data_4LOR
#
_model_server_result.job_id            8ertmVUwYEZPKEyvx3noFw 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-08-14 19:42:23' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4lor 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":304}' 
#
_entry.id    4LOR 
#
_exptl.entry_id    4LOR 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              22.99 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'SODIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          111.12 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            4LOR 
_cell.length_a            71.353 
_cell.length_b            71.173 
_cell.length_c            98.393 
_cell.Z_PDB               12 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4LOR 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        5 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'C 1 2 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 H N N 
? 4 I N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 49 A CYS 50 1_555 A SG CYS 67 A CYS 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 119 A CYS 120 1_555 A SG CYS 131 A CYS 132 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf3 A SG CYS 127 A CYS 128 1_555 A SG CYS 140 A CYS 141 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf4 A SG CYS 142 A CYS 143 1_555 A SG CYS 155 A CYS 156 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf5 A SG CYS 159 A CYS 160 1_555 A SG CYS 186 A CYS 187 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf6 A SG CYS 218 A CYS 219 1_555 A SG CYS 235 A CYS 236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
covale ? covale1 A ND2 ASN 158 A ASN 159 1_555 J C1 NAG . A NAG 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? 
covale ? covale2 B C HYP 4 B HYP 4 1_555 B N GLY 5 B GLY 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale3 B C PRO 6 B PRO 6 1_555 B N HYP 7 B HYP 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale4 B C HYP 7 B HYP 7 1_555 B N GLY 8 B GLY 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale5 B C PRO 9 B PRO 9 1_555 B N HYP 10 B HYP 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale6 B C HYP 10 B HYP 10 1_555 B N GLY 11 B GLY 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale7 B C PRO 12 B PRO 12 1_555 B N HYP 13 B HYP 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale8 B C HYP 13 B HYP 13 1_555 B N GLY 14 B GLY 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale9 B C PRO 18 B PRO 18 1_555 B N HYP 19 B HYP 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale10 B C HYP 19 B HYP 19 1_555 B N GLY 20 B GLY 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale11 B C PRO 21 B PRO 21 1_555 B N HYP 22 B HYP 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale12 B C HYP 22 B HYP 22 1_555 B N GLY 23 B GLY 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale13 B C PRO 24 B PRO 24 1_555 B N HYP 25 B HYP 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale14 B C HYP 25 B HYP 25 1_555 B N GLY 26 B GLY 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale15 C C HYP 4 C HYP 4 1_555 C N GLY 5 C GLY 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale16 C C PRO 6 C PRO 6 1_555 C N HYP 7 C HYP 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale17 C C HYP 7 C HYP 7 1_555 C N GLY 8 C GLY 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale18 C C PRO 9 C PRO 9 1_555 C N HYP 10 C HYP 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale19 C C HYP 10 C HYP 10 1_555 C N GLY 11 C GLY 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale20 C C PRO 12 C PRO 12 1_555 C N HYP 13 C HYP 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale21 C C HYP 13 C HYP 13 1_555 C N GLY 14 C GLY 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale22 C C PRO 18 C PRO 18 1_555 C N HYP 19 C HYP 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale23 C C HYP 19 C HYP 19 1_555 C N GLY 20 C GLY 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale24 C C PRO 21 C PRO 21 1_555 C N HYP 22 C HYP 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale25 C C HYP 22 C HYP 22 1_555 C N GLY 23 C GLY 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale26 C C PRO 24 C PRO 24 1_555 C N HYP 25 C HYP 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale27 C C HYP 25 C HYP 25 1_555 C N GLY 26 C GLY 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale28 D C PRO 3 D PRO 3 1_555 D N HYP 4 D HYP 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale29 D C HYP 4 D HYP 4 1_555 D N GLY 5 D GLY 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale30 D C PRO 6 D PRO 6 1_555 D N HYP 7 D HYP 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale31 D C HYP 7 D HYP 7 1_555 D N GLY 8 D GLY 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale32 D C PRO 9 D PRO 9 1_555 D N HYP 10 D HYP 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale33 D C HYP 10 D HYP 10 1_555 D N GLY 11 D GLY 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale34 D C PRO 12 D PRO 12 1_555 D N HYP 13 D HYP 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale35 D C HYP 13 D HYP 13 1_555 D N GLY 14 D GLY 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale36 D C PRO 18 D PRO 18 1_555 D N HYP 19 D HYP 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale37 D C HYP 19 D HYP 19 1_555 D N GLY 20 D GLY 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale38 D C PRO 21 D PRO 21 1_555 D N HYP 22 D HYP 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale39 D C HYP 22 D HYP 22 1_555 D N GLY 23 D GLY 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
metalc ? metalc1 A OG SER 9 A SER 10 1_555 H NA NA . A NA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? 
metalc ? metalc2 A O PRO 10 A PRO 11 1_555 H NA NA . A NA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? 
metalc ? metalc3 A O GLN 14 A GLN 15 1_555 H NA NA . A NA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.049 ? 
metalc ? metalc4 A OE1 GLU 44 A GLU 45 1_555 E CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? 
metalc ? metalc5 A OD2 ASP 52 A ASP 53 1_555 E CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.563 ? 
metalc ? metalc6 A OD1 ASP 52 A ASP 53 1_555 E CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.682 ? 
metalc ? metalc7 A OD1 ASP 97 A ASP 98 1_555 E CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? 
metalc ? metalc8 A O SER 99 A SER 100 1_555 E CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? 
metalc ? metalc9 A OD1 ASN 100 A ASN 101 1_555 E CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? 
metalc ? metalc10 A O THR 105 A THR 106 1_555 H NA NA . A NA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.182 ? 
metalc ? metalc11 A OD1 ASP 115 A ASP 116 1_555 F CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.622 ? 
metalc ? metalc12 A O ILE 116 A ILE 117 1_555 F CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? 
metalc ? metalc13 A OE1 GLU 118 A GLU 119 1_555 F CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.94 ? 
metalc ? metalc14 A OD1 ASN 133 A ASN 134 1_555 F CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? 
metalc ? metalc15 A O PHE 134 A PHE 135 1_555 F CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.462 ? 
metalc ? metalc16 A O GLY 137 A GLY 138 1_555 F CA CA . A CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.442 ? 
metalc ? metalc17 A OG SER 173 A SER 174 1_555 I NA NA . A NA 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.713 ? 
metalc ? metalc18 A O PRO 174 A PRO 175 1_555 I NA NA . A NA 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.802 ? 
metalc ? metalc19 A O LYS 178 A LYS 179 1_555 I NA NA . A NA 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.024 ? 
metalc ? metalc20 A OE1 GLU 210 A GLU 211 1_555 G CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? 
metalc ? metalc21 A OD2 ASP 220 A ASP 221 1_555 G CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? 
metalc ? metalc22 A OD1 ASP 220 A ASP 221 1_555 G CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.642 ? 
metalc ? metalc23 A OD1 ASP 259 A ASP 260 1_555 G CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? 
metalc ? metalc24 A O THR 261 A THR 262 1_555 G CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.46 ? 
metalc ? metalc25 A O GLY 262 A GLY 263 1_555 G CA CA . A CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? 
metalc ? metalc26 A O LYS 265 A LYS 266 1_555 I NA NA . A NA 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.857 ? 
metalc ? metalc27 E CA CA . A CA 301 1_555 K O HOH . A HOH 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.475 ? 
metalc ? metalc28 F CA CA . A CA 302 1_555 K O HOH . A HOH 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? 
metalc ? metalc29 G CA CA . A CA 303 1_555 K O HOH . A HOH 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.522 ? 
#
_chem_comp.formula           'Na 1' 
_chem_comp.formula_weight    22.99 
_chem_comp.id                NA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'SODIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     4LOR 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.014015 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.005414 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.01405 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.010895 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 3 CA A 1 301 290 CA CA . 
F 3 CA A 1 302 291 CA CA . 
G 3 CA A 1 303 292 CA CA . 
H 4 NA A 1 304 296 NA NA . 
I 4 NA A 1 305 297 NA NA . 
J 5 NAG A 1 306 300 NAG NAG . 
K 6 HOH A 1 401 1 HOH HOH . 
K 6 HOH A 2 402 2 HOH HOH . 
K 6 HOH A 3 403 3 HOH HOH . 
K 6 HOH A 4 404 4 HOH HOH . 
K 6 HOH A 5 405 5 HOH HOH . 
K 6 HOH A 6 406 6 HOH HOH . 
K 6 HOH A 7 407 7 HOH HOH . 
K 6 HOH A 8 408 8 HOH HOH . 
K 6 HOH A 9 409 9 HOH HOH . 
K 6 HOH A 10 410 10 HOH HOH . 
K 6 HOH A 11 411 11 HOH HOH . 
K 6 HOH A 12 412 12 HOH HOH . 
K 6 HOH A 13 413 13 HOH HOH . 
K 6 HOH A 14 414 14 HOH HOH . 
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