data_4LUE
#
_model_server_result.job_id            tbffcS8xLg9CtwkloFjJbw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-01 11:02:53' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          4lue 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":603}' 
#
_entry.id    4LUE 
#
_exptl.entry_id    4LUE 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              482.62 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            7-[trans-4-(4-methylpiperazin-1-yl)cyclohexyl]-5-(4-phenoxyphenyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            4LUE 
_cell.length_a            73.4 
_cell.length_b            93.53 
_cell.length_c            181.49 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 4LUE 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,C,D,E,F,G,N 1 1 
B,H,I,J,K,L,M,O 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 D N N 
? 3 J N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A C GLN 449 A GLN 526 1_555 A N PTR 450 A PTR 527 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale2 A C PTR 450 A PTR 527 1_555 A N GLU 451 A GLU 528 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale3 B C GLN 449 B GLN 526 1_555 B N PTR 450 B PTR 527 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale4 B C PTR 450 B PTR 527 1_555 B N GLU 451 B GLU 528 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
metalc ? metalc1 A OE2 GLU 413 A GLU 490 1_555 C CA CA . A CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLU 413 A GLU 490 1_555 C CA CA . A CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.84 ? 
metalc ? metalc3 A O GLU 447 A GLU 524 1_555 H CA CA . B CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.557 ? 
metalc ? metalc4 A O PTR 450 A PTR 527 1_555 H CA CA . B CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? 
metalc ? metalc5 C CA CA . A CA 601 1_555 B O GLU 447 B GLU 524 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.458 ? 
metalc ? metalc6 C CA CA . A CA 601 1_555 B O PTR 450 B PTR 527 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.503 ? 
metalc ? metalc7 B OE2 GLU 413 B GLU 490 1_555 H CA CA . B CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.708 ? 
metalc ? metalc8 B OE1 GLU 413 B GLU 490 1_555 H CA CA . B CA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.993 ? 
#
_chem_comp.formula           'C29 H34 N6 O' 
_chem_comp.formula_weight    482.62 
_chem_comp.id                VSE 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              7-[trans-4-(4-methylpiperazin-1-yl)cyclohexyl]-5-(4-phenoxyphenyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
CAR CAS VSE sing 428 n n 
CAR CAQ VSE sing 429 n n 
CAS CAT VSE sing 430 n n 
CAX CAY VSE sing 431 n n 
CAX NAW VSE sing 432 n n 
CAY NAZ VSE sing 433 n n 
CAP CAO VSE doub 434 n y 
CAP CAJ VSE sing 435 n y 
C2 N1 VSE sing 436 n y 
C2 N3 VSE doub 437 n y 
CAT NAW VSE sing 438 n n 
CAT CAU VSE sing 439 n n 
CAO CAN VSE sing 440 n y 
N1 C6 VSE doub 441 n y 
N3 C4 VSE sing 442 n y 
NAW CBB VSE sing 443 n n 
C6 NAK VSE sing 444 n n 
C6 C5 VSE sing 445 n y 
C4 C5 VSE doub 446 n y 
C4 NAG VSE sing 447 n y 
C5 CAI VSE sing 448 n y 
CAQ NAG VSE sing 449 n n 
CAQ CAV VSE sing 450 n n 
NAG CAH VSE sing 451 n y 
CAH CAI VSE doub 452 n y 
CAI CAJ VSE sing 453 n n 
NAZ CBC VSE sing 454 n n 
NAZ CBA VSE sing 455 n n 
CAJ CAL VSE doub 456 n y 
CBB CBA VSE sing 457 n n 
CAN OBD VSE sing 458 n n 
CAN CAM VSE doub 459 n y 
OBD CBE VSE sing 460 n n 
CAV CAU VSE sing 461 n n 
CAL CAM VSE sing 462 n y 
CBE CBF VSE doub 463 n y 
CBE CBJ VSE sing 464 n y 
CBF CBG VSE sing 465 n y 
CBJ CBI VSE doub 466 n y 
CBG CBH VSE doub 467 n y 
CBI CBH VSE sing 468 n y 
NAK H1 VSE sing 469 n n 
NAK H2 VSE sing 470 n n 
CAL H3 VSE sing 471 n n 
CAM H4 VSE sing 472 n n 
CBF H5 VSE sing 473 n n 
CBG H6 VSE sing 474 n n 
CBH H7 VSE sing 475 n n 
CBI H8 VSE sing 476 n n 
CBJ H9 VSE sing 477 n n 
CAO H10 VSE sing 478 n n 
CAP H11 VSE sing 479 n n 
CAH H12 VSE sing 480 n n 
C2 H13 VSE sing 481 n n 
CAQ H14 VSE sing 482 n n 
CAV H15 VSE sing 483 n n 
CAV H16 VSE sing 484 n n 
CAU H17 VSE sing 485 n n 
CAU H18 VSE sing 486 n n 
CAT H19 VSE sing 487 n n 
CAS H20 VSE sing 488 n n 
CAS H21 VSE sing 489 n n 
CAR H22 VSE sing 490 n n 
CAR H23 VSE sing 491 n n 
CAX H25 VSE sing 492 n n 
CAX H26 VSE sing 493 n n 
CAY H27 VSE sing 494 n n 
CAY H28 VSE sing 495 n n 
CBC H30 VSE sing 496 n n 
CBC H31 VSE sing 497 n n 
CBC H32 VSE sing 498 n n 
CBA H33 VSE sing 499 n n 
CBA H34 VSE sing 500 n n 
CBB H35 VSE sing 501 n n 
CBB H36 VSE sing 502 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     4LUE 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.013624 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.010692 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.00551 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 CA A 1 601 1 CA CA . 
D 3 VSE A 1 602 1 VSE LIG . 
E 4 CL A 1 603 1 CL CL . 
F 5 GOL A 1 604 1 GOL GOL . 
G 5 GOL A 1 605 1 GOL GOL . 
H 2 CA B 1 601 1 CA CA . 
I 5 GOL B 1 602 1 GOL GOL . 
J 3 VSE B 1 603 1 VSE LIG . 
K 4 CL B 1 604 1 CL CL . 
L 6 IMD B 1 605 1 IMD IMD . 
M 5 GOL B 1 606 1 GOL GOL . 
N 7 HOH A 1 701 1 HOH HOH . 
N 7 HOH A 2 702 4 HOH HOH . 
N 7 HOH A 3 703 5 HOH HOH . 
N 7 HOH A 4 704 10 HOH HOH . 
N 7 HOH A 5 705 11 HOH HOH . 
N 7 HOH A 6 706 13 HOH HOH . 
N 7 HOH A 7 707 24 HOH HOH . 
N 7 HOH A 8 708 25 HOH HOH . 
N 7 HOH A 9 709 26 HOH HOH . 
O 7 HOH B 1 701 14 HOH HOH . 
O 7 HOH B 2 702 16 HOH HOH . 
O 7 HOH B 3 703 19 HOH HOH . 
O 7 HOH B 4 704 20 HOH HOH . 
O 7 HOH B 5 705 21 HOH HOH . 
O 7 HOH B 6 706 22 HOH HOH . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 N NAK VSE . . . J 3 34.345 -0.263 -81.041 1 53.8 ? NAK VSE 603 B 1 
HETATM 2 C C6 VSE . . . J 3 33.313 -1.101 -81.28 1 49.09 ? C6 VSE 603 B 1 
HETATM 3 C C5 VSE . . . J 3 31.97 -0.686 -81.065 1 39.67 ? C5 VSE 603 B 1 
HETATM 4 C CAI VSE . . . J 3 31.228 0.486 -80.61 1 52.86 ? CAI VSE 603 B 1 
HETATM 5 C CAJ VSE . . . J 3 31.886 1.76 -80.219 1 37.74 ? CAJ VSE 603 B 1 
HETATM 6 C CAL VSE . . . J 3 32.753 2.479 -81.061 1 31.83 ? CAL VSE 603 B 1 
HETATM 7 C CAM VSE . . . J 3 33.36 3.677 -80.71 1 34.93 ? CAM VSE 603 B 1 
HETATM 8 C CAN VSE . . . J 3 33.137 4.276 -79.459 1 46.94 ? CAN VSE 603 B 1 
HETATM 9 O OBD VSE . . . J 3 33.764 5.479 -79.169 1 53.08 ? OBD VSE 603 B 1 
HETATM 10 C CBE VSE . . . J 3 34.104 5.885 -77.889 1 51.07 ? CBE VSE 603 B 1 
HETATM 11 C CBF VSE . . . J 3 34.827 5.013 -77.055 1 48.44 ? CBF VSE 603 B 1 
HETATM 12 C CBG VSE . . . J 3 35.182 5.403 -75.771 1 66.19 ? CBG VSE 603 B 1 
HETATM 13 C CBH VSE . . . J 3 34.846 6.654 -75.278 1 82.43 ? CBH VSE 603 B 1 
HETATM 14 C CBI VSE . . . J 3 34.139 7.518 -76.096 1 73.88 ? CBI VSE 603 B 1 
HETATM 15 C CBJ VSE . . . J 3 33.769 7.151 -77.384 1 42.77 ? CBJ VSE 603 B 1 
HETATM 16 C CAO VSE . . . J 3 32.265 3.589 -78.604 1 37.13 ? CAO VSE 603 B 1 
HETATM 17 C CAP VSE . . . J 3 31.671 2.385 -78.975 1 45.13 ? CAP VSE 603 B 1 
HETATM 18 C CAH VSE . . . J 3 29.885 0.107 -80.683 1 64.45 ? CAH VSE 603 B 1 
HETATM 19 N NAG VSE . . . J 3 29.73 -1.228 -81.132 1 47.8 ? NAG VSE 603 B 1 
HETATM 20 C C4 VSE . . . J 3 31.038 -1.696 -81.37 1 47.46 ? C4 VSE 603 B 1 
HETATM 21 N N3 VSE . . . J 3 31.319 -2.983 -81.833 1 30.97 ? N3 VSE 603 B 1 
HETATM 22 C C2 VSE . . . J 3 32.617 -3.205 -81.976 1 37.63 ? C2 VSE 603 B 1 
HETATM 23 N N1 VSE . . . J 3 33.665 -2.373 -81.74 1 44.69 ? N1 VSE 603 B 1 
HETATM 24 C CAQ VSE . . . J 3 28.745 -2.362 -81.483 1 50.87 ? CAQ VSE 603 B 1 
HETATM 25 C CAV VSE . . . J 3 27.937 -3.3 -80.497 1 78.25 ? CAV VSE 603 B 1 
HETATM 26 C CAU VSE . . . J 3 26.408 -3.039 -80.573 1 64.25 ? CAU VSE 603 B 1 
HETATM 27 C CAT VSE . . . J 3 25.944 -2.895 -82.004 1 69.38 ? CAT VSE 603 B 1 
HETATM 28 C CAS VSE . . . J 3 26.491 -1.616 -82.516 1 65.4 ? CAS VSE 603 B 1 
HETATM 29 C CAR VSE . . . J 3 27.96 -1.807 -82.748 1 79.37 ? CAR VSE 603 B 1 
HETATM 30 N NAW VSE . . . J 3 24.431 -2.942 -82.124 1 55.43 ? NAW VSE 603 B 1 
HETATM 31 C CAX VSE . . . J 3 23.786 -2.549 -80.834 1 46.71 ? CAX VSE 603 B 1 
HETATM 32 C CAY VSE . . . J 3 22.274 -2.765 -80.901 1 62.05 ? CAY VSE 603 B 1 
HETATM 33 N NAZ VSE . . . J 3 21.967 -4.189 -81.243 1 57.46 ? NAZ VSE 603 B 1 
HETATM 34 C CBC VSE . . . J 3 20.497 -4.333 -81.373 1 78.18 ? CBC VSE 603 B 1 
HETATM 35 C CBA VSE . . . J 3 22.585 -4.538 -82.544 1 51.86 ? CBA VSE 603 B 1 
HETATM 36 C CBB VSE . . . J 3 24.079 -4.362 -82.437 1 79.32 ? CBB VSE 603 B 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              18 
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_model_server_stats.encode_time_ms          4 
_model_server_stats.element_count           36 
#