data_4LUE
#
_model_server_result.job_id            930sCOrhmAFrnen8WbH5Zw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-03 03:13:57' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4lue 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":602}' 
#
_entry.id    4LUE 
#
_exptl.entry_id    4LUE 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              482.62 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            7-[trans-4-(4-methylpiperazin-1-yl)cyclohexyl]-5-(4-phenoxyphenyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            4LUE 
_cell.length_a            73.4 
_cell.length_b            93.53 
_cell.length_c            181.49 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4LUE 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,C,D,E,F,G,N 1 1 
B,H,I,J,K,L,M,O 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 D N N 
? 3 J N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A C GLN 449 A GLN 526 1_555 A N PTR 450 A PTR 527 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale2 A C PTR 450 A PTR 527 1_555 A N GLU 451 A GLU 528 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale3 B C GLN 449 B GLN 526 1_555 B N PTR 450 B PTR 527 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale4 B C PTR 450 B PTR 527 1_555 B N GLU 451 B GLU 528 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
metalc ? metalc1 A OE2 GLU 413 A GLU 490 1_555 C CA CA . A CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLU 413 A GLU 490 1_555 C CA CA . A CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.84 ? 
metalc ? metalc3 A O GLU 447 A GLU 524 1_555 H CA CA . B CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.557 ? 
metalc ? metalc4 A O PTR 450 A PTR 527 1_555 H CA CA . B CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? 
metalc ? metalc5 C CA CA . A CA 601 1_555 B O GLU 447 B GLU 524 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.458 ? 
metalc ? metalc6 C CA CA . A CA 601 1_555 B O PTR 450 B PTR 527 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.503 ? 
metalc ? metalc7 B OE2 GLU 413 B GLU 490 1_555 H CA CA . B CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.708 ? 
metalc ? metalc8 B OE1 GLU 413 B GLU 490 1_555 H CA CA . B CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.993 ? 
#
_chem_comp.formula           'C29 H34 N6 O' 
_chem_comp.formula_weight    482.62 
_chem_comp.id                VSE 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              7-[trans-4-(4-methylpiperazin-1-yl)cyclohexyl]-5-(4-phenoxyphenyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
CAR CAS VSE sing 428 n n 
CAR CAQ VSE sing 429 n n 
CAS CAT VSE sing 430 n n 
CAX CAY VSE sing 431 n n 
CAX NAW VSE sing 432 n n 
CAY NAZ VSE sing 433 n n 
CAP CAO VSE doub 434 n y 
CAP CAJ VSE sing 435 n y 
C2 N1 VSE sing 436 n y 
C2 N3 VSE doub 437 n y 
CAT NAW VSE sing 438 n n 
CAT CAU VSE sing 439 n n 
CAO CAN VSE sing 440 n y 
N1 C6 VSE doub 441 n y 
N3 C4 VSE sing 442 n y 
NAW CBB VSE sing 443 n n 
C6 NAK VSE sing 444 n n 
C6 C5 VSE sing 445 n y 
C4 C5 VSE doub 446 n y 
C4 NAG VSE sing 447 n y 
C5 CAI VSE sing 448 n y 
CAQ NAG VSE sing 449 n n 
CAQ CAV VSE sing 450 n n 
NAG CAH VSE sing 451 n y 
CAH CAI VSE doub 452 n y 
CAI CAJ VSE sing 453 n n 
NAZ CBC VSE sing 454 n n 
NAZ CBA VSE sing 455 n n 
CAJ CAL VSE doub 456 n y 
CBB CBA VSE sing 457 n n 
CAN OBD VSE sing 458 n n 
CAN CAM VSE doub 459 n y 
OBD CBE VSE sing 460 n n 
CAV CAU VSE sing 461 n n 
CAL CAM VSE sing 462 n y 
CBE CBF VSE doub 463 n y 
CBE CBJ VSE sing 464 n y 
CBF CBG VSE sing 465 n y 
CBJ CBI VSE doub 466 n y 
CBG CBH VSE doub 467 n y 
CBI CBH VSE sing 468 n y 
NAK H1 VSE sing 469 n n 
NAK H2 VSE sing 470 n n 
CAL H3 VSE sing 471 n n 
CAM H4 VSE sing 472 n n 
CBF H5 VSE sing 473 n n 
CBG H6 VSE sing 474 n n 
CBH H7 VSE sing 475 n n 
CBI H8 VSE sing 476 n n 
CBJ H9 VSE sing 477 n n 
CAO H10 VSE sing 478 n n 
CAP H11 VSE sing 479 n n 
CAH H12 VSE sing 480 n n 
C2 H13 VSE sing 481 n n 
CAQ H14 VSE sing 482 n n 
CAV H15 VSE sing 483 n n 
CAV H16 VSE sing 484 n n 
CAU H17 VSE sing 485 n n 
CAU H18 VSE sing 486 n n 
CAT H19 VSE sing 487 n n 
CAS H20 VSE sing 488 n n 
CAS H21 VSE sing 489 n n 
CAR H22 VSE sing 490 n n 
CAR H23 VSE sing 491 n n 
CAX H25 VSE sing 492 n n 
CAX H26 VSE sing 493 n n 
CAY H27 VSE sing 494 n n 
CAY H28 VSE sing 495 n n 
CBC H30 VSE sing 496 n n 
CBC H31 VSE sing 497 n n 
CBC H32 VSE sing 498 n n 
CBA H33 VSE sing 499 n n 
CBA H34 VSE sing 500 n n 
CBB H35 VSE sing 501 n n 
CBB H36 VSE sing 502 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     4LUE 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.013624 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.010692 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.00551 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 CA A 1 601 1 CA CA . 
D 3 VSE A 1 602 1 VSE LIG . 
E 4 CL A 1 603 1 CL CL . 
F 5 GOL A 1 604 1 GOL GOL . 
G 5 GOL A 1 605 1 GOL GOL . 
H 2 CA B 1 601 1 CA CA . 
I 5 GOL B 1 602 1 GOL GOL . 
J 3 VSE B 1 603 1 VSE LIG . 
K 4 CL B 1 604 1 CL CL . 
L 6 IMD B 1 605 1 IMD IMD . 
M 5 GOL B 1 606 1 GOL GOL . 
N 7 HOH A 1 701 1 HOH HOH . 
N 7 HOH A 2 702 4 HOH HOH . 
N 7 HOH A 3 703 5 HOH HOH . 
N 7 HOH A 4 704 10 HOH HOH . 
N 7 HOH A 5 705 11 HOH HOH . 
N 7 HOH A 6 706 13 HOH HOH . 
N 7 HOH A 7 707 24 HOH HOH . 
N 7 HOH A 8 708 25 HOH HOH . 
N 7 HOH A 9 709 26 HOH HOH . 
O 7 HOH B 1 701 14 HOH HOH . 
O 7 HOH B 2 702 16 HOH HOH . 
O 7 HOH B 3 703 19 HOH HOH . 
O 7 HOH B 4 704 20 HOH HOH . 
O 7 HOH B 5 705 21 HOH HOH . 
O 7 HOH B 6 706 22 HOH HOH . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 N NAK VSE . . . D 3 38.893 -1.654 -16.272 1 50.53 ? NAK VSE 602 A 1 
HETATM 2 C C6 VSE . . . D 3 39.914 -2.505 -16.024 1 49.95 ? C6 VSE 602 A 1 
HETATM 3 C C5 VSE . . . D 3 41.264 -2.09 -16.175 1 32.29 ? C5 VSE 602 A 1 
HETATM 4 C CAI VSE . . . D 3 42.028 -0.907 -16.563 1 48.94 ? CAI VSE 602 A 1 
HETATM 5 C CAJ VSE . . . D 3 41.412 0.385 -16.939 1 27.97 ? CAJ VSE 602 A 1 
HETATM 6 C CAL VSE . . . D 3 40.565 1.126 -16.095 1 35.37 ? CAL VSE 602 A 1 
HETATM 7 C CAM VSE . . . D 3 40.006 2.35 -16.445 1 33.18 ? CAM VSE 602 A 1 
HETATM 8 C CAN VSE . . . D 3 40.266 2.949 -17.689 1 39.82 ? CAN VSE 602 A 1 
HETATM 9 O OBD VSE . . . D 3 39.697 4.174 -17.987 1 45.43 ? OBD VSE 602 A 1 
HETATM 10 C CBE VSE . . . D 3 39.255 4.518 -19.25 1 53.14 ? CBE VSE 602 A 1 
HETATM 11 C CBF VSE . . . D 3 39.646 5.763 -19.776 1 36.51 ? CBF VSE 602 A 1 
HETATM 12 C CBG VSE . . . D 3 39.225 6.161 -21.038 1 71.35 ? CBG VSE 602 A 1 
HETATM 13 C CBH VSE . . . D 3 38.413 5.346 -21.811 1 77.31 ? CBH VSE 602 A 1 
HETATM 14 C CBI VSE . . . D 3 38.023 4.12 -21.297 1 68.48 ? CBI VSE 602 A 1 
HETATM 15 C CBJ VSE . . . D 3 38.43 3.699 -20.036 1 65.15 ? CBJ VSE 602 A 1 
HETATM 16 C CAO VSE . . . D 3 41.118 2.24 -18.538 1 44.19 ? CAO VSE 602 A 1 
HETATM 17 C CAP VSE . . . D 3 41.663 1.015 -18.171 1 35.11 ? CAP VSE 602 A 1 
HETATM 18 C CAH VSE . . . D 3 43.362 -1.294 -16.455 1 62.1 ? CAH VSE 602 A 1 
HETATM 19 N NAG VSE . . . D 3 43.502 -2.635 -16.04 1 36.23 ? NAG VSE 602 A 1 
HETATM 20 C C4 VSE . . . D 3 42.184 -3.114 -15.87 1 40.21 ? C4 VSE 602 A 1 
HETATM 21 N N3 VSE . . . D 3 41.883 -4.412 -15.461 1 41.59 ? N3 VSE 602 A 1 
HETATM 22 C C2 VSE . . . D 3 40.58 -4.634 -15.373 1 41.47 ? C2 VSE 602 A 1 
HETATM 23 N N1 VSE . . . D 3 39.543 -3.791 -15.619 1 40.1 ? N1 VSE 602 A 1 
HETATM 24 C CAQ VSE . . . D 3 44.481 -3.755 -15.709 1 60.02 ? CAQ VSE 602 A 1 
HETATM 25 C CAV VSE . . . D 3 44.932 -4.905 -16.627 1 80.2 ? CAV VSE 602 A 1 
HETATM 26 C CAU VSE . . . D 3 46.392 -5.312 -16.279 1 78.51 ? CAU VSE 602 A 1 
HETATM 27 C CAT VSE . . . D 3 47.422 -4.16 -16.401 1 59.79 ? CAT VSE 602 A 1 
HETATM 28 C CAS VSE . . . D 3 46.804 -2.822 -16.04 1 54.87 ? CAS VSE 602 A 1 
HETATM 29 C CAR VSE . . . D 3 45.679 -3.017 -15.056 1 40.73 ? CAR VSE 602 A 1 
HETATM 30 N NAW VSE . . . D 3 48.639 -4.427 -15.53 1 47.31 ? NAW VSE 602 A 1 
HETATM 31 C CAX VSE . . . D 3 49.824 -3.889 -16.3 1 39.2 ? CAX VSE 602 A 1 
HETATM 32 C CAY VSE . . . D 3 51.166 -4.435 -15.812 1 54 ? CAY VSE 602 A 1 
HETATM 33 N NAZ VSE . . . D 3 51.131 -5.917 -15.775 1 41.42 ? NAZ VSE 602 A 1 
HETATM 34 C CBC VSE . . . D 3 52.449 -6.415 -15.319 1 64.93 ? CBC VSE 602 A 1 
HETATM 35 C CBA VSE . . . D 3 50.105 -6.324 -14.8 1 60.21 ? CBA VSE 602 A 1 
HETATM 36 C CBB VSE . . . D 3 48.763 -5.925 -15.356 1 75.96 ? CBB VSE 602 A 1 
#
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