 LHG sing 480 n n 
C11 H112 LHG sing 481 n n 
C12 C13 LHG sing 482 n n 
C12 H121 LHG sing 483 n n 
C12 H122 LHG sing 484 n n 
C13 C14 LHG sing 485 n n 
C13 H131 LHG sing 486 n n 
C13 H132 LHG sing 487 n n 
C14 C15 LHG sing 488 n n 
C14 H141 LHG sing 489 n n 
C14 H142 LHG sing 490 n n 
C15 C16 LHG sing 491 n n 
C15 H151 LHG sing 492 n n 
C15 H152 LHG sing 493 n n 
C16 C17 LHG sing 494 n n 
C16 H161 LHG sing 495 n n 
C16 H162 LHG sing 496 n n 
C17 C18 LHG sing 497 n n 
C17 H171 LHG sing 498 n n 
C17 H172 LHG sing 499 n n 
C18 C19 LHG sing 500 n n 
C18 H181 LHG sing 501 n n 
C18 H182 LHG sing 502 n n 
C19 C20 LHG sing 503 n n 
C19 H191 LHG sing 504 n n 
C19 H192 LHG sing 505 n n 
C20 C21 LHG sing 506 n n 
C20 H201 LHG sing 507 n n 
C20 H202 LHG sing 508 n n 
C21 C22 LHG sing 509 n n 
C21 H211 LHG sing 510 n n 
C21 H212 LHG sing 511 n n 
C22 H221 LHG sing 512 n n 
C22 H222 LHG sing 513 n n 
C22 H223 LHG sing 514 n n 
C25 C26 LHG sing 515 n n 
C25 H251 LHG sing 516 n n 
C25 H252 LHG sing 517 n n 
C26 C27 LHG sing 518 n n 
C26 H261 LHG sing 519 n n 
C26 H262 LHG sing 520 n n 
C27 C28 LHG sing 521 n n 
C27 H271 LHG sing 522 n n 
C27 H272 LHG sing 523 n n 
C28 C29 LHG sing 524 n n 
C28 H281 LHG sing 525 n n 
C28 H282 LHG sing 526 n n 
C29 C30 LHG sing 527 n n 
C29 H291 LHG sing 528 n n 
C29 H292 LHG sing 529 n n 
C30 C31 LHG sing 530 n n 
C30 H301 LHG sing 531 n n 
C30 H302 LHG sing 532 n n 
C31 C32 LHG sing 533 n n 
C31 H311 LHG sing 534 n n 
C31 H312 LHG sing 535 n n 
C32 C33 LHG sing 536 n n 
C32 H321 LHG sing 537 n n 
C32 H322 LHG sing 538 n n 
C33 C34 LHG sing 539 n n 
C33 H331 LHG sing 540 n n 
C33 H332 LHG sing 541 n n 
C34 C35 LHG sing 542 n n 
C34 H341 LHG sing 543 n n 
C34 H342 LHG sing 544 n n 
C35 C36 LHG sing 545 n n 
C35 H351 LHG sing 546 n n 
C35 H352 LHG sing 547 n n 
C36 C37 LHG sing 548 n n 
C36 H361 LHG sing 549 n n 
C36 H362 LHG sing 550 n n 
C37 C38 LHG sing 551 n n 
C37 H371 LHG sing 552 n n 
C37 H372 LHG sing 553 n n 
C38 H381 LHG sing 554 n n 
C38 H382 LHG sing 555 n n 
C38 H383 LHG sing 556 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     4L6V 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.004659 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.001802 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.007481 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.004877 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
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VM 11 CLA 2 1 1229 1229 CLA CLA . 
WM 11 CLA 2 1 1230 1230 CLA CLA . 
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